Toutes les procédures expérimentales ont été approuvées par le NIH Institutional Animal Care and Use Committee (IACUC) et respectaient la politique du Public Health Service concernant les soins et l’utilisation humains des animaux de laboratoire.
1. Préparation de l’appareil
REMARQUE : Chaque appareil du système de test IntelliCage se compose d’une grande cage en plastique (39 cm x 58 cm x 21 cm) à l’intérieur de laquelle jusqu’à 16 souris de même sexe peuvent résider. Les cohortes précédentes variaient en taille de 8 à 16 souris/cage. L’appareil est équipé de quatre coins opérants, tous connectés à un microprocesseur central situé sur le couvercle supérieur. La nourriture pour rongeurs est accessible depuis une grande trémie métallique placée au centre du couvercle. À l’intérieur de la cage, les souris se déplacent librement entre les coins opérants et un espace de vie central, équipé de literie et de matériaux d’enrichissement. Chaque coin opérant possède une petite entrée circulaire qui ne permet physiquement l’entrée que par une seule souris à la fois. L’identité de la souris est lue et enregistrée à partir de la double antenne RFID en anneau et des relevés du capteur de température, qui doivent être positifs pour qu’une visite soit enregistrée. Dans chaque coin opérant, les souris disposent de deux ports de nez, chacun contrôlant l’accès à l’une des deux portes motorisées. Ces portes programmables et motorisées donnent accès à l’une des deux bouteilles à tampon. Les enquêteurs programment manuellement les conditions d’accès à la bouteille à déversement, ainsi que la sensibilité des lickomètres à capacité. Les données visite, nosepoke et lick sont enregistrées individuellement pour chaque souris et transpondées via un microprocesseur central vers un ordinateur sur lequel le système logiciel propriétaire de TSE est chargé. Bien que cela ne soit pas abordé dans ce protocole, chaque chambre opérante contient également une soupape de souffle d’air programmable pour une utilisation en conditionnement aversif.
- Équipez la cage en plastique de cinq coussinets en fibre de coton comprimée (15,24 x 25,4 cm), deux petits carrés en coton (5,08 x 5,08 cm) et quatre structures de fouière en plastique pour la litière et l’enrichissement.
REMARQUE : L’utilisation de tampons en fibre de coton compressée est recommandée pour deux raisons : (1) pour éviter que la poussière ou les éclats des matériaux de literie couramment utilisés n’interfèrent avec la mécanique des portes, et (2) pour faciliter l’identification des combats entre animaux.
- Placez le couvercle supérieur avec des coins opérants dans la cage en plastique de la maison.
- Si la déconnexion est déconnectée, connectez tous les coins opérants au microprocesseur central à l’aide des câbles fournis, puis connectez le microprocesseur central à un ordinateur préchargé avec un logiciel TSE à l’aide de câbles CAN.
- Si vous utilisez plusieurs appareils, connectez toutes les cages au même ordinateur en série.
- Connectez le microprocesseur à la source d’alimentation et assurez-vous que les lumières LED de chaque coin s’allument et que les huit portes motorisées bougent.
- Remplissez huit bouteilles à bec avec ~250 mL chacune d’eau du robinet (ou autre liquide), appuyez fermement sur les bouchons pour assurer une bonne étanchéité, puis tournez doucement dans les ouvertures du lickomètre, assurant une connexion hermétique au lickomètre.
REMARQUE : La sensibilité des capteurs de visite, de nez et de léchage peut être optimisée en option via une expérience pilote. Pour ajuster la sensibilité de chaque coin, suivez les instructions du fabricant décrites dans le fichier « Aide » du programme « Contrôleur ». Toutes les études ont utilisé les réglages suivants : visite- 816 ON/768 OFF ; Un nez - 21 SUR / 26 EN OFF ; Compteur - 69 SUR / 80 EN OFF / 15 temps mort.
- Remplissez la sachette de nourriture avec de la nourriture pour rongeurs.
- Allumez l’ordinateur, ouvrez l’application « Contrôleur » et chargez le fichier d’expérience désiré.
