Cette étude a été approuvée par le comité d'éthique de l'hôpital Zhangjiakou First (numéro d'approbation : 2024-KY-18). Tous les participants ont été informés des objectifs de l'étude et des risques éventuels, et ont donné leur consentement éclairé par écrit avant leur inclusion. Des échantillons de sang veineux ont été prélevés chez des sujets témoins sains lors d'examens médicaux de routine et chez des patients présentant une lésion médullaire (SCI) immédiatement après leur admission à l'hôpital. Les analyses en laboratoire ont été réalisées par le laboratoire clinique de l'hôpital. Les outils de recherche utilisés dans ce protocole sont énumérés dans la Table des matériels.
1. Sujets
Un total de 75 patients présentant une lésion médullaire ont été recrutés à l'hôpital Zhangjiakou First entre janvier 2023 et janvier 2025. Les critères d'inclusion étaient une lésion médullaire confirmée par tomodensitométrie (CT) ou imagerie par résonance magnétique (MRI), ainsi qu'un délai entre le traumatisme et l'admission à l'hôpital inférieur ou égal à 12 h. Les critères d'exclusion étaient un antécédent de traumatisme ou de chirurgie de la moelle épinière ou du cerveau au cours des 6 mois précédents, une maladie cardiovasculaire sévère incluant un infarctus du myocarde ou une arythmie, une grossesse ou une période de lactation, ainsi que la présence de tumeurs malignes, une atteinte hépatique ou rénale, une maladie cérébrovasculaire sévère ou des maladies infectieuses.
Selon les normes de classification neurologique de l'American Spinal Injury Association (ASIA)26, 75 patients présentant une lésion médullaire ont été classés en fonction de leur fonction neurologique normale (n = 21), lésion médullaire incomplète (n = 36) et lésion médullaire complète (n = 18). La répartition des sites de lésion était la suivante : cervical, 36,0 % ; thoracique, 30,7 % ; et lombaire, 33,3 %. Trente individus sains appariés à la population étudiée ont été recrutés aléatoirement pour constituer le groupe témoin. Des informations cliniques de base ont été recueillies pour tous les participants. Les critères d'inclusion pour les individus sains étaient l'absence d'antécédents de traumatisme médullaire ou cérébral, de chirurgie ou de troubles neurologiques ; l'absence d'antécédents de maladies inflammatoires chroniques, de troubles auto-immuns ou de malignités ; l'absence de maladie cardiovasculaire, hépatique ou rénale sévère ; l'absence d'infection aiguë ou chronique au cours des 4 semaines précédentes ; l'absence de grossesse ou d'allaitement ; et un appariement par âge et sexe avec le groupe présentant une lésion médullaire.
La mesure d'indépendance fonctionnelle (FIM) a été utilisée pour évaluer l'autonomie fonctionnelle dans les activités quotidiennes. Le score FIM maximal est de 126. Les scores de sensation tactile, d'acmésthésie et moteur ont été utilisés pour évaluer les fonctions sensorielle et motrice. Les scores maximaux de sensation tactile et d'acmésthésie étaient de 112, et le score moteur maximal était de 100. Des scores plus faibles indiquent un déficit neurologique plus sévère.
2. Culture cellulaire, construction du modèle et transfection
Les cellules microgliales murines immortalisées BV2 ont été obtenues auprès du Centre de ressources cellulaires de l'Institut de biotechnologie de Shanghai. Les cellules ont été cultivées dans un milieu de culture modifié d'Eagle (DMEM) à haute teneur en glucose, complété avec 10 % de sérum bovin fœtal (FBS), de pénicilline (100 U/mL) et de streptomycine (100 U/mL). Les cellules ont été maintenues à 37 °C dans un incubateur humidifié contenant 5 % de CO₂.
Pour la construction du modèle, les cellules BV2 ont été stimulées avec 0, 10, 20, 50, 100, 150 ou 200 ng/mL de lipopolysaccharide (LPS) pendant 24 h. La concentration optimale de LPS a été sélectionnée en fonction des résultats expérimentaux.
