Effets de l'extrait de ZeLan sur les phénotypes cliniques du SOPK
L'administration de DHEA a induit chez le rat des phénotypes endocriniens et métaboliques semblables à ceux du SOPK, comme en témoignent des augmentations significatives du poids corporel, de la concentration sérique de testostérone, du rapport LH/FSH et des taux d'insuline à jeun par rapport au groupe témoin (tous P < 0,05). L'évaluation de la distribution à l'aide du test de Shapiro-Wilk a permis une analyse paramétrique des principaux paramètres de poids corporel et d'hormones résumés dans le Tableau 1. Un traitement de 28 jours avec l'extrait de ZeLan a significativement amélioré ces perturbations métaboliques et hormonales. Le poids corporel a été enregistré à la fin de la période de traitement, au jour 56 du protocole, incluant la période d'acclimatation de 7 jours. Comme indiqué dans le Tableau 1, le poids corporel du groupe Modèle (291,12 ± 15,35 g) était nettement supérieur à celui du groupe Témoin (227,45 ± 10,12 g, P < 0,05), tandis que le traitement par ZeLan a réduit significativement le poids corporel à 245,25 ± 10,21 g (P < 0,05 par rapport au groupe Modèle). Les taux sériques de testostérone étaient fortement élevés chez les rats modèles de SOPK (1,85 ± 0,21 ng/mL) par rapport aux témoins (0,51 ± 0,05 ng/mL), et l'intervention par ZeLan a abaissé la testostérone à 0,92 ± 0,12 ng/mL. Le rapport LH/FSH était significativement augmenté dans le groupe Modèle (3,28 ± 0,25) par rapport au groupe Témoin (1,25 ± 0,11) et a été partiellement normalisé par le traitement ZeLan (1,85 ± 0,15). Les taux d'insuline à jeun étaient élevés chez les animaux modèles (28,95 ± 2,35 mIU/L contre 12,55 ± 1,12 mIU/L chez les témoins) et ont été significativement réduits après l'administration de ZeLan (18,82 ± 1,55 mIU/L) (Figure 2). Ces résultats confirment la mise en place réussie d'un phénotype endocrinien-métabolique similaire au SOPK ; toutefois, l'histopathologie ovarienne, le décompte des follicules, l'analyse des corps jaunes et la surveillance du cycle œstral n'ont pas été réalisés dans cette étude.
L'extrait de ZeLan a restauré la diversité alpha du microbiote intestinal
L'analyse des indices de diversité alpha a révélé des modifications importantes de la structure de la communauté microbienne intestinale associée au SOPK et à son traitement. Comme illustré dans le tableau 2 et la figure 3, l'indice de diversité de Shannon était significativement plus faible chez les rats modèles de SOPK (4,19 ± 0,35) que chez les témoins sains (6,51 ± 0,28 ; P < 0,05), indiquant une diminution de la diversité microbienne alpha dans l'état pathologique. Le traitement par ZeLan a partiellement restauré la diversité microbienne, l'indice de Shannon passant à 5,79 ± 0,26 (P < 0,05 par rapport au modèle). Des résultats cohérents ont été observés pour l'indice de Simpson, qui a diminué de 0,98 ± 0,01 chez les témoins à 0,82 ± 0,03 chez les animaux modèles, puis s'est rétabli à 0,93 ± 0,02 après l'intervention par ZeLan. L'estimateur Chao1, reflétant la richesse spécifique, présentait un profil similaire : l'induction du SOPK a fortement réduit Chao1, passant de 1215,3 ± 45,4 à 665,8 ± 52,1, tandis que le traitement par ZeLan a augmenté la richesse à 963,5 ± 38,6. Ces résultats indiquent globalement que le SOPK est associé à une dysbiose microbienne intestinale caractérisée par une réduction de la diversité alpha et de la richesse, et que l'extrait de ZeLan peut partiellement restaurer la structure de la communauté microbienne vers un profil proche de celui du témoin.