2. Préparation des animaux
REMARQUE : Les animaux doivent recevoir des transpondeurs RFID implantés au moins une semaine avant le début des tests comportementaux afin de garantir un temps de récupération suffisant. Utilisez des souris vieillies au moins ~50 jours, avec un poids corporel supérieur à 15 g. L’implantation de souris plus petites augmente le risque de blessure lors de l’injection. Selon la lignée de souris, l’agressivité peut devenir un problème dans les conditions de logements collectifs, en particulier chez les mâles. Réduisez ce risque en hébergeant toutes les souris ensemble pendant l’adolescence. Les auteurs n’ont pas observé d’agressivité significative dans des études sur des souris adultes (~PND 80–150) sauvages C57BL/6, mais cela ne garantit pas la généralisation de ce protocole à d’autres génotypes, âges ou arrangements de logement.
- Implanter sous-cutanément des souris avec des transpondeurs RFID dans la région dorsocervicale pour une identification unique.
- Imprimez un tableau de données listant tous les animaux expérimentaux avec un espace à côté de chaque pièce d’identité pour placer un autocollant de code-barres indiquant leur code RFID.
- Rassemblez tous les animaux et les fournitures nécessaires : transpondeurs RFID, injecteur RFID rechargeable et installation d’induction isoflurane.
- Placez la première souris dans la chambre d’induction et anesthésiez à l’aide d’isoflurane vaporisé (débitmètre d’oxygène : 1,5 mL/min, isoflurane : 1,5–3,5 %) jusqu’à ce que la souris prenne de grandes inspirations haletantes et ne réponde plus à une pincée de l’orteil.
- En attendant que la souris soit anesthésée, chargez le transpondeur RFID sur l’injecteur en vissant l’aiguille préchargée sur la base de l’injecteur, puis en éjectant lentement la seringue jusqu’à ce que la puce bouge.
- Appliquez le code-barres identifiant le code RFID sur la table de données imprimée à côté de l’identifiant animal approprié.
- Retirez la souris de la chambre d’induction et implantez le transpondeur RFID préchargé de façon sous-cutanée dans la région dorsocervicale.
- Après avoir d’abord vérifié que la souris ne répond pas à une pincement de l’orteil, utilisez le pouce et l’index de la main non dominante pour pincer la peau de la souris directement au-dessus des omoplats.
- Avec la main dominante, insérez l’aiguille injectrice de façon sous-cutanée à l’extrémité postérieure de la peau de la souris, en veillant à garder l’aiguille levée au-dessus et parallèle à la colonne vertébrale pour éviter de blesser la souris.
- Avec la pointe de la seringue à l’intérieur de la peau de la tarte de la souris et fermement stabilisée entre le pouce et l’index, déplacez délicatement la main dominante afin que la personne puisse appuyer sur le plongeur injecteur.
- Éjectez le transpondeur RFID, en gardant les doigts de la main non dominante pincés autour de la peau du col afin que l’on puisse sentir une fois que la puce est sortie de la pointe de la seringue.
- Tout en gardant la peau du col pincée, retirez lentement l’injecteur. Ne libérez la barbe que lorsque l’injecteur a été complètement retiré pour éviter que le transpondeur ne tombe.
REMARQUE : En option, un seul nœud de suture peut être ajouté pour fermer la peau pendant que la souris est sous anesthésie.
- Remis la souris dans sa cage et surveille la récupération après anesthésie jusqu’à ce qu’elle soit complètement déambulante.
- Surveillez la souris pour tout signe d’altération physique, y compris une paralysie partielle, une boiterie ou des tournées en rond, pouvant indiquer une injection hors cible. Si les troubles persistent plus de 24 heures ou affectent gravement le bien-être animal, euthanasiez de manière humaine.
- Pointez le lecteur de transpondeur RFID au-dessus de la région dorsocervicale de la souris et faites un scan pour confirmer le placement réussi.
- En option, prélève un échantillon de tissu pour le génottypage.
- Répétez avec toutes les souris expérimentales.
- Un jour après l’implantation initiale du transpondeur RFID, utilisez le lecteur RFID pour vérifier qu’aucune souris n’a perdu son transpondeur RFID. Si des souris ont perdu leur transpondeur, répétez la procédure avec un nouveau transpondeur et mettez à jour les enregistrements en conséquence.
REMARQUE : En général, si une souris doit perdre son transpondeur RFID, cela se produit dans les 24 heures suivant l’implantation. Cela peut se produire à cause d’un mauvais placement du transpondeur RFID et/ou d’un toilettage ou d’un grattage de souris au site d’injection. Évitez de réinjecter dans les plaies d’injection précédentes et excluez les souris après trois implantations ratées de transpondeurs RFID.
