Les modèles animaux, y compris les poissons vertébrés, sont des outils essentiels pour modéliser les phénomènes biologiques et les pathologies complexes dans des systèmes relativement simples et accessibles. Par exemple, le poisson-zèbre, Danio rerio, est l’un des modèles de poissons téléostéens les plus utilisés, avec une multitude de méthodes appliquées pour étudier leur développement, leur génétique, leur physiologie et leur comportement, avec un impact significatif dans les sciences biomédicales etneurocomportementales 1,2,3,4,5,6,7,8 . Un avantage majeur à utiliser le poisson-zèbre aujourd’hui est la disponibilité de plusieurs méthodes pour étudier l’histologie et la pathologie des organes et des tissus dans les lignées mutantes à perte de fonction, pour lesquelles des protocoles de dissection étape par étapeexistent 3,9,10.
Cependant, un certain nombre d’autres modèles de poissons téléostéens ont émergé au cours des dernières décennies, adaptés à poser d’autres types de questions, notamment dans les domaines de la biologie évolutive 11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21, mécanismes biologiques sous-jacents au vieillissement2,22, toxicologie23,24, etautres 25,26. Un exemple est le cas du tétra mexicain, Astyanax mexicanus, un poisson téléostéen originaire du nord-est du Mexique, avec des populations ancestrales de poissons de surface riveraines et plus de 30 populations de poissons des cavernes aveugles vivant dans des grottes (Figure 1)12.
Les poissons-caverne ont adopté un ensemble de caractéristiques morphologiques, notamment la perte oculaire12,27, la perte depigmentation 28, l’expansion des systèmes sensoriels 17,29,30, et une augmentation du stockage de graisse 12,31, ce qui leur a permis de survivre dans des habitats de grottes hostiles. Ces poissons ont également adopté un ensemble de traits comportementaux, notamment des réductions du sommeil19,20, de l’anxiété32, de banc33, et de l’agressivité 13,18,19,20,29,34,35,36,37, comparé à leurs poissons de surface ancestraux. L’adaptation de la plupart de ces caractéristiques résultait très probablement d’une combinaison de variation génétique et de pressions environnementales 35,36,28, qui incluent les différences d’habitat entre les rivières et les grottes. Un modèle de plus en plus utile pour poser des questions sur l’impact de la variation génétique sur l’adaptation morphologique et comportementale des traits 16,18,19,20,35,38,39 et plus récemment, sur la diversité du microbiote intestinal 14,15, questions qui peuvent nécessiter la collecte d’organes comme le cerveau, les intestins, le foie et d’autres, il est nécessaire d’instaurer un protocole standardisé de dissection anatomique globale qui pourrait être utilisé par l’ensemble de la communauté. Bien que les dissections du cerveau entier et des organes chez A. mexicanus aient déjà été réalisées, il manque une méthode globale et globale permettant de comprendre comment réaliser ces types de dissections de manière efficace, ce qui est crucial pour de nombreux projets, y compris ceux qui nécessitent la collecte d’échantillons pour la métabolomique40, la métagénomique41. ou imagerie de l’organeentier 16,38. Notre objectif est de supprimer la barrière du dépannage permettant d’accéder aux organes dans ce modèle pour le post-traitement, permettant aux utilisateurs de la communauté de se concentrer sans effort sur leurs recherches.
Dans ce protocole, nous exposons une méthode étape par étape pour la dissection cérébrale et gastro-intestinale chez les poissons adultes de surface et les poissons des cavernes Pachón de l’espèce Astyanax mexicanus. Cette méthodologie peut être adaptée à divers protocoles en aval, notamment ceux associés au microbiome intestinal, à la métabolomique tissulaire et au dégagement cérébral pour l’imagerie cérébrale globale au microscope en feuille lumineuse. Cette technique est également adaptable pour une application simultanée sur le même spécimen.