Modifications de la composition du microbiote intestinal
Le profilage taxonomique au niveau du phylum a révélé des différences compositionnelles distinctes entre les groupes expérimentaux. Comme illustré dans la Figure 4, les Firmicutes et les Bacteroidetes étaient les phylums dominants dans tous les groupes, représentant ensemble plus de 85 % de l'ensemble de la communauté bactérienne. Le groupe Modèle présentait une abondance nettement accrue de Firmicutes (environ 75 %) associée à une proportion réduite de Bacteroidetes (environ 15 %), par comparaison avec le groupe Témoin (Firmicutes environ 40 %, Bacteroidetes environ 45 %), ce qui entraînait un rapport Firmicutes/Bacteroidetes (F/B) nettement augmenté, caractéristique d'une dysbiose métabolique. Le traitement par ZeLan a modulé ce déséquilibre, réduisant l'abondance des Firmicutes à environ 52 % tout en augmentant celle des Bacteroidetes à environ 35 %, normalisant ainsi partiellement le rapport F/B vers les niveaux du groupe témoin.
L'analyse LEfSe a été utilisée pour identifier les taxons bactériens distinguant les groupes Témoin et Modèle, définissant ainsi la signature microbienne associée à la maladie. Comme illustré dans la Figure 5, au niveau du genre, le groupe Modèle SOP a présenté des abondances significativement accrues de Bacteroides (score LDA > 3,5), de Prevotella (score LDA > 3,0) et d'Escherichia (score LDA > 2,5), tous généralement associés auparavant à un dysfonctionnement métabolique et à l'inflammation. En revanche, le groupe Témoin présentait un enrichissement en genres bénéfiques, notamment Lactobacillus (score LDA > 3,0) et Ruminococcus (score LDA > 2,5), reconnus pour leur rôle dans le maintien de l'intégrité de la barrière intestinale et la production de métabolites bénéfiques tels que les acides gras à chaîne courte. Le groupe ZeLan n'a pas été représenté comme une classe LEfSe distincte dans la Figure 5, car cette analyse se concentrait sur les taxons distinguant la maladie de l'état sain ; les effets liés à ZeLan ont été interprétés à partir des variations d'abondance vers le profil témoin et des corrélations entre le microbiome et le métabolome.
Profilage métabolomique et identification des métabolites différentiels
L'analyse métabolomique non ciblée a révélé des perturbations métaboliques importantes associées au SOPK et à son traitement par l'extrait de ZeLan. Le diagramme en volcan de la Figure 6 montre la répartition des caractéristiques des métabolites entre les groupes Modèle et Contrôle, les caractéristiques surexprimées et sous-exprimées étant mises en évidence selon la direction du rapport d'abondance et la signification statistique. Un total de 52 caractéristiques de métabolites annotées a été conservé dans le tableau complet de rapport métabolomique pour la comparaison Modèle versus Contrôle. La liste complète, incluant le nom du métabolite, l'identifiant HMDB, la classe biochimique, le log2 du rapport d'abondance, la valeur P et le sens de régulation, est fournie en tant que Tableau Supplémentaire 1. Le Tableau 3 présente des métabolites annotés représentatifs ayant une forte pertinence biologique par rapport au SOPK.
Tableau 3 résume les principaux métabolites différentiels représentatifs ayant des scores VIP élevés et une pertinence biologique pour la physiopathologie du SOPK. Les hormones stéroïdiennes, notamment la testostérone (VIP = 2,56, P < 0,001) et l'androstènedione (VIP = 2,34, P < 0,001), étaient significativement augmentées chez les animaux modèles de SOPK, ce qui est conforme à l'état d'hyperandrogénie caractéristique de cette affection. Le métabolisme des acides gras était également perturbé, avec des augmentations significatives de l'acide palmitique (VIP = 2,12) et de l'acide arachidonique (VIP = 1,89), tandis que le médiateur lipidique pro-inflammatoire, la prostaglandine E2, était également surexprimé (VIP = 2,05). En revanche, les métabolites associés à une activité microbienne intestinale bénéfique étaient réduits chez les animaux atteints de SOPK : l'acide lithocholique, un acide biliaire secondaire produit par biotransformation microbienne, diminuait fortement (VIP = 2,45), de même que l'acide gras à chaîne courte, l'acide butyrique (VIP = 2,21). De plus, l'acide succinique et l'acide aminé essentiel L-tryptophane étaient réduits dans le groupe Modèle, suggérant une fermentation microbienne altérée et un métabolisme des acides aminés modifié.
