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Article de recherche

Cartographie des connaissances des preuves cliniques et de la recherche mécanistique sur Tongxie Yaofang pour la colite ulcéreuse : une analyse bibliométrique

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DOI :

10.3791/72094

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11 août 2026

 ,  , 
1Department of Pharmacy, Dongtai People's Hospital

Dans cet article

Résumé

Cette étude bibliométrique cartographie les preuves de la collection centrale Web of Science en langue anglaise sur Tongxie Yaofang (TXYF) pour la colite ulcéreuse et distingue les courants de recherche clinique, mécanistique et translationnelle. L’analyse identifie un domaine en pleine expansion, dirigé par la Chine, avec la pharmacologie en réseau, les modèles animaux, le microbiote et la signalisation inflammatoire dépassant les études cliniques standardisées sur les critères d’évaluation.

Résumé

Pour cartographier systématiquement le paysage des connaissances sur les preuves cliniques et la recherche mécaniste sur Tongxie Yaofang (TXYF) pour la colite ulcéreuse (UC), nous avons réalisé une analyse bibliométrique et de graphe de connaissances d’articles et de revues en anglais récupérés depuis la Web of Science Core Collection jusqu’au 31 décembre 2025. Après le filtrage, 133 enregistrements ont été analysés pour les tendances de publication, les réseaux de collaboration, la distribution des revues, les clusters de co-citation, la cooccurrence de mots-clés et la structure thématique clinique contre mécaniste. Des critères opérationnels ont été utilisés pour classer les dossiers comme preuves cliniques, recherche mécanistique ou études translationnelles/transitionnelles. Le champ s’est nettement élargi après 2020, avec la domination des institutions chinoises, mais la collaboration internationale et inter-équipes est restée limitée. La recherche mécanistique a montré une forte activité autour du facteur nucléaire kappa B (NF-κB)/protéine réceptrice de type NOD 3 (NLRP3), de la protéine kinase activée par le mitogène (MAPK)/AKT (protéine kinase B), du microbiote intestinal, du métabolisme des acides gras à chaîne courte, de la réparation de la barrière intestinale, de la polarisation des macrophages et de la pharmacologie computationnelle. Les preuves cliniques dans le corpus WoSCC anglophone étaient relativement rares et reposaient souvent sur des résultats larges des symptômes ou de l’activité de la maladie plutôt que sur des critères standardisés rapportés par les patients, endoscopiques, histologiques et biomarqueurs. Ces résultats indiquent un décalage translationnel entre la découverte mécanistique et l’évaluation clinique, et ils soutiennent le développement d’études cliniques multicentriques informées par les mécanismes, avec des lectures biologiques prédéfinies.

Introduction

La colite ulcéreuse (CU) est une maladie inflammatoire chronique du côlon façonnée par des facteurs environnementaux, génétiques, microbiens, de barrière épithéliale etimmunitaires 1. La prise en main actuelle est allée au-delà du soulagement des symptômes pour adopter des stratégies traitant vers cible qui mettent l’accent sur la guérison muqueuse, la rémission durable et la prévention des complications. Bien que l’acide 5-aminosalicilique, les corticostéroïdes, les immunomodulateurs, les biologiques, les inhibiteurs de petites molécules et les thérapies ciblant l’interleukine aient amélioré les résultats pour de nombreux patients, la non-réponse primaire, la perte secondaire de la réponse, le risque d’infection, le coût et la charge du traitement restent des défis cliniquementimportants 2,3,4. Ces besoins non satisfaits ont suscité un intérêt soutenu pour des approches complémentaires multicomposantes susceptibles de réguler l’inflammation, les lésions de la barrière, les perturbations du microbiote et le déséquilibre immunitaire grâce à des mécanismes coordonnés.

