L'électroacupuncture améliore la fonction cardiaque et atténue les lésions myocardiques chez les rats souffrant d'insuffisance cardiaque chronique
Pour évaluer les effets de l'EA sur l'IC, un modèle rat a été établi par ligature de l'artère coronaire antérieure descendante (LAD), suivie d'interventions spécifiques d'EA ou d'EA Sham. Des évaluations systématiques, incluant l'échocardiographie, des dosages biochimiques et des colorations histologiques, ont été réalisées (Figure 2A). Sur le plan fonctionnel, le groupe IC présentait une dilatation ventriculaire et une altération de la contractilité. Le traitement par EA a atténué les réductions du VESG et du VSSG observées chez les rats souffrant d'IC, tandis que le groupe EA Sham présentait des niveaux de fonction cardiaque comparables à ceux du groupe IC (Figure 2B et Figure 2C).
En outre, l'EA a réduit les taux sériques de NT-proBNP et de cTnT, indiquant une diminution de la charge cardiaque et une atténuation des lésions myocardiques. En revanche, le groupe EA Sham a présenté des paramètres biochimiques similaires à ceux du groupe IC (Figure 2E,F). L'analyse histologique a montré que le groupe IC présentait des lésions structurales myocardiques et une fibrose. Le traitement par EA a amélioré l'architecture myocardique et réduit la FVC, tandis que le groupe EA Sham conservait des modifications pathologiques et des taux de FVC comparables à ceux du groupe IC (Figure 2D). Dans l'ensemble, l'EA a exercé des effets cardioprotecteurs contre l'IC, alors que l'intervention EA Sham n'a pas produit d'effets thérapeutiques similaires.
L'électroacupuncture active les neurones du noyau du faisceau solitaire chez des rats présentant une insuffisance cardiaque chronique
Pour déterminer si le SNT médie la réponse centrale au traitement par EA, l'activation neuronale a été évaluée par marquage de la protéine c-Fos, un marqueur de l'excitation neuronale. L'imagerie en immunofluorescence (Figure 3A) et le comptage quantitatif des cellules (Figure 3B) ont révélé que le nombre de neurones positifs pour c-Fos dans le SNT était inférieur dans le groupe IC sévère par rapport au groupe faux opéré. Toutefois, le traitement par EA a augmenté l'expression de c-Fos à des niveaux comparables à la valeur de base du groupe faux opéré. Parallèlement aux résultats fonctionnels périphériques, le groupe faux traitement par EA a présenté des niveaux d'expression de c-Fos similaires à ceux du groupe IC sévère.
Afin d'évaluer l'état fonctionnel de ces neurones du SNT, des signaux électrophysiologiques in vivo ont été enregistrés. Les tracés de décharge des potentiels d'action (Figure 3C) et la fréquence moyenne de décharge quantitative (Figure 3D) étaient conformes aux résultats histologiques. La fréquence de décharge spontanée des neurones du SNT était réduite dans les conditions d'ICG. En revanche, l'intervention par EA augmentait la fréquence de décharge neuronale, tandis que la procédure d'EA factice ne provoquait aucun changement électrophysiologique de ce type.
Ce modèle d'activation neuronale a été confirmé par l'analyse du potentiel de champ local. Comme illustré dans les spectrogrammes colorés 2D du PCL et les cartes tridimensionnelles de densité spectrale de puissance (Figure 3E), l'énergie oscillatoire neuronale au sein du SNT a été atténuée durant l'état d'IC. Après le traitement par EA, une augmentation de l'intensité de puissance a été observée sur l'ensemble du spectre de fréquences neuronales, indiquant une activation du réseau, laquelle était absente dans le groupe témoin EA factice.
Afin d'examiner la pertinence physiologique de cette activation centrale, une analyse de corrélation de Pearson a été réalisée, intégrant des paramètres cardiaques périphériques à l'activité neuronale centrale du noyau du faisceau solitaire (NTS) (Figure 3F). L'analyse a montré que la fréquence moyenne de décharge et l'expression de c-Fos au sein du NTS étaient positivement corrélées avec la fraction d'éjection du ventricule gauche (LVEF). En revanche, ces indicateurs d'activité neuronale centrale présentaient une corrélation négative avec le marqueur sérique de l'insuffisance cardiaque NT-proBNP. Ces corrélations indiquent que l'activation neuronale du NTS modulée par l'EA est liée à son efficacité cardioprotectrice périphérique.
