Le carcinome hépatocellulaire (CHC), troisième cause de décès par cancer dans le monde, se caractérise par une hétérogénéité élevée et des taux de récidive1. Cette hétérogénéité spatiale et temporelle rend certaines populations cellulaires des tissus tumoraux plus actives que d’autres dans le métabolisme, la prolifération, la progression, la tolérance au stress et la résistance aux médicaments. La détection in situ de cellules viables dans les tissus du CHC revêt une profonde importance clinique et biologique, car ces cellules englobent des sous-clones proliférants, des populations résistantes au traitement et des cellules initiatrices de métastases. De telles cellules viables pourraient servir de moteurs essentiels de la récidive tumorale, de l’évasion immunitaire et de l’échec thérapeutique2.
Cependant, les technologies actuelles de profilage spatial (par exemple, la transcriptomique spatiale) nécessitent une instrumentation spécialisée et sont associées à des coûts élevés, tandis que les analyses en vrac traditionnelles négligent souvent l’hétérogénéité spatiale des cellules viables et leurs interactions dynamiques avec les composants stromaux3. Par exemple, les cellules CHC viables résiduelles après résection présentent des profils métaboliques distincts qui ne peuvent pas être récapitulés fidèlement dans les systèmes cellulaires dissociés4. Ainsi, il est impératif de faire progresser les technologies de détection spatialement résolues pour démêler l’interaction fonctionnelle entre les cellules tumorales viables et leur microenvironnement, afin d’éclairer les stratégies thérapeutiques de précision. Bien que des méthodes conventionnelles telles que la cytométrie en flux ou l’immunohistochimie (IHC) aient été utilisées par notre groupe pour détecter les cellules viables dans le CHC, elles nécessitent une dissociation ou une fixation tissulaire, perdant ainsi le contexte spatial et entravant l’analyse des interactions cellule-cellule 5,6. Ainsi, le développement de technologies non destructives à haute résolution pour la détection in situ de cellules viables est essentiel pour élucider les mécanismes de résistance au CHC et guider les thérapies de précision.
Afin de détecter et d’afficher rapidement les cellules viables dans les tissus du CHC in situ sans traitement destructeur, une méthode simple de culture tissulaire à base de bromure de 3-(4,5-diméthylthiazol-2-yl)-2,5-diphényltétrazolium (MTT) a été développée. En bref, les tissus minces frais du CHC (environ 1 × 1 × 0,2 cm3) ont d’abord été cultivés dans un milieu DMEM pendant 3 h contenant 20 % de sérum de veau fœtal (FBS) et de MTT (1 mg/mL). Ensuite, après une fixation à 4 % de paraformaldéhyde (PFA) et un montage contenant du DAPI, des lames de tissu congelées incluses dans de l’OCT (20 μm d’épaisseur) ont été soumises à une observation microscopique sous une lumière vive ou UV. Les cellules viables afficheront une coloration violette, rouge-violet ou violet-noir. En utilisant ce protocole, nous avons réussi à détecter les cellules viables dans les tissus du CHC en 5 heures. Parallèlement, cette méthode préserve la microarchitecture 3D, est compatible avec l’analyse multi-omique en aval et est simple, tout en permettant d’économiser du temps et de l’argent. Cependant, cette méthode présente certaines limites. Les processus en plusieurs étapes de lavage, de sectionnement et de culture peuvent induire une déformation structurelle et une apoptose dans les tissus, en particulier dans les échantillons à métabolisme élevé, tels que le tissu CHC dans cette étude. De plus, l’épaisseur accrue des coupes de cryosection compromet la clarté et la planéité des observations microscopiques.