1. Taxonomie et caractéristiques du genre Nocardia
- Système de classification de Nocardia
Selon le système de classification le plus récent, Nocardia spp. comprend actuellement 109 espèces validement nommées, dont environ la moitié sont considérées comme cliniquementpertinentes 1. La taxonomie de Nocardia évolue continuellement, et l’application du séquençage des gènes 16S rRNA, de l’analyse de séquences multilocus (MLSA) et du séquençage du génome entier (WGS) a considérablement affiné la classification et l’identification de ce genre1˒10.
La prévalence des espèces spécifiques de Nocardia varie considérablement selon la méthodologie d’identification, la présentation clinique et la régiongéographique 1. Lorsque des techniques moléculaires telles que le MLSA sont appliquées, Nocardia cyriacigeorgica et Nocardia farcinica émergent comme les espèces les plus répandues dansl’ensemble 1˒3˒4. Notamment, de nombreux isolats précédemment rapportés comme astéroïdes de Nocardia ont été reclassés en N. cyriacigeorgica sur la base de la caractérisationmoléculaire 1. En revanche, Nocardia brasiliensis est l’agent prédominant de la nocardiose cutanée primaire et de l’actinomycétome nocardique, plutôt qu’une espèce universellement répandue dans tous les syndromescliniques 1. D’autres espèces cliniquement pertinentes couramment rencontrées incluent Nocardia nova, Nocardia otitidiscaviarum, Nocardia veterana, ainsi que des membres du complexe Nocardia transvalensis 1˒3.
Les facteurs géographiques et le statut immunitaire de l’hôte influencent également de manière significative la répartition des espèces. Par exemple, N. brasiliensis est plus fréquemment observé dans les régions tropicales et subtropicales, tandis que N. farcinica et N. cyriacigeorgica sont couramment identifiés dans les climats tempérés1˒3. Chez les patients immunodéprimés, certaines espèces comme N. farcinica et N. cyriacigeorgica sont associées à des infections disséminées plus graves2˒6.
Une identification précise des espèces est essentielle pour développer des stratégies de traitement efficaces, car différentes espèces de Nocardia présentent des profils de susceptibilité antimicrobienne distincts. Par exemple, N. farcinica est intrinsèquement résistante à de nombreux β-lactames11, tandis que N. brasiliensis montre souvent une susceptibilité réduite aux carbapénèmes3˒4. Ainsi, une identification précise des espèces guide directement la thérapie antimicrobienne appropriée et améliore les résultats cliniques.
- Caractéristiques biologiques de Nocardia
Nocardia spp. sont des bactéries filamenteuses ramifiées Gram-positives, dotées d’une forte capacité à s’adapter à diverses niches, leur permettant de survivre dans des conditions environnementales diverses12. Ces bactéries forment généralement des colonies filamenteuses et produisent des colonies caractéristiques « crayeuses » ou « ridées » sur un milieu agar (Figure 1). Nocardia se développe lentement, nécessitant généralement plusieurs jours à plusieurs semaines d’incubation pour une croissance visible. De plus, Nocardia spp. peut utiliser diverses sources de carbone, démontrant une forte diversité métabolique, ce qui permet de survivre dans une grande variété d’environnementsnaturels 13.
- Caractéristiques infectieuses de Nocardia
Les infections à nocardie se manifestent généralement par des infections pulmonaires, des infections cutanées ou des maladies systémiques et sont plus fréquentes chez les patientsimmunodéprimés 2˒14. Cliniquement, les manifestations sont diverses et peuvent inclure la toux, la fièvre et des difficultés respiratoires. Les infections peuvent rapidement évoluer vers une maladie pulmonaire sévère ou une septicémie. Dans certains cas, les infections à Nocardia peuvent également provoquer des abcès cérébraux ou d’autres infections du système nerveux central, en particulier chez les patients immunodéprimés15. Par conséquent, une identification précoce et un traitement rapide sont essentiels pour améliorer le pronostic du patient.
- Caractéristiques épidémiologiques des infections à Nocardia
Les études épidémiologiques montrent une variation géographique significative des infections à Nocardia . L’incidence mondiale est relativement faible mais augmente nettement dans les populations à haut risque, telles que les personnes infectées par le VIH et les receveurs de greffes d’organes. Par exemple, l’incidence des infections à Nocardia chez les receveurs de greffe rénale est d’environ 0,4 % à 1,3 %, tandis que chez les receveurs de greffe pulmonaire, elle peut atteindre 9 %16˒17.