L'électroacupuncture modifie le profil protéomique global dans le noyau du faisceau solitaire
En raison du manque d'efficacité thérapeutique observé dans le groupe EA Sham lors des évaluations fonctionnelles précédentes, la phase protéomique a inclus uniquement les groupes Sham, CHF et EA. Avant la collecte des tissus, 12 rats par groupe ont subi une évaluation échocardiographique afin d'évaluer les effets thérapeutiques de l'EA, et ces résultats sont présentés dans la figure supplémentaire 1A. Suite à cette évaluation, 6 réplicats biologiques de chaque groupe ont été soumis à une analyse protéomique quantitative basée sur la spectrométrie de masse.
Des contrôles de qualité et des analyses multivariées ont été réalisés afin d'évaluer la fiabilité et la distribution globale des données protéomiques. Le nombre total de protéines identifiées était de 5 914 dans le groupe Sham, de 5 980 dans le groupe CHF et de 5 836 dans le groupe EA, indiquant une détection comparable des protéines entre les trois groupes expérimentaux (Figure 4A et Tableau supplémentaire 1). Une analyse discriminante par moindres carrés partiels a mis en évidence une séparation nette entre les groupes Sham, CHF et EA, indiquant des profils protéomiques globaux distincts associés à l'état pathologique et à l'intervention EA (Figure 4B).
L'analyse discriminante par moindres carrés partiels orthogonaux par paires a de nouveau mis en évidence une séparation entre les groupes Sham et CHF (Figure 4C) ainsi qu'entre les groupes CHF et EA (Figure 4D). Les tests de permutation correspondants ont confirmé la fiabilité des modèles respectifs. De plus, la carte thermique des corrélations de Pearson a révélé des corrélations élevées au sein de chaque groupe et des profils distincts entre les groupes parmi les échantillons protéomiques, ce qui soutient la reproductibilité des réplicats biologiques (Figure 4E). Collectivement, ces analyses de contrôle qualité et multivariées indiquent que le jeu de données protéomiques était suffisamment robuste pour permettre l'identification ultérieure et l'analyse bioinformatique des protéines différentiellement exprimées.
L'électroacupuncture module les protéines différentiellement exprimées et les voies de signalisation centrales dans le noyau du faisceau solitaire
Afin d'explorer les cibles moléculaires de l'EA, les modifications des protéines ont été analysées. Les diagrammes en volcan ont montré la répartition des protéines surexprimées et sous-exprimées dans les comparaisons Sham versus CHF et CHF versus EA (Figure 5A, Tableau supplémentaire 2 et Tableau supplémentaire 3). Afin d'identifier les cibles thérapeutiques, une analyse d'intersection a été réalisée. Comme illustré par les diagrammes de Venn, 58 protéines surexprimées dans le groupe CHF mais sous-exprimées après le traitement par EA ont été identifiées, ainsi que 27 protéines sous-exprimées dans le groupe CHF et surexprimées suite à l'intervention par EA (Figure 5B et Tableau supplémentaire 4). Ce criblage a permis d'obtenir un total de 85 protéines différentiellement exprimées centrales. La carte thermique de regroupement hiérarchique a démontré que l'intervention par EA modulait les profils d'expression anormaux de ces 85 protéines, en les rapprochant du niveau de référence Sham (Figure 5C).
Afin de déterminer les fonctions biologiques de ces cibles principales, des analyses d'enrichissement GO et KEGG ont été réalisées séparément pour les deux sous-ensembles de protéines distincts. Pour le sous-ensemble des 58 protéines régulées à la baisse par l'EA, le graphique en bulles GO a montré un enrichissement significatif dans des processus biologiques tels que l'organisation de la matrice extracellulaire et l'organisation de la structure extracellulaire, ainsi que dans des composants cellulaires tels que la structure encapsulante externe et le trimère de collagène, et des fonctions moléculaires telles que la liaison au collagène et la liaison au récepteur du glutamate (Figure 5D et Tableau supplémentaire 5). L'analyse ultérieure des voies KEGG, visualisée à l'aide de diagrammes en cordes et de diagrammes de Sankey, a révélé que ces 58 protéines participent à des cascades incluant la digestion et l'absorption des protéines, le cytosquelette des cellules musculaires et la voie de signalisation TGF-β (Figure 5E et Tableau supplémentaire 6). Ces visualisations topologiques ont mis en évidence des protéines spécifiques, notamment COL3A1, COL14A1, MYH11, DCN et DPF2, en tant que nœuds importants reliant plusieurs voies pathologiques.
