Cette étude rétrospective monocentrique analyse des isolats non redondants de Pseudomonas aeruginosa (PA) provenant des années 2023 à 2025 et examine les tendances de résistance avant et après une intervention de bon usage des antimicrobiens en quatre composantes dans la Resp-TB.
Article de recherche
Tendances de la résistance de Pseudomonas aeruginosa après une intervention de bon usage des antimicrobiens en quatre dimensions
* These authors contributed equally
Dans cet article
Résumé
Résumé
Cette étude rétrospective monocentrique a analysé des isolats non redondants de Pseudomonas aeruginosa recueillis à l'Hôpital municipal des maladies infectieuses de Huaian entre 2023 et 2025. Au total, 121 isolats uniques ont été inclus, dont 83,5 % provenaient de crachats. Le test de sensibilité aux antimicrobiens (AST) a été réalisé à l’aide d’un système automatisé de microbiologie, et les résultats de concentration minimale inhibitrice (CMI) ont été interprétés selon les recommandations du CLSI M100, 33e édition. Début 2024, une intervention ciblée de stewardship antimicrobien basée sur un lien en quatre dimensions a été mise en œuvre dans le service de pneumologie et tuberculose (Resp-TB) (n = 97), comprenant : (1) une surveillance dynamique de la résistance aux antimicrobiens avec un retour trimestriel ; (2) une prescription d’antimicrobiens stratifiée par niveau de risque fondée sur les données locales de sensibilité ; (3) des protocoles normalisés de prélèvement d’échantillons ; et (4) des mesures renforcées de prévention et de contrôle des infections. Dans le service Resp-TB, les taux globaux de résistance étaient de 74,19 % en 2023, 81,63 % en 2024 et 82,93 % en 2025, sans réduction significative après l’intervention (p ≈ 0,37). En 2025, la résistance à la tobramycine était de 0/41 (0,00 %), à la cefepime de 1/41 (2,44 %) et à la pipéracilline-tazobactam de 0/41 (0,00 %) ; la résistance à la lévofloxacine atteignait 15/41 (36,59 %). La résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole est restée élevée tout au long de la période d’étude. Ces résultats montrent une persistance de la résistance aux antimicrobiens dans le service Resp-TB après la mise en œuvre de l’intervention, tandis que la résistance à certains agents sélectionnés, notamment la tobramycine, la cefepime et la pipéracilline-tazobactam, est restée faible en 2025.
Introduction
Pseudomonas aeruginosa (PA) est une cause majeure d'infections nosocomiales et l'une des bacilles à Gram négatif non fermentescents les plus fréquemment isolées en pratique clinique1. Sa résistance intrinsèque et acquise à de nombreux antimicrobiens est associée à une faible perméabilité de la membrane externe, à une surexpression des pompes d'efflux et à la production d'enzymes dégradant les médicaments. Sous pression de sélection par les antibiotiques, PA peut facilement acquérir de nouveaux phénotypes résistants2,3. Ces dernières années, l'augmentation des souches de PA multirésistantes (MDR) et extrêmement résistantes (XDR) a réduit les options thérapeutiques et a été associée à une hospitalisation prolongée ainsi qu'à une mortalité accrue4,5,6,7. L'approche « Une seule santé » (One Health), qui reconnaît l'interconnexion entre la santé humaine, animale et environnementale, est de plus en plus préconisée comme un cadre important pour la prévention et la maîtrise de la résistance aux antimicrobiens4,6. Dans ce contexte, les données locales de surveillance de la résistance aux antimicrobiens, telles que les tendances de résistance de PA rapportées ici, peuvent aider à orienter les stratégies de bon usage des antimicrobiens et de contrôle des infections.
Ces défis sont particulièrement pertinents dans les hôpitaux spécialisés en maladies infectieuses. Les patients atteints de tuberculose reçoivent souvent un traitement anti-tuberculeux à long terme pouvant inclure des fluoroquinolones, ce qui augmente le risque de résistance croisée à des agents tels que la lévofloxacine et complique la prise en charge des co-isolats de PA8,9. De plus, l'état d'immunodépression et les séjours hospitaliers prolongés au sein de cette population de patients peuvent accroître la susceptibilité aux isolats de PA multirésistants ainsi que s'associer à des résultats cliniques moins favorables10,11.
De nombreuses études de surveillance antérieures ont utilisé des dénombrements totaux d'isolats sans tenir compte des biais potentiels causés par des prélèvements répétés sur le même patient. L'Organisation mondiale de la Santé Système mondial de surveillance de la résistance aux antimicrobiens (WHO GLASS) et l'Institut de normalisation en sciences cliniques et biologiques (CLSI) recommandent des stratégies de dédoublement afin d'améliorer la précision des données, telles que la conservation du seul premier isolat par patient et par épisode d'infection12.
Bien que la résistance antimicrobienne du PA soit une préoccupation mondiale bien établie, les données sur les interventions ciblées de bon usage des antimicrobiens dans les services respiratoires spécialisés pour la tuberculose (Resp-TB) restent limitées. La plupart des études existantes se concentrent sur les unités de soins intensifs ou les services respiratoires généraux, laissant un vide quant à la manière dont des interventions structurées et pluridimensionnelles se comportent dans des contextes à forte prévalence de tuberculose et à antécédents complexes d'exposition aux antibiotiques. Cette étude rétrospective monocentrique a analysé des isolats de PA non redondants recueillis à l'Hôpital municipal des maladies infectieuses de Huaian entre 2023 et 2025, en portant une attention particulière au Resp-TB. Nous avons émis l'hypothèse que des modifications des profils de résistance antimicrobienne du PA seraient observées après la mise en œuvre d'une intervention ciblée de bon usage des antimicrobiens en quatre dimensions, comprenant une surveillance dynamique, une prescription stratifiée par risque, un prélèvement standardisé des échantillons et un renforcement de la prévention et du contrôle des infections. L'étude visait à décrire les tendances locales de résistance et à évaluer si ces données pouvaient soutenir les pratiques de bon usage des antimicrobiens et de contrôle des infections dans cet hôpital.
Protocole
Les informations relatives aux échantillons des isolats de Pseudomonas aeruginosa recueillis entre 2023 et 2025 ont été obtenues à partir de la base de données de laboratoire de l'Hôpital populaire n°4 de Huai’an. Tous les échantillons ont été anonymisés avant l'analyse et traités conformément aux protocoles approuvés par le Comité d'éthique de l'Hôpital populaire n°4 de Huai’an (n° d'approbation : HASY2024011).
Sujets de l'étude et critères d'inclusion
Cette étude rétrospective monocentrique a inclus des isolats cliniques de Pseudomonas aeruginosa (PA) recueillis par le laboratoire de microbiologie de l'hôpital des maladies infectieuses de Huaian entre janvier 2023 et décembre 2025. Les isolats étaient éligibles s'ils avaient été formellement identifiés comme étant des PA à l'aide d'un système automatisé de microbiologie utilisant une carte d'identification GN et s'ils présentaient des résultats complets et lisibles de tests de sensibilité aux antimicrobiens (AST). Les échantillons provenaient principalement de prélèvements respiratoires, notamment des crachats et des lavages broncho-alvéolaires, mais des isolats provenant d'autres sites ont également été inclus.
