La microscopie intravitale à haute résolution a transformé l’étude du comportement cellulaire dynamique au sein des tissus intacts en permettant la visualisation directe de la migration cellulaire, des interactions vasculaires et de la surveillance immunitaire à la résolutionunicellulaire 1,2,3,4. Bien que ces approches soient largement utilisées dans la recherche surle cancer 3,5, leur application aux infections pulmonaires a été limitée par la mobilité respiratoire, la fragilité tissulaire et les contraintes de biosécurité. Les avancées récentes dans les plateformes d’imagerie thoracique, y compris les fenêtres optiques stabilisées sous vide et implantées de façon permanente, ont permis de résoudre bon nombre de ces défis techniques en fournissant une imagerie stable et sans mouvement du microenvironnement pulmonaire sur de longuespériodes 6,7,8,9,10 . Les fenêtres implantables de façon permanente, en particulier, sont des outils puissants car elles permettent une visualisation répétée du flux vasculaire, de la dynamique des cellules immunitaires et du comportement unicellulaire pendant des heures à des semaines, et ont joué un rôle déterminant dans la définition des mécanismes de la métastase cancéreuse, de la perméabilité vasculaire et de la surveillanceimmunitaire 11,12.
Malgré ces avancées, l’imagerie intravitale n’a jamais été appliquée auparavant à l’infection par Mycobacterium tuberculosis (Mtb) dans le poumon mammifère in vivo à résolution unicellulaire. Les précédents les plus proches proviennent des images intravitales d’infections mycobactériennes dans d’autres contextes. L’imagerie en temps réel de l’infection par Mycobacterium marinum chez les embryons de poisson-zèbre13 a révélé des interactions précoces avec les macrophages et l’initiation du granulome, tandis que l’imagerie à deux photons des granulomes induits par BCG dans le foiede souris 14,15 a révélé la dynamique des macrophages et des lymphocytes T lors du développement du granulome, ainsi qu’une présentation limitée de l’antigène ainsi qu’une fonction effectrice des lymphocytes T dans les lésions granulomateuses. Ces études ont établi des connaissances fondamentales sur les interactions mycobactériennes hôte-pathogène mais n’ont pas accédé au poumon intact desmammifères 8,16.
Des approches d’imagerie intravitale ont également été appliquées au poumon dans d’autres contextes infectieux et biologiques, notamment l’imagerie pulmonaire générale8, des études révélant que la patrouille des macrophages alvéolaires peut dissimuler des bactéries du systèmeimmunitaire 17 et caractérisant la réponse myéloïde immédiate à l’infection par le SARS-CoV-2 dans le poumonhumain 16. L’imagerie intravitale a également été appliquée aux poumons infectés par la grippe, permettant une visualisation directe du comportement dynamique des cellules immunitaires dans le tissu pulmonaireinfecté 18,19.
Les approches d’imagerie optique corporelle entière, utilisant la technologie d’excitation microendoscopiquepar fibre optique 20 et la fluorescence enzymatiquerapporteuse 21,22, ont permis une détection sensible du MTB dans les poumons de souris, mais ne peuvent pas détecter individuellement ou de petits groupes de bacilles, suivre la dynamique de l’agrégation bactérienne ou visualiser les interactions directes entre les mycobactéries et les cellules hôtes dans le tissu pulmonaire intact. Des approches d’imagerie intravitale à haute capacité de confinement ont été mises en œuvre pour les poumons infectés dans des contextes BSL-3, y compris les plateformes d’imagerie multiphotonique axées sur le SARS-CoV-223 et les plateformes d’imagerie multiphotonique axées sur le MTB. Ces études démontrent la faisabilité d’imager les poumons infectés en confinement, mais de tels systèmes restent techniquement exigeants et ne sont pas largement accessibles. Le travail avec le MTB virulent nécessite un confinement BSL-3, posant d’importants défis d’ingénierie et de biosécurité pour l’imagerieintravitale 23,24. En conséquence, la plupart des études sur l’infection précoce à la MTB reposent sur des tests de point final statiques qui ne peuvent pas capturer la dynamique spatiale et temporelle du comportement bactérien dans le poumon.
Le développement de souches de MTB triple-auxotrophes définies génétiquement et approuvées par BSL-2 offre une opportunité unique de surmonter ces limites. La souche mc2 7902, dérivé de l’auxotrophe Mtb pantothénate-leucine-arginine du H37Rv, est entièrement atténuée, ne se réplique pas chez les souris immunodéprimées, conserve la coloration acide classique à l’acide rapide, présente une susceptibilité normale aux phages et peut être manipulée en toute sécurité en dehors des installationsBSL-325. Ces propriétés font dumc27902 un substitut idéal pour établir des approches d’imagerie intravitale et sonder les interactions précoces hôte-pathogène sous un confinement réduit de la biosécurité.
Ici, nous appliquons la fenêtre pour l’imagerie à haute résolution du poumon (WHRIL) avec mc28471, un dérivé fluorescent exprimant tdtomato de la souche triple auxotrophe de Mtb mc27902, afin de visualiser une infection précoce à MTB dans le poumon murin intact. Des expériences ont été menéessur des souris Rag2-/- immunodéprimées croisées avec des sourisMacBlue 27, dans lesquelles le promoteur Csf1r favorise l’expression de la protéine fluorescente cyan améliorée (ECFP) dans les monocytes, les microglies et les sous-ensembles de cellules dendritiques et macrophages. Le transgène MacBlue permet une visualisation claire des populations de phagocytes mononucléaires lors des premières infections à Mtb. Nous avons choisi d’utiliser des souris déficientes en Rag2 pour concentrer le système sur les premières interactions innées hôte-pathogène et pour éviter la complexité supplémentaire des réponses immunitaires adaptatives durant la courte fenêtre d’imagerie examinée ici. Il est important de noter que cette technique ne se limite pas aux souris déficientes en Rag2 et peut également être réalisée chez des animaux immunocompétents.
En combinant une fenêtre pulmonaire permanente avec une souche de MTB atténuée fluorescente compatible BSL-2, cette plateforme permet l’imagerie intravitale en série des interactions bacille-cellule hôte dans le même microenvironnement pulmonaire à une seule résolution sur plusieurs jours. Bien que démontrée ici pour une infection précoce, la plateforme elle-même n’est pas intrinsèquement limitée à des points temporels précoces et pourrait, en principe, être appliquée aux stades ultérieurs selon le modèle expérimental et la conception de l’étude. Puisque la réussite de cette plateforme d’imagerie dépend de l’utilisation de la préparation bacillaire fluorescente spécifique décrite ici, nous avons inclus les étapes essentielles nécessaires pour générer et préparer ce réactif dans le cadre du protocole complet. Cette plateforme fournit une imagerie directe et en temps réel du comportement des MTB in vivo et établit une base pour de futures études mécanistes de physiologie bactérienne, de reconnaissance de l’hôte et de décontamination par le système immunitaire.