Inversement, une annotation fonctionnelle a été réalisée pour le sous-ensemble de 27 protéines surexprimées suite à l'intervention EA. L'analyse d'enrichissement en termes de GO a indiqué leur implication dans des processus biologiques tels que la régulation de la croissance cellulaire et la régulation positive de l'élongation de la transcription à partir d'un brin matrice d'ADN, ainsi que dans des fonctions moléculaires incluant la liaison aux protéines dépendante du calcium et la liaison aux tétrapyrroles (Figure 5F et Tableau supplémentaire 7). Les diagrammes en cordes et de Sankey de KEGG correspondants ont attribué ces protéines à des voies essentielles, notamment le remodelage de la chromatine dépendant de l'ATP et le complexe répresseur polycomb (Figure 5G et Tableau supplémentaire 8). Notamment, cette cartographie de réseau a isolé des protéines clés telles que YY1, E2F2 et ENTPD5, assurant ainsi un lien entre ces réseaux de signalisation centraux. Cette stratification fonctionnelle complète a établi la base structurelle nécessaire à la validation ultérieure des cibles principales.
La topologie du réseau et le profilage d'expression identifient YY1 comme une cible candidate associée aux effets de l'intervention par électroacupuncture
Afin de déterminer le gène central parmi les 85 protéines exprimées de manière différentielle, un réseau d'interactions protéine-protéine a été construit. L'analyse topologique a identifié 18 nœuds présentant des scores de connectivité élevés (Figure 6A et Tableau supplémentaire 9). Ensuite, une analyse des voies KEGG a été réalisée spécifiquement pour ces 18 protéines centrales. Les diagrammes circulaires et de Sankey correspondants ont mis en évidence les relations complexes entre ces protéines centrales et les cascades de signalisation enrichies, notamment le remodelage de la chromatine dépendant de l'ATP, le complexe répresseur polycomb et la voie de signalisation TGF-β (Figure 6A et Tableau supplémentaire 10). Sur la base de ce profil fonctionnel, les 10 protéines les plus fortement enrichies ont été sélectionnées pour un criblage supplémentaire. Étant donné que la cible thérapeutique de l'EA se situe dans le système nerveux central, ces 10 candidats ont été évalués à l'aide de la base de données d'expression tissulaire humaine GTEx (Figure 6B et Figure supplémentaire 1B–J). Les résultats ont indiqué que seules YY1 (Figure 6B), DMAP1 (Figure supplémentaire 1C) et DPF2 (Figure supplémentaire 1D) étaient exprimées dans les tissus cérébraux.
Afin d'isoler la cible candidate hautement sensible à l'EA, des expériences moléculaires in vivo utilisant des tissus du SNT ont été réalisées. Une PCR quantitative en temps réel a été utilisée pour évaluer la sensibilité transcriptionnelle des trois candidats enrichis dans le cerveau. L'expression des ARNm de YY1 était réduite dans les conditions d'IC et augmentée après le traitement par EA, tandis que les niveaux d'expression des ARNm de DPF2 et DMAP1 ne présentaient aucune variation statistiquement significative entre les groupes expérimentaux (Figure 6C). Ce criblage transcriptionnel a exclu DPF2 et DMAP1 d'une validation ultérieure et a désigné YY1 comme le principal candidat sensible. Une analyse ultérieure par immunobuvardage a montré que les niveaux protéiques de YY1 étaient réduits dans le groupe IC par rapport au témoin faux opéré, alors que l'intervention par EA inversait cette tendance, augmentant l'expression protéique de YY1 (Figure 6D et Figure 6E). Ces résultats expérimentaux indiquent que l'EA régule positivement l'expression de YY1 au sein du SNT.
Afin d'étudier les mécanismes régulateurs en amont contrôlant l'expression de YY1, des analyses ont été menées sur les modifications histones associées et les facteurs de transcription concernés. Il est important de noter que ces résultats reposent exclusivement sur des prédictions bioinformatiques computationnelles issues du Cistrome Data Browser et ne représentent pas une validation expérimentale directe par ChIP-séq. La prédiction épigénétique a mis en évidence des modifications des histones, notamment H3K27ac, H3K27me3 et H3K4me3, présentant de hauts scores de potentiel régulateur au niveau du locus YY1 (Figure 6F). Parallèlement, le score de potentiel régulateur a identifié des facteurs de transcription tels que CDK9, PRDM1 et ELL2 comme régulateurs en amont de YY1 (Figure 6G). Ces prédictions bioinformatiques décrivent les réseaux épigénétiques et transcriptionnels potentiels contrôlant l'expression de YY1 dans le SNT.