La procédure de déduplication a suivi strictement le principe « un patient – un isolat par année civile » et a été appliquée en deux étapes. Premièrement, au sein de chaque année civile, lorsque plusieurs isolats de PA étaient identifiés chez le même patient, appariés par nom, seul le premier isolat cliniquement significatif était conservé pour l'analyse de cette année. Deuxièmement, sur plusieurs années civiles, un patient ayant des hospitalisations distinctes et des isolats de PA correspondants sur plusieurs années était considéré comme une observation indépendante dans chaque cohorte annuelle. Ainsi, le même patient pouvait théoriquement être inclus dans plusieurs cohortes annuelles. Cette règle est conforme au principe de déduplication de l'OMS GLASS/CLSI13.
Les critères d'exclusion étaient les isolats répétés provenant du même patient au cours de la même année civile, les informations incomplètes sur le patient et les résultats de l'AST techniquement illisibles, tels qu'une croissance anormale dans les puits témoins positifs. Les isolats présentant des profils de sensibilité aux antimicrobiens incomplets ont été exclus des analyses spécifiques à l'antibiotique correspondant, et le nombre réel d'isolats testés (n) a été indiqué pour chaque antibiotique. Un total de 121 patients avec 121 isolats de PA ont été inclus : 31 en 2023, 49 en 2024 et 41 en 2025. Figure 1 présente le schéma du plan d'étude.
Pour les prélèvements respiratoires, une évaluation standard de la qualité en laboratoire a été appliquée. Les échantillons de crachats ont été évalués selon les critères de Murray–Washington, qui exigent <10 cellules épithéliales squameuses et >25 leucocytes polynucléaires par champ à faible grossissement afin de garantir la validité du prélèvement. Tous les isolats provenaient de prélèvements cliniques soumis à des fins diagnostiques courantes chez des patients présentant une infection suspectée. Toutefois, en raison de la conception rétrospective de l'étude et de l'absence de données cliniques de corrélation systématiques, incluant les signes et symptômes, les résultats d'imagerie, les marqueurs inflammatoires et la réponse au traitement, une distinction formelle entre infection réelle et colonisation n'a pas été établie pour chaque isolate. Par conséquent, le terme neutre « isolats cliniques » est utilisé tout au long du texte pour désigner des micro-organismes possédant une signification clinique potentielle, sans affirmer que chaque isolate représentait nécessairement une infection authentique.
Regroupement des données
Les données ont été stratifiées par année, par département et par origine des prélèvements. Pour la comparaison longitudinale, les isolats ont été regroupés par année : 2023, 2024 et 2025. Pour l'analyse par département, les isolats ont été répartis comme suit : Resp-TB (n = 97/121, 80,17 %), service des Maladies digestives et hépatologie (n = 12/121, 9,92 %), service des Maladies infectieuses (n = 5/121, 4,13 %) et autres départements (n = 7/121, 5,79 %). Le groupe Resp-TB constituait la cohorte principale d'observation. Les origines des prélèvements ont été regroupées en : crachats, liquide de lavage bronchoalvéolaire et autres sources, afin de quantifier la contribution des prélèvements respiratoires.
Culture microbien, identification et test de sensibilité aux antimicrobiens
Les isolats ont été cultivés sur gélose au sang de mouton à 5 %, gélose de MacConkey et gélose au soja tryptique avec de la bacitracine, à 35–37 °C pendant 18–24 h. L'identification présomptive était basée sur la morphologie des colonies et un test oxydase positif. L'identification définitive et les tests de sensibilité aux antimicrobiens (AST) ont été réalisés à l'aide d'un système automatisé de microbiologie utilisant des cartouches GN pour l'identification et des cartouches AST-N399 pour la sensibilité. Des suspensions bactériennes ont été préparées à une concentration correspondant à l'étalon de McFarland 0,50–0,63 dans du sérum physiologique stérile, conformément aux instructions du fabricant. Un total de 10 agents antimicrobiens a été testé : la tobramycine, le cefépime, le pipéracilline-tazobactam, l'amikacine, le méropénème, l'imipénème, la gentamicine, le cefazoline, la lévofloxacine et le triméthoprime-sulfaméthoxazole. Ces agents ont été choisis en fonction du panel AST habituel du laboratoire, des antimicrobiens couramment utilisés pour les infections à P. aeruginosa dans l'établissement, ainsi que des agents pris en compte dans l'intervention de bon usage des antimicrobiens en quatre dimensions. Les résultats ont été interprétés selon les recommandations du CLSI M100, 33e édition14. Les résultats intermédiaires ont été classés comme résistants lors du calcul des taux de résistance.
Contrôle de qualité
Afin de garantir la reproductibilité et la précision, un contrôle de qualité quotidien de l'AST a été effectué à l'aide de la souche de référence Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853. La souche a été testée contre le même panel d'antimicrobiens afin de confirmer que les concentrations minimales inhibitrices (CMI) se situaient dans les plages recommandées par le CLSI. Si les résultats du contrôle qualité sortaient des limites acceptables, le lot de tests était rejeté et ne pouvait être renouvelé qu'après recalibrage du système automatisé de microbiologie et vérification de l'intégrité des réactifs.
Intervention ciblée en quatre dimensions dans la tuberculose respiratoire
À partir de janvier 2024, une intervention ciblée d'optimisation de l'utilisation des antimicrobiens, appelée « liaison en quatre dimensions », a été mise en œuvre dans le Resp-TB. L'intervention a été coordonnée par le directeur du service, des médecins spécialistes des maladies infectieuses, des pharmaciens cliniciens et du personnel dédié à la prévention et au contrôle des infections (PCI). Elle comprenait quatre composantes.
Premièrement, une surveillance dynamique de la résistance aux antimicrobiens et un système de retour ont été mis en place. Un système d'alerte précoce au niveau des services a été établi pour la résistance du *Pseudomonas aeruginosa* (PA), et les évolutions des profils de résistance ont été résumées dans des rapports trimestriels afin d'éclairer les décisions en matière de bon usage des antimicrobiens. Deuxièmement, un programme de bon usage des antimicrobiens fondé sur une stratification des risques a été mis en œuvre, en se basant sur les données locales de sensibilité. Le parcours prescriptif en niveaux privilégiait les agents présentant des taux de résistance constamment faibles, notamment la tobramycine et la cefépime, comme options empiriques ; préconisait la prudence avec les agents dont la résistance augmentait ou était élevée, tels que la lévofloxacine ; et excluait la triméthoprime-sulfaméthoxazole, dont l'activité intrinsèque contre le PA est médiocre. Ces mesures s'appuyaient sur les données locales d'antibiogramme et sur les politiques institutionnelles de bon usage des antimicrobiens, sans constituer des recommandations cliniques formelles.
Troisièmement, la collecte des échantillons respiratoires a été standardisée. Les patients ont reçu pour instruction de prendre une profonde inspiration, de se racler la gorge et de recueillir les crachats conformément au protocole de laboratoire. Cette procédure visait à réduire la contamination oropharyngée et à améliorer la fiabilité des tests de sensibilité pour les prélèvements des voies respiratoires inférieures. Quatrièmement, les mesures de prévention et de contrôle des infections ont été renforcées. Elles comprenaient des vérifications régulières du respect de l'hygiène des mains avant et après tout contact avec les patients, des procédures strictes de manipulation et d'élimination des sécrétions respiratoires, ainsi qu'une désinfection environnementale planifiée afin de réduire le risque de propagation intrahospitalière du PA. À des fins d'évaluation, la période de l'étude a été divisée en une période préintervention (janvier 2023 à décembre 2023) et une période postintervention (janvier 2024 à décembre 2025).
