Les protocoles expérimentaux utilisés dans la présente étude ont été approuvés par le Comité d’éthique de l’Hôpital général de Hainan (protocole n° 2021-239). Le Guide des National Institutes of Health des États-Unis pour le soin et l’utilisation des animaux de laboratoire ainsi que la Déclaration d’Helsinki ont été strictement suivis dans toutes les procédures expérimentales. Les réactifs et l’équipement utilisés dans cette étude sont listés dans le tableau des matériaux.
1. Modèle animal et conception expérimentale
Trente-six souris mâles C57BL/6J (âgés de 4 semaines, environ 20 g) ont été utilisés dans cette étude. Toutes les souris étaient hébergées dans des conditions de laboratoire standard (20–25 °C, 50 %–65 % d’humidité relative, cycle clair/obscur de 12 heures) avec un accès ad libitum à la nourriture et à l’eau. Après une période d’acclimatation de 7 jours, les souris ont été divisées aléatoirement en deux groupes (n=18 par groupe) : le groupe de surcharge en fer (groupe modèle), qui recevait des injections intrapéritonéales de dextrane de fer (0,2 g/kg) deux fois par semaine pendant 4 semaines ; et le groupe témoin, recevant des volumes équivalents de solution salée normale par injection intrapéritonéale. Après 4 semaines, les souris ont été euthanasiées et des tissus pancréatiques prélevés pour une analyse ultérieure.
2. Mesure du fer sérique
Des échantillons sanguins ont été prélevés dans le sinus rétro-orbitaire sous anesthésie pentobarbitale à 1 % pendant le diestrus. Après avoir été laissé à température ambiante pendant 1 heure, le sang a été centrifugé à 4 °C, 3 000 tr/min pendant 15 minutes. Le sérum était séparé et stocké à -80 °C. Les concentrations sériques de fer ont été déterminées à l’aide d’un kit de test colorimétrique de fer selon le protocole du fabricant.
3. Analyse histologique
Les échantillons de tissu pancréatique ont été immergés dans 4 % de paraformodéhyde pour fixation, suivis d’une implantation de paraffine avant la préparation de la section. Des sections de tissu en série d’une épaisseur allant de 4 à 5 μm ont été obtenues et traitées par des procédures standard de déparaffinisation et de réhydratation. Un examen histomorphologique a ensuite été réalisé à l’aide de coloration par hématoxyline et éosine, tandis que le dépôt de fer dans les tissus pancréatiques a été évalué par coloration au bleu de Prusse selon les protocoles de coloration histologique conventionnels.
4. Culture cellulaire et transfection de petits acides ribonucléiques interférents
Les β pancréatiques de souris MIN6 ont été cultivées dans le milieu Eagle modifié de Dulbecco à haute glycémie, complétés avec 15 % de sérum bovin fœtal, 100 U/mL de pénicilline, 100 μg/mL de streptomycine, 10 mM HEPES, 50 mM pyruvate de sodium et 50 μmol/L β-mercaptoéthanol. Toutes les expériences ont été réalisées à 80 % de confluence cellulaire. À chaque fois pendant la culture cellulaire, on prélève entre 6 et 8 ml de milieu de culture. Les cellules étaient maintenues à 37 °C dans une atmosphère humidifiée de 5 % de CO₂. Pour les études fonctionnelles, les cellules MIN6 en phase de croissance logarithmique ont été transfectées avec un petit ARNn interférant (si) spécifique à lncRNA (ciblant des ARNnc sélectionnés sur la base des résultats de microarrays ; Groupe inhibiteur) ou siRNA témoins négatif (groupe inhibiteur NC) utilisant Lipofectamine 2000, selon les instructions du fabricant. Après une culture pendant 24 heures, les cellules ont été analysées par réaction en chaîne quantitative par polymérase (qRT-PCR) ou western blot pour déterminer l’efficacité du knockdown. Les séquences cibles de ce siRNA étaient les suivantes : siMEG3 : GCGUCUUCCUGUGCCAUUUTTAAAUGGCACAGGAAGGCTT ; siNC : UUCUCCGAACGUGUCACGUTTACGUGACGUUCGGAGAATT. Chaque expérience a été réalisée en triple exemplaire et répétée trois fois.