En résumé, les données présentées démontrent que l'intervention par électroacupuncture améliore efficacement la fonction cardiaque systémique et atténue les lésions myocardiques chez les rats souffrant d'insuffisance cardiaque chronique. Ces effets cardioprotecteurs périphériques s'accompagnent de façon centrale par la restauration de l'activité de décharge neuronale et de l'énergie oscillatoire neuronale au sein du noyau du faisceau solitaire. De plus, un criblage protéomique quantitatif a identifié 85 protéines différentiellement exprimées clés et mis en évidence le facteur de transcription YY1 comme un candidat cible particulièrement sensible. Dans leur ensemble, ces résultats suggèrent que l'efficacité thérapeutique de l'électroacupuncture contre l'insuffisance cardiaque chronique est étroitement associée à la restauration de la fonction neuronale du noyau du faisceau solitaire et que la surexpression de YY1 pourrait être impliquée dans ce processus neurobiologique central.
Disponibilité des données
Toutes les données générées et analysées pour étayer les résultats de cette étude sont incluses dans le manuscrit et son fichier supplémentaire 1. Afin de respecter l'exigence d'accessibilité publique des données, toutes les données brutes disponibles à l'appui de cette recherche ont été déposées dans le référentiel public Zenodo et sont librement accessibles via le lien suivant : https://doi.org/10.5281/zenodo.22030720. Des données complémentaires sont disponibles auprès des auteurs correspondants sur demande raisonnable.

Figure 1 : Schéma expérimental, mise en place du modèle de rat atteint d'insuffisance cardiaque chronique et intervention par électroacupuncture. (A) Schéma général de l'expérience, incluant la chronologie et la répartition en groupes pour les deux séries expérimentales indépendantes. (B) Enregistrements représentatifs d'électrocardiogrammes avant et après la ligature de l'artère coronaire antéro-descendante (LAD), les flèches indiquant l'élévation du segment ST confirmant l'ischémie myocardique. (C) Analyse quantitative de la FEVG quatre semaines après la chirurgie, afin de confirmer la réussite de la modélisation (réplicats biologiques n = 6, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham. (D) Intervention par électroacupuncture aux points d'acupuncture HT7 bilatéraux. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 2 : L'électroacupuncture améliore la fonction cardiaque et atténue les lésions myocardiques chez des rats présentant une insuffisance cardiaque chronique. (A) Échocardiogrammes représentatifs en mode M accompagnés d'images de colorations par l'hématoxyline-éosine et la trichrome de Masson des tissus myocardiques provenant des quatre groupes expérimentaux (barre d'échelle = 50 µm). (B) Analyse quantitative de la FEVG entre les groupes (réplicats biologiques n = 6, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (C) Analyse quantitative de la FSVD entre les groupes (réplicats biologiques n = 6, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (D) Analyse quantitative de la FVC entre les groupes (réplicats biologiques n = 3, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ##p < 0,01 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (E) Analyse quantitative des taux sériques de NT-proBNP entre les groupes (réplicats biologiques n = 6, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (F) Analyse quantitative des taux sériques de cTnT entre les groupes (réplicats biologiques n = 6, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 3 : L'électroacupuncture restaure l'activité neuronale dans le noyau du faisceau solitaire chez des rats présentant une insuffisance cardiaque chronique. (A) Images représentatives d'immunofluorescence de l'expression de c-Fos dans le NTS selon les différents groupes. Les noyaux sont contre-colorés avec le DAPI, et les cellules positives pour c-Fos sont colorées en vert. Les lignes en pointillés délimitent la région anatomique, et les flèches blanches indiquent des neurones représentatifs positifs pour c-Fos (barre d'échelle = 30 µm). (B) Analyse quantitative du nombre de cellules positives pour c-Fos selon les groupes (réplicats biologiques n = 3, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (C) Traces représentatives in vivo de décharges électrophysiologiques de potentiels d'action dans le NTS selon les groupes. (D) Analyse quantitative de la fréquence moyenne de décharge neuronale selon les groupes (réplicats biologiques n = 3, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (E) Spectrogrammes locaux représentatifs en 2D et topographies tridimensionnelles de densité spectrale de puissance illustrant l'énergie oscillatoire neuronale au sein du NTS. (F) Matrice de corrélation évaluant les relations entre les phénotypes cardiovasculaires périphériques et les paramètres d'activité neuronale centrale. Les cercles rouges et bleus indiquent respectivement des corrélations positives et négatives. **p < 0,01 ; ***p < 0,001. Veuillez cliquer ici pour consulter une version agrandie de cette figure.