Pour la transfection, les cellules BV2 ont été ensemencées dans des plaques de 6 puits et transfectées une fois qu'elles ont atteint la confluence appropriée. Un réactif de transfection a été utilisé à raison de 1,5 µL par puits selon les instructions du fabricant. Après 6 h, le milieu de culture a été remplacé par du milieu frais, et les cellules ont été cultivées pendant 24 h supplémentaires. Le construct de silençage de LINC00707, le contrôle négatif correspondant, l'oligonucléotide miR-145-5p et l'oligonucléotide contrôle correspondant ont chacun été utilisés à une concentration de 50 nM par puits. Toutes les expériences de transfection ont été répétées indépendamment au moins 5 fois, avec 3 réplicats parallèles par expérience indépendante. Les données ont été analysées statistiquement à l'aide des résultats d'au moins 5 expériences indépendantes.
3. ELISA
Les surnageants de culture de cellules BV2 transfectées et stimulées par le LPS ont été recueillis par centrifugation à 12 000 × g pendant 10 min, et les concentrations d'interleukine-1β (IL-1β), d'IL-6 et de facteur de nécrose tumorale-α (TNF-α) ont été mesurées à l'aide des kits ELISA correspondants. Brièvement, le test a été réalisé en incubant successivement avec un anticorps biotinylé, un conjugué streptavidine-HRP et un substrat TMB, conformément aux instructions du fabricant. L'absorbance a été mesurée à 450 nm à l'aide d'un lecteur de microplaques. Les concentrations en cytokines ont été déterminées à partir de courbes standards. Chaque échantillon a été mesuré en triplets, et six expériences indépendantes ont été réalisées.
4. Mesure des ERO
Les niveaux intracellulaires d'espèces réactives de l'oxygène (ERO) dans les cellules BV2 stimulées par le LPS ont été mesurés à l'aide d'un kit de dosage des espèces réactives de l'oxygène. Brièvement, les cellules ont été incubées avec 10 µmol/L de DCFH-DA à 37 °C pendant 20 min. Après l'incubation, le surnageant a été éliminé et les cellules ont été lavées 3 fois avec une solution saline tamponnée au phosphate (PBS) afin d'éliminer l'excès de sonde extracellulaire. L'intensité de fluorescence a été mesurée à l'aide d'un lecteur de microplaque aux longueurs d'onde d'excitation et d'émission de 488 nm et 525 nm, respectivement. Les niveaux relatifs d'ERO ont été calculés à partir de l'intensité de fluorescence. Tous les échantillons ont été analysés en triplicata, et l'ensemble de l'expérience a été répété de manière indépendante au moins 5 fois.
5. Détection du malondialdéhyde, de la superoxyde dismutase et du glutathion
Les cellules BV2 traitées ont été recueillies et des homogénats cellulaires ont été préparés. Les échantillons ont été centrifugés à 12 000 × g pendant 10 min à 4 °C afin d'obtenir le surnageant. Des kits de détection commerciaux pour le malondialdéhyde (MDA), la superoxyde dismutase (SOD) et le glutathion (GSH) ont été utilisés conformément aux instructions du fabricant afin de déterminer leurs concentrations dans les surnageants cellulaires. Tous les échantillons ont été analysés en triple, et l'ensemble de l'expérience a été répété de manière indépendante au moins 5 fois.
6. Essai rapporteur double luciférase
Des fragments de la région non traduite 3' (3' UTR) de LINC00707 et de TRAF6 contenant les sites de liaison prévus pour miR-145-5p, ainsi que les séquences mutantes correspondantes, ont été clonés dans le vecteur rapporteur luciférase pmirGLO afin de générer des constructions rapporteuses de type sauvage (WT-LINC00707 et WT-TRAF6) et mutantes (MUT-LINC00707 et MUT-TRAF6). Les cellules BV2 ont été co-transfectées avec les constructions rapporteuses et des oligonucléotides miR-145-5p, puis cultivées pendant 24 h. Les cellules ont ensuite été récoltées, et les activités de la luciférase de luciole et de la luciférase Renilla ont été mesurées à l’aide d’un lecteur de microplaques.
