La fibrose pulmonaire idiopathique (IPF) est une maladie pulmonaire fibrosante chronique et progressive, et une affection réfractaire du système respiratoire. Elle est principalement provoquée par une structure anormale du tissu pulmonaire et par le dépôt de matrice extracellulaire dans les poumons19. Les patients atteints de IPF présentent souvent des caractéristiques typiques telles qu'une inflammation chronique, une diminution de la fonction pulmonaire et une fibrose pulmonaire20. Grâce à des méthodes d'exploration de données, cette étude a caractérisé les habitudes prescriptives du Dr Xu et identifié les plantes médicinales fréquemment utilisées, les associations végétales principales et les formules candidates potentielles pour la IPF-AG.
Il convient de souligner que les 84 prescriptions analysées dans cette étude représentent des dossiers réels de prescription clinique, et non une preuve d'efficacité du traitement. La valeur de ces prescriptions réside dans leur capacité à refléter des schémas répétés de prise de décision clinique par un praticien expérimenté lors de la prise en charge de l'IPF-CE. Par conséquent, les associations de plantes extraites doivent être interprétées comme des caractéristiques de prescription potentielles et des hypothèses de recherche, et non comme des protocoles thérapeutiques validés.
Dans la présente étude, les seuils de support et de confiance ont été prédéfinis en fonction à la fois des considérations méthodologiques et des caractéristiques du jeu de données de prescriptions. Étant donné que l'analyse portait sur 84 prescriptions cliniques contenant plusieurs herbes, un seuil de support de 50 a été retenu afin de garantir que les combinaisons extraites reflètent des motifs de compatibilité fortement récurrents plutôt que des co-occurrences occasionnelles. Un seuil de confiance de 0,8 a été choisi pour identifier des associations fiables présentant une forte probabilité de coexistence des herbes. Toutefois, la confiance seule ne permet pas de déterminer si une association est véritablement significative, car elle peut être influencée par la fréquence globale de l'herbe conséquente. Par conséquent, les valeurs de lift ont été intégrées afin d'évaluer si la co-occurrence observée dépassait la probabilité attendue par hasard. La combinaison de support, de confiance et de lift a permis une évaluation plus complète de la force des associations et a amélioré l'interprétabilité et la reproductibilité des motifs de prescription identifiés. Bien que différents réglages de seuils puissent influencer le nombre de règles extraites, ces critères ont permis d'identifier des combinaisons fondamentales cliniquement pertinentes et reproductibles. Des études futures impliquant des jeux de données plus importants pourraient explorer davantage l'optimisation des paramètres par des analyses de sensibilité.
Dans les applications pratiques de l'exploration de données de prescriptions, plusieurs défis analytiques doivent également être pris en compte. La sélection des paramètres, tels que le support, la confiance et les seuils de lift dans l'analyse des règles d'association, peut influencer le nombre et la force des règles extraites. Des seuils excessivement stricts pourraient exclure des combinaisons cliniquement pertinentes mais peu fréquentes, tandis que des seuils trop permissifs pourraient produire des associations instables ou fallacieuses. Ces problèmes peuvent être identifiés en évaluant la cohérence des motifs extraits selon différents réglages de paramètres et être corrigés par des analyses de sensibilité. De plus, la qualité des données et les procédures de prétraitement, incluant les dossiers de prescription incomplets, la nomenclature incohérente des plantes médicinales et les variations dans les méthodes de traitement, peuvent affecter la fiabilité des analyses. Dans la présente étude, ces sources potentielles de biais ont été réduites grâce à l'utilisation d'une nomenclature normalisée des plantes médicinales, à la fusion de matériaux médicinaux synonymes, à une vérification indépendante des données par deux chercheurs et à un contrôle croisé avec les dossiers médicaux originaux. De futurs jeux de données multicentriques, accompagnés de protocoles standardisés de collecte de données, pourraient encore améliorer la robustesse et la reproductibilité des analyses de motifs prescriptifs.