Le Tongxie Yaofang (TXYF), une formule classique de médecine traditionnelle chinoise (MTC) associée au principe de retenir le bois et de soutenir la terre, est couramment discutée pour la diarrhée et les douleurs abdominales liées à la stagnation hépatique et aux schémas de carence en rate5. Dans la pratique clinique contemporaine, il est devenu un traitement fréquemment prescrit pour la colite ulcéreuse et les maladies inflammatoires de l’intestin associées. Les recherches scientifiques récentes sur la formule Tongxieyao sont passées de la validation empirique clinique à une analyse approfondie des mécanismesmoléculaires 6,7. Des études pharmacologiques modernes révèlent que cette formule n’agit pas comme un agent anti-inflammatoire unique mais exerce des effets à travers plusieursvoies 8. En ce qui concerne la régulation de l’inflammation, la recherche démontre sa capacité significative à inhiber la suractivation des voies de signalisation pertinentes et des microsomes inflammatoires. Concernant la réparation de la barrière muqueuse intestinale, la formule régule à l’exprès l’expression des protéines des jonctions étroites et réduit la perméabilitéintestinale 9. De plus, la restauration de l’équilibre du microbiote intestinal et la modulation du réseau neuroendocrino-immunitaire de l’axe intestin-cerveau émergent comme de nouveaux points focaux pour élucider les mécanismes thérapeutiques de la formule Tongxieyao. Les dernières expériences fondamentales indiquent que la formule améliore la dysrégulation immunitaire en régulant le métabolisme du tryptophane et l’activité des récepteurs, fournissant des preuves solides soutenant la logique scientifique de son efficacité thérapeutique dans la coliteulcéreuse 10.

Malgré l’augmentation de l’activité de publication, le paysage des preuves reste fragmenté. Les études actuelles adoptent principalement des approches à perspective unique : soit en se concentrant sur les indicateurs d’efficacité clinique à travers des essais contrôlés randomisés sur un petit échantillon, soit en menant des expériences purement basiques sur des interventions spécifiques via lasignalisation 11,12. Il existe un décalage important entre les preuves cliniques et les études mécanistes, avec une intégration insuffisante de leurs relations interactives. De plus, une analyse systématique reste à mener concernant la répartition des équipes de recherche principales, l’intensité de la collaboration interinstitutionnelle, le rôle fondamental de la littérature fondamentale et les schémas d’évolution temporelle des thèmes de recherche. Par exemple, alors que des mots-clés tels que pharmacologie de réseau, microbiote intestinal et voies de signalisation montrent une fréquence élevée dans le regroupement de mots-clés, l’analyse quantitative de big data reste insuffisante pour éclairer comment ces points chauds de recherche ont évolué à partir des méthodes traditionnelles d’évaluation des symptômes et pour déterminer leurs trajectoires développementalesfutures 13. Dans la recherche liée à l’UC, TXYF a été étudié à travers des revues, la pharmacologie en réseau, le docking moléculaire, des modèles de maladies, des analyses de microbiotes, la transcriptomique, des expériences de polarisation des macrophages et la validation de la transplantation du microbiotefécal 2,14,15,16,17,18,19,20 . Les preuves actuelles suggèrent que la recherche TXYF s’est déplacée d’une interprétation empirique axée sur les symptômes vers des hypothèses impliquant le facteur nucléaire kappa B (NF-κB)/protéine récepteur de type NOD 3 (NLRP3), la protéine kinase activée par les mitogènes (MAPK)/AKT (kinase protéine B), la signalisation IL-10RA/NF-kB, la protection de la barrière épithéliale, le remodelage microbien et la mitophagie. Les études cliniques et protocoles tendent à mettre l’accent sur le soulagement des symptômes, l’activité de la maladie, la récidive, la sécurité et la différenciation du syndrome de MTC, tandis que les études mécanistes examinent fréquemment la prédiction computationnelle des cibles, la signalisation inflammatoire, la validation animale ou cellulaire, la modulation du microbiote et la réparation de la barrièreépithéliale 2,14,15,16,17,18,19 ,20. Ces courants ne sont pas encore bien intégrés : les résultats mécanistes sont rarement intégrés de manière prospective dans les critères d’évaluation des essais cliniques, et les études cliniques incluent rarement des panels de biomarqueurs standardisés capables de tester les voies biologiques proposées par les travaux précliniques.