Les analyses de susceptibilité dans différentes populations indiquent que les patients recevant un traitement immunosuppresseur à long terme sont plus susceptibles d’avoir des infections à Nocardia , qui sont étroitement associées à une fonction immunitairecompromise 2. De plus, les facteurs d’exposition environnementale, tels que le contact avec le sol et l’inhalation de poussière, sont considérés comme augmentant le risque d’infection par Nocardia , en particulier chez les personnes vivant ou travaillant dans des environnements à haut risque18.
2. Avancées dans les techniques d’identification moléculaire des Nocardia spp.
- Séquençage du gène 16S rRNA
En raison du processus complexe et chronophage de cultivation et d’isolement de Nocardia, l’introduction de la technologie PCR a considérablement amélioré la vitesse et la précision du diagnostic. Laurent et al. ont démontré que l’amplification du gène 16S rRNA à l’aide d’amorces spécifiques pouvait rapidement identifier Nocardia à partir d’isolats cultivés, posant ainsi les bases de son application en microbiologieclinique 19. Par la suite, une détection directe de Nocardia à partir d’échantillons cliniques via PCR à ARNr 16S a été rapportée, bien que sa sensibilité reste variable et nécessite une suspicion cliniquepréalable 20˒21.
Des études comparatives directes ont montré que la qPCR spécifique à Nocardia, ciblant le gène 16S rRNA, offre une sensibilité plus élevée et un délai de réponse plus court que la culture conventionnelle dans des échantillons cliniques, y compris le lavage bronchoalvéolaire, les crachats, le pus et les échantillons de tissus. Couble et al. ont rapporté une sensibilité de 88 % et une spécificité de 98 % pour la qPCR directe de Nocardie , avec des résultats disponibles en quelques heures, tandis que la culture peut nécessiter des jours à des semaines d’incubation22. Ding et al. ont également confirmé que la PCR du gène 16S rRNA peut être appliquée directement à des échantillons cliniques pour la détection de Nocardia , permettant une identification rapide même dans les cas négatifs en culture et compensant efficacement les limites de la culturetraditionnelle 21.
Cette méthode confirme efficacement l’infection nocardique mais, en tant qu’approche ciblée, nécessite une suspicion clinique préalable. Malgré sa grande précision pour l’identification au niveau du genre, la forte conservation du gène 16S rRNA pose des défis pour distinguer les espèces étroitement apparentées, telles que celles du complexe Nocardia astereoïdes 10,21. Cette limitation reflète une résolution au niveau des espèces plutôt qu’une faible précision globale. Ainsi, les résultats du séquençage nécessitent souvent une validation croisée avec d’autres méthodes, telles que l’analyse de séquences multilocus (MLSA) ou le séquençage du génome entier (WGS), afin d’atteindre une résolution définitive au niveau de l’espèce23˒24.
- Analyse de séquences multilocus (MLSA)
MLSA est une technique moléculaire ayant une valeur d’application significative dans l’identification et le typage des espècesbactériennes 23. Pour les genres complexes tels que Nocardia, le MLSA permet une identification plus précise des espèces en analysant les informations de séquence provenant de plusieurs gènes conservés. Des études ont démontré que le MLSA peut efficacement différencier différentes espèces de Nocardia , en particulier celles morphologiquement et physiologiquement similaires25. Par exemple, une étude a identifié 14 espèces différentes de Nocardia en séquençant quatre gènes (par exemple, gyrB, hsp65, secA1 et 16S rRNA), mettant en lumière l’efficacité et la précision de MLSA25. De plus, la MLSA peut révéler la diversité génétique et soutenir des investigations épidémiologiques. Elle facilite également le suivi de la transmission et de la variation des souches, fournissant des données importantes pour la surveillance et le contrôle des infections.
Cependant, le MLSA est très laborieux, coûteux et ne respecte pas de seuils de seuil de seuil universel, limitant ainsi son application clinique de routine. Comme l’ont noté Traxler et al., MLSA n’est pas bien adapté à un usage routinier en raison de cescontraintes 1. Par conséquent, le rôle principal de la MLSA dans la pratique actuelle se limite aux milieux de recherche, notamment les enquêtes épidémiologiques, le typage des souches et les études taxonomiques. Pour l’identification clinique de routine, le MALDI-TOF MS est préféré en raison de sa rapidité, de son faible coût et de sa facilité d’utilisation. Lorsque la résolution est plus élevée — comme pour l’identification définitive de l’espèce, la détection de gènes de résistance ou l’analyse phylogénétique — le séquençage du génome complet (WGS) offre des capacités supérieures. Des études récentes utilisant le WGS ont non seulement distingué des espèces connues de Nocardia par leur haute résolution, mais ont également permis d’identifier des espèces potentiellement nouvelles, dépassant les capacités de MLSAseul 24. WGS s’est donc imposé comme une alternative plus puissante, offrant une résolution plus élevée et une capacité analytiqueaméliorée 9.