- Avant de réintégrer les souris dans l’appareil IntelliCage, vérifiez que tous les transpondeurs RFID peuvent être lus correctement. Peser et noter le poids corporel de toutes les souris.
3. Préparation des fichiers expérimentaux
REMARQUE : Le système de test IntelliCage est contrôlé et exploité via des interfaces graphiques fournies par TSE. Trois applications sont utilisées pour exécuter les expériences IntelliCage : « Designer », « Controller » et « Analyzer ». Les différentes phases de l’expérience sont exécutées via différents fichiers expérimentaux, conçus dans l’application « Designer » puis exécutés dans l’application « Contrôleur ». Des informations détaillées sur la conception et l’adaptation des fichiers d’expériences ont déjà étédécrites 48,49. Des modèles des quatre fichiers d’expériences utilisés dans l’étude (Habituation.experiment, Water Training.experiment, Intermittent Alcohol.experiment, Open Bar.experiment) ont été fournis pour faciliter la réplication des protocoles. Dans ces fichiers, les changements de phase ont lieu à 12h30. Les auteurs ont choisi ce moment parce que les animaux étaient hébergés lors d’un cycle lumineux de 6h00 à 18h00. Cela permettait une phase sombre ininterrompue pour mesurer les habitudes de consommation d’alcool. Cependant, les enquêteurs pourraient souhaiter modifier ce calendrier pour qu’il soit cohérent avec d’autres méthodes de consommation d’alcool, telles que les procédures « drinking in the dark» 50.
- Configurez des fichiers d’expériences dans l’application « Designer ».
REMARQUE : Si vous utilisez les fichiers modèles, supprimez les quatre animaux exemples avant d’entrer dans la cohorte en cours. Renommer également les noms des groupes selon le plan expérimental et ajouter des groupes si nécessaire. Assurez-vous que les nouveaux groupes commencent tous avec le même cluster que ceux du modèle.
- Ouvrez le fichier Habituation.experiment dans l’application « Designer » et entrez soigneusement l’identifiant animal, le code du transpondeur RFID et le groupe/génotype expérimental pour chaque souris. Sauvegardez le fichier avec un nouveau nom pour conserver le modèle de fichier.
REMARQUE : Si les codes transpondeur RFID sont mal tapés, les données ne seront pas enregistrées. Attribuer les animaux aux groupes expérimentaux pertinents aidera à surveiller leur comportement et, en fin de compte, à analyser les données.
- Exportez les informations animales sous forme de fichier animal.
- Pour chaque phase de l’expérience, ouvrez le fichier d’expérience correspondant et chargez le fichier des animaux. Sauvegardez et renommez en conséquence.
- Si vous conçoivez des fichiers sur un ordinateur séparé, téléchargez les fichiers expérimentaux sur une clé USB portable pour les transporter dans la salle de comportement.
- Téléchargez tous les fichiers d’expériences sur l’ordinateur connecté à(s) appareil(s) IntelliCage et ouvrez le premier fichier dans l’application « Contrôleur ». Vérifiez que toutes les informations se chargent correctement.
- Que ce soit sur papier ou électroniquement, créez un fichier journal expérimental dans lequel l’on note la date et l’heure à laquelle on peut commencer/arrêter différentes phases de l’expérience. Cela aidera grandement dans l’analyse, puisque certaines conditions de drogue (par exemple, alcool adultéré à la quinine) ne sont pas enregistrées dans les fichiers d’archives IntelliCage.

Figure 2 : Chronologie expérimentale pour le paradigme de consommation d’alcool opérant et intermittent. (A) Schéma de l’appareil IntelliCage avec des bouteilles à dévorer contenant de l’alcool dans deux des quatre coins. (B) Chronologie expérimentale illustrant le calendrier de toutes les phases expérimentales, comme utilisé dans la publicationprécédente 23. La cohorte 1 a réalisé un test d’alcool adultéré à la quinine après avoir conclu la consommation intermittente d’alcool, tandis que les cohortes 2 et 3 sont revenues à une consommation intermittente d’alcool après adultération. (C) Calendrier expérimental détaillé illustrant les changements logiciels pour toutes les phases expérimentales : habituation, formation à l’eau, consommation intermittente d’alcool, test d’alcool adultéré à la quinine, et consommation d’alcool « open bar »/accès libre. Les changements de cage sont programmés au moins une fois par semaine après la fin d’un module « Accès à l’alcool ON ». Dessins animés réalisés à partir de modèles BioRender modifiés par Lucy Anderson, sous licence CC BY 4.0 (https://BioRender.com/ko79xuy). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figurine.
