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L’environnement muqueux du tractus gastro-intestinal des mammifères est très dynamique, favorisant la colonisation d’une communauté microbienne diversifiée. L’épithélium intestinal est constitué de diverses cellules spécialisées qui collaborent pour absorber les nutriments, maintenir l’intégrité de la barrière et communiquer avec le système immunitaire1. Parmi celles-ci, les cellules caliciformes stockent des granules de mucine et sécrètent du mucus dans la lumière dans des conditions d’état stationnaire. Ce mucus forme une barrière physique critique, empêchant le contact microbien direct avec la couche épithéliale, modulant l’inflammation des tissus et maintenant l’homéostasie intestinale 2,3. La dérégulation de la sécrétion de mucus compromet la fonction barrière et a été associée à l’inflammation et à la tumorigenèse 4,5,6,7.
La sécrétion de mucus intestinal peut être déclenchée par des facteurs intrinsèques, tels que le neurotransmetteur acétylcholine, et par des composants microbiens provenant de commensaux 8,9. Compte tenu de la complexité de l’environnement intestinal, de nombreux facteurs influençant la sécrétion de mucus des cellules caliciformes restent inexplorés. Par conséquent, une méthode précise de quantification du mucus luminal est essentielle pour étudier comment différents stimuli affectent la dynamique de la sécrétion. Les approches traditionnelles reposent principalement sur la quantification relative : par exemple, mesurer l’épaisseur du mucus à l’aide de particules fluorescentes ou de charbon de bois dans des systèmes d’explants intestinaux ex vivo 10,11, ou évaluer la distance entre les microbes luminaux et l’épithélium dans des coupes de tissus colorés12,13. Bien que ces méthodes soient pratiques pour les comparaisons relatives, elles peuvent ne pas capturer la distribution complète ou la structure tridimensionnelle du mucus sécrété, d’autant plus que le mucus sécrété ne couvre pas toujours uniformément l’épithélium.
Dans cette étude, nous présentons une méthode de visualisation tridimensionnelle et de quantification absolue du mucus luminal à l’aide de tissus intestinaux entiers. Cette approche nécessite une fixation des tissus frais à l’aide d’un fixateur approprié pour préserver l’intégrité structurelle et la morphologie, suivie d’une coloration fluorescente et d’une imagerie à l’aide d’un microscope confocal ou multiphotonique. En administrant des agents d’essai directement dans des anses intestinales ligaturées de souris profondément anesthésiées, suivi d’une fixation immédiate, la méthode préserve l’architecture native du mucus et permet d’analyser la cinétique de sécrétion. Par rapport aux tissus sectionnés, où la profondeur d’imagerie est principalement limitée par l’épaisseur du tissu, la profondeur d’imagerie des tissus entiers (sans délipidation) atteint environ 200-300 μm, limitée par la diffusion de la lumière et l’opacité des tissus. En utilisant cette technique, nous montrons que le chlorure de carbamoylcholine (CCh), un analogue de l’acétylcholine dont les récepteurs sont exprimés sur les cellules caliciformes14, induit de manière robuste une sécrétion rapide de mucus. Notamment, le mucus sécrété forme à la fois une couche continue le long de l’épithélium et des structures discontinues dans la lumière, des caractéristiques difficiles à détecter dans les coupes de tissus conventionnelles. Ce protocole fournit une plate-forme robuste pour quantifier la distribution tridimensionnelle du mucus intestinal et pour comparer le potentiel d’induction de mucus de divers stimuli.