Analyse statistique
Les données ont été saisies deux fois et vérifiées. Les taux de résistance ont été exprimés en pourcentages avec des intervalles de confiance à 95 % (IC). Les comparaisons annuelles, par département et avant par rapport à après l'intervention ont été analysées à l'aide du test χ2 de Pearson ; le test exact de Fisher a été utilisé lorsque les fréquences attendues étaient <5. Le test χ2 de Cochran-Armitage a été utilisé pour l'analyse des tendances. Les p-values ajustées sont indiquées lorsque pertinent. Pour la comparaison principale entre 2023 et 2025 portant sur les 10 antibiotiques, une correction de Bonferroni a été appliquée pour ajuster le seuil de significativité (α = 0,05/10 = 0,005). Une p-value bilatérale < 0,05 a été considérée comme statistiquement significative pour les comparaisons non ajustées ; les p-values ajustées sont indiquées lorsque pertinent. Les détails relatifs aux logiciels sont fournis dans le Tableau des matériaux.
Résultats
Répartition générale des souches et des patients
Sur la base des critères d'étude et de la stratégie de regroupement décrits ci-dessus, un total de 121 isolats non redondants de PA provenant de 121 patients ont été inclus dans l'analyse (Figure 1). La répartition annuelle était de 31 isolats en 2023, 49 en 2024 et 41 en 2025 (Table 1). L'expectoration constituait la principale source d'échantillons, représentant 83,5 % de tous les prélèvements (Figure 2). Le service de pneumologie-TB a fourni la proportion la plus élevée d'isolats (n = 97/121, 80,17 %), suivi du service de gastro-entérologie et hépatologie (n = 12/121, 9,92 %), du service des maladies infectieuses (n = 5/121, 4,13 %) et d'autres services (n = 7/121, 5,79 %) (Table 2 et Figure 2).
La proportion d'échantillons de crachats est restée relativement stable tout au long de la période d'étude : 82,9 % en 2023, 83,5 % en 2024 et 83,0 % en 2025. Le liquide de lavage bronchoalvéolaire et les prélèvements au prélèvement protégé représentaient ensemble environ 7,6 % des échantillons, tandis que le sang, l'urine et les autres types d'échantillons représentaient les 8,9 % restants. Ces résultats indiquent que les isolats de PA dans cet hôpital étaient principalement concentrés dans les échantillons respiratoires.
Dans l'ensemble, les isolats de PA étaient concentrés parmi les patients du groupe Resp-TB et parmi les prélèvements respiratoires. Cette répartition appuyait le choix du groupe Resp-TB comme cohorte principale pour évaluer l'intervention ciblée décrite ci-dessus.
Tendances annuelles de la résistance aux antimicrobiens de Pseudomonas aeruginosa dans l'hôpital
D'après le protocole de SCA décrit ci-dessus, les profils annuels de résistance antimicrobienne du PA sont résumés dans Tableau 1 et Figure 3. En raison des taux de sensibilité et d'intermédiaires dans Tableau 1 sont des mesures sommaires pondérées, des comparaisons formelles ont été effectuées au niveau de chaque antimicrobien individuel. Les valeurs de p obtenues sont présentées dans Tableau 3 pour la comparaison entre 2023 et 2025. Le test de Pearson χ2 le test ou le test exact de Fisher n'ont montré aucune différence statistiquement significative après correction de Bonferroni (toutes les p ajustées < 0,05) > 0.05; Tableau 3).
Le taux de résistance pondéré était inférieur de 4,25 points de pourcentage en 2025 par rapport à 2023, tandis que le taux de sensibilité pondéré a augmenté de 4,25 points de pourcentage sur la même période. Toutefois, ces mesures synthétiques doivent être interprétées de manière descriptive, car elles regroupent des résultats provenant de plusieurs agents antimicrobiens. Les tendances spécifiques à chaque antibiotique sont donc rapportées séparément dans le Tableau 3.
Le taux intermédiaire a légèrement augmenté en 2025 après une valeur plus faible en 2024. Ce changement doit être interprété avec prudence, car les résultats intermédiaires peuvent varier selon l'agent antimicrobien et ont été classés comme résistants pour les calculs du taux de résistance. Dans l'ensemble, la résistance du PA est restée une préoccupation en matière de surveillance tout au long de la période d'étude, soulignant la nécessité d'une bonne utilisation continue des antimicrobiens ainsi que de la prévention et du contrôle des infections.
Profils de résistance aux principaux antibiotiques
En s'appuyant sur les données de DST décrites ci-dessus, des profils de résistance divergents parmi les 10 agents antimicrobiens testés ont été observés au cours de la période de trois ans, comme indiqué dans le Tableau 3 et illustré dans la Figure 4 et la Figure 5. Quatre profils descriptifs de résistance ont été identifiés.
Premièrement, la résistance à la tobramycine, à la cefépime et à la pipéracilline-tazobactam a diminué au cours de la période d'étude. La résistance à la tobramycine est passée de 3,23 % en 2023 à 0,00 % en 2025, celle à la cefépime de 12,90 % à 2,44 %, et celle à la pipéracilline-tazobactam de 9,68 % à 0,00 %. En 2025, les trois agents présentaient des taux de résistance faibles dans cet ensemble de données (Figure 4). Deuxièmement, la résistance à l'amikacine est restée faible, oscillant entre 0,00 % et 4,08 % sur les trois années. Troisièmement, la résistance aux carbapénèmes a augmenté en 2024, puis a diminué en 2025. La résistance au méropénème est passée de 9,68 % en 2023 à 18,37 % en 2024, puis a diminué à 12,20 % en 2025. La résistance à l'imipénème est passée de 12,90 % à 24,49 %, puis a diminué à 17,07 %. Ces résultats indiquent un pic transitoire de résistance aux carbapénèmes en 2024. Quatrièmement, la résistance aux fluoroquinolones est restée préoccupante. La résistance à la ciprofloxacine est restée élevée tout au long de la période d'étude, et la résistance à la lévofloxacine a augmenté de 16,13 % en 2023 à 36,59 % en 2025. La résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole est restée constamment élevée (>79 %) sur les trois années. Les comparaisons annuelles des taux de résistance pour chaque antibiotique sont illustrées dans Figure 5.
Dans l'ensemble, ces résultats montrent des profils hétérogènes de résistance spécifiques aux antibiotiques chez les isolats de PA dans cet établissement. L'augmentation de la résistance à la lévofloxacine et la persistance d'une résistance élevée au triméthoprime-sulfaméthoxazole soutiennent la nécessité d'une surveillance continue dans le cadre de la bonne utilisation des antimicrobiens.