4. Conduite de l’expérience
REMARQUE : Le paradigme opérant et intermittent de consommation d’alcool se compose de cinq phases : (1) habituation, (2) entraînement à l’eau, (3) consommation intermittente d’alcool, (4) test d’alcool adultéré à la quinine, et (5) « bar ouvert »/consommation d’alcool en accès libre. Chaque phase de l’expérience est réalisée sur différents fichiers expérimentaux, à l’exception des tests intermittents drinking drinking et alcohol adulteré à la quinine, qui utilisent tous deux les paramètres spécifiés dans le fichier Intermittent Alcohol.experiment . En dehors des changements de cage, les expérimentateurs devraient vérifier la présence des souris au moins trois fois par semaine afin d’évaluer le bien-être des animaux et de s’assurer que le logiciel fonctionne correctement. Toute souris trouvée blessée ou malade doit être retirée de l’expérience. Pour un exemple de calendrier expérimental, voir la Figure 2.
- Changements de cage
REMARQUE : Effectuez des changements de cage au moins une fois par semaine. Pendant la consommation d’alcool, effectuez ces changements seulement après 12h30, lors de la période « Accès à l’eau UNIQUEMENT » afin d’éviter d’interrompre la consommation d’alcool. Pour faciliter cela, les fichiers Intermittent Alcohol.experiment et Open Bar.experiment commenceront toujours par « Accès à l’eau UNIQUEMENT ». En raison de la taille des cages, il est difficile de manipuler seuls. Les auteurs recommandent d’avoir au moins un autre enquêteur pour aider à changer de cage. Vérifiez les souris 24 heures après chaque changement de cage pour vous assurer que le logiciel fonctionne correctement et qu’aucune agressivité ou combat n’a eu lieu en réponse au stress du changement.
- Avant de commencer à changer de cage, préparez une nouvelle cage en plastique propre avec de nouvelles literies et matériaux pour le nidification. Remplissez chacune des huit bouteilles/cages avec ~250 mL d’eau du robinet ou 20 % d’alcool (95 % d’éthanol [190 proof] dans l’eau du robinet, v/v).
REMARQUE : En option, les enquêteurs peuvent ajouter une petite quantité de l’ancien matériau de lit à la nouvelle cage propre. Cela minimise la perturbation des hiérarchies de groupe établies et peut diminuer le risque de conflits.
- Arrêtez l’expérience dans l’application « Contrôleur ». Après s’être assuré qu’aucune souris n’est dans les coins opérants, retirez la trémie métallique des aliments. Faites soulever l’appareil de microprocesseur métallique par une personne suffisamment haut pour que la seconde puisse faire glisser la cage en plastique en dessous. Vérifiez le nombre correct de souris.
- Retirez les souris une par une de la cage sale, scannez le transpondeur RFID et enregistrez le poids corporel. Examinez visuellement chaque souris à la recherche de signes de blessure ou de maladie.
REMARQUE : Les auteurs recommandent d’enregistrer le poids corporel dans un tableau électronique (csv) afin qu’il puisse être facilement lu dans le pipeline d’analyse.
- Placez temporairement les souris dans un récipient propre après avoir enregistré le poids corporel.
- Nettoyez la partie supérieure et les coins avec une serviette humide trempée dans du désinfectant. Prenez particulièrement soin d’essuyer la surface et la faîte inférieure de la plaque d’angle, sans laisser de liquide s’échapper sur les composants électroniques.
- Soulevez l’appareil microprocesseur métallique assez haut pour faire glisser la nouvelle cage en plastique propre en place.
- Faites doucement tourner de nouvelles bouteilles à tampon dans les ouvertures du léchimètre, assurant une connexion bien serrée au léchimètre.
- Transférez les souris dans un nouvel appareil propre.
- Remplacez la trémie par une nouvelle et propre trémie et une nourriture fraîche pour rongeurs.
- Redémarrez la même expérience dans l’application « Contrôleur » ou chargez et lancez un nouveau fichier d’expérience.