- Application et défis du MALDI-TOF MS
La spectrométrie de masse par désorption laser assistée par matrice – spectrométrie de masse en temps de vol (MALDI-TOF MS) est devenue de plus en plus répandue en microbiologie, en particulier pour l’identification rapide des agents pathogènes, démontrant une valeur clinique significative26. Cette technologie analyse les spectres protéiques microbiens afin d’assurer une identification précise au niveau des espèces ou des complexes en peu de temps. Par exemple, des études ont rapporté une précision d’identification de 97,3 % des espèces de Nocardia dans des échantillons cliniques auJapon 27.
Malgré ses performances solides, des défis subsistent. La précision de l’identification au niveau de l’espèce peut varier selon la version de la base de données et selon les espècestestées 23. Des bases de données mises à jour ont démontré qu’elles améliorent la proportion d’isolats obtenant une identification fiable au niveau du genre (score >1,7) de 77,6 % à 94,7 %, soulignant l’importance des mises à jour régulières des bases de données. L’identification au niveau de l’espèce nécessite généralement des seuils de score plus élevés (par exemple, >2,0).
Le MS de MALDI-TOF offre une identification rapide (généralement <10 minutes par isolat après la croissance de la colonie), un faible coût par test (1 à 5 $ par échantillon) et une complexité technique minimale, ce qui le rend idéal pour les laboratoires de microbiologie clinique de première ligne. Cependant, les limites incluent le coût initial élevé de l’instrument et la nécessité de bases de données spectrales complètes et régulièrement mises à jour pour maintenir la précision au niveau des espèces.
- Percées dans le séquençage du génome entier (WGS)
Le séquençage du génome entier (SGB) démontre de plus en plus d’avantages significatifs dans l’identification microbienne en fournissant des informations génomiques complètes et en permettant une analyse phylogénétique, offrant ainsi des perspectives sur les relations évolutivesbactériennes 28. Des études ont montré que WGS permet une caractérisation détaillée de la diversité génétique et de la structure de la population de Nocardia24.
La faisabilité de la mise en œuvre de WGS dans les laboratoires cliniques s’améliore. Par exemple, le WGS peut identifier les variants émergents et fournir des données pour la surveillance de la résistance auxantimicrobiens 29. Cependant, malgré sa grande précision et sa production exhaustive, l’adoption généralisée reste limitée par les coûts élevés et la complexité de l’analyse des données.
Bien que le WGS devienne une méthode de référence, des obstacles tels que le coût, la complexité opérationnelle et les exigences d’infrastructure persistent. Dans la plupart des laboratoires cliniques, le WGS est peu pratique pour les diagnostics de routine en raison des coûts (100–300 $ par isolat), des délais de traitement (3 à 7 jours), du besoin d’une infrastructure bioinformatique avancée et d’une expertise spécialisée. Actuellement, son utilisation est largement limitée aux laboratoires de référence et aux enquêtes sur les épidémies.
- Séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS)
Le séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS) a introduit de nouvelles possibilités pour détecter Nocardia30. Les méthodes traditionnelles de culture rencontrent souvent des défis en raison de la croissance lente et des besoins environnementaux spécifiques de Nocardia, ce qui entraîne un diagnostic retardé. Dans ce contexte, le mNGS s’est imposé comme une alternative précieuse.
Plusieurs rapports de cas et études à petite échelle ont démontré le potentiel de la mNGS pour la détection de Nocardia 31. Par exemple, le mNGS a été utilisé pour diagnostiquer une infection cutanée de Nocardia , identifiant rapidement le pathogène chez des patientsimmunocompétents 32. De même, dans les infections de l’oreille, du nez et de la gorge, la mNGS a identifié N. farcinica, permettant un traitementciblé 33. Chez les patients atteints de maladie pulmonaire obstructive chronique, l’analyse mNGS des échantillons respiratoires a permis d’identifier avec succès N. otitidiscaviarum, améliorant ainsi la rapidité et la précisiondiagnostiques 34. De plus, le mNGS peut détecter des infections mixtes, comme démontré dans les cas où N. farcinica et d’autres agents pathogènes ont étéidentifiés 30.