Analyse d'enrichissement des voies KEGG
L'analyse d'enrichissement des voies métaboliques à l'aide de la base de données KEGG a révélé plusieurs voies métaboliques sériques significativement perturbées dans le SOPK et modulées par le traitement à base de ZeLan. Comme illustré dans la Figure 7, la biosynthèse des hormones stéroïdiennes s'est avérée être la voie la plus significativement enrichie (Facteur d'enrichissement = 0,80, P < 0,01), ce qui est cohérent avec le phénotype hyperandrogénique du SOPK. La voie de la stéroïdogenèse ovarienne était également fortement enrichie (Facteur d'enrichissement = 0,75, P < 0,01), reflétant l'implication d'une synthèse altérée des androgènes dans le dysfonctionnement ovarien. La biosynthèse des acides biliaires primaires présentait un enrichissement significatif (Facteur d'enrichissement = 0,62, P < 0,02), indiquant une circulation entérohépatique des acides biliaires perturbée, qui pourrait être liée à des modifications du microbiote intestinal. Le métabolisme de l'acide arachidonique (Facteur d'enrichissement = 0,56, P < 0,03) et la voie de la résistance à l'insuline (Facteur d'enrichissement = 0,40, P < 0,04) étaient également significativement enrichis, confirmant la présence de troubles inflammatoires et métaboliques caractéristiques du SOPK. La voie de biosynthèse des acides gras montrait un enrichissement modeste (Facteur d'enrichissement = 0,30), suggérant une implication d'une dysrégulation du métabolisme lipidique.
Analyse des corrélations entre le microbiome et le métabolome
Afin d'évaluer les relations fonctionnelles entre la composition du microbiote intestinal et les modifications métaboliques, une analyse de corrélation de Spearman avec contrôle du taux de fausses découvertes a été réalisée entre les genres bactériens différemment abondants et les métabolites clés. La carte thermique des corrélations groupée hiérarchiquement présentée dans la Figure 8 révèle des profils distincts d'associations entre microbiote et métabolome. Les bactéries bénéfiques, notamment Lactobacillus et Ruminococcus, présentaient de fortes corrélations positives avec l'acide lithocholique (r = 0,72 et 0,68, respectivement) et l'acide butyrique (r = 0,65 et 0,60, respectivement), tout en montrant des corrélations négatives avec la testostérone (r = -0,75 et -0,80) et l'androstènedione (r = -0,68 et -0,72). Ces résultats suggèrent que les bactéries bénéfiques identifiées dans l'analyse taxonomique étaient associées à des métabolites liés aux androgènes et à une activité métabolique liée aux AGCC.
Inversement, les genres associés au SOPK Bacteroides, Prevotella et Escherichia présentaient des profils de corrélation opposés. Ces bactéries étaient positivement corrélées avec la testostérone (r = 0,85, 0,82 et 0,60, respectivement), l'androstènedione (r = 0,78, 0,75 et 0,55) et l'acide palmitique (r = 0,65, 0,60 et 0,45), tout en montrant des corrélations négatives avec des métabolites bénéfiques, notamment l'acide lithocholique et l'acide butyrique. Ces profils de corrélation appuient des associations fonctionnelles entre des taxons microbiens intestinaux spécifiques et les perturbations métaboliques caractéristiques du SOPK, mais ils n'établissent pas de causalité directe.