- Assurez-vous que le programme fonctionne correctement et que toutes les souris ont des visites, des coups de nez et des coups de langue enregistrés correctement.
REMARQUE : Le programme « Controller » affichera automatiquement des avertissements lorsqu’un animal n’a pas enregistré de licks dans une période de 12 heures.
- Nettoyez le matériel sale. Les cages en plastique, les bouteilles à goutte et les structures de forage en plastique peuvent généralement être lavées à travers les systèmes de lavage de cage classiques.
- Jour 0 : Habituation
REMARQUE : La phase d’habituation est exécutée à l’aide du fichier Habituation.experiment . Pendant cette phase, toutes les bouteilles à dégustation contiennent de l’eau du robinet. Les souris ont un accès libre à toutes les bouteilles sans nez opérants. Les portes motorisées s’ouvrent lorsque les souris entrent dans un coin opérant, révélant l’accès aux buses des bouteilles à tampon.
- Après avoir vérifié la présence du transpondeur RFID et enregistré le poids corporel de la souris, remplissez les huit bouteilles à dégustation avec ~250 mL d’eau du robinet et tournez doucement dans les ouvertures du lichimètre.
- Placez jusqu’à 16 souris de même sexe dans l’appareil IntelliCage préparé.
- Chargez le fichier Habituation.experiment dans l’application « Controller » et commencez l’enregistrement.
- Vérifiez que toutes les portes motorisées s’ouvrent correctement lorsqu’une souris entre dans le coin opérant et que toutes les visites, nez et coups de langue sont enregistrés avec succès pour chaque souris. Si aucune visite, nez ou léchage n’a été enregistré pour une souris dans une période de 6 heures, vérifiez le fichier .animal pour détecter des erreurs.
- Jours 1 à 3 : Entraînement aquatique
REMARQUE : La phase d’entraînement aquatique se déroule à l’aide du fichier Water Training.experiment . Toutes les bouteilles à dégustation doivent continuer à ne contenir que de l’eau du robinet. Cette phase entraîne les souris à faire le nosepock sur un FR-1 puis sur un calendrier FR-3 pour accéder aux buses des bouteilles de bec. Après un coup de nez réussi, des portes motorisées s’ouvrent pour permettre l’accès à la bouteille à tampon pendant 5 secondes. Une fois qu’une souris atteint un taux de réussite de 60 % ou plus, elle est passée à un calendrier FR-3 pour le reste de la durée du programme. Habituellement, les souris passent à un programme FR-3 dans les 24 à 72 heures. Surveillez la performance des animaux dans le « Contrôleur ». Si un animal n’atteint pas un calendrier FR-3 dans les 72 heures, il est exclu de toute expérimentation ultérieure.
- Si toutes les souris semblent hydratées et indemnes après 24 heures d’habituation, arrêtez de lancer le fichier Habitatuation.experiment et commencez à lancer le fichier Water Training.experiment .
- Vérifiez que les visites, les nez et les coups de nez sont enregistrés avec succès par le logiciel pour chaque souris et que toutes les portes motorisées s’ouvrent correctement.
- Jour 4+ : consommation d’alcool intermittente
REMARQUE : La phase de consommation intermittente d’alcool est réalisée à l’aide du fichier Intermittent Alcohol.experiment . À cette étape, les bouteilles à dégustation dans deux des quatre coins opérants sont remplacées par de l’alcool à 20 %. Les coins eau vs alcool sont pré-spécifiés via la fonctionnalité « Clusters » dans le fichier expérimental. Dans le modèle, l’eau est distribuée dans les coins un et trois (étiquetés « neutre ») tandis que l’alcool est dans les coins deux et quatre (qualifiés d'« incorrect »). Les souris ont un accès continu à l’eau, mais un accès intermittent à l’alcool pendant des périodes de 24 heures (de 12h30 à 12h30) un jour sur deux. 5 s d’accès à la bouteille à dégustation est assuré sur un FR-3 pour tous les coins. Pendant cette phase de l’expérience, effectuez des changements de cage pendant les périodes « Accès à l’eau UNIQUEMENT » afin d’éviter d’interrompre la consommation d’alcool. Les chercheurs doivent s’assurer que les groupes expérimentaux montrent une préférence à peu près égale pour les quatre coins lors de l’entraînement aquatique avant d’attribuer des coins alcool pour la consommation intermittente d’alcool. Dans chacune des cohortes, les groupes expérimentaux ont montré des visites et des coups de langue à peu près équivalents sur les quatre coins pendant l’entraînement aquatique. Pour cette raison, les auteurs ont maintenu les attributions de coin fixes entre les cohortes. Les expérimentateurs peuvent facilement voir la proportion de licks et de visites dans les coins via le programme « Controller ». Veillez à surveiller régulièrement les données de visite et de découpage tout au long de l’expérience afin de ne pas survenir de problèmes (par exemple, pannes d’équipement ou souris qui « monopolisent » certains coins).
