Streptococcus agalactiae (Streptococcus du groupe B, GBS) est un pathobionte bactérien à Gram positif qui colonise plusieurs sites polymicrobiens, notamment les voies gastro-intestinales et vaginales. Bien que la colonisation vaginale soit généralement asymptomatique, pendant la grossesse, le GBS peut remonter du tractus vaginal vers l'utérus et traverser des membranes intactes, provoquant une infection du liquide amniotique et du placenta. Il constitue donc un facteur de risque majeur d'événements indésirables pendant la grossesse, d'infection fœtale et de maladie néonatale1,2. En tant que cause principale d'infection invasive chez les nouveau-nés, il est essentiel de caractériser les facteurs influençant le risque de transmission et d'infection. La prophylaxie antibiotique intrapartum peut réduire la transmission verticale et la maladie à GBS précoce chez les nouveau-nés3,4 ; toutefois, elle a été associée à une augmentation des taux de résistance aux antibiotiques ainsi qu'à des effets potentiellement à long terme liés à l'administration prénatale ou précoce d'antibiotiques5,6,7,8. Ces facteurs rendent nécessaire le développement d'interventions préventives et thérapeutiques plus ciblées.
Des preuves émergentes ont démontré que la composition du microbiome et les interactions polymicrobiennes influencent l'homéostasie et la probabilité de développer une maladie9. La dominance du SGB dans le microbiome vaginal humain a été associée à une diminution de l'abondance de Lactobacillus, et des interactions spécifiques au niveau des espèces et des souches ont été observées , pouvant avoir divers effets sur la colonisation in vitro et in vivo10,11. Précédemment, notre groupe de recherche a mis au point un modèle murin de colonisation vaginale par le SGB afin d'étudier les corrélats bactériens et de l'hôte liés à la capacité d'adaptation du SGB12. Ce modèle consiste à traiter les souris par une dose unique de 17β-estradiol, suivie d'une inoculation intravaginale de SGB le jour suivant. Ce modèle a été utilisé pour caractériser l'importance des protéines de surface du SGB, des réseaux de signalisation régulateurs et de la sécrétion de toxines dans le maintien de la colonisation et l'invasion des tissus du tractus génital féminin. De plus, nous avons constaté que le SGB présente des interactions complexes avec d'autres bactéries du tractus vaginal, notamment Akkermansia muciniphila et Enterococcus faecalis13,14,15, illustrant ainsi la manière dont le mode de vie et la persistance du SGB sont influencés par la présence de microbes voisins.
Bien que ce modèle existant ait été adapté pour étudier les interactions interbactériennes, des modifications supplémentaires ont été nécessaires pour étudier d'autres micro-organismes. Les champignons constituent une composante peu étudiée du microbiome vaginal, et grâce au modèle présenté ici, nous avons cherché à développer un outil permettant d'étudier la colonisation fongique ainsi que les interactions fongi-bactériennes in vivo. Le champignon le plus fréquemment isolé du tractus vaginal humain est Candida albicans, qui colonise plus de 70 % des individus16. C. albicans est polymorphe et peut subir une morphogenèse en passant d'une forme levurienne bourgeonnante à des morphotypes filamenteux. La filamentation est associée à un répertoire particulier d'expression génique17,18. Certaines de ces gènes spécifiques aux hyphes ont récemment été signalées comme conférant un avantage de fitness dans le contexte d'une colonisation polymicrobienne19,20,21.
Plusieurs études ont signalé l'isolement simultané de C. albicans et GBS dans des prélèvements vaginaux humains, et notre groupe de recherche a récemment découvert que les individus colonisés par C. albicans présentent des taux de portage de GBS significativement plus élevés22. Nous avons développé un in vivo système permettant d'étudier les interactions tripartites entre les champignons commensaux, les bactéries et l'hôte. Les études sur les champignons chez des souris conventionnelles nécessitent généralement un traitement antibiotique afin de surmonter la résistance à la colonisation médiée par les bactéries et d'établir une colonisation persistante23. Pour y parvenir sans perturber la capacité de colonisation du GBS, nous traitons les souris avec un cocktail d'antibiotiques, puis nous les inoculons avec C. albicans, et une fois la colonisation établie, nous supprimons l'exposition à l'antibiotique afin de permettre à GBS de coloniser ultérieurement. Ce protocole a été optimisé de manière à ce que les deux C. albicans et le SGB colonisent le tractus vaginal avec des charges similaires et selon des chronologies comparables, permettant des interactions directes dans le tractus vaginal. Ce protocole décrit une méthode pour préparer des souris à l’aide d’antibiotiques, puis administrer 17β-estradiol, établir une colonisation avec les champignons et les bactéries, puis prélever des échantillons de lavage et de tissus pour des analyses ultérieures.