5. Essai de réaction en chaîne par polymérase par transcription inverse
L’ARN total a été extrait d’échantillons de tissu pancréatique et de cellules MIN6 à l’aide d’un réactif d’isolement d’ARN à base de phénol disponible dans le commerce, conformément aux instructions du fabricant. L’ADN complémentaire a été synthétisé à l’aide d’un kit de transcription inverse dans un volume total de réaction de 20 μL. Après transcription inversée, la concentration d’ADNc de la plupart des échantillons était d’environ 1 μg/μL selon l’analyse de quantification de l’échantillon. Par la suite, 1 μL de gabarit d’ADNc a été utilisé pour l’amplification quantitative en temps réel par PCR. La qRT-PCR a été réalisée à l’aide d’un kit de détection PCR à base de SYBR Green dans les conditions de cycle suivantes : 95 °C pendant 30 s, 90 °C pendant 15 s, 60 °C pendant 34 s, et 68 °C pendant 30 s. Les niveaux relatifs d’expression génique ont été déterminés à l’aide de la méthode du cycle seuil comparatif (méthode 2-ΔCT ). Le GAPDH a été utilisé comme gène de référence interne pour la normalisation des données PCR en temps réel. Toutes les procédures expérimentales étaient réalisées selon les protocoles des fabricants respectifs, et chaque expérience était répétée indépendamment au moins trois fois. Les séquences d’amorces utilisées dans cette étude sont listées dans les Panneaux Supplémentaires 1 et Tableau 2.
6. Kit de comptage cellulaire - Essai 8
La capacité de prolifération cellulaire a été déterminée à l’aide d’un test de comptage cellulaire kit-8 conformément aux directives du fabricant. En résumé, les cellules MIN6 ont été placées dans des plaques de culture de 96 puits à une densité de 5 x 10cellules 3 par puits après transfection avec si-MEG3 ou si-NC et maintenues pendant 24 heures. Aux moments désignés, 10 μL de réactif de viabilité cellulaire étaient introduits dans chaque puits, et les plaques étaient incubées à 37 °C pendant 2 heures. Les valeurs d’absorbance ont ensuite été mesurées à 450 nm à l’aide d’un lecteur de microplaques. La viabilité cellulaire a été calculée en pourcentage par rapport au groupe témoin.
7. Détection de l’apoptose par cytométrie en flux
Les modifications apoptotiques des cellules MIN6 ont été examinées à l’aide d’un kit de détection d’apoptose Annexin V-FITC/PI selon les instructions du fabricant. Après 48 heures de transfection d’ARNsi, les cellules ont été prélevées, lavées deux fois avec du sérum physiologique tampon phosphaté à froid, puis remises en suspension dans un tampon de liaison. Par la suite, les cellules ont été incubées avec 5 μL d’annexine V-FITC et 5 μL d’iodure de propidium pendant 15 minutes à température ambiante dans des conditions sombres. Immédiatement après la coloration, les échantillons ont été analysés par cytométrie en flux. Les populations cellulaires apoptotiques précoces et tardives ont été quantifiées à l’aide d’un logiciel d’analyse cytométrique en flux. La proportion de cellules apoptotiques a ensuite été calculée pour des comparaisons intergroupes. Chaque expérience a été menée indépendamment trois fois.
8. Analyse des taches occidentales
Les expériences Western blot ont été réalisées selon les protocoles18 précédemment rapportés. Les cellules ont d’abord été digérées avec de la trypsine, collectées, puis lysées sur glace à l’aide d’un tampon de lyse par immunoprécipitation radio. Les concentrations de protéines ont été quantifiées, et des quantités équivalentes de protéines ont été soumises à une séparation sur des gels d’électrophorèse en gel de dodécyle à 10 % de sulfate de sodium et de polyacrylamide avant le transfert sur des membranes de fluorure de polyvinylidène. Après le blocage membranaire, des échantillons ont été incubés avec des anticorps primaires contre NF-κB (1:1000), Bcl-2 (1:1000), Bax (1:1000), caspase-3 (1:1000) et glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase (GAPDH) (1:2000) aux rapports de dilution indiqués, suivis d’une incubation avec des anticorps secondaires liés à la peroxydase du raifort. Les signaux protéiques étaient détectés à l’aide d’un système de chimiluminescence et quantifiés avec le logiciel ImageJ. Le GAPDH a été utilisé comme contrôle de charge interne, et les niveaux d’expression protéique étaient exprimés par des changements de pli par rapport au groupe témoin.
9. Analyse statistique
Les données étaient exprimées en moyenne ± écart-type (DE). Des comparaisons entre groupes ont été réalisées à l’aide du test Mann–WhitneyU 19 à l’aide d’analyses statistiques. Une valeur p <0,05 était considérée comme statistiquement significative.