Les 22 principales herbes utilisées ont été identifiées plus de 50 fois, ce qui suggère des schémas thérapeutiques concentrés. La plupart des herbes, telles que Radix Scutellariae, Bulbus Fritillariae Thunbergii, Forsythia suspensa et Radix et Rhizoma Salviae Miltiorrhizae, sont froides ou fraîches, ce qui est conforme au tableau prédominant de chaleur-phlegmon et à l'excès de chaleur, également mentionné dans des articles d'autorité concernant la FPI-AG21,22,23,24,25. Cette affirmation est corroborée par une abondante littérature clinique en médecine traditionnelle chinoise indiquant que la FPI-AG se manifeste typiquement par une accumulation de chaleur et une obstruction par le phlegmon, bloquant le poumon et altérant la dynamique du Qi pulmonaire.
Les saveurs principales des herbes — amère, sucrée et piquante — remplissent chacune une fonction propre, comme l’élimination de la chaleur, la résolution des glaires, le tonifiant du pancréas et la mobilisation du Qi pulmonaire26,27,28. Ces fonctions reflètent certains des processus pathologiques observés lors de l’inflammation des voies aériennes dans la FPI-CE, de l’hyperproduction de mucus et de la réponse au stress oxydatif.
Le regroupement par règles d'association a identifié Radix Scutellariae, Bulbus Fritillariae Thunbergii, Cortex Mori, Radix et Rhizoma Salviae Miltiorrhizae, Flos Lonicerae Japonicae, Forsythia suspensa et Semen Coicis comme un principal groupe de plantes médicinales. Ce groupe de plantes reflète le principe de dissiper la chaleur, résoudre les glaires, faire circuler les stagnations et détoxifier, ce qui est conforme aux principes établis dans d'autres études de fouille de données portant sur les troubles inflammatoires pulmonaires25,26,27,28,29.
Des preuves pharmacologiques modernes appuient la logique thérapeutique de ces plantes médicinales. La baicaline, extraite de la Radix Scutellariae, s'est révélée efficace à la fois à des fins antibactériennes et anti-inflammatoires30,31,32. Dans des modèles expérimentaux de fibrose pulmonaire, le traitement par la baicaline a réduit le dépôt de collagène et inhibé l'activation des fibroblastes, suggérant ainsi sa contribution potentielle à la régulation de la fibrose33. La présence d'acide chlorogénique dans le Flos Lonicerae Japonicae peut inhiber Staphylococcus aureus ainsi que divers virus respiratoires34. La Salvia miltiorrhiza, par exemple, possède des actions antibactériennes et anti-fibrosantes à large spectre35. Des composés tels que la morine et la cudraflavone B présents dans l'écorce de Morus (Cortex Mori) ont montré une réduction de l'inflammation provenant des macrophages tout en supprimant l'expression de la COX-236 ; par ailleurs, des extraits alcooliques de Cortex Mori peuvent améliorer le bronchospasme induit par l'histamine et les leucotriènes37. Les alcaloïdes du Bulbus Fritillariae Thunbergii, tels que la peimine et la peiminine, favorisent la bronchodilatation via des canaux K+ dépendants du Ca2+38, tandis que l'isopeimine inhibe l'activité de NF-κB et diminue les réponses inflammatoires39. Ensemble, ces données pharmacologiques fournissent un soutien biologique préliminaire aux associations principales identifiées dans cette étude. Des études expérimentales récentes ont en outre démontré que des composés d'herbes chinoises peuvent atténuer la fibrose pulmonaire en régulant les réponses inflammatoires, le stress oxydatif, la transition épithélio-mésenchymateuse (EMT) et l'activation des fibroblastes. Par exemple, des composés dérivés de l’Astragalus membranaceus et de la Salvia miltiorrhiza ont été signalés comme inhibant l'activation des myofibroblastes et le dépôt de la matrice extracellulaire par modulation des voies de signalisation TGF-β/Smad et NF-κB dans des modèles cellulaires et animaux de fibrose pulmonaire2. Ces résultats renforcent la plausibilité biologique des caractéristiques thérapeutiques multi-cibles des associations végétales identifiées dans notre analyse. Toutefois, la majorité des données disponibles provient de composés isolés ou d'herbes individuelles, et il reste incertain si les associations multi-plantes identifiées exercent des effets synergiques dans la fibrose pulmonaire interstitielle aiguë (AE-IPF). De futures recherches devraient intégrer des approches de validation in vitro et in vivo, incluant des modèles cellulaires de fibrose, des modèles animaux de fibrose pulmonaire, le profilage des cytokines inflammatoires, l'analyse transcriptomique et l'évaluation pharmacocinétique, afin de confirmer l'activité biologique et les mécanismes moléculaires des formules candidates. Des études expérimentales antérieures ont montré que des formules chinoises multi-composants peuvent réguler des voies liées à la fibrose pulmonaire, notamment la signalisation TGF-β/Smad, les réponses au stress oxydatif, la polarisation des macrophages et le remodelage de la matrice extracellulaire, dans des modèles de fibrose pulmonaire induite par la bléomycine, suggérant ainsi des mécanismes potentiels qui méritent une validation plus approfondie pour les formules candidates identifiées dans cette étude40.
Le regroupement fondé sur l'entropie a identifié quatre formules candidates intégrant des actions thérapeutiques complémentaires, notamment l'élimination de la chaleur, la résolution des glaires, le renforcement du pancréas et l'élimination des toxines. Ces résultats sont cohérents avec des études antérieures de pharmacologie en réseau, qui ont démontré que les préparations à base de plusieurs plantes peuvent exercer des effets synergiques par des interactions multi-composants et multi-cibles, modulant le stress oxydatif, la prolifération des fibroblastes, la régulation immunitaire et d'autres voies pertinentes pour la fibrose pulmonaire29,30,31,32,33,34.
La littérature existante confirme une concordance partielle entre nos résultats et des études antérieures d'exploration de données menées dans d'autres contextes de médecine traditionnelle chinoise11. Des analyses précédentes de prescriptions liées à la fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) provenant de divers établissements ont également signalé l'utilisation fréquente d'herbes dépuratives de la chaleur, résolvant les glaires et activant le sang, suggérant des principes thérapeutiques communs parmi les praticiens cliniciens11. Toutefois, plusieurs caractéristiques des prescriptions identifiées dans la présente étude, notamment la combinaison spécifique de Radix Scutellariae, Bulbus Fritillariae Thunbergii, Cortex Mori et Radix et Rhizoma Salviae Miltiorrhizae, pourraient refléter l'expérience clinique individualisée du professeur Xu et sa stratégie de différenciation des syndromes23. Bien que plusieurs herbes principales, telles que Radix Scutellariae, Bulbus Fritillariae Thunbergii et Pinellia ternata, soient conformes aux principes classiques de la MTC concernant l'élimination de la chaleur et la résolution des glaires, la nouveauté de cette étude ne réside pas dans l'identification de concepts thérapeutiques entièrement nouveaux. Son apport réside plutôt dans la quantification systématique de la fréquence des prescriptions, des relations de compatibilité et de l'évolution potentielle des formules au sein d'un ensemble de données cliniques provenant d'un expert particulier. Des études comparatives impliquant plusieurs experts et centres sont nécessaires afin de distinguer les principes de prescription universellement applicables des préférences propres à chaque praticien, et pour évaluer davantage la généralisabilité de ces résultats.