Disponibilité des données :
Les jeux de données générés et analysés au cours de cette étude comprennent les métadonnées des échantillons, les données brutes des phénotypes, les indices de diversité alpha 16S, les résumés d'abondance au niveau du phylum, les résultats des taxons bactériens différentiels, les tableaux d'analyse différentielle en métabolomique, les résultats représentatifs des métabolites, les résultats d'enrichissement des voies KEGG, ainsi que la matrice de corrélation entre microbiote et métabolites. Ces données brutes sous-jacentes sont fournies sous forme de Fichier Supplémentaire 1 associé. Le jeu de données des métabolites différentiels traité est fourni sous forme de Tableau Supplémentaire 1.

Figure 1 : Chronologie de la conception expérimentale et du traitement. Illustration schématique du déroulement expérimental, indiquant une période d'acclimatation de 7 jours, une période d'injection de DHEA ou de véhicule de 21 jours, un traitement de 28 jours avec l'extrait ZeLan ou son véhicule, et la collecte finale des échantillons sériques et fécaux au jour 56 du protocole. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Effets de l'extrait de ZeLan sur les paramètres endocriniens et métaboliques. Boîtes à moustaches montrant (A) la concentration sérique de testostérone, (B) le rapport LH/FSH et (C) le poids corporel dans les groupes contrôle, modèle et traité par ZeLan après la période d'intervention. Veuillez cliquer ici pour consulter une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Diversité microbienne alpha au niveau intestinal. Comparaison de l'indice de diversité de Shannon entre les groupes Contrôle, Modèle et traité au ZeLan, illustrant les différences de diversité microbienne intestinale alpha. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : Composition du microbiote intestinal au niveau du phylum. Graphique en barres empilées montrant l'abondance relative des phylums bactériens prédominants dans le microbiote intestinal des groupes Témoin, Modèle et traité par ZeLan. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 5 : Taxons bactériens différentiels identifiés par l'analyse LEfSe. Analyse de la taille de l'effet par discriminant linéaire (LEfSe) identifiant les genres bactériens distinguant les groupes Témoin et Modèle. Les scores LDA indiquent la taille de l'effet des taxons différentiellement abondants. Les modifications associées à ZeLan sont décrites dans les Résultats, en fonction des variations d'abondance par rapport au groupe Modèle. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 6 : Profilage différentiel des métabolites. Graphique volcan montrant les caractéristiques métabolomiques différemment exprimées entre les groupes Modèle et Contrôle. Les points rouges et bleus représentent respectivement les caractéristiques métaboliques significativement surexprimées et sous-exprimées, selon le changement d'expression et la signification statistique. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 7 : Analyse d'enrichissement des voies métaboliques KEGG. Graphique en bulles montrant les voies métaboliques significativement enrichies identifiées à partir des métabolites différentiellement exprimés. La taille des bulles représente le nombre de métabolites associés, et la couleur des bulles indique la significativité statistique (valeur de p) de l'enrichissement de la voie. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 8 : Corrélation entre le microbiote intestinal et les métabolites sériques. Carte thermique groupée hiérarchiquement montrant les coefficients de corrélation de Spearman entre les genres bactériens différemment abondants et les métabolites sériques représentatifs. Le rouge indique des corrélations positives, tandis que le bleu indique des corrélations négatives. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
| Groupe | N | Poids corporel (g) | Testostérone (ng/mL) | Rapport LH/FSH | Insuline (mIU/L) |
| Témoin | 8 | 227,45 ± 10,12 | 0,51 ± 0,05 | 1,25 ± 0,11 | 12,55 ± 1,12 |
| Modèle | 8 | 291,12 ± 15,35a | 1,85 ± 0,21a | 3,28 ± 0,25a | 28,95 ± 2,35a |
| ZeLan | 8 | 245,25 ± 10,21b | 0,92 ± 0,12b | 1,85 ± 0,15b | 18,82 ± 1,55b |
| Remarque : Les données sont exprimées en moyenne ± écart-type. a = p < 0,05 par rapport au groupe témoin ; b = p < 0,05 par rapport au groupe modèle. |
Tableau 1 : Paramètres endocriniens et métaboliques chez les rats atteints de SOPK. Le poids corporel, la testostérone sérique, le rapport LH/FSH et les taux d'insuline à jeun ont été mesurés chez les groupes témoins, modèles et traités par ZeLan. Les données sont exprimées comme moyenne ± écart-type.