Cette étude visait donc à cartographier le paysage de recherche en anglais sur les WoSCC sur TXYF pour l’UC, à identifier les principaux contributeurs et structures de connaissances, et à comparer la maturité et la connectivité translationnelle entre les preuves cliniques et la recherche mécaniste. L’objectif n’était pas de revendiquer une couverture exhaustive de toutes les études TXYF chinoises et internationales, mais de caractériser le corpus anglophone indexé internationalement et d’identifier où les travaux futurs devraient renforcer la reproductibilité, la collaboration, la standardisation des critères d’évaluation et la conception des études du mécanisme à la clinique.

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Protocole

Conception de l’étude

Cette étude a utilisé un design bibliométrique et de graphe de connaissances axé sur les preuves cliniques et la recherche mécanistique sur TXYF pour la UC. Le flux de travail est illustré à la Figure 1 et comprend six étapes liées : récupération de la base de données, suppression des doublons, filtrage des titres/résumés, évaluation intégrale de l’éligibilité au texte intégral, extraction de données structurées et visualisation/synthèse. L’échantillon analytique final comprenait 133 articles et revues en anglais. Le tableau 1 résume la stratégie de recherche et les critères d’éligibilité, et le tableau des matériaux liste la plateforme bibliographique, le type de données exporté, les outils logiciels et les notes de reproductibilité.

La conception intègre des métadonnées bibliographiques, des informations sur les auteurs et les institutions, les pays/régions, les revues sources, les références citées, les mots-clés, les résumés et des attributs thématiques codés manuellement. Cette approche permet au manuscrit de décrire les schémas de croissance de publication et de collaboration tout en examinant si les preuves cliniques et la recherche mécanistique se développent en tant que flux translationnels connectés ou comme des corpus parallèles faiblement liés.

Source de données et stratégie de recherche

La source de données était la Web of Science Core Collection (WoSCC), sélectionnée car elle fournit des enregistrements de citations standardisés, des mots-clés d’auteur, des affiliations institutionnelles, des champs pays/régions, des références citées et des formats d’exportation compatibles avec VOSviewer et CiteSpace. La recherche a couvert les dossiers disponibles jusqu’au 31 décembre 2025. La récupération et l’exportation des données étaient effectuées simultanément pour réduire l’instabilité causée par les mises à jour de la base de données.

La requête exacte de recherche thématique exécutée dans WoSCC était :

TS=(« Tongxie Yaofang » OU « Tong Xie Yao Fang » OU « Tongxie-Yaofang » OU « Formule Tongxie » OU « TXYF ») ET (« colite ulcéreuse » OU « UC »))

Les résultats de recherche se limitaient aux articles et critiques en anglais. Les résumés de conférences, éditoriaux, lettres, corrections, critiques de livres et documents sans informations bibliographiques suffisantes étaient exclus. Ces restrictions étaient appliquées pour maintenir la cohérence des métadonnées pour la construction du réseau ; cependant, la conception WoSCC uniquement en anglais est reconnue dans la Discussion comme une limitation importante de la récupération plutôt qu’une preuve de l’absence de travaux cliniques en langue chinoise.

Pour des raisons de reproductibilité, tous les enregistrements WoSCC éligibles ont été exportés en enregistrements complets avec références citées. Les descripteurs restrictifs tels que clinique, mécanisme, pharmacologie réseautique, voie de signalisation, microbiote ou essai n’ont pas été ajoutés à la requête initiale. Après la récupération, les enregistrements étaient filtrés manuellement et codés par titre, résumé et, si nécessaire, texte intégral. Les champs géographiques étaient standardisés avant la visualisation : les enregistrements d’affiliation de Taïwan, Hong Kong et Macao étaient considérés comme des registres régionaux de la Chine pour le comptage au niveau des pays et n’étaient pas interprétés comme des pays souverains distincts.