- Après que toutes les souris ont réussi à atteindre un programme FR-3 pour accéder aux bouteilles à tampon, préparez un alcool à 20 % (95 % d’éthanol [190 proof] dans l’eau du robinet, v/v ; ~250 mL/bouteille).
- Arrête de lancer le fichier Water Training.experiment .
- Retirez les bouteilles à bec dans les coins opérants deux et quatre (ou les coins que vous avez spécifiés dans le fichier expérimental, s’ils sont différents) et remplacez-les chacune par ~250 mL d’alcool à 20 %.
- Tournez doucement les nouvelles bouteilles à déguster contenant de l’alcool dans les ouvertures du léchômètre, assurant ainsi une connexion bien serrée au léchimètre.
- Chargez le fichier Intermittent Alcohol.experiment et commencez l’enregistrement.
- Vérifiez que les visites, les nez et les coups de nez sont enregistrés avec succès par le logiciel pour chaque souris et que toutes les portes motorisées s’ouvrent correctement.
- Après 12h30 le lendemain, vérifiez que le programme est passé avec succès du module « Accès à l’eau UNIQUEMENT » au module « Accès à l’alcool ACTIVÉ » et que des coups ont été enregistrés dans les coins opérants contenant de l’alcool.
- Jour 16+ : Test d’alcool adultéré à la quinine
REMARQUE : La phase de test d’alcool adultéré à la quinine se fait à l’aide du fichier Intermittent Alcohol.experiment. À cette étape, les bouteilles à déguster dans deux coins opérants contenant auparavant 20 % d’alcool sont remplacées par 0,5 mM, puis 1 mM de quinine adultérée à 20 % d’alcool pour évaluer une consommation insensible à la punition. Ces concentrations de quinine, qui correspondent respectivement à 0,016 % et 0,032 % de quinine (v/v), ont déjà été jugées aversives lors des tests effectués par les groupes27,28 et31 autres. Les souris ont un accès continu à l’eau, mais un accès intermittent à l’alcool adultéré à la quinine pendant des périodes de 24 heures tous les deux jours (c’est-à-dire un jour de 0,5 mM de quinine, un jour d’accès uniquement à l’eau, un jour de 1,0 mM de quinine). L’accès est assuré selon un horaire FR-3 pour tous les coins. Dans cette étude, les souris ont réalisé cette phase de la tâche après 16 ou 24 jours consécutifs de consommation intermittente d’alcool non altérée. Aucun changement de cage n’a été effectué le jour de l’eau entre les tests d’adultération afin d’éviter les effets confondus du stress. Après cette phase de l’expérience, les souris peuvent soit commencer à boire de l’alcool en « open bar » ou en accès libre, soit revenir à une consommation intermittente pour évaluer la consommation de rebond après l’adultération.
- Préparez 0,5 mM et 1 mM d’alcool à 20 % adultéré à la quinine (95 % d’éthanol [190 proof] dans l’eau du robinet, v/v ; ~250 mL/bouteille).
- Effectuez un changement de cage en retirant toutes les bouteilles à tampon.
- Remplissez chaque bouteille à dégustation dans les coins d’alcool avec ~250 mL de solution alcoolisée à 20 % de 0,5 mM et adultérée à la quinine.
- Tournez doucement les nouvelles bouteilles à déguster contenant de l’alcool dans les ouvertures du léchômètre, assurant ainsi une connexion bien serrée au léchimètre.
- Chargez le fichier Intermittent Alcohol.experiment et commencez l’enregistrement.
- Vérifiez que les visites, les nez et les coups de nez sont enregistrés avec succès par le logiciel pour chaque souris et que toutes les portes motorisées s’ouvrent correctement.