Figure 4 : Contrôle qualité et évaluation statistique multivariée des profils protéomiques dans le noyau du faisceau solitaire. (A) Aperçu quantitatif des protéines identifiées dans les trois groupes expérimentaux (réplicats biologiques n = 6). (B) Graphique des scores de l'analyse discriminante des moindres carrés partiels illustrant la distribution spatiale globale et la séparation entre les groupes. (C) Graphique des scores de l'analyse discriminante des moindres carrés partiels orthogonaux et le test de permutation correspondant validant la fiabilité du modèle pour la comparaison Sham versus CHF (200 permutations). (D) Graphique des scores de l'analyse discriminante des moindres carrés partiels orthogonaux et le test de permutation correspondant validant la fiabilité du modèle pour la comparaison CHF versus EA (200 permutations). (E) Carte thermique de regroupement hiérarchique des coefficients de corrélation de Pearson évaluant la reproductibilité intra-groupe et la variance inter-groupes pour tous les échantillons protéomiques. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 5 : Identification et analyse d'enrichissement fonctionnel des protéines modulées de manière différentielle par l'électroacupuncture dans le noyau du faisceau solitaire. (A) Diagrammes en volcan illustrant la répartition des protéines surexprimées et sous-exprimées dans les comparaisons Sham versus CHF et CHF versus EA. (B) Diagrammes de Venn représentant l'analyse d'intersection afin d'identifier les protéines centrales sous-exprimées et surexprimées après l'intervention par EA. (C) Carte thermique de regroupement hiérarchique des profils d'expression des protéines différentiellement exprimées. (D) Diagrammes en bulles GO détaillant les processus biologiques, composants cellulaires et fonctions moléculaires enrichis pour le sous-ensemble de protéines sous-exprimées. (E) Diagrammes en cordes et diagrammes de Sankey de KEGG représentant les voies de signalisation enrichies par les protéines sous-exprimées. (F) Diagrammes en bulles GO détaillant les processus biologiques, composants cellulaires et fonctions moléculaires enrichis pour le sous-ensemble de protéines surexprimées. (G) Diagrammes en cordes et diagrammes de Sankey de KEGG représentant les voies de signalisation enrichies par les protéines surexprimées. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 6 : La topologie du réseau, le profilage de l'expression tissulaire et la validation moléculaire identifient YY1 comme une cible candidate associée à l'électroacupuncture. (A) Réseau d'interactions protéine-protéine, diagramme en cordes et diagramme de Sankey des protéines centrales identifiées. (B) Profil d'expression tissulaire humain de YY1 dérivé de la base de données GTEx, la boîte rouge mettant en évidence les tissus cérébraux. (C) Analyse quantitative de l'expression des ARNm de YY1, DPF2 et DMAP1 dans le SNT selon les groupes (réplicats biologiques n = 6, moyenne ± écart-type). **p < 0,01, ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe CHF ; ns, non significatif par rapport au groupe CHF. (D) Bandes représentatives de Western blot de YY1 et de β-actine dans le SNT selon les groupes. (E) Analyse quantitative de l'expression protéique de YY1 selon les groupes (réplicats biologiques n = 3, moyenne ± écart-type). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; #p < 0,05 par rapport au groupe CHF. (F) Prédiction bioinformatique des modifications épigénétiques des histones régulant le locus YY1, basée sur les scores de potentiel régulateur. (G) Prédiction bioinformatique des facteurs de transcription en amont régulant le locus YY1, basée sur les scores de potentiel régulateur. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.