Analyse comparative des taux de résistance antimicrobienne dans trois services clés
En fonction de la stratification par département décrite ci-dessus, les taux de résistance dans les trois principaux départements sont résumés dans le Tableau 2 et la Figure 6. La TB respiratoire était la cible principale de l'intervention et a présenté un taux de résistance élevé tout au long de la période d'étude : 74,19 % en 2023 (23/31, IC 95 % : 55,39–85,78 %), 81,63 % en 2024 (40/49, IC 95 % : 67,98–89,76 %) et 82,93 % en 2025 (34/41, IC 95 % : 67,94–91,18 %). Aucune réduction statistiquement significative n'a été observée (test de tendance linéaire de Cochran-Armitage, Z = 0,89, p ≈ 0,37 ; test exact de Fisher pour 2023 par rapport à 2025, p ≈ 0,37). Ces résultats ne soutiennent pas une association temporelle claire entre l'intervention et une réduction de la résistance au niveau départemental.
Le service des maladies infectieuses a compté quelques isolats au cours de la période d'étude (n = 5). Les taux correspondants étaient de 6,45 % en 2023 (2/31), de 4,08 % en 2024 (2/49) et de 2,44 % en 2025 (1/41). En raison du faible nombre d'isolats, ces résultats doivent être interprétés avec prudence et ne se prêtent pas à une analyse robuste des tendances.
Le service de gastro-entérologie et d'hépatologie a également comptabilisé un petit nombre d'isolats (n = 12). Les taux rapportés étaient de 0,00 % en 2023, de 55,56 % en 2024 et de 0,00 % en 2025. Cette fluctuation reflète probablement la petite taille des échantillons annuels, dans lesquels un faible nombre d'isolats résistants peut fortement influencer les estimations en pourcentage.
Dans l'ensemble, le Resp-TB a représenté la majorité des isolats de PA et a conservé des taux de résistance élevés tout au long de la période d'étude. Les petits groupes départementaux avaient des tailles d'échantillons limitées, ce qui réduit la fiabilité des comparaisons entre départements. Les tendances départementales annuelles sont présentées dans Figure 6.
Intervention ciblée dans la tuberculose respiratoire
Après la mise en œuvre de l'intervention ciblée à quatre dimensions en janvier 2024, la proportion départementale signalée pour la Resp-TB n’a pas diminué comme prévu (Figure 6). La valeur signalée était de 74,19 % en 2023, 81,63 % en 2024 et 82,93 % en 2025, sans réduction statistiquement significative (test de tendance linéaire de Cochran–Armitage, Z = 0,89, p ≈ 0,37 ; test exact de Fisher pour 2023 par rapport à 2025, p ≈ 0,37 ; Tableau 2 et Figure 6). À titre descriptif, les valeurs annuelles départementales ont été tracées en parallèle avec des valeurs de référence multicentriques chinoises et internationales provenant de rapports de surveillance antérieurs (Figure 7)15,16. Ces valeurs de référence externes sont présentées uniquement à titre informatif et ne sont pas directement comparables avec le jeu de données actuel, car les études diffèrent par leurs définitions de la résistance, leurs populations de patients, leurs stratégies d’échantillonnage, leurs procédures de dédoublement des isolats et leurs panneaux d’antimicrobiens. Par conséquent, Figure 7 ne doit pas être interprétée comme illustrant une réduction significative, une réduction cumulative, une convergence vers une référence externe, l’atteinte d’un objectif ou l’efficacité de l’intervention.
Les profils spécifiques aux antibiotiques variaient. La résistance à la tobramycine est restée faible, aucune souche résistante n'ayant été détectée en 2025. La résistance au cefepime a diminué, passant de 12,90 % en 2023 à 2,44 % en 2025. En revanche, la résistance à la lévofloxacine a augmenté, passant de 5/31 (16,13 %) en 2023 à 11/49 (22,45 %) en 2024 et à 15/41 (36,59 %) en 2025, malgré la restriction de l'utilisation de la lévofloxacine dans le cadre de l'intervention. Cette augmentation pourrait refléter une pression sélective croisée exercée par les régimes antituberculeux contenant des fluoroquinolones, bien que l'absence de données sur les prescriptions limite l'évaluation directe de l'effet de l'intervention sur les comportements prescripteurs. La résistance au triméthoprime-sulfaméthoxazole est restée constamment élevée : 96,77 % en 2023, 79,59 % en 2024 et 92,68 % en 2025.
Dans l'ensemble, la proportion annuelle au niveau du service dans le Resp-TB est restée élevée tout au long de la période d'étude, et les données disponibles n'ont pas mis en évidence de diminution clairement associée à l'intervention. Néanmoins, les résultats spécifiques aux antibiotiques — notamment la faible résistance à la tobramycine et au cefepime, ainsi que l'augmentation de la résistance à la lévofloxacine — pourraient orienter la poursuite de la surveillance locale de la résistance aux antimicrobiens et du suivi du bon usage des antibiotiques. Étant donné que cette étude ne disposait pas de données sur la consommation d'antibiotiques au niveau des patients, de services témoins contemporains ni d'ajustement pour les changements dans la composition des cas de patients, aucune relation de cause à effet entre l'intervention en quatre dimensions et les profils de résistance observés ne doit être déduite.
Résumé des résultats par rapport à l'hypothèse de l'étude
Cette étude émettait l'hypothèse qu'une mise en œuvre de l'intervention ciblée de bon usage des antimicrobiens en quatre dimensions serait associée à une réduction de la résistance du Pseudomonas aeruginosa dans la Resp-TB. Toutefois, le taux de résistance au niveau du service n'a pas diminué après l'intervention : 74,19 % en 2023, 81,63 % en 2024 et 82,93 % en 2025, sans réduction statistiquement significative (test de tendance linéaire de Cochran-Armitage, Z = 0,89, p ≈ 0,37 ; Tableau 2 et Figure 6). Ces résultats ne soutiennent pas l'hypothèse de l'étude au niveau du service. Les tendances spécifiques aux antibiotiques variaient, avec une faible résistance à la tobramycine, à la cefépime et au pipéracilline-tazobactam en 2025, tandis que la résistance à la lévofloxacine augmentait jusqu'à 36,59 % (Tableau 3, Figure 4 et Figure 5).
DISPONIBILITÉ DES DONNÉES :
Les jeux de données brutes à l'origine de toutes les figures et tableaux de cet article sont fournis sous forme de Tableau supplémentaire S1, Tableau supplémentaire S2 et Tableau supplémentaire S3.
Figure 1. Schéma général de la conception de l'étude. Ce schéma résume la collecte des échantillons, la culture, l'identification bactérienne, les tests de sensibilité aux antimicrobiens, le contrôle qualité, la suppression des doublons, le moment de l'intervention et l'évaluation des résultats dans cette étude de surveillance rétrospective monocentrique. Des échantillons respiratoires et d'autres échantillons cliniques ont été cultivés ; l'identification présomptive était basée sur la morphologie des colonies et le test de l'oxydase, tandis que l'identification définitive et les tests de sensibilité (AST) ont été réalisés à l'aide d'un système automatisé de microbiologie. Les résultats de la CMI ont été interprétés selon les recommandations du CLSI M100, 33e édition. Un contrôle qualité quotidien a été effectué avec Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853. Une règle de dédoublonnage d'un isolat par patient et par année civile a été appliquée. La période préintervention correspond à l'année 2023, et la période postintervention s'étend de 2024 à 2025. Abréviations : AST = test de sensibilité aux antimicrobiens ; CLSI = Institut de normalisation en biologie clinique et en laboratoire ; CMI = concentration minimale inhibitrice. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure 2. Composition des isolats de Pseudomonas aeruginosa selon le type d'échantillon et le service, 2023–2025. Cette figure montre la répartition des isolats selon la source de l'échantillon et le service clinique. (A) Nombre et proportion d'isolats selon la source de l'échantillon, incluant les crachats, le LBA, le sang, les urines et d'autres sources. (B) Nombre et proportion d'isolats selon le service clinique. Abréviations : LBA = liquide de lavage broncho-alvéolaire ; GI-Hép = service de gastro-entérologie et d'hépatologie ; MI = service des maladies infectieuses ; Resp-TB = service de pneumologie et de tuberculose. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure 3. Profil annuel de sensibilité aux antimicrobiens des isolats de Pseudomonas aeruginosa, 2023–2025. Les barres indiquent les proportions annuelles de résultats résistants, sensibles et intermédiaires pour les agents antimicrobiens testés. Les comparaisons statistiques formelles spécifiques aux antibiotiques sont fournies dans le Tableau 2. Abréviations : I = intermédiaire ; R = résistant ; S = sensible. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure 4. Taux de résistance de Pseudomonas aeruginosa aux principaux agents antimicrobiens en 2025. Les antibiotiques sont classés par taux de résistance en 2025. La ligne de référence en pointillés indique le taux de résistance global pondéré pour les agents antimicrobiens testés. Aucune catégorie de recommandation clinique n'est sous-entendue. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure 5. Taux annuels de résistance de Pseudomonas aeruginosa à cinq agents antimicrobiens sélectionnés, 2023–2025. Les barres illustrent les taux annuels de résistance à la tobramycine, au cefepime, au pipéracilline-tazobactam, à la lévofloxacine et au triméthoprime-sulfaméthoxazole. Les comparaisons statistiques formelles sont indiquées dans le Tableau 2 et décrites dans la section Résultats. Abréviation : PA = Pseudomonas aeruginosa. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure 6. Répartition annuelle des isolats de Pseudomonas aeruginosa par service, 2023–2025. Le graphique compare la proportion annuelle d'isolats provenant de trois services cliniques. La ligne continue rouge représente le service Resp-TB, le service cible de l'intervention. La ligne pointillée bleue représente le service des maladies infectieuses. La ligne en pointillés jaune représente le service de gastro-entérologie et d'hépatologie. Abréviations : ID = service des maladies infectieuses ; Resp-TB = service de pneumologie et de tuberculose. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure 7. Présentation descriptive des valeurs annuelles départementales comparées aux valeurs de référence externes de résistance aux antimicrobiens. La figure présente de manière descriptive les valeurs annuelles rapportées pour le service Resp-TB, ainsi que les valeurs de référence provenant d'une étude de surveillance multicentrique chinoise et d'une étude internationale réalisée dans des hôpitaux tertiaires15,16. La ligne rouge continue indique la valeur annuelle pour le Resp-TB. La barre grise représente l'année 2023, tandis que les barres bleues représentent les années 2024 et 2025. La ligne verte en pointillés indique la valeur de référence multicentrique chinoise, et la ligne violette en tirets indique la valeur de référence internationale. Ces valeurs de référence externes sont fournies uniquement à titre descriptif et ne peuvent pas être directement comparées aux données actuelles, car les études sous-jacentes diffèrent par leurs définitions de la résistance, leurs populations étudiées, leurs stratégies d'échantillonnage, leurs procédures de dédoublement des isolats et leurs panels d'antimicrobiens. Par conséquent, cette figure ne doit pas être interprétée comme démontrant une réduction statistiquement significative, une réduction cumulative, une convergence vers une référence externe, l'atteinte d'un objectif prédéfini ou l'efficacité de l'intervention. Abréviations : PA = Pseudomonas aeruginosa ; Resp-TB = Service de pneumologie et de tuberculose. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
| Indicateur | 2023 (n=31) | 2024 (n=49) | 2025 (n=41) | Tendance |
| Nombre de patients/isolats | 31/31 | 49/49 | 41/41 | Augmentation initiale suivie d'une diminution |
| Taux de sensibilité global (%) | 46,31 | 47,6 | 50,56 | Augmentation continue |
| Taux intermédiaire (%) | 7,26 | 5,62 | 8,3 | Légère fluctuation |
| Taux de résistance (%) | 46,44% | 46,78% | 41,14% | Légère fluctuation |
Tableau 1 : Profil global de sensibilité aux antimicrobiens des isolats non dupliqués de Pseudomonas aeruginosa, 2023–2025. Le tableau résume les pourcentages annuels pondérés de résultats de TSA classés comme résistants, sensibles et intermédiaires pour les agents antimicrobiens testés. Ces pourcentages récapitulatifs sont descriptifs et ne proviennent pas d’un dénominateur binomial unique ; par conséquent, les valeurs-p de χ2 de Pearson ne sont pas applicables à ce niveau de synthèse. Les comparaisons statistiques spécifiques à chaque antibiotique sont fournies dans le Tableau 2. Abréviations : TSA = test de sensibilité aux antimicrobiens ; I = intermédiaire ; R = résistant ; S = sensible. Il s’agit de mesures descriptives pondérées, et non de taux de résistance par patient.
| Département | 2023 (N=31) | 2024 (N=49) | 2025 (N=41) | Total (N=121) |
| Département tuberculose respiratoire | 23/31 (74.19%) | 40/49 (81.63%) | 34/41 (82.93%) | 97 (80.17%) |
| Digestif & ; Service d'Hépatologie | 4/31 (12.90%) | 5/49 (10.20%) | 3/41 (7.32%) | 12 (9.92%) |
| Département des maladies infectieuses | 2/31 (6.45%) | 2/49 (4.08%) | 1/41 (2.44%) | 5 (4.13%) |
| Autres | 2/31 (6.45%) | 2/49 (4.08%) | 3/41 (7.32%) | 7 (5.79%) |
| Total | 31/31 (100.00%) | 49/49 (100.00%) | 41/41 (100.00%) | 121 (100.00%) |
Tableau 2 : Répartition des isolats de Pseudomonas aeruginosa par département, 2023–2025. Les valeurs sont exprimées en n/N (%), où n correspond au nombre d'isolats provenant du département et de l'année précisés, et N au nombre total d'isolats cette année-là. L'unité d'analyse est l'isolat après application de la règle de dédoublonnage un-patient–un-isolat-par-année-calendrier. Le service Resp-TB constituait la cohorte principale d'observation pour l'intervention ciblée à quatre dimensions. Abréviations : GI-Hep = service de gastro-entérologie et d'hépatologie ; ID = service des maladies infectieuses ; PA = Pseudomonas aeruginosa ; Resp-TB = service de pneumologie et de tuberculose.
| Agent antimicrobien | 2023 (N=31) | 2024 (N=49) | 2025 (N=41) | Valeur P* |
| Tobramycine | 1/31 (3,23) | 1/49 (2,04) | 0/41 (0,00) | ns |
| Céfépime | 4/31 (12,90) | 3/49 (6,12) | 1/41 (2,44) | ns |
| Pipéracilline/Tazobactam | 3/31 (9,68) | 3/49 (6,12) | 0/41 (0,00) | ns |
| Lévofloxacine | 5/31 (16,13) | 11/49 (22,45) | 15/41 (36,59) | ns |
| Triméthoprime/Sulfaméthoxazole | 30/31 (96,77) | 39/49 (79,59) | 38/41 (92,68) | ns |
| Méropénème | 3/31 (9,68) | 9/49 (18,37) | 5/41 (12,20) | ns |
| Imipénème | 4/31 (12,90) | 12/49 (24,49) | 7/41 (17,07) | ns |
| Gentamicine | 2/31 (6,45) | 6/49 (12,24) | 2/41 (4,88) | ns |
| Amikacine | 0/31 (0,00) | 2/49 (4,08) | 1/41 (2,44) | ns |
| Céfazoline | 6/31 (19,35) | 10/49 (20,41) | 4/41 (9,76) | ns |
Tableau 3 : Taux annuels de résistance de Pseudomonas aeruginosa à 10 agents antimicrobiens, 2023–2025. Les valeurs sont exprimées sous la forme R/n (%), où R représente le nombre d'isolats résistants et n le nombre d'isolats testés pour chaque agent antimicrobien et chaque année. Les valeurs de p comparent 2023 à 2025 à l'aide du test exact de Fisher. Le seuil de significativité ajusté selon Bonferroni était fixé à α = 0,005. Les intervalles de confiance à 95 % ont été calculés selon la méthode exacte de Clopper-Pearson. Les dénominateurs reflètent les effectifs annuels d'isolats dédupliqués, sauf lorsque des profils incomplets d'antibiotiques imposent des dénominateurs spécifiques à chaque antibiotique. La déduplication a été effectuée selon la règle d'un isolat par patient et par année civile, en conservant le premier isolat. Abréviations : CI = intervalle de confiance ; TMP-SMX = triméthoprime-sulfaméthoxazole. ns = non significatif.
Tableau supplémentaire S1 : Analyse des données de prélèvements bactériens en microbiologie ; période de déclaration : 1er janvier 2023 00:00:00 – 31 décembre 2023 23:59:59. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire S2 : Analyse des données de prélèvements bactériens en microbiologie ; période de déclaration : 1er janvier 2024 00:00:00 – 31 décembre 2024 23:59:59. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire S3 : Analyse des données de prélèvements bactériens en microbiologie ; période de déclaration : 1er janvier 2025 00:00:00 – 31 décembre 2025 23:59:59. Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Discussion
Le stewarding antimicrobien fondé sur la qualité des données de surveillance
Les méthodes traditionnelles de dénombrement d'isolats peuvent surestimer la résistance aux antimicrobiens en raison d'échantillonnages répétés provenant du même patient, particulièrement dans les unités où les patients subissent fréquemment des hospitalisations prolongées. L'utilisation d'une stratégie de déduplication consistant à ne retenir qu'un premier isolat par patient est conforme aux recommandations de l'OMS pour le système GLASS et permet de réduire ce biais potentiel17,18. Dans la présente étude, l'approche « un patient – un isolat par année civile » a permis d'évaluer les profils annuels de résistance du PA à l'aide d'un jeu de données centré sur le patient, plutôt que sur une accumulation d'isolats répétés. Néanmoins, puisqu'un même patient pourrait théoriquement être inclus dans plus d'une cohorte annuelle, les données doivent être interprétées comme une surveillance annuelle au niveau des isolats, et non comme une cohorte longitudinale de patients.
Après suppression des doublons, les profils de résistance aux antimicrobiens du PA ont été analysés à l'échelle de l'hôpital et comparés de manière descriptive au cours des trois années de l'étude. Le profil de résistance pondéré à l'échelle de l'hôpital a montré des changements modestes seulement entre 2023 et 2025, et les données disponibles n'ont pas mis en évidence de réduction significative de la résistance après la mise en œuvre de l'intervention en quatre dimensions. Les résultats actuels ne doivent donc pas être interprétés comme une preuve d'efficacité de l'intervention. Un effet différé de la maîtrise des antimicrobiens reste possible, car les modifications des comportements prescripteurs, de la consommation d'antimicrobiens et de la pression sélective peuvent nécessiter plus d'un cycle clinique avant de devenir mesurables19,20. Des études antérieures ont signalé des réductions progressives de la résistance du PA après des interventions combinées de maîtrise des antimicrobiens et de prévention des infections21,22. Toutefois, ces études ont été menées dans des environnements de soins différents et ont utilisé des populations de patients, des composantes d'intervention, des définitions de la résistance, des périodes d'observation et des critères de jugement différents. Leurs résultats doivent donc être comparés avec prudence à ceux de la présente étude rétrospective monocentrique.
Les rapports de surveillance externe ont été utilisés uniquement pour fournir un contexte descriptif des profils de résistance observés dans cet hôpital. Les données de surveillance CHINET en Chine ont signalé une diminution de la résistance du PA à l'imipénème et au méropénème d'ici 2024, tandis que d'autres études multicentriques et régionales ont également décrit des évolutions des résistances du PA au fil du temps23,24,25,26. En revanche, la présente étude a été menée dans un hôpital spécialisé en maladies infectieuses, où la majorité des isolats de PA provenaient de la TB-Resp. Les patients de ce service ont pu connaître une hospitalisation prolongée, des antécédents infectieux complexes, des maladies pulmonaires chroniques et des expositions répétées aux antimicrobiens, facteurs qui auraient pu influencer les profils de résistance observés. Une étude menée dans un hôpital tertiaire en Arabie saoudite a rapporté un taux de PA-MDR d'environ 37,5 %16, mais cette valeur ne peut être directement comparée aux résultats actuels en raison de différences dans la conception de l'étude, les caractéristiques des patients, les méthodes d'échantillonnage, les procédures de dédoublement, les définitions de la résistance et les panneaux d'antimicrobiens. Une prudence similaire s'impose lors de la comparaison des données actuelles avec des études longitudinales provenant d'autres régions27. Par conséquent, les valeurs de référence externes présentées dans la Figure 7 sont uniquement descriptives et ne doivent pas être interprétées comme une preuve de réduction significative, d'amélioration cumulative, de convergence vers une référence, d'atteinte d'un objectif ou d'efficacité d'une intervention.
L'augmentation transitoire de la résistance aux carbapénèmes en 2024 doit également être interprétée avec prudence. La résistance au méropénème est passée de 9,68 % en 2023 à 18,37 % en 2024, puis a diminué à 12,20 % en 2025. De même, la résistance à l'imipénème est passée de 12,90 % à 24,49 %, puis a diminué à 17,07 %. Ces fluctuations pourraient refléter des changements dans la pression de sélection antimicrobienne, la composition des cas de patients, l'utilisation empirique des carbapénèmes ou des dynamiques de transmission potentielles. Toutefois, la dissémination clonale, la production de carbapénémases, les modifications des porines, l'expression des pompes d'efflux et d'autres mécanismes moléculaires de résistance n'ont pas été directement étudiées. Par conséquent, ces mécanismes doivent être considérés comme des explications possibles déduites d'études antérieures28,29,30,31,32, et non comme des conclusions étayées par les données actuelles. Le nombre relativement faible d'isolats annuels pourrait également avoir amplifié les variations apparentes d'une année à l'autre des pourcentages de résistance.
Les trajectoires de résistance aux 10 agents antimicrobiens évalués ont révélé des profils hétérogènes spécifiques à chaque antibiotique. La résistance à la tobramycine, à la cefepime et à la pipéracilline–tazobactam a diminué au cours de la période d'étude et est restée faible en 2025. La résistance à la tobramycine et à la pipéracilline–tazobactam a atteint 0,00 % en 2025, tandis que celle à la cefepime a baissé à 2,44 %. La résistance à l'amikacine est également restée faible tout au long de la période d'étude, oscillant entre 0,00 % et 4,08 %. Ces résultats pourraient refléter les pratiques locales de prescription, les mesures de bon usage des antimicrobiens, les différences d'exposition aux antimicrobiens et les changements de pression sélective33,34. Toutefois, les données individuelles sur les prescriptions, les doses journalières définies, les jours de traitement, les indications thérapeutiques, les schémas posologiques et la durée des traitements n'étaient pas disponibles. Par conséquent, les modifications spécifiques à chaque antibiotique observées ne peuvent pas être attribuées de façon causale à l'intervention en quatre dimensions.
La résistance aux carbapénèmes a atteint un pic en 2024, puis a diminué en 2025. Ce schéma pourrait être associé à l'utilisation empirique de carbapénèmes chez des patients plus gravement malades, à des modifications des caractéristiques cliniques des patients hospitalisés, à une pression sélective des antimicrobiens ou à des facteurs de contrôle des infections non mesurés. La tolérance associée aux biofilms et d'autres mécanismes adaptatifs ont été décrits dans des études antérieures sur le PA35,36. Néanmoins, la présente étude n'incluait pas de tests sur les biofilms, de détection des carbapénémases, d'analyse moléculaire de la résistance, de séquençage complet du génome ni d'évaluation de la transmission clonale. Ces explications restent donc des hypothèses fondées sur la littérature et ne doivent pas être considérées comme des mécanismes démontrés dans la cohorte actuelle.
La résistance à la lévofloxacine a augmenté progressivement, passant de 16,13 % en 2023 à 22,45 % en 2024, puis à 36,59 % en 2025. Dans la tuberculose respiratoire (Resp-TB), les patients peuvent être exposés de manière prolongée ou répétée à des régimes antituberculeux contenant des fluoroquinolones, notamment la moxifloxacine et la lévofloxacine. Une telle exposition peut exercer une pression sélective croisée sur *P. aeruginosa* (PA) et d'autres pathogènes bactériens.37,38Cependant, la présente étude n’a pas recueilli de données individuelles sur les régimes antituberculeux, les antécédents d’exposition aux fluoroquinolones, les doses cumulées d’antimicrobiens, la durée du traitement ou l’observance thérapeutique. Par conséquent, il n’a pas été possible de tester une association directe entre un traitement antituberculeux contenant des fluoroquinolones et l’augmentation de la résistance à la lévofloxacine. La tendance observée doit être considérée comme un signal de surveillance nécessitant des investigations supplémentaires, plutôt que comme une preuve d’une relation causale confirmée.
La résistance au triméthoprime–sulfaméthoxazole est restée constamment élevée tout au long de la période d'étude, avec des taux de 96,77 % en 2023, de 79,59 % en 2024 et de 92,68 % en 2025. *Pseudomonas aeruginosa* (PA) présente une sensibilité intrinsèquement faible au triméthoprime–sulfaméthoxazole ; par conséquent, ces résultats ne doivent pas être interprétés de la même manière que la résistance acquise aux agents antipseudomonadiques habituellement actifs. Au contraire, ces résultats confirment la faible utilité du triméthoprime–sulfaméthoxazole dans le traitement ciblant *P. aeruginosa* et soulignent l'importance d'interpréter les résultats des tests de sensibilité aux antibiotiques dans le contexte des caractéristiques de résistance intrinsèque et des normes actuelles de détection de la sensibilité.
Le Resp-TB a été choisi comme cible principale de la surveillance et des interventions dirigées contre P. aeruginosa (PA) car il a représenté la proportion la plus élevée d'isolats durant la période d'étude. Les patients atteints de tuberculose pulmonaire peuvent présenter des lésions pulmonaires structurelles, une hospitalisation prolongée, des expositions répétées à des agents antimicrobiens, une réponse immunitaire altérée et de nombreuses maladies sous-jacentes, facteurs qui pourraient tous augmenter la susceptibilité à la colonisation ou à l'infection par le PA.39,40,41,42,43,44,45De plus, les services de tuberculose impliquent fréquemment la collecte et la manipulation d'échantillons respiratoires et de sécrétions, ainsi qu'un contact étroit entre patients, soignants et personnel de santé. Ces conditions peuvent favoriser une contamination environnementale et une transmission nosocomiale.46,47La forte concentration d'isolats de PA dans ce service justifie donc la poursuite de la surveillance de la résistance, de la collecte standardisée des prélèvements respiratoires, du nettoyage environnemental, de la gestion des sécrétions et du renforcement des pratiques d'hygiène des mains.
Dans les limites de cette étude rétrospective monocentrique, la proportion annuelle départementale signalée pour la Resp-TB n'a pas diminué après la mise en œuvre de l'intervention. Les valeurs rapportées étaient de 74,19 % en 2023, de 81,63 % en 2024 et de 82,93 % en 2025, sans réduction statistiquement significative (test de tendance linéaire de Cochran–Armitage, Z = 0,89, p ≈ 0,37). Ces valeurs décrivent la répartition annuelle départementale des isolats de PA et ne doivent pas être interprétées comme un taux direct de résistance spécifique à un antibiotique. Par conséquent, les résultats ne démontrent pas de réduction claire associée à l'intervention de la résistance du PA au niveau départemental. Néanmoins, le cadre en quatre composantes — surveillance dynamique de la résistance, prescription stratifiée par risque, collecte standardisée des échantillons et renforcement de la prévention et du contrôle des infections — pourrait fournir une structure pratique pour coordonner les activités de bon usage des antimicrobiens, de diagnostic microbiologique et de contrôle des infections autour des données de surveillance locales.
L'absence de réduction statistiquement significative n'indique pas nécessairement que chaque composant de l'intervention était dépourvu de valeur. La collecte standardisée des échantillons a pu améliorer la qualité et la représentativité des prélèvements respiratoires, tandis que les rapports de surveillance trimestriels ont pu accroître la sensibilisation des cliniciens aux profils de résistance locaux. L'hygiène des mains renforcée et la désinfection de l'environnement ont également pu soutenir les pratiques courantes de prévention des infections. Toutefois, le jeu de données rétrospectif actuel ne comprenait pas d'indicateurs de processus, tels que la consommation d'antimicrobiens, l'adéquation des prescriptions empiriques, le respect des protocoles de prélèvement, l'observance de l'hygiène des mains, les résultats des prélèvements environnementaux ou le délai jusqu'au traitement approprié. Par conséquent, la fidélité de la mise en œuvre et les effets indépendants des quatre composants de l'intervention n'ont pas pu être évalués.
Plusieurs orientations devraient être prioritaires dans les recherches futures. Premièrement, des études prospectives multicentriques avec des échantillons plus larges et des services témoins contemporains sont nécessaires pour valider les tendances de résistance observées et déterminer si des cadres de bon usage similaires s'appliquent dans différents contextes de soins. Deuxièmement, des données cliniques au niveau du patient doivent être intégrées, notamment les diagnostics, la gravité de l'infection, les comorbidités, l'exposition aux antimicrobiens, la durée du traitement, les résultats cliniques, ainsi que la distinction entre infection et colonisation. Troisièmement, la consommation d'antimicrobiens devrait être quantifiée à l'aide de mesures standardisées, telles que les doses journalières définies ou les jours de traitement, afin d'évaluer la relation entre les pratiques de prescription et la résistance ultérieure.
Les études futures devraient également intégrer des méthodes d'épidémiologie moléculaire. Le séquençage complet du génome, la détection des gènes de carbapénémase, l'analyse des altérations d'OprD et l'évaluation de l'expression des pompes d'efflux permettraient de clarifier les mécanismes sous-jacents à la résistance aux carbapénèmes et de déterminer si les changements temporels sont liés à un acquit de résistance indépendant ou à une transmission clonale. Un suivi longitudinal est nécessaire pour évaluer la durabilité des interventions ciblées dans les environnements à forte charge, tels que les services de pneumologie et de tuberculose. En outre, un cadre « Une seule santé » intégrant la surveillance environnementale des eaux usées hospitalières, des surfaces à haut contact, des équipements de soins respiratoires et des données régionales de résistance aux antimicrobiens pourrait aider à clarifier les implications plus larges pour la santé publique de la résistance locale du PA.
En conclusion, cette étude rétrospective monocentrique a utilisé une approche de déduplication d'un patient–un isolat par année civile pour décrire les profils de résistance aux antimicrobiens des isolats cliniques de PA recueillis entre 2023 et 2025. La proportion annuelle au sein du service rapportée pour la Resp-TB n’a pas diminué après la mise en œuvre de l’intervention ciblée en quatre dimensions, et les données disponibles n’ont pas mis en évidence de réduction de la résistance aux antimicrobiens associée à l’intervention. Des valeurs de référence externes ont été utilisées uniquement à des fins de contexte descriptif et n’étaient pas directement comparables en raison des différences dans les définitions de la résistance, les méthodes d’échantillonnage, les populations de patients, les procédures de déduplication et les panneaux d’antimicrobiens. Les profils spécifiques aux antibiotiques étaient hétérogènes : la résistance à la tobramycine, au cefepime et au pipéracilline–tazobactam est restée faible en 2025, tandis que la résistance à la lévofloxacine a augmenté et que la résistance au triméthoprime–sulfaméthoxazole est restée constamment élevée. Ces résultats soutiennent la poursuite de la surveillance locale de la résistance et du suivi du bon usage des antimicrobiens, en particulier dans la Resp-TB, qui a fourni la majorité des isolats de PA.
Cette étude présente plusieurs limites. Premièrement, la conception rétrospective monocentrique et la taille d'échantillon relativement faible (n = 121) ont limité la puissance statistique et la généralisabilité, en particulier pour les départements disposant de peu d'isolats. Deuxièmement, les données cliniques détaillées n'étaient pas systématiquement disponibles. Par conséquent, les isolats sont décrits comme des « isolats cliniques » plutôt que comme des infections confirmées, et une distinction formelle entre infection et colonisation n'a pas pu être établie. Troisièmement, les données relatives à la prescription et à la consommation d'antimicrobiens au niveau des patients n'étaient pas disponibles, ce qui limite l'évaluation de la relation entre l'intervention de stewardship, l'utilisation des antimicrobiens et les profils de résistance.
Quatrièmement, l'étude n'a pas inclus un service témoin contemporain et n'a pas utilisé un dispositif d'analyse de séries chronologiques interrompues. Par conséquent, il n'était pas possible de distinguer les changements temporels des tendances générales, des modifications dans la composition des patients ou d'autres activités concomitantes de contrôle des infections. Cinquièmement, les mécanismes moléculaires de résistance—y compris les gènes de carbapénémases, les altérations d'OprD, l'expression des pompes d'efflux, la tolérance associée aux biofilms et la transmission clonale—n'ont pas été étudiés. Sixièmement, la suppression des doublons s'appuyait sur les noms des patients et sur une règle d'un-patient–un-isolat-par-année-calendrier. Une mauvaise classification et l'inclusion répétée d'un même patient au cours d'années différentes ne peuvent donc être exclues.
Enfin, les phénotypes MDR et XDR n'ont pas été classés systématiquement dans ce jeu de données rétrospectif, et l'étude s'est concentrée sur les taux de résistance spécifiques aux antibiotiques plutôt que sur les phénotypes de résistance composés. Les indicateurs de processus reflétant la fidélité de l'intervention, notamment la consommation d'antimicrobiens, l'adéquation du traitement empirique, la conformité à l'hygiène des mains, les taux de rejet liés à la qualité des échantillons et l'efficacité de la désinfection environnementale, n'étaient pas non plus disponibles. De futures études prospectives multicentriques devraient utiliser des identifiants patients robustes, des définitions normalisées des MDR/XDR, des données au niveau des prescriptions, des témoins contemporains, des tests moléculaires et des périodes d'observation suffisamment longues afin de valider ces résultats et de déterminer la valeur à long terme des interventions ciblées de bon usage des antimicrobiens.
Déclarations de divulgation
Les auteurs n'ont aucun conflit d'intérêts à divulguer.
Remerciements
Nous remercions les membres de l'équipe pour leur soutien et leur contribution à cette expérience. Ce travail a été financé par le projet du Bureau des sciences et technologies de Huaian (subvention n° HAB2024030).
Matériaux
| Nom | Entreprise | Numéro de catalogue | Commentaires |
|---|---|---|---|
| Étalons de McFarland à 0,5 | bioMérieux, France | 21182 | Standardisation de l'inoculum |
| Agar au sang de mouton à 5 % | Thermo Fisher Scientific, USA | PKR01200 | Culture des prélèvements cliniques |
| Cartouche AST-N399 | bioMérieux, France | REF 423701 | Test de sensibilité aux antimicrobiens pour le panel antimicrobien |
| CLSI M100 (33e éd.) | CLSI, USA | M100-ED33 | Interprétation des seuils de résistance |
| Cartouche d'identification GN | bioMérieux, France | 21341 | Identification définitive des isolats Gram-négatif |
| GraphPad Prism | GraphPad Software, USA | Version 9.0 | Génération de figures |
| Agar MacConkey | Thermo Fisher Scientific, USA | R01552 | Différenciation des bactéries Gram-négatif |
| P. aeruginosa ATCC 27853 | ATCC, USA | ATCC 27853 | Souche de contrôle qualité quotidien |
| SPSS Statistics | IBM Corp., USA | Version 26.0 | Analyse statistique |
| Agar Tryptic Soya avec bacitracine | BD, USA | ICN1010617 | Culture sélective |
| Système VITEK 2 Compact | bioMérieux, France | V2COMPACT | Identification et AST automatisées |
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