| Groupe | Indice de Shannon | Indice de Simpson | Estimateur de Chao1 |
| Témoin | 6,51 ± 0,28 | 0,98 ± 0,01 | 1215,3 ± 45,4 |
| Modèle | 4,19 ± 0,35a | 0,82 ± 0,03a | 665,8 ± 52,1a |
| ZeLan | 5,79 ± 0,26b | 0,93 ± 0,02b | 963,5 ± 38,6b |
| Remarque : Les données sont exprimées comme moyenne ± ÉT. a = p < 0,05 par rapport au groupe témoin ; b = p < 0,05 par rapport au groupe modèle. |
Tableau 2 : Indices de diversité microbienne alpha de l'intestin. Comparaison de l'indice de Shannon, de l'indice de Simpson et de l'estimateur de Chao1 entre les groupes Contrôle, Modèle et traitement ZeLan. Les données sont exprimées comme moyenne ± écart-type.
| Nom du métabolite | ID HMDB | Classe | Tendance (Modèle par rapport au témoin) | valeur-p | Score VIP |
| Testosterone | HMDB0000286 | Steroid | Augmenté ↑ | < 0.001 | 2.56 |
| Androstenedione | HMDB0000055 | Steroid | Augmenté ↑ | < 0.001 | 2.34 |
| Acide palmitique | HMDB0000220 | Acide gras | Augmenté ↑ | < 0.001 | 2.12 |
| Acide arachidonique | HMDB0001043 | Acide gras | Augmenté ↑ | 0.003 | 1.89 |
| Prostaglandine E2 | HMDB0001036 | Lipide | Augmenté ↑ | < 0.001 | 2.05 |
| Acide lithocholique | HMDB0000752 | Acide biliaire | Diminué ↓ | < 0.001 | 2.45 |
| Acide butyrique | HMDB0000039 | AGCC | Diminué ↓ | < 0.001 | 2.21 |
| Acide succinique | HMDB0000254 | Acide organique | Diminué ↓ | 0.021 | 1.65 |
| L-Tryptophane | HMDB0000929 | Acide aminé | Diminué ↓ | 0.015 | 1.58 |
| Remarque : VIP = Importance variable en projection (VIP > 1 considéré comme significatif). | | |
Tableau 3 : Métabolites sériques différentiels représentatifs. Métabolites annotés représentatifs associés au SOPK et régulés par l'extrait de ZeLan, incluant les identifiants HMDB, la classe de métabolite, la tendance de régulation, la valeur P et le score VIP. La liste complète des 52 caractéristiques de métabolites annotés est fournie dans le Tableau supplémentaire 1.
Tableau supplémentaire 1 : Jeu de données complet des métabolites annotés. Liste complète des 52 caractéristiques de métabolites annotées conservées pour le rapport en métabolomique, incluant le nom du métabolite, l'identifiant HMDB, la classe biochimique, le facteur de variation, la valeur P et le sens de régulation.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Fichier supplémentaire 1 : Données brutes soutenant les analyses expérimentales, du microbiome et de métabolomique. Ce classeur contient les informations sur les échantillons, les mesures des phénotypes cliniques, les indices de diversité issus du séquençage de l'ARNr 16S, l'abondance relative microbienne au niveau du phylum, l'analyse des taxons différentiels par LEfSe, l'analyse différentielle en métabolomique, les métabolites représentatifs, l'analyse d'enrichissement des voies métaboliques KEGG, la matrice de corrélation et un résumé de la vérification des données utilisées pour produire les figures et tableaux présentés dans l'article.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.