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Article de méthode

Les tendances et perspectives de la recherche sur Caenorhabditis elegans dans la zone du vieillissement : une analyse bibliométrique et de visualisation

257 vues

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DOI :

10.3791/70364

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22 mai 2026

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* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Ici, nous présentons un protocole pour récupérer, valider et analyser les archives de la collection centrale Web of Science sur Caenorhabditis elegans et le vieillissement en utilisant CiteSpace, VOSviewer, Bibliometrix et Scimago Graphica pour une cartographie bibliométrique reproductible.

Résumé

Le vieillissement est un phénomène biologique complexe caractérisé par la détérioration progressive des fonctions physiologiques et une vulnérabilité accrue aux maladies associées à l’âge. Au niveau cellulaire, ce processus est illustré par la sénescence, durant laquelle les cellules subissent un arrêt irréversible de leur division et entrent dans un état d’arrêt permanent de la croissance, sans progresser vers l’apoptose. Cependant, les mécanismes sous-jacents restent incomplètement compris. Le nématode Caenorhabditis elegans (C. elegans), à la courte durée de vie et à la génétique bien caractérisée, constitue un modèle puissant pour déchiffrer la base moléculaire du vieillissement. Néanmoins, une cartographie bibliométrique complète de la recherche à l’intersection de C. elegans et du vieillissement fait encore défaut. Ici, nous présentons un protocole pour récupérer les enregistrements de la Web of Science Core Collection, effectuer le traitement des données et réaliser une visualisation bibliométrique reproductible à l’aide de CiteSpace, Bibliometrix (R), VOSviewer et Pajek, visant à cartographier la structure des connaissances et à identifier les tendances émergentes dans la recherche sur le vieillissement de C. elegans . À partir de 6 117 articles publiés entre 1970 et le 5 juin 2025, nous avons analysé les contributions nationales et institutionnelles, l’auteur, l’impact des revues, les schémas de citation et l’évolution thématique. L’ensemble de données comprenait 6 117 enregistrements provenant de 19 864 auteurs répartis dans 3 798 instituts dans 91 pays. Le nombre de publications annuelles est passé de 312 en 2020 à 341 en 2021 et est resté élevé par la suite. Les États-Unis ont mené la production mondiale, suivis par la Chine, l’Allemagne et le Royaume-Uni, avec des réseaux de collaboration concentrés entre ces pays. Le système de l’Université de Californie s’est classé premier en productivité, tandis que l’Académie chinoise des sciences s’est classée troisième. L’évolution du sujet a montré un passage des études fondamentales sur les voies de signalisation insulino/facteur de croissance type insuline (IIS) et les réponses au stress vers des thèmes émergents tels que le contrôle thermique et la mitophagie dans les modèles de vieillissement de C. elegans . Dans l’ensemble, ce protocole permet des analyses bibliométriques transparentes et actualisables et soutient les études futures sur les principales directions, notamment la restriction calorique et la mitophagie.

Introduction

Le vieillissement est un processus biologique multifacette qui fait référence à la perte de la capacité proliflective des cellules somatiques normales après un nombre limité de divisions. Au cours du vieillissement, les fonctions physiologiques de l’organisme déclinent progressivement, et la susceptibilité aux maladies liées à l’âgeaugmente 1. Au niveau cellulaire, ce processus se manifeste par des dommages à l’ADN, tels que l’accumulation de ruptures de double brin et de dommages oxydatifs, et ces dommages dépassent la capacité de manipulation des mécanismes de réparation. Ces changements au niveau cellulaire ....

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Protocole

Cette étude ne fait pas référence à l’approbation éthique ni au consentement à la participation. Les données utilisées dans cette étude ont été obtenues à partir de la Web of Science Core Collection (WoSCC).

1. Sélection de la base de données

  1. Accédez à la base de données Web of Science Core Collection (WoSCC) via https://webofscience. clarivate.cn/wos/author/author-search.
  2. Élaborez une stratégie de recherche en utilisant des mots-clés ciblés, en particulier « C. elegans » et « vieillissement », afin d’identifier la littérature pertinente.
  3. Dépistage d....

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Résultats

Aperçu des tendances et de l’évolution de C. elegans dans la zone vieillissante
L’analyse bibliométrique comprenait 6 117 enregistrements de publications provenant de 1 123 sources, sélectionnés parmi 6 205 publications initiales de WOSCC répondant aux critères d’éligibilité. Cela comprenait 45 revues en accès anticipé et 145 articles de procès-verbaux. Après avoir exclu 87 publications non pertinentes et une publication rétractée, les données ont été analysé.......

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Discussion

Pour garantir la reproductibilité et l’interprétabilité, les étapes clés de ce flux de travail incluent : un rapport complet de la stratégie de récupération (source de la base de données, requête, types de documents, limites de langage, date de récupération), la gestion d’un filtrage de pertinence et la validation des données pour minimiser les enregistrements hors sujet, le rapport cohérent des paramètres de l’outil (découpage temporel, types de nœuds, élagage, seuils, regroupement), et.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Les auteurs souhaitent exprimer leur reconnaissance à tous les participants et chercheurs ayant contribué à ce travail. De plus, ils sont reconnaissants pour les outils analytiques fournis par CiteSpace, VOSviewer, Scimago Graphica et R, qui ont joué un rôle clé dans la conduite de cette recherche.

....

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
LEGION Savior Y7000 2019 ordinateur portable (numéro de série PF1CGZJU)Lenovohttps://pcsupport.lenovo.com/us/en/products/laptops-and-netbooks/legion-series/legion-y7000-2019Ordinateur utilisé pour les analyses
R (version 4.5.2)Fondation R pour l’informatique statistique / Équipe centrale Rhttps://www.r-project.org/Environnement informatique statistique
CiteSpace (version 6.3.R3)CiteSpace / Chaomei Chen (Université Drexel)https://citespace.podia.com/Logiciels de visualisation et d’analyse bibliométriques
VOSviewer (version 1.6.20)CWTS de l’Université de Leiden (Nees Jan van Eck, Ludo Waltman)https://www.vosviewer.com/Logiciel de cartographie bibliométrique
Pajek (version 64.6.01)Université de Ljubljana (Vladimir Batagelj, Andrej Mrvar)http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/Logiciels d’analyse et de visualisation de réseaux

Références

  1. McHugh, D., Durán, I., Gil, J. Senescence as a therapeutic target in cancer and age-related diseases. Nat Rev Drug Discov. 24 (1), 57-71 (2025).
  2. Young, A. R. J., Narita, M. SASP reflects senescence. EMBO Rep. 10 (3), 228-230 (2019).
  3. Suda, M., Tchkonia, T., Kirkland, J. L., Minamino....

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Réimpressions et autorisations

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