Cependant, ces résultats reposent en grande partie sur des rapports de cas ou de petites cohortes et nécessitent une validation dans des études prospectives plus larges. Par conséquent, les conclusions concernant la performance diagnostique de la mNGS pour Nocardia doivent être interprétées avec prudence, et la technologie reste un outil complémentaire plutôt qu’une méthode diagnostique de première ligne.
Malgré ses promesses, le mNGS présente plusieurs limites importantes. Le coût élevé (500–1 500 $ par échantillon) et la disponibilité limitée limitent son utilisation aux centres spécialisés ou aux cascomplexes 7˒31. L’absence de protocoles standardisés contribue à la variabilité des performances7 à 30. L’interprétation est difficile en raison de la difficulté à distinguer une infection réelle de la colonisation ou de la contamination, en particulier dans les échantillonsrespiratoires 30˒31˒35. De plus, le mNGS ne fournit pas de données sur la susceptibilité aux antimicrobiens, qui sont essentielles pour orienter la thérapie1˒4. Enfin, la signification clinique des séquences à faible abondance reste incertaine, et les seuils standardisés de déclaration font défautà 7 à 31.
Dans l’ensemble, la mNGS représente un outil diagnostique complémentaire précieux, en particulier chez les patients complexes ou gravement malades lorsque les méthodes conventionnelles sont non concluantes. Cependant, il ne faut pas considérer cela comme une solution diagnostique universelle, et les résultats doivent être interprétés parallèlement aux résultats cliniques, radiographiques et microbiologiques.
- Exploration des méthodes moléculaires émergentes de diagnostic
Avec les avancées en biologie moléculaire, de nouvelles approches diagnostiques sont explorées pour la détection de Nocardia . Les technologies de détection basées sur CRISPR permettent l’identification rapide de séquences génétiques spécifiques à hautesensibilité 36. De plus, les approches d’apprentissage automatique et d’intelligence artificielle (IA) ont introduit de nouvelles possibilités de dépistage rapide de Nocardia37.
Cependant, ces résultats proviennent d’études à petite échelle basées sur la preuve de concept et doivent être interprétés avec prudence. À l’heure actuelle, aucune de ces approches n’a été validée cliniquement pour la détection de Nocardie de routine. Les tests basés sur CRISPR pourraient évoluer en outils rapides et peu coûteux au point de soins, mais cela nécessitera une validation clinique approfondie. De même, l’analyse d’images assistée par IA a montré un potentiel préliminaire de dépistage mais manque de protocoles standardisés et d’évaluation prospective. Les deux approches sont encore en phase de développement précoce et ne sont pas encore recommandées pour un usage clinique. Les études futures devraient se concentrer sur la validation multicentrique, la standardisation et la démonstration de l’utilité clinique avant que ces méthodes ne puissent être adoptées dans la pratique courante.
Pour faciliter la comparaison, les principales caractéristiques de performance, contraintes pratiques et rôles cliniques recommandés de ces méthodes sont résumés dans le tableau 1.
3. Tests de susceptibilité antimicrobienne (AST) des Nocardia spp.
- Mécanismes de résistance de Nocardia
Les mécanismes de résistance des espèces de Nocardia incluent principalement les mutations génétiques, la production d’enzymes et la formation debiofilms 1. De nombreuses espèces de Nocardia, en particulier N. farcinica et N. cyriacigeorgica, ont démontré une résistance à plusieurs antibiotiques38. Par exemple, la résistance aux sulfonamides chez Nocardia spp. est associée à des mutations du gène de la dihydrofolate réductase, entraînant une diminution de la susceptibilité au triméthoprime–sulfaméthoxazole (TMP-SMX)39,40,41.
De plus, les espèces de Nocardia peuvent produire des β-lactamases et d’autres enzymes qui dégradent les antibiotiques, ce qui entraîne une résistance aux pénicillines et aux céphalosporines42. Ces mécanismes de résistance compliquent le traitement des infections à Nocardia , en particulier chez les populations à haut risque, où l’apparition de souches résistantes aggrave encore les défis thérapeutiques. Les principaux mécanismes de résistance identifiés chez les espèces de Nocardia sont résumés dans le tableau 2, incluant des gènes spécifiques de résistance, des types de mutations et des données quantitatives de susceptibilité.
- Tests traditionnels de susceptibilité aux antimicrobiens
Les méthodes traditionnelles de test de susceptibilité aux antimicrobiens incluent principalement des techniques de microdilution et de diffusion de l’agar. La méthode de microdilution est considérée comme la plus fiable pour déterminer la susceptibilité antimicrobienne de Nocardia, fournissant des valeurs précises de concentration inhibitrice minimale (CMI)43.
Bien qu’il s’agisse de méthode de référence, la microdilution du bouillon pour Nocardia est soumise à une variabilité significative entre et intra-laboratoire. Des facteurs tels que la préparation de l’inocule, le choix du milieu de culture, le temps d’incubation et les difficultés d’interprétation des points dus à une croissance traînée ou à une faible turbidité peuvent affecter lareproductibilité 35˒43. Ces défis techniques sont particulièrement pertinents pour les organismes à croissance lente et hétérogènes tels que Nocardia et soulignent l’importance des protocolesstandardisés 1.
Dans une étude, 146 souches de Nocardia ont été testées par microdilution, montrant une forte susceptibilité au linézolide, à l’amikacine et au TMP-SMX, avec des taux de 100 %, 96 % et 94 %, respectivement4 à 444. Cependant, ces données proviennent d’une seule région géographique (le Japon) et ne doivent pas être généralisées sans prudence. Les profils de résistance aux antimicrobiens de Nocardia varient considérablement selon la région géographique, influencés par les schémas locaux d’utilisation des antibiotiques et les espècescirculantes 1˒3. La méthode de diffusion de l’agar est également largement utilisée pour les tests de susceptibilité chez Nocardia. Cependant, sa précision est influencée par des facteurs tels que le milieu de culture, la densité des inoculations et le taux de croissance lent de Nocardia, ce qui peut entraîner des zones d’inhibition maldéfinies 1 à 43. Contrairement à la microdilution du bouillon, la diffusion de l’agar n’a pas été standardisée pour Nocardia par le Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) et doit être considérée comme une méthode de dépistage plutôt qu’une technique de référence.
Bien que les méthodes traditionnelles restent efficaces en pratique clinique, l’augmentation de la diversité et de la résistance chez les espèces de Nocardia a suscité un intérêt croissant pour l’intégration des méthodes de détection moléculaire afin de fournir une évaluation plus complète. La méthode de microdilution reste la référence pour les tests de susceptibilité aux antimicrobiens ; cependant, elle dépend du taux de croissance bactérienne, ce qui peut poser problème pour les espèces à croissance lente comme Nocardia. La méthode de diffusion par disque est plus pratique mais moins sensible pour ces organismes. Les techniques moléculaires, y compris la détection des gènes de résistance par PCR, offrent des alternatives rapides mais restent complémentaires et ne peuvent remplacer les tests phénotypiques.
- Application des méthodes de détection moléculaire
Avec les avancées en biologie moléculaire, les méthodes de détection moléculaire sont de plus en plus utilisées pour compléter les approches phénotypiques traditionnelles d’identification, tandis que leur rôle dans les tests de susceptibilité antimicrobienne reste un domaine de recherche actif, principalement axé sur la détection de gènes spécifiquesde résistance 35.
Par exemple, le séquençage des gènes 16S rRNA et le MLSA peuvent différencier les espèces de Nocardia et fournir un éclairage sur les gènes de résistanceassociés 21. Le séquençage du génome entier (WGS) permet une analyse génomique complète, offrant des perspectives plus approfondies sur la composition génétique et les mécanismesde résistance 24˒28. Certaines études ont identifié divers gènes β-lactamase chez N. farcinica11, qui sont étroitement associés à la résistance auxantibiotiques 38.
Le séquençage métagénomique de nouvelle génération (mNGS) démontre également des avantages pour identifier les souches résistantes. Dans certains cas, le mNGS peut identifier les espèces de Nocardia et fournir des informations liées à la résistance, favorisant la sélection des antibiotiques et réduisant les traitements inappropriés dus à une erreurde diagnostic 30.
Cependant, la compréhension actuelle des corrélations génotype–phénotype chez Nocardia reste incomplète, et de nombreux déterminants de la résistance restent mal caractérisés. Par conséquent, les approches moléculaires ne peuvent pas remplacer les tests de susceptibilité phénotypiques à l’heure actuelle. Ils servent d’outils complémentaires pour soutenir l’interprétation des résultats basés sur la culture et peuvent guider une thérapie ciblée lorsque des gènes de résistance bien caractérisés sont détectés. Les décisions cliniques doivent continuer à s’appuyer principalement sur les résultats phénotypiques de l’AST, en particulier compte tenu de la variabilité géographique des schémas de résistance et de l’absence de critères interprétatifs standardisés pour les méthodes moléculaires.
4. Défis cliniques dans l’identification de Nocardia et les tests de susceptibilité aux antimicrobiens
Les espèces de Nocardia sont des agents pathogènes opportunistes pouvant provoquer des infections graves, en particulier chez les patients immunodéprimés1˒46. Bien que ces infections soient relativement rares, leur morbidité et mortalité élevées représentent des défis importants pour le diagnostic clinique et le traitement. Le diagnostic précis de la nocardiose commence avant les tests en laboratoire, les facteurs pré-analytiques jouant un rôle crucial dans le succès des méthodes basées sur la culture et moléculaires. La qualité des échantillons influence directement les taux de détection ; des échantillons de respiration profonde tels que le lavage bronchoalvéolaire (BAL), les spécimens d’échats induits ou de biopsie donnent des taux de récupération plus élevés que les expectorations expectorées. Les conditions de transport sont tout aussi importantes, car les espèces de Nocardia sont méticuleuses et peuvent être envahies par la flore commensale si les spécimens sont retardés ou mal stockés. Des temps de transport prolongés (>2 h) sans un milieu approprié peuvent compromettre la viabilité et réduire le rendementculturel à 45.
Les procédures de décontamination utilisées pour les échantillons respiratoires (par exemple, N-acétyl-L-cystéine–NaOH) peuvent involontairement réduire la récupération de Nocardia en raison de sa croissance lente et de sa susceptibilité aux agents chimiques. Par conséquent, les laboratoires devraient envisager des milieux sélectifs (par exemple, agar extrait de levure de charbon tamponné) et des périodes d’incubation prolongées (jusqu’à 2 à 4 semaines) pour améliorer larécupération 46. Un défi clinique majeur est de distinguer la colonisation de la véritable infection. La nocardie peut être isolée à partir d’échantillons respiratoires chez des patients atteints de maladies pulmonaires chroniques (par exemple, bronchiectasie, maladie pulmonaire obstructive chronique) sans preuve de maladie invasive. Dans de tels cas, la détection peut représenter une colonisation plutôt qu’une infection. Cette distinction est cruciale, car un traitement inutile peut augmenter la toxicité et la résistance, tandis que l’absence de traitement de la véritable infection peut entraîner une maladie disséminée à forte mortalité. Le jugement clinique, soutenu par des résultats radiographiques, l’histopathologie et les symptômes systémiques, estessentiel 2.
Les facteurs de l’hôte influencent significativement à la fois la susceptibilité et les résultats. Le type et le degré d’immunosuppression sont des déterminants clés. Chez les receveurs de greffe d’organes solides, l’incidence varie selon le type d’organe : les receveurs de greffe pulmonaire présentent le risque le plus élevé (jusqu’à 9 %), suivis des receveurs cardiaques et hépatiques, tandis que les receveurs de greffe rénale ont une incidence plus faible mais néanmoins significative (0,4 % à 1,3 %). Ces différences reflètent des variations dans les régimes immunosuppresseurs et l’exposition environnementale. L’utilisation d’agents appauvrissant les lymphocytes T et de corticostéroïdes à forte dose augmente encore le risque, en particulier au cours de la première année après lagreffe 1.
Les technologies basées sur la spectrométrie de masse, telles que la MALDI-TOF MS, ont démontré une grande précision dans l’identification de Nocardia , bien que des limites restent26 à 27. La précision de l’identification au niveau de l’espèce dépend fortement de l’exhaustivité et de la validité de la base de données de référence, et la performance varie selon les versions de la base de données. Ces facteurs, plutôt que les échecs d’identification spécifiques à chaque espèce, représentent les principaux défis pour les laboratoires cliniques de routine23.
Concernant les tests de susceptibilité aux antimicrobiens, une variabilité significative existe parmi les espèces de Nocardia . Bien que de nombreuses souches restent sensibles au linézolide et à l’amikacine, la résistance aux autres antibiotiques varie selon les espèces et peut influencer les résultats du traitement3. Par conséquent, le test de susceptibilité reste crucial pour orienter la thérapie, comme expliqué à la Section 3.