Figure 7 : Modèle proposé de l'association entre l'électroacupuncture au point HT7, la surexpression de YY1, la restauration de l'activité neuronale dans le noyau du faisceau solitaire et l'amélioration de l'insuffisance cardiaque chronique. (Gauche) État pathologique : Dans le modèle d'ICC induit par la ligature de l'artère coronaire descendante antérieure (LAD), l'activité neuronale au sein du NTS est réduite, accompagnée par la suppression du facteur de transcription YY1. Cette inhibition neuronale centrale est associée à un remodelage cardiaque pathologique, se manifestant par une diminution de la FEVG, une augmentation de la fibrose myocardique et une élévation des marqueurs sériques de l'insuffisance cardiaque. (Droite) Traitement par EA : L'intervention par électroacupuncture au niveau du point d'acupuncture HT7 induit une surexpression de YY1 dans le NTS et restaure la décharge neuronale. Cette neuromodulation centrale exerce des effets cardioprotecteurs, atténuant le remodelage pathologique et améliorant la fonction cardiaque systémique. Veuillez cliquer ici pour visualiser une version agrandie de cette figure.
Figure supplémentaire 1 : Évaluation de la fonction cardiaque de la cohorte protéomique et profils d'expression tissulaire humaine des gènes centraux candidats. (A) Analyse quantitative de l'EFVG et de la SFVG entre les groupes (réplicats biologiques n = 12, moyenne ± ÉT). ***p < 0,001 par rapport au groupe Sham ; ###p < 0,001 par rapport au groupe IC. (B-J) Profils d'expression tissulaire humaine des gènes centraux candidats issus de la base de données GTEx, incluant COL3A1 (B), DMAP1 (C), DPF2 (D), FMOD (E), MYH11 (F), E2F2 (G), LUM (H), DCN (I) et COL14A1 (J).Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 1 : Matrice complète d'identification et de quantification du protéome global dans le noyau du faisceau solitaire. Ce tableau présente l'ensemble des données protéomiques quantitatives obtenues pour tous les groupes expérimentaux. Les colonnes importantes incluent l'identifiant de la protéine (numéro d'accession UniProt), le gène (symbole du gène), la première description de la protéine (annotation fonctionnelle), ainsi que les valeurs d'intensité protéique normalisées pour chaque réplicat biologique dans les groupes Sham, CHF et EA (n = 6 par groupe).Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 2 : Scores d'importance des variables en projection (VIP) du modèle OPLS-DA pour les protéines dans la comparaison faux opérés versus IC. Ce tableau répertorie les caractéristiques distinguant les groupes faux opérés et IC selon le modèle OPLS-DA. Les colonnes principales incluent « feature » (représentant l'identifiant de la protéine ou du gène spécifique) et la valeur VIP (importance de la variable en projection), qui indique la contribution de chaque caractéristique à la séparation des groupes (seuil VIP > 1,0).Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 3 : Scores d'importance des variables en projection OPLS-DA pour les protéines dans la comparaison ICN par rapport à AE. Ce tableau recense les caractéristiques distinguant les groupes ICN et AE selon le modèle OPLS-DA. De manière similaire au tableau S2, il inclut la colonne des caractéristiques et les valeurs VIP correspondantes, en mettant en évidence les caractéristiques les plus sensibles à l'intervention AE.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 4 : Liste détaillée des 85 protéines différentiellement exprimées, considérées comme protéines centrales, modulées par l'électroacupuncture. Ce tableau présente l'intersection des protéines significativement modifiées par l'insuffisance cardiaque congestive (CHF) puis inversées par l'intervention d'électroacupuncture (EA). Les colonnes importantes incluent Protein_ID, Gene, log2FC (logarithme en base 2 du rapport d'expression indiquant la variation d'expression), P_value pour la significativité statistique (seuil p < 0,05), et VIP_value évaluant la contribution au modèle.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 5 : Analyse d'enrichissement de l'ontologie génique du sous-ensemble de protéines principales régulées à la baisse. Ce tableau présente l'annotation fonctionnelle selon l'ontologie génique (GO) pour les 58 protéines régulées à la baisse par l'EA. Les colonnes importantes incluent ONTOLOGY (classée en Processus biologique [BP], Composant cellulaire [CC] et Fonction moléculaire [MF]), la description fonctionnelle, p.adjust (valeur p ajustée pour les tests multiples) et geneID, qui correspond aux gènes spécifiques enrichis pour chaque terme.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 6 : Analyse d'enrichissement des voies de la Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pour le sous-ensemble de protéines centrales régulées à la baisse. Ce tableau illustre les cascades de signalisation enrichies pour les 58 protéines régulées à la baisse. Les colonnes principales incluent le Terