Une méthode personnalisable pour l'administration de protéines immunitaires sécrétées dans le cerveau vivant de la souris, permettant la caractérisation temporelle et spatiale des interactions neuro-immunitaires.
Article de méthode
Une méthode personnalisable pour l'administration de protéines immunitaires sécrétées dans le cerveau vivant de la souris, permettant la caractérisation temporelle et spatiale des interactions neuro-immunitaires.
Bien que les protéines immunitaires sécrétées soient de plus en plus reconnues pour leur influence sur le fonctionnement du système nerveux, des obstacles techniques persistent dans la définition de leurs dynamiques spatiotemporelles au sein de l'environnement complexe du cerveau. Par exemple, les microglies, une population de cellules immunitaires essentielles dans le cerveau, libèrent une variété de facteurs qui interagissent avec de nombreuses cibles cellulaires différentes. Les protéines d'origine microgliale peuvent transmettre des signaux à d'autres types cellulaires via des mécanismes tels que la liaison à des récepteurs de surface sans internalisation, le transport passif à travers la membrane, la prise en charge par phagocytose ou la prise en charge médiée par endocytose. Ici, une méthode de délivrance localisée d'une protéine sécrétée d'origine microgliale est présentée afin d'analyser les mécanismes d'interaction cellulaire et les effets fonctionnels en aval in vivo. Nous décrivons comment préparer les échantillons protéiques à délivrer, comment réaliser une administration stéréotaxique de la protéine dans des régions cérébrales ciblées, ainsi que les meilleures pratiques pour la collecte et la préparation des tissus cérébraux afin de visualiser par immunohistochimie des protéines sensibles à la fixation. Cette approche fournit un cadre souple pour des études contrôlées spatiotemporellement de la communication neuro-immunitaire, permettant une exploration mécanistique de la manière dont les protéines d'origine immunitaire régulent dynamiquement les fonctions neuronales et cérébrales.
La communication neuro-immunitaire, ou la conversation moléculaire entre les systèmes nerveux et immunitaire, n'a été reconnue que récemment comme essentielle à la compréhension de la santé et de la maladie. Le cerveau, autrefois considéré comme largement protégé contre l'activité du système immunitaire1,2, est désormais reconnu comme abritant des niches immunitaires hautement dynamiques, permettant au système nerveux d'envoyer et de recevoir des signaux immunitaires dans tout l'organisme3. Ce dialogue bidirectionnel robuste est le plus souvent assuré par des cellules immunocompétentes qui résident soit dans le cerveau, soit aux interfaces du système nerveux, telles que le plexus choroïde, les méninges et les espaces périvasculaires4. Toutefois, dans le parenchyme cérébral proprement dit, la signalisation immunitaire est principalement assurée par les microglies, des macrophages tissulaires résidents à longue durée de vie qui colonisent initialement le cerveau durant le développement embryonnaire. Bien qu'elles soient souvent étudiées expérimentalement en mettant l'accent sur leurs fonctions phagocytaires, les microglies interagissent également avec leur environnement immédiat et à distance grâce à la libération d'une grande variété de facteurs immunitaires5.
La modélisation de conditions complexes et multifactorielles telles que les infections, les lésions et les maladies in vivo, bien qu'utile pour obtenir une compréhension globale du système nerveux soumis à un stress, entraîne une cascade de facteurs aux conséquences étendues et variées, difficiles à dissocier. De plus, en raison de l'hétérogénéité élevée entre les cellules des différentes régions cérébrales, il reste difficile d'identifier précisément la libération causale et les effets associés de facteurs individuels. Bien que des outils tels que les vecteurs viraux lentiviraux et les vecteurs viraux associés aux adénovirus, permettant une surexpression de facteurs spécifiques après une infection localisée avec précision, aient permis d'étudier les rôles de facteurs sécrétés par d'autres cellules cérébrales, comme les neurones et les astrocytes, dans divers contextes, la modulation spécifique et robuste des microglies de cette manière s'est révélée jusqu'à présent difficile6. Par conséquent, la possibilité de délivrer des molécules de signalisation dérivées des microglies à un emplacement cérébral défini constitue une méthode utile pour distinguer leurs rôles précis et leurs conséquences dans différents contextes.
Le but de cette méthode est d'administrer de manière spatiotemporelle des facteurs dérivés des microglies dans le cerveau d'une souris vivante afin de permettre l'analyse en aval des effets fonctionnels d'une protéine ou d'une molécule d'intérêt. En outre, cette méthode d'administration intracrânienne peut être adaptée à de nombreux autres contextes et questions, tels que via la co-administration de plusieurs facteurs, tels que des facteurs immunitaires ou des inhibiteurs interagissant entre eux, ou l'étude des réponses tissulaires au cours d'une période d'intérêt. Bien que ce protocole décrive la collecte et la préparation des tissus en vue d'analyses immunohistochimiques, divers autres paramètres cérébraux pourraient être associés à cette méthode d'administration, comme la collecte de prélèvements tissulaires congelés frais provenant d'une région cérébrale d'intérêt pour des analyses de qPCR ou de quantification protéique via immunotransfert ou ELISA, ou l'enregistrement d'activités électrophysiologiques de l'activité neuronale dans une région cérébrale injectée.
Toutes les procédures impliquant des animaux sont réalisées conformément au guide des National Institutes of Health pour le soin et l'utilisation des animaux de laboratoire, et selon des protocoles approuvés par le comité institutionnel de soins aux animaux et d'utilisation (IACUC) de l'établissement de recherche. Toutes les procédures décrites ici ont été examinées et approuvées par l'IACUC de l'Université Duke. Les réactifs et l'équipement utilisés sont listés dans le Tableau des matériaux.
1. (Facultatif) Préparation de l'injectat avec le marqueur d'intérêt
2. Préparation du matériel pour l'intervention chirurgicale
3. Procédure chirurgicale stéréotaxique
REMARQUE : Toutes les interventions chirurgicales ont été réalisées dans un bloc opératoire hautement ventilé, et tout le personnel portait des équipements de protection individuelle comprenant des gants, des masques faciaux, des coiffes, des surchaussures et des blouses. L'exposition au gaz isoflurane présente un risque pour la santé et nécessite donc un système d'aspiration, tel que des cartouches de charbon actif, qui doivent être pesées avant et après l'utilisation de l'isoflurane. Veiller à ce que tout l'équipement, comme le vaporisateur d'anesthésie, les systèmes de ventilation et le matériel d'aspiration, soit correctement certifié et étalonné avant utilisation.
4. Injection de la protéine d'intérêt et récupération chirurgicale
5. Préparation du tissu pour la procédure d'immunohistochimie
6. Réalisation d'une immunohistochimie pour la protéine injectée
La protéine C1q est une protéine de grande taille (~450 kD) fortement exprimée dans tout l'organisme et joue des rôles bien définis dans le système immunitaire inné en tant que membre clé de la voie classique du complément. Toutefois, les fonctions de la C1q dans le cerveau font encore l'objet d'investigations. Dans le cerveau, la C1q est principalement produite et libérée par les microglies, la population cellulaire immunitaire résidente du cerveau9. Le rôle de la C1q dans des processus tels que l'élimination synaptique au cours du développement normal du cerveau, l'apprentissage, la mémoire, ainsi que dans divers contextes pathologiques, a été démontré à plusieurs reprises10,11,12,13,14. On a également observé que la C1q s'accumule dans ou immédiatement à proximité de structures neuronales au cours du vieillissement cérébral, tant chez les rongeurs que chez les primates non humains9,15,16. Notre laboratoire s'intéresse aux conséquences fonctionnelles de l'accumulation de C1q dans le cerveau au cours du vieillissement. Cette étude a révélé que la C1q interagit avec des protéines intracellulaires neuronales chez les rongeurs adultes et âgés, notamment avec des protéines liant l'ARN8. Étant donné que des lymphocytes T ont déjà été montrés capables d'internaliser de la C1q provenant d'autres types cellulaires17, nous avons déterminé si les neurones sont également capables d'internaliser une C1q exogène in vivo.
Cette étude a d'abord réalisé des injections unilatérales intracérébroventriculaires (ICV) de 2 µL de protéine C1q chez des souris mâles âgées de 3 mois. Étant donné que la protéine C1q est exprimée dans le cerveau adulte de type sauvage, deux approches ont été utilisées : premièrement, la protéine C1q a été injectée chez une souris C1q -/- (knockout) ; deuxièmement, la C1q a été marquée de manière fluorescente par conjugaison au 594-maleimide afin de permettre de distinguer la protéine C1q endogène de la protéine exogène dans un animal C1q +/+ (de type sauvage). La protéine a été administrée à une concentration de 1 mg/mL, en suspension dans une solution tampon contenant 10 mM de HEPES, 300 mM de NaCl, pH 7,2. Les coordonnées stéréotaxiques suivantes ont été utilisées pour une injection ICV dans l'hémisphère gauche : X = +1,0 mm, Y = -0,4 mm, Z = -2,5 mm, et le volume a été injecté à un débit de 500 nL/min. Afin de réduire le reflux, l'aiguille en verre tirée utilisée pour l'injection a été laissée en place pendant 5 minutes après l'arrêt de l'injection avant d'être retirée. Les tissus ont été prélevés 1 heure après l'injection et traités pour une analyse immunohistochimique sur des coupes sagittales. Une injection réussie doit entraîner une fluorescence localisée dans la zone ciblée stéréotaxiquement.
Premièrement, chez des souris C1q -/-, nous avons réalisé l'imagerie de sections sagittales de 30 µm de l'hémisphère gauche (Figure 3A) et droit (Figure 3B) après la procédure complète d'immunohistochimie (étapes 6.1–6.17). Un anticorps anti-NeuN a été utilisé pour visualiser les corps cellulaires neuronaux (en cyan) et un anticorps anti-C1q (en rouge) pour détecter la C1q non marquée injectée une heure auparavant dans le ventricule gauche. Une forte accumulation de C1q est observée dans l'hémisphère gauche au niveau du parenchyme périventriculaire, ainsi qu'une importante colocalisation entre les corps cellulaires neuronaux et la C1q dans la région CA3 de l'hippocampe (Figure 3A), similaire à ce que nous observons chez une souris de type sauvage exprimant naturellement la C1q. Comme prévu, la C1q injectée n'est pas détectée autour des ventricules (ni nulle part ailleurs dans le parenchyme) dans l'hémisphère controlatéral une heure après l'injection (Figure 3B). Ensuite, des cerveaux de souris de type sauvage C1q +/+ (C57BL/6J) ayant reçu une injection intracérébroventriculaire de C1q-594 ont été analysés par imagerie. Dans ce cas, il a été confirmé que la C1q-594 (en magenta) pouvait être visualisée sur des sections sagittales de 30 µm après seulement inhibition de la fluorescence spontanée et montage sous lame avec DAPI (en bleu) (étapes 6.12–6.17). Dans l'hémisphère gauche (injecté), la C1q injectée marquée par fluorescence (en magenta) est observée avec la même distribution périventriculaire (Figure 3C).
Afin de confirmer la colocalisation neuronale, une expérience secondaire a été réalisée sur deux mâles C1q -/- âgés de 2 mois. Dans un hémisphère, les souris ont reçu une injection ICV de 2 µL de C1q-594, et dans l'autre hémisphère, elles ont reçu 2 µL de C1q-594 inactivé par la chaleur (HI). L'inactivation par la chaleur a été effectuée après la conjugaison au 594-maléimide, en plaçant la moitié de la préparation protéique dans un bloc chauffant réglé à 56 °C pendant 30 min. L'inactivation thermique a déjà été montrée antérieurement pour modifier la structure native de la protéine C1q et perturber son activation18. La C1q normale et native, à une concentration de 200 µg/mL dans un tampon de suspension (50 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7,5), est soluble en solution et ne forme aucun agrégat visible en microscopie à champ clair (Figure 4A). En revanche, lorsque la même préparation protéique a été chauffée, des agrégats visibles ont été observés en champ clair (Figure 4B), suggérant un changement de conformation de la protéine. Ensuite, on a déterminé si l'injection de C1q-HI in vivo modifiait la capture neuronale de C1q. Les cerveaux ont été prélevés 1 h après l'injection, et chaque hémisphère a été traité de manière identique selon le protocole décrit ci-dessus. Sur des coupes sagittales de 20 µm, une immunohistochimie a été réalisée pour identifier les neurones. Des images en 40x ont été acquises avec des réglages identiques dans la région CA3 de l'hippocampe afin de visualiser les neurones NeuN+ (cyan) et le C1q-594 (rouge) (Figure 5A,B). Dans l'hémisphère injecté avec du C1q-594 normal, une forte marquage de C1q a été observé (Figure 5A), tandis que dans les hémisphères injectés avec du C1q-594-HI, aucun C1q-594 n'a été détecté dans la région CA3, bien que la protéine fluorescente puisse être observée s'accumulant aux bords des ventricules (Figure 4C), ce qui est compatible avec une altération de la fonction normale de C1q dans la capture neuronale. La quantification manuelle, réalisée par un expérimentateur aveugle, des cellules NeuN+ dans 8 champs d'observation en 40x n'a révélé aucune modification de la densité des neurones dans la région CA3 entre les hémisphères (Figure 5D), mais le pourcentage de neurones C1q+ était significativement réduit dans les hémisphères injectés avec du C1q-594-HI (Figure 5C), selon un test t bilatéral (p = 0,026, n = 2 animaux, 2 images par hémisphère et par animal analysées).

Figure 1 : Installation chirurgicale et préparation du champ stérile chirurgical. (A) Matériel chirurgical : 1. Stéréotaxique, 2. Réchauffeur pour rongeur, 3. Vaporisateur d'isoflurane, 4. Cartouche de captage d'isoflurane, 5. Bras stéréotaxique numérique, 6. Microinjecteur, 7. Foret, 8. Microscope stéréo. (B) Outils stérilisés au autoclave et serviette chirurgicale stérile munie d'une bande indicatrice de vapeur pour confirmer la stérilité. (C) Les outils stérilisés sont placés avec précaution « pointes vers l'intérieur » dans la zone stérile désignée sur la serviette chirurgicale stérilisée à l'autoclave. Les manches restent à l'extérieur du centre stérile, et les extrémités des instruments ne doivent entrer en contact avec l'animal qu'après stérilisation au bétadine et à l'éthanol à 70 %. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : Transformation et congélation du cerveau pour la section sagittale. (A) Utiliser une lame de rasoir pour couper le cerveau selon la ligne médiane, puis placer chaque hémisphère avec le côté médian vers le bas dans un moule de congélation. (B) Remplir les moules avec un mélange 50:50 de milieu d'encrage pour congélation et de saccharose 30 % dans du PBS. (C) Congeler les cerveaux dans les moules sur de la glace sèche (à gauche). Ils deviendront opaques une fois complètement congelés (à droite). Veuillez cliquer ici pour afficher une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : Résultats représentatifs de l'administration intracérébroventriculaire (ICV) de la protéine C1q une heure après l'injection. (A) Section sagittale de la protéine C1q injectée (en rouge) et des corps cellulaires neuronaux NeuN+ (en cyan) dans l'hémisphère injecté, et un encart du secteur CA3 de l'hippocampe adjacent au ventricule. (B) Section sagittale de l'hémisphère controlatéral à l'injection chez le même animal, montrant la protéine C1q injectée (en rouge) et les corps cellulaires neuronaux NeuN+ (en cyan), ainsi qu'un encart du CA3. (C) Section sagittale d'un animal de type sauvage injecté ICV avec la protéine C1q marquée par fluorescence à l'aide d'une conjuguaison au 594-maléimide (en magenta), non amplifiée par immunohistochimie, mais montée avec du DAPI (en bleu), et un encart du CA3. Les barres d'échelle des images de gauche = 1000 µm, celles des images de droite = 150 µm. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : Inactivation thermique de la protéine C1q. (A) Protéine C1q native, mise en suspension dans un tampon (50 mM HEPES, 150 mM NaCl, pH 7,5) à 200 μg/mL, observée par microscopie en champ clair. (B) La même source de protéine C1q, mise en suspension dans le même tampon à la même concentration, mais traitée à la chaleur à 56 °C pendant 30 min avant observation par microscopie en champ clair. (C) Localisation de C1q inactivée par la chaleur (HI)-C1q-594 (en rouge) et des cellules NeuN+ (en cyan) dans une section sagittale 1 h après injection ICV. Barre d'échelle supérieure = 10 µm, barre d'échelle inférieure = 1000 µm. Veuillez cliquer ici pour consulter une version agrandie de cette figure.

Figure 5: Quantification de l'absorption de la protéine C1q normale par rapport à la C1q inactivée par la chaleur dans les neurones de l'hippocampe. (A) Coupe sagittale de la région CA3 de l'hippocampe adjacente au ventricule, où C1q-594 a été injecté une heure auparavant. Corps cellulaires neuronaux NeuN+ (cyan), C1q-594 (rouge) et superposition des deux.B) Coupe sagittale de la région CA3 de l'hippocampe adjacente au ventricule, où du C1q-594 inactivé par la chaleur (HI-C1q-594) a été injecté une heure auparavant. Corps cellulaires neuronaux NeuN+ (cyan), C1q-594 (rouge) et superposition des deux.CQuantification du pourcentage de cellules NeuN+ qui sont C1q-594+ dans le champ de vision à 40x, test bilatéral test t. (D) Quantification du nombre de cellules NeuN+ dans le champ de vision à 40x, test t bilatéral. Échelles = 50 µm. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
| Marquage des protéines | Anticorps | |
| Visualisation | Directe, indépendante d’un anticorps | Peut présenter une réactivité croisée avec d'autres protéines, dépend de la disponibilité de l'antigène |
| Préparation | Préparation plus longue et plus technique de la protéine d'intérêt, car le marquage peut altérer la structure et la fonction de la protéine. Les rendements de la réaction peuvent être faibles et nécessiter de grands volumes de protéine initiale | Aucune préparation nécessaire, de nombreux anticorps sont disponibles commercialement et déjà validés |
| Flexibilité expérimentale | Suivi en temps réel possible si souhaité | Requiert une fixation |
| Sensibilité | Sensibilité limitée en raison de la stœchiométrie | Permet une amplification |
Tableau 1 : Avantages et inconvénients du marquage des protéines vs. détection par anticorps.
Des preuves émergentes soutiennent un rôle essentiel des microglies dans l'homéostasie du SNC, assurée par un répertoire de plus en plus complexe de facteurs sécrétés5. La capacité de délivrer des facteurs dérivés des microglies de manière spatiotemporelle définie constitue un outil précieux pour démêler la communication neuro-immunitaire complexe dans diverses conditions environnementales et génétiques.
Cette méthode peut être facilement adaptée pour répondre à une grande variété de questions biologiques. Bien que cette méthode ait été utilisée précédemment pour mieux comprendre les rôles de la C1q, une protéine très grande, dans la fonction neuronale8, elle pourrait également être appliquée pour étudier les fonctions d'autres protéines de grande taille, ainsi que de petites protéines telles que les cytokines et les chimioquines. Alors que les rôles immunitaires des cytokines et des chimioquines sont relativement bien compris, in vivo, ces facteurs sont souvent libérés simultanément, en réponse à un stress, et de manière diffuse. De plus, les rôles non immunitaires ou non canoniques, souvent homéostatiques, de divers facteurs immunitaires deviennent de plus en plus évidents. L'utilisation de cette méthode permettrait d'étudier des facteurs spécifiques de manière isolée, ainsi que dans des régions cérébrales spécifiques, voire les rôles de ces facteurs dans l'homéostasie. Une autre application intéressante de ce protocole serait l'administration de protéines d'intérêt chez des lignées de souris transgéniques, par exemple chez des lignées d'invalidation génique (knockout) ou des modèles de pathologies spécifiques. La possibilité de contrôler avec précision la localisation et la quantité d'une protéine d'intérêt chez une souris ne produisant pas cette protéine de façon endogène peut permettre de déterminer si une administration aiguë et localisée de la protéine induit un effet, tel qu'un changement comportemental. Alternativement, on pourrait réaliser une injection dans une lignée transgénique dépourvue d'un récepteur spécifique ou d'une protéine de signalisation dont on suppose qu'elle est essentielle pour la fonction du facteur injecté.
En outre, l'administration intracrânienne de facteurs dérivés des microglies peut être réalisée en parallèle avec l'injection d'autres facteurs afin d'approfondir notre compréhension mécanistique de la fonction d'une protéine. Par exemple, afin de déterminer comment la C1q, une protéine dérivée des microglies, pénètre dans les neurones et interagit avec leur machinerie de traduction, nous avons précédemment utilisé cette technique pour coadministrer un inhibiteur de l'endocytose 30 min avant l'injection de C1q. Cela nous a permis de démontrer que la C1q peut pénétrer dans les neurones via l'endocytose, puisque la coapplication avec l'inhibiteur a entraîné une réduction significative de la C1q dans les neurones8. Des expériences similaires pourraient être menées en administrant des anticorps bloquants ou même d'autres facteurs hypothétiques compétitifs pour la liaison. Ces expériences de coadministration peuvent également être modulées dans le temps en allongeant ou en raccourcissant les intervalles d'injection, par exemple en injectant un facteur 30 min avant l'autre, ou un facteur 5 min contre 1 h auparavant.
Plusieurs facteurs doivent être pris en compte lors de la conception d'expériences utilisant cette méthodologie, en commençant par la stratégie de détection de la protéine d'intérêt. Ici, deux approches représentatives ont été démontrées : le marquage fluorescent direct de la protéine (Figure 3C) et la détection immunohistochimique à l'aide d'anticorps (Figure 3A), chacune présentant des avantages et des limites distincts (Table 1). La détection par anticorps est très sensible et permet une amplification du signal, mais nécessite une fixation des tissus, ce qui la rend inadaptée à des applications telles que l'imagerie en temps réel des dynamiques protéiques. Le marquage fluorescent direct évite cette limitation, mais exige une modification de la protéine elle-même, ce qui peut en altérer les propriétés et doit donc faire l'objet d'une validation. Quelle que soit l'approche choisie, une validation rigoureuse est essentielle. Les anticorps commerciaux sont largement disponibles, mais peuvent présenter des liaisons hors cible ou des réactions croisées, rendant indispensable le test de spécificité. Dans la mesure du possible, les performances des anticorps doivent être confirmées à l'aide de contrôles appropriés, tels que la comparaison de la coloration entre des tissus de type sauvage et des tissus invalidés pour la protéine, ce qui reste la référence absolue en matière de validation d'anticorps.
En revanche, le marquage fluorescent direct nécessite une préparation et une validation préalables avant son utilisation expérimentale. Bien que cette approche permette une visualisation directe de la protéine sans recourir à des anticorps, il est essentiel de confirmer que la balise fluorescente n'altère ni la structure, ni la localisation, ni les interactions, ni la fonction de la protéine. La validation appropriée dépend de la protéine concernée, mais peut inclure la confirmation du poids moléculaire attendu par immunobuvardage, la vérification d'une localisation cellulaire ou sous-cellulaire normale, ou l'évaluation du maintien des interactions protéine–protéine connues à l'aide de tests tels que la co-immunoprécipitation. En définitive, les deux méthodes — la détection par anticorps et le marquage direct des protéines — présentent des avantages et des limites inhérents, et l'approche la plus adaptée doit être déterminée empiriquement au moyen d'études pilotes spécifiques à la protéine d'intérêt et conformes aux recommandations publiées19.
Pour que cette méthodologie soit fiable, il est essentiel que les coordonnées stéréotaxiques et la concentration de protéine injectée choisies par l'expérimentateur soient optimisées et validées empiriquement au préalable. La validation des coordonnées peut être réalisée par une injection pilote d'un colorant, tel que le vert rapide (Fast Green), suivie d'une collecte immédiate du cerveau après l'injection. Cela permettra de confirmer visuellement la localisation du colorant dans la région d'intérêt, tout en offrant la possibilité d'ajuster les coordonnées afin d'obtenir une injection aussi précise que possible. Les auteurs recommandent de se référer à des travaux précédemment publiés afin de déterminer des coordonnées stéréotaxiques précises pour les régions d'intérêt, ou de calculer des coordonnées adaptées aux souris de grande ou petite taille en fonction du rapport bregma-lambda, comme décrit dans le Protocole.
Afin de tirer des conclusions expérimentales fiables concernant la protéine injectée, un certain nombre de contrôles essentiels doivent être pris en compte et inclus dans une expérience bien conçue. L'étude des protéines dérivées des microglies présente des difficultés intrinsèques via administration intracrânienne. Si un expérimentateur s'intéresse à la réponse à une protéine particulière dans une région cérébrale spécifique, la chirurgie elle-même sera inflammatoire et pourrait fausser les résultats. En ce qui concerne les protéines liées au système immunitaire, les contrôles les plus simples à réaliser sont les contrôles chirurgicaux, dans lesquels soit une chirurgie factice est effectuée (toutes les étapes sauf l'injection de la protéine), soit une injection de contrôle de véhicule est réalisée (toutes les étapes, mais au lieu de la protéine, le même volume de la solution tampon de la protéine est injecté). Ces contrôles permettent de distinguer les effets liés à la chirurgie ou aux lésions tissulaires de ceux dus à la protéine elle-même. Encore plus concluant serait d'inclure un contrôle dans lequel une protéine inactive ou sans rapport est injectée au même volume et à la même concentration. Il est important de prendre en compte la taille relative de la protéine de contrôle par rapport à la protéine expérimentale ; par exemple, la C1q est une protéine très grande (~450 kD), donc injecter une protéine de contrôle courante comme l'albumine sérique bovine (~66 kD) pourrait ne pas être le choix le plus approprié. Par conséquent, la C1q inactivée par la chaleur a été utilisée comme contrôle de protéine inactive. Selon la diffusion de la protéine injectée durant l'intervalle de temps souhaité avant la collecte, ce contrôle peut être réalisé chez le même sujet en incluant l'une de ces conditions de contrôle dans l'hémisphère controlatéral à l'hémisphère injecté expérimentalement, comme illustré dans Résultats représentatifs (Figure 4 et Figure 5).
Un aspecte important à prendre en compte dans la conception expérimentale est la stratégie de fixation des tissus, car le type et la durée de la fixation peuvent fortement influencer la visualisation des protéines, la morphologie tissulaire et, dans certains cas, la fonction protéique. Les fixateurs de type réticulant, tels que le paraformaldéhyde (PFA), préservent généralement mieux l'architecture tissulaire, mais peuvent réduire la détection des épitopes sensibles à la fixation en raison d'une réticulation excessive des protéines, augmenter l'autofluorescence et nécessiter une récupération d'antigène. En revanche, les fixateurs non réticulants, comme les solutions à base d'alcool, d'acétone ou de méthanol, préservent souvent mieux les protéines sensibles à la fixation, mais peuvent compromettre l'intégrité tissulaire. Ces compromis peuvent être atténués en optimisant la durée et la méthode de fixation, notamment par l'utilisation de coupes fraîchement congelées fixées directement sur la lame, une perfusion saline suivie d'une brève immersion dans du PFA, ou une fixation par perfusion classique, selon les objectifs expérimentaux. Comme aucune stratégie de fixation unique n'est optimale pour toutes les applications, les chercheurs doivent choisir et optimiser empiriquement les conditions de fixation en fonction de leurs critères principaux afin d'obtenir le meilleur équilibre entre préservation tissulaire et détection des protéines.
L'objectif de ce protocole est de normaliser la livraison des protéines plutôt que de prescrire des méthodes pour quantifier les résultats expérimentaux ; toutefois, plusieurs approches peuvent être utiles selon les objectifs de l'étude. Dans cet exemple, l'absorption protéique spécifique aux types cellulaires est évaluée par immunomarquage à l'aide d'anticorps dirigés contre des marqueurs cellulaires (par exemple, NeuN pour les neurones) et par quantification de la colocalisation avec la protéine d'intérêt (Figure 5), bien que des lignées de souris transgéniques exprimant un marqueur fluorescent offrent un moyen alternatif d'identifier des populations cellulaires spécifiques. Un autre résultat important est la diffusion de la protéine, qui est fortement influencée par les propriétés biochimiques de la protéine injectée. Lorsqu'une caractérisation précise de la diffusion protéique est requise, nous recommandons d'injecter simultanément un traceur fluorescent inerte, tel que des dextranes de poids moléculaires définis, afin d'estimer la distribution de l'injection et la diffusion tissulaire à des moments précis après l'administration intracrânienne. Ces expériences ont déjà été réalisées par les auteurs afin de déterminer les paramètres expérimentaux pour la section Résultats représentatifs8.
Enfin, une optimisation de la détection des protéines et de la délivrance intracrânienne peut être nécessaire lors du dépannage. L'un des défis courants consiste à obtenir un signal fluorescent fiable pour la protéine d'intérêt. Comme indiqué ci-dessus, la stratégie de fixation est un facteur déterminant majeur de la qualité du signal. Si une forte autofluorescence s'accompagne d'un signal fluorescent réel faible, il est recommandé de réduire d'abord la durée et/ou l'ampleur de la fixation des tissus, car une sur-fixation est fréquente et peut contribuer à la fois à une augmentation de l'autofluorescence et à une diminution du signal ciblé. Ce protocole inclut également une solution d'inhibition de l'autofluorescence, qui peut améliorer le rapport signal sur bruit du fluorescence ciblée. Lorsqu'elle est correctement réalisée, la procédure d'injection doit entraîner des lésions tissulaires minimales. Aucune cavitation ni formation de lésion au site d'entrée de l'injecteur ne devrait être observée. Si l'un ou l'autre phénomène se produit, la préparation des pipettes en verre étirées pourrait nécessiter une optimisation afin d'assurer une pénétration tissulaire propre. Par exemple, vérifiez que la pointe de la pipette est suffisamment rigide et ne fléchit pas au contact du parenchyme cérébral, et ajustez le biseau selon les besoins pour obtenir un bord tranchant facilitant une pénétration fluide. Pour les injections dans des régions profondes du cerveau, la longueur de la pipette étirée pourrait également devoir être augmentée afin d'atteindre la région cible sans que l'injecteur ne touche la surface cérébrale. Lors de l'administration du liquide injecté directement dans le parenchyme cérébral plutôt que dans un ventricule, un petit volume d'injection (<1 µL) est recommandé afin de minimiser l'œdème, d'éviter la cavitation au site d'injection et de réduire le reflux du liquide lors du retrait de la pipette. Il est également recommandé d'injecter lentement (<500 nL/min) et d'attendre 5 à 10 minutes après la fin de l'injection avant de retirer la pipette, afin de permettre au liquide injecté de diffuser dans le tissu environnant. Si un écoulement de liquide est observé le long du trajet d'injection lors du retrait de la pipette ou s'il est détecté le long du trajet d'injection après traitement immunohistochimique, le volume d'injection et/ou la vitesse d'injection devraient être réduits, et la période d'attente après l'injection devrait être prolongée.
Les auteurs déclarent ne pas avoir de conflits d'intérêts.
Ce travail a été financé par le National Alzheimer’s Coordinating Center (NACC; NSH), l'Alzheimer’s Association (NSH) et le prix Germinator du Duke Institute for Brain Sciences (DIBS) (JD).
| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| Sérum physiologique à 0,9 % (qualité pharmaceutique) | Cytiva | Z1376 | |
| Seringues de 30 mL | Becton, Dickinson and Company (BD) | 302832 | |
| Éthanol à 70 % | Koptec | UN1170 | |
| Alexa Fluo 594 C5 Maleimide | Invitrogen | A10256 | |
| Vaporisateur d'anesthésique | RWD | TAIJI-IE | |
| Stérilisateur à billes | VWR | 75999-324 | |
| BSA | Genessee Scientific | 25-529 | |
| Aiguille papillon - Vacutainer Safety-Lok | Becton, Dickinson and Company (BD) | 367281 | |
| Coverslips - 50 mm No. 1 | Avantor (VWR) | 48393-081 | |
| Stereotaxie numérique pour rongeur | RWD | 68803 | |
| Moules de congélation jetables | Electron Microscopy Sciences | 70182 | 22 mm x 22 mm pour des coupes sagittales de cerveau de souris adulte |
| Microscope de dissection | Leica | MZ FLIII | |
| Milieu d'inclusion - Tissue-Tek OCT | Sakura | 4583 | |
| Lubrifiant oculaire | Optixcare | OPX-4242 | |
| Tireuse de pipettes en verre | Sutter Instrument Co. | Model P-30 | Nous utilisons une taille de 1,14 mm, 3,5" pour notre injecteur |
| Pipettes en verre | World Precision Instruments | 504949 | |
| Anticorps secondaire caprin anti-lapin AF594 | Invitrogen | A-11012 | |
| Anticorps secondaire caprin anti-rat AF488 | Invitrogen | A-11006 | |
| Crème dépilatoire | Nair | 42016527 | |
| Plateau chauffant - Rodent Warmer X1 | Stoelting | 53800M | |
| Micromoteur rotatif à haute vitesse (perceuse) avec forets | Stoelting | 51449 | |
| Isoflurane | Dechra | Isospire | |
| Microinjecteur et contrôleur | WPI | NANOLITER2020 | |
| Lames de microscope | Premiere | 8348 | |
| Huile minérale légère | Fisher Scientific Education | S25439 | |
| Milieu de montage avec DAPI | Sigma-Aldrich | F6057 | |
| Vernis à ongles | Electron Microscopy Sciences | 72180 | |
| Protéine native du complément C1q de souris | Creative Biolabs | CTP-463 | Les produits d'autres fabricants peuvent contenir des contaminants moléculaires qui inhibent la dynamique normale du C1q cérébral |
| Stylo hydrophobe - ImmEdge Pen | Vector Laboratories | H-4000 | |
| Paraformaldéhyde - 16 % | Electron Microscopy Sciences | 15710 | Diluer à 4 % |
| Solution tamponnée au phosphate (PBS) | Sigma-Aldrich | P3813 | |
| Solution de povidone-iodure, 10 % (p/v) | Ricca | 3955-16 | |
| Anticorps primaire anti-C1q de lapin | Abcam | ab182451 | |
| Anticorps primaire anti-NeuN (RBFOX3) de rat | Biolegend | 608451 | |
| Saponaïne | Sigma-Aldrich | 47036 | |
| Lames de bistouri - No. 10 | VWR | 76457-442 | |
| Bandes indicatrices de stérilisation à la vapeur | Steris | 801010 | |
| Applicateurs stériles Puritan à embout coton | Puritan | 25-806 1WC | |
| Saccharose | Sigma-Aldrich | 84097 | |
| Serviettes chirurgicales | McKesson | 16-6006-B | |
| Adhésif tissulaire - Vetbond | 3M | 1469SB | |
| Solution tamponnée au Tris | Sigma-Aldrich | T5941, S7653 | |
| TrueBlack | BIOTIUM | 23007 |
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