- Après 12h30, vérifiez que le programme est passé avec succès du module « Accès à l’eau UNIQUEMENT » au module « Accès à l’alcool activé » et que des coups ont été enregistrés dans les coins opérants contenant de l’alcool.
- Avant 12h30 le jour suivant d’alcool, remplacez chaque bouteille dans le coin alcool par ~250 mL de solution à 20 % d’alcool adultérée à la quinine de 1 mM. Il n’est pas nécessaire d’arrêter l’expérience pour le changement de bouteille.
- Avant 12h30 le prochain jour d’alcool, retirez les bouteilles à dégustation contenant de l’alcool adultéré et remplacez-les par ~250 mL d’alcool non altéré à 20 %.
- Jour 20+ : « Open bar » / accès gratuit à la consommation d’alcool
REMARQUE : On peut éventuellement organiser une journée de « bar ouvert » / accès libre à l’alcool pour servir de contrôle non opérant. Cette phase est exécutée à l’aide du fichier Open Bar.experiment . À cette étape, les bouteilles à dégustation dans deux des quatre coins opérants contiennent 20 % d’alcool, auquel les souris ont accès pendant une période de 24 heures (de 12h30 à 12h30). Une visite d’angle ouvrira les portes sans nécessiter de nez-sepoks. Dans cette étude, les souris ont réalisé cette phase de la tâche après les phases de test de consommation intermittente d’alcool ou d’alcool adultéré à la quinine.
- Si nécessaire, préparez 20 % d’alcool (95 % d’éthanol [190 proof] dans de l’eau du robinet, v/v ; ~250 mL/bouteille).
- Avant 12h30 le prochain jour d’alcool, arrêtez de lancer le fichier de l’expérience en cours.
- Si nécessaire, retirez les bouteilles à déversement dans les coins d’alcool et remplacez-les par ~250 mL d’alcool à 20 %.
- Tournez doucement les nouvelles bouteilles à déguster contenant de l’alcool dans les ouvertures du léchômètre, assurant ainsi une connexion bien serrée au léchimètre.
- Chargez le fichier Open Bar.experiment et commencez l’enregistrement.
- Vérifiez que les visites, les nez et les licks sont enregistrés avec succès par le logiciel pour chaque souris et que toutes les portes motorisées sont ouvertes librement.
- Après 12h30, vérifiez que le programme est passé avec succès du module « Accès à l’eau UNIQUEMENT » au module « Accès à l’alcool activé » et que des coups ont été enregistrés dans les coins opérants contenant de l’alcool.
5. Analyse des données
REMARQUE : Les données de chaque expérience sont stockées en interne jusqu’à ce que le programme soit arrêté. À ce moment-là, un fichier d’archive de données compressé est créé et stocké sur le disque dur local dans C :\Documents\NewBehavior\IntelliCage Plus\Archives. Le nom du fichier correspond à la date et à l’heure de lancement du programme et se termine en .zip. Les fichiers d’archives de données contiennent toutes les informations pertinentes sur l’expérience, y compris les visites d’angle (heure de début, heure de fin, durée, séquence de visite), les nosepokes (heure de début, heure de fin, durée), les licks (heure de début, heure de fin, durée), les heures de lumière et d’obscurité, ainsi que les données de température. Cette archive de données peut être lue et analysée avec le programme « Analyzer ». Bien que d’autres packages open source existent pour analyser les données d’IntelliCage (Ruffini et al., 2021 ; Gastaldi et al., 2025), les auteurs ont créé un pipeline d’analyse de données en R en utilisant des packages publics issus du tidyverse pour analyser les données issues du paradigme de la consommation intermittente d’alcool. La chaîne comprend plusieurs étapes de contrôle qualité, notamment l’analyse de l’occupation des coins par souris ; fréquence moyenne de visite, de nez-sepoké et de léchage à travers le rythme circadien ; FR-3 vitesse d’acquisition par souris ; et le nombre quotidien de léchages par souris. De plus, les auteurs fournissent des analyses de base sur les mesures sur la consommation d’alcool. La base est un fichier modèle de cahier R utilisant le langage de balisage Quarto qui traite les fichiers de données et peut être adapté aux variations spécifiques à chaque cohorte animale. L’analyse est réalisée via la version gratuite de RStudio. Un fichier modèle de projet pour R se trouve dans le dépôtGitHub 29.
- Compiler toutes les données, y compris les fichiers zip générés par l’application « Contrôleur » et le fichier CSV contenant les données du poids corporel de la souris.
REMARQUE : Les poids sont nécessaires pour normaliser l’apport par le poids corporel. Dans ce flux de travail, il était plus logique de collecter les données de poids dans un fichier séparé que de les ajouter à chaque fichier d’expérience. La première colonne doit correspondre à l’identifiant animal des fichiers d’archive.
- Téléchargez le modèle de projet R depuis le dépôt GitHub.
- Renommer le projet pour qu’il corresponde à l’expérience.
- Le modèle est fourni avec des fichiers de données exemples pour illustrer le fonctionnement de l’analyse, situés dans le sous-dossier data/C1. Remplacez les fichiers d’archive par des archives de données personnalisées.
- Lance RStudio et ouvre le projet.
- Dans la section fichiers de la fenêtre en bas à droite de RStudio, allez dans le dossier qmd et ouvrez le fichier IC_template.qmd.
- Dupliquez le fichier modèle et renommez pour qu’il corresponde à l’expérience.
- Ajustez les métadonnées dans la partie en-tête YAML du fichier dupliqué et le bloc de code initial.
- Ajustez les noms des groupes dans le fichier IC_Commons.R dans le répertoire R pour qu’ils correspondent aux groupes expérimentaux. (Le modèle utilise deux groupes : Contrôle et LBN.)
- Lance le fichier du carnet.
REMARQUE : Des instructions plus détaillées sont fournies avec les fichiers README.md dans le dépôt GitHub.

Figure 3 : Accès comparable aux coins opérants chez toutes les souris lors de l’entraînement et des phases intermittentes de consommation d’alcool. Parmi les souris de la cohorteun, 23, la carte thermique montre le temps total passé dans chaque coin par jour par souris pendant (A) l’habituation et l’entraînement à l’eau contre (B) les quatre premiers jours de consommation intermittente d’alcool (n = 15 F, 16 M). Les couleurs rouge plus foncé indiquent plus de temps passé dans le coin par jour. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figurine.

Figure 4 : Les souris effectuent des visites, des sépons et des léchouilles cohérentes avec le rythme circadien et acquièrent avec succès un accès à la bouteille opérante sous un calendrier FR-3. Parmi les souris de la premièrecohorte, 23, la densité moyenne de visites dans le coin opérant (A), (B) de sepones de nez et (C) de léchages sur toute la durée de la séance durant les huit premiers jours de test. (D) Temps jusqu’à ce que chaque souris lèche avec succès un rapport FR-3 lors de l’entraînement aquatique. (E) Taux de réussite des visites (= % des visites se terminant par léchage / visite totale) chez les souris lors de l’habituation et de l’entraînement à l’eau (à gauche) par rapport aux quatre premiers jours de consommation intermittente d’alcool (à droite). Les symboles circulaires désignent les femmes (n = 15) ; les symboles carrés désignent les mâles (n = 16). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figurine.

Figure 5 : Les souris participent à des taux de léchage quotidiens comparables pendant l’entraînement et les phases intermittentes de consommation d’alcool. Parmi (A) les femelles (n = 15) et (B) mâles (n = 16) de la cohorte un,23 souris, nombre total de léchages quotidiens d’eau (bleu) et d’alcool (rouge) pendant l’habituation et l’entraînement à l’eau (jour -4–0) contre consommation intermittente d’alcool (jour 1–4). C signifie élevage contrôlé ; L signifie élevage LBN. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figurine.

Figure 6 : Les souris exposées à l’adversité précoce consomment plus d’alcool que les contrôles dans le paradigme opérant et intermittent. (A) Moyenne des coups d’alcool par jour normalisés par le poids corporel (g ; mesuré hebdomadaire) pendant 8 jours d’accès intermittent à l’alcool chez les souris témoins (gris ; gauche) et élevées en LBN (rose ; droite). (B) Consommation moyenne d’alcool par jour normalisée par poids corporel avant, pendant et après l’adultération de la quinine (0,5 mM, 1 mM). (C) Graphique de densité montrant la moyenne des coups d’alcool par jour normalisés par le poids corporel lors d’une seule journée d’accès à l’alcool « Open Bar » FR-0. Les symboles circulaires désignent les femmes (n = 15) ; les symboles carrés désignent les mâles (n = 16). Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figurine.