Critères d’éligibilité et sélection de la littérature

Pour garantir une grande pertinence entre la littérature incluse et le sujet de recherche, et pour améliorer la précision et l’interprétabilité des résultats ultérieurs de l’analyse des graphes de connaissances, cette étude a établi des critères clairs d’inclusion et d’exclusion avant l’analyse formelle et a procédé à un tri progressif de la littérature récupérée à l’aide de procédures standardisées. Le processus global de sélection comprenait quatre étapes : la déduplication des documents, le premier filtrage des titres et résumés, la re-sélection du texte intégral et la détermination de l’inclusion finale (voir Figure 1 pour le flux de travail détaillé). Après une récupération systématique et un dépistage progressif, un total de 133 articles ont finalement été inclus dans l’analyse bibliométrique de cette étude.

Concernant les critères d’inclusion, cette étude a principalement sélectionné la littérature répondant aux exigences suivantes : premièrement, le sujet de recherche doit explicitement inclure Tongxie Yaofang et la colite ulcéreuse, ce qui signifie que Tongxie Yaofang et la colite ulcéreuse servent toutes deux de sujets de recherche centrals plutôt que simplement mentionnées dans des sections de contexte ou de discussion. Deuxièmement, le type de littérature doit être strictement limité aux articles ou revues officiellement publiés afin d’assurer l’exhaustivité des informations bibliographiques et des données de citation. Troisièmement, la langue de la littérature doit être limitée à l’anglais afin d’améliorer la cohérence des sources de données et de répondre aux exigences fondamentales de l’analyse bibliométrique internationale. Quatrièmement, les archives de littérature doivent contenir des informations de métadonnées relativement complètes, incluant le titre, l’auteur, la revue source, le résumé, les mots-clés et les détails des citations, permettant ainsi une analyse collaborative de réseau ultérieure, une analyse de cooccurrence de mots-clés et une analyse de co-citation.

Les critères d’exclusion incluent principalement les catégories suivantes : premièrement, les documents de littérature en double ; Deuxièmement, les études qui ne sont pas directement liées aux thèmes de la Tongxie Yaofang (formule antidouleur) ou de la colite ulcéreuse, comme celles qui ne discutent que d’autres formulations de la médecine traditionnelle chinoise ou se concentrent sur les maladies inflammatoires générales de l’intestin sans référence explicite à la Tongxie Yaofang ; Troisièmement, les résumés de conférences, éditoriaux, lettres de lecteurs, erta, critiques de livres et autres documents académiques informels dépourvus de structures de recherche complètes ; Quatrièmement, les documents contenant des informations bibliographiques incomplètes ou des résumés valides et des citations de base indisponibles ; Cinquièmement, la littérature où Tongxie Yaofang n’est pas le sujet principal de recherche malgré les correspondances de termes de recherche, ou la colite ulcéreuse, n’est pas le principal sujet de la maladie. Grâce à ces critères, l’étude vise à minimiser les interférences de la littérature non ciblée et des matériaux à faible contenu informationnel sur les résultats de la recherche.

Le processus de sélection de la littérature a été mené selon une approche hiérarchique progressive. Premièrement, tous les enregistrements originaux importés des bases de données étaient transférés vers des logiciels de gestion de la littérature et des tableurs, où les informations sur le titre, l’auteur, l’année et la revue étaient vérifiées, et les duplicatas étaient supprimées. Par la suite, la phase initiale de sélection des titres et résumés a été lancée, chaque titre et résumé étant examinés indépendamment selon des critères d’inclusion/exclusion prédéfinis afin d’exclure préliminairement les documents qui ne répondaient clairement pas aux exigences thématiques. Par la suite, les documents conservés ont fait l’objet d’un réexamen intégral du texte afin d’évaluer si leurs sujets, leur contenu et leurs thèmes centraux étaient réellement centrés sur la « formule de soulagement de la douleur pour le traitement de la colite ulcéreuse », tout en vérifiant également la conformité aux exigences de classification des types de littérature et aux exigences de complétude des métadonnées.