Plusieurs limites de cette étude doivent être reconnues. Premièrement, la conception rétrospective monocentrique, basée sur les dossiers cliniques d'un seul praticien, pourrait introduire un biais de sélection, un biais lié aux pratiques régionales et des préférences spécifiques à ce praticien en matière d'ordonnancement. Par conséquent, les schémas d'ordonnancement identifiés doivent être interprétés comme l'expérience clinique d'un expert plutôt que comme des règles universelles de traitement en médecine traditionnelle chinoise (MTC) pour la fibrose pulmonaire idiopathique aiguement exacerbée (AE-IPF), et une validation externe à l'aide de jeux de données multicentriques impliquant plusieurs praticiens de MTC est nécessaire. De plus, l'absence de groupe témoin et de données longitudinales sur les résultats cliniques empêche toute évaluation de la relation entre les schémas d'ordonnancement identifiés et l'efficacité thérapeutique. De futures cohortes de validation multicentriques impliquant différents hôpitaux et cliniciens sont nécessaires pour évaluer la reproductibilité et la généralisabilité de ces résultats. Deuxièmement, bien qu'une validation interne ait été effectuée par analyse de cohérence et interprétation pharmacologique, une validation externe à l'aide de jeux de données d'ordonnancement indépendants reste indispensable. Troisièmement, les effets biologiques des formules candidates doivent être confirmés par des études mécanistiques utilisant des modèles expérimentaux. Les mécanismes proposés restent incomplètement compris et nécessitent davantage de preuves empiriques provenant d'expériences in vitro et in vivo, ainsi que d'études pharmacologiques. En outre, compte tenu de la nature multicomposante et multitarget des prescriptions de MTC, des analyses supplémentaires — notamment le dockage moléculaire, la pharmacologie en réseau, la pharmaco-chimie sérique et la métabolomique — sont nécessaires pour élucider les composants actifs et leurs mécanismes d'action, afin de préciser si et comment ces formules candidates pourraient offrir des bénéfices thérapeutiques dans le traitement de l'AE-IPF.
En résumé, cette approche de fouille de données a permis de caractériser efficacement les profils d'ordonnancement, les associations d'herbes principales et les formules candidates au sein de ce jeu de données cliniques provenant d'un seul expert, offrant des informations structurées qui pourraient guider de futures recherches sur la pertinence clinique et les mécanismes biologiques de ces combinaisons.
Dans cette étude, des techniques d'exploration de données ont été appliquées pour caractériser les schémas de prescription de la médecine traditionnelle chinoise pour la MPP-IRA à partir de 84 prescriptions issues de la pratique clinique du professeur Xu Zhiying. L'analyse a identifié 22 plantes à fréquence élevée (fréquence ≥50), dont Radix Scutellariae, Bulbus Fritillariae Thunbergii et Pinellia ternata étaient les plus prédominantes, révélant un axe thérapeutique centré sur l'élimination de la chaleur, la résolution des glaires, l'élimination des toxines et le soutien du pancréas. L'extraction de règles d'association a permis d'identifier 11 combinaisons fondamentales d'herbes avec un support ≥50, une confiance ≥0,8 et un lift >1, tandis qu'un regroupement hiérarchique fondé sur l'entropie a produit quatre formules candidates intégrant ces principes thérapeutiques complémentaires. Les résultats sont largement appuyés par les actions pharmacologiques documentées des plantes constitutives, notamment des effets anti-inflammatoires, anti-fibrotiques et immunomodulateurs. Toutefois, plusieurs limites doivent être reconnues : la conception monocentrique et monoclinicien limite la généralisabilité ; l'absence de données sur les résultats cliniques empêche toute évaluation de l'efficacité ; et les formules candidates nécessitent une validation par des études expérimentales et cliniques. De futures recherches multicentriques impliquant plusieurs praticiens de médecine traditionnelle chinoise et des plans de cohortes prospectifs sont nécessaires pour confirmer la reproductibilité, la pertinence clinique et la valeur thérapeutique de ces schémas de prescription. Malgré ces limites, cette étude fournit un cadre systématique et fondé sur les données pour caractériser l'expérience experte en matière de prescription et pourrait servir de base à de futures recherches mécanistiques et translationnelles dans la prise en charge de la MPP-IRA par la médecine traditionnelle chinoise.