7. RT-qPCR
L'ARN total a été extrait à l'aide d'un réactif d'extraction d'ARN. La qualité de l'ARN a été évaluée à partir du rapport OD₂₆₀/OD₂₈₀, les valeurs comprises entre 1,8 et 2,0 étant considérées comme acceptables. Environ 1 µg d'ARN total a été transcrit en ADN complémentaire (ADNc) à l'aide d'un kit de transcription inverse. L'expression génique a été quantifiée par RT-qPCR en utilisant un mélange maître PCR SYBR Green. La transcription inverse a été réalisée à 42 °C pendant 15 min, suivie d'une inactivation de la transcriptase inverse à 95 °C pendant 3 min. L'ADNc synthétisé a été stocké à −20 °C jusqu'à l'analyse. La PCR quantitative en temps réel a été effectuée avec une étape de pré-dénaturation à 95 °C pendant 1 min, suivie de 40 cycles de dénaturation à 95 °C pendant 5 s et d'hybridation et extension à 60 °C pendant 15 s. Les signaux de fluorescence ont été collectés à la fin de chaque étape d'hybridation et d'extension. Une analyse de la courbe de fusion a été réalisée à 95 °C pendant 15 s, suivie de 60 °C pendant 1 min. Les niveaux d'expression relatifs ont été calculés selon la méthode 2⁻ΔΔCt. GAPDH ou 5S a été utilisé comme référence interne pour la normalisation de l'expression génique. Les séquences des amorces étaient les suivantes : LINC00707, amorce sens 5'-CCAACAGGGTATCAGAATTCTC-3' et amorce antisens 5'-TGCTGACAATAGCCATTAGG-3' ; miR-145-5p, amorce sens 5'-GCCGAGGTCCAGTTTTCCCA-3' et amorce antisens 5'-CTCAACTGGTGTCGTGGA-3' ; TRAF6, amorce sens 5'-ATTACAACTGAGGTGCTTCT-3' et amorce antisens 5'-GCATCTGGTTCTGTTATAGGA-3' ; GAPDH, amorce sens 5'-ATCCCATCACCATCTTCCAGG-3' et amorce antisens 5'-CGCCCCACTTGATTTTGG-3' ; et 5S, amorce sens 5'-TCGTCTGATCTCGGAAGCTAA-3' et amorce antisens 5'-AAGCCTACAGCACCCGGTAT-3'.
8. Analyse statistique
Les analyses statistiques ont été réalisées à l'aide d'un logiciel statistique. La normalité de la distribution des données a été évaluée à l'aide du test de Shapiro-Wilk, un seuil de P > 0,05 indiquant une distribution normale. Les données normalement distribuées ont été exprimées sous la forme moyenne ± écart-type (ET), tandis que les données non normalement distribuées ont été présentées sous la forme médiane (P25, P75). Pour les variables continues à distribution normale, les comparaisons entre deux groupes ont été effectuées à l'aide du test t de Student, et les comparaisons entre plusieurs groupes ont été réalisées à l'aide d'une ANOVA à un facteur suivie du test post hoc de Tukey. Pour les données non normalement distribuées, le test de Mann-Whitney U a été utilisé pour les comparaisons à deux groupes, et le test de Kruskal-Wallis a été utilisé pour les comparaisons entre plusieurs groupes. Le test du chi-deux a été employé pour analyser les variables catégorielles entre les groupes. Des analyses de régression logistique univariée et multivariée ont été utilisées afin d'évaluer les facteurs cliniques associés à l'expression de LINC00707. Les variables continues ont été dichotomisées selon la médiane de la cohorte (groupe à valeur élevée = 1 ; groupe à valeur basse = 0). Les variables présentant une valeur de P < 0,05 dans l'analyse de régression logistique univariée ont été intégrées dans l'analyse de régression logistique multivariée. Les résultats ont été exprimés sous forme de rapports de cotes (odds ratios, OR) avec des intervalles de confiance à 95 % (IC 95 %), un OR > 1 indiquant une association positive et un OR < 1 une association négative. Toutes les expériences sur les phénotypes cellulaires ont inclus au moins quatre réplicats biologiques indépendants, avec trois réplicats techniques par réplicat biologique. Une valeur de P < 0,05 a été considérée comme statistiquement significative.