Les définitions opérationnelles étaient appliquées avant le codage. Les études de preuves cliniques étaient définies comme des dossiers dont l’objectif principal était d’évaluer l’efficacité, la sécurité, la récidive, le changement de symptômes, l’activité de la maladie, la qualité de vie, les résultats du syndrome de la MTC, les marqueurs inflammatoires, les résultats endoscopiques, histologiques ou d’autres critères cliniques. Les études mécanistes étaient définies comme des enregistrements dont le but principal était d’expliquer l’action du TXYF via la pharmacologie en réseau, le docking moléculaire, la dynamique moléculaire, la prédiction des cibles, les modèles animaux, la validation cellulaire, l’analyse du microbiote, les multi-omiques, la signalisation inflammatoire, la régulation immunitaire, la réparation de la barrière épithéliale, le stress oxydatif, l’apoptose, la mitophagie ou des voies apparentées. Les études translationnelles ou de transition étaient définies comme des dossiers reliant l’évaluation clinique à la mesure mécanistique, à la synthèse des preuves, à la cartographie des biomarqueurs ou à la validation expérimentale d’une manière pouvant orienter la conception des essais cliniques.

Extraction des données et classification thématique

Après avoir terminé le tri de la littérature et sélectionné finalement 133 publications cibles, cette étude a mené une extraction structurée et une organisation des informations bibliographiques pertinentes afin d’établir la base de données pour l’analyse ultérieure des graphes de connaissances. L’extraction des données englobait principalement trois composantes : les informations de base sur la littérature, les détails des citations et les données thématiques des attributs. Les informations de base sur la littérature comprenaient le titre, l’auteur, l’année de publication, la revue source, le pays/région, l’institution, le type de document et le résumé. Les données de citation comprenaient la fréquence de citation, les références, les mots-clés et les mots-clés de l’auteur. Les informations thématiques sur les attributs ont été utilisées pour la stratification du contenu de recherche et l’analyse comparative, couvrant les sujets de recherche, les méthodologies, les modèles et les orientations thématiques principales.

Les attributs thématiques ont été extraits en plus des champs bibliométriques standards. Pour chaque dossier, les auteurs ont codé le type d’étude dominant, le modèle ou méthode principal, le focus clinique ou mécanistique principal, et si l’étude reliait directement les résultats au niveau du mécanisme aux critères cliniques. Les documents ambigus étaient classés selon l’objectif principal indiqué dans le titre, le résumé et les méthodes, plutôt que par de brèves énoncés de discussion spéculative.

Le codage clinique des critères d’arrêt a été affiné en critères de jugement rapportés par les patients (PRO) et objectifs de jugement. Les PRO comprenaient la diarrhée, les douleurs abdominales, la fréquence des selles, l’amélioration globale des symptômes, la qualité de vie et les scores du syndrome de la MTC. Les critères objectifs comprenaient les indices d’activité de la maladie, les marqueurs inflammatoires, les mesures endoscopiques ou de cicatrisation muqueuse, l’histologie, la récidive, les événements de sécurité, les profils microbiotes, les indicateurs de barrière épithéliale, les cytokines, les phénotypes des cellules immunitaires et les biomarqueurs des voies.

Les études combinant la prédiction de la pharmacologie en réseau avec la validation animale, cellulaire, microbiote ou moléculaire ont été codées comme des études mécanistes si l’élucidation des mécanismes était l’objectif principal. Les études portant sur l’observation de l’efficacité mais ne mentionnant les mécanismes possibles que dans la discussion ont été codées comme des études de preuves cliniques. Les protocoles ou enregistrements de synthèse des preuves qui tentaient explicitement d’intégrer l’évaluation des effets cliniques avec l’exploration des mécanismes étaient codés comme des études translationnelles/ponts.

Analyse bibliométrique et visualisation

L’analyse bibliométrique a été réalisée avec un logiciel de tableur, VOSviewer et CiteSpace ; le tableau des matériaux rapporte les champs de version/identifiant et signale les éléments nécessitant la confirmation de l’auteur à partir des journaux d’analyse originaux. Des logiciels de tableur étaient utilisés pour les vérifications en double, les statistiques descriptives, le nombre annuel de publications, la classification par type de recherche et la préparation de tableaux sources. VOSviewer a été utilisé pour construire des réseaux de co-occurrence en co-auteur, institutionnels, pays/région, revues et mots-clés. CiteSpace était utilisé pour l’analyse de co-citations, la détection de clusters, l’interprétation de la timeline et la détection de mots-clés en rafale.

L’analyse de co-citation a été utilisée pour identifier les modules de base de connaissances cités à plusieurs reprises par les études TXYF-UC. Les clusters ont été interprétés manuellement en lisant des titres représentatifs, des résumés et des contextes de références citées, en portant attention aux mécanismes inflammatoires de la CU, aux preuves d’intervention sur les composés de la MTC, aux études sur le microbiote intestinal et la barrière muqueuse, ainsi qu’aux méthodes de pharmacologie computationnelle.

Le prétraitement des mots-clés comprenait la consolidation des synonymes, la standardisation orthographique, la normalisation des cas, la suppression de termes non informatifs et l’harmonisation de concepts biologiques équivalents. La cooccurrence de mots-clés et les analyses temporelles ont ensuite été utilisées pour identifier les principaux points chauds de recherche et les frontières émergentes, notamment la signalisation inflammatoire, les preuves cliniques de la MTC, les interactions microbiote-métabolisme, la pharmacologie computationnelle et la régulation de l’immunité de la barrière.

La cartographie clinique contre mécaniste combinait la classification thématique avec des clusters de mots-clés et des domaines de terminaison codés. La comparaison a examiné six domaines : le contrôle des symptômes, la réponse inflammatoire, la réparation de la barrière intestinale, le microbiote intestinal, la régulation immunitaire et la progression de la maladie.

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Résultats

Sélection de la littérature et caractéristiques générales de publication

Basée sur des stratégies de recherche établies et des critères de dépistage, cette étude a finalement inclus 133 articles en anglais relatifs à l’utilisation de la formule Tongxieyao dans le traitement de la colite ulcéreuse, formant l’échantillon fondamental pour l’analyse ultérieure des graphes de connaissances. Dans l’ensemble, ce domaine est passé de premières explora...

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Discussion

Cette étude fournit une carte structurée de la littérature anglophone WoSCC sur TXYF pour l’UC et montre que le domaine s’est rapidement développé depuis 2020. Le corpus cartographié est dirigé par la Chine, concentré institutionnellement et de plus en plus orienté vers les mécanismes. Les preuves cliniques restent visibles mais relativement moins standardisées, tandis que les travaux mécanistes sont devenus plus denses autour de NF-kB/NLRP3, MAPK/AKT, IL-10RA/NF-kB, le remodelage du mic...

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

Remerciements

Les auteurs remercient sincèrement le département de pharmacie de l’hôpital populaire de Dongtai pour son soutien institutionnel et un environnement académique pour ce travail bibliométrique. Les auteurs remercient également les collègues qui ont aidé à la recherche de littérature, à la vérification des données et à la discussion des manuscrits. Aucun financement externe spécifique ni subvention n’a été signalé pour cette étude.

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
CiteSpaceChaomei Chen, Drexel Universityhttps://citespace.podia.com/Analyse de cocitation, analyse de regroupement, visualisation chronologique et détection de mots-clés en rafale.
Microsoft ExcelMicrosoft Corporationhttps://www.microsoft.com/en-in/microsoft-365/ExcelNettoyage des données, vérification des doublons, statistiques descriptives, décompte annuel des publications, classification par type de recherche et préparation de tableaux.
VOSviewerCentre for Science and Technology Studies, Leiden Universityhttps://www.vosviewer.com/Construction et visualisation de réseaux de co-occurrence d'auteurs, d'institutions, de pays, de revues et de mots-clés.
Web of Science Core CollectionClarivate Analyticshttps://clarivate.com/academia-government/scientific-and-academic-research/research-discovery-and-referencing/web-of-science/web-of-science-core-collection/Base bibliographique principale utilisée pour extraire des articles et des revues en langue anglaise sur le Tongxie Yaofang et la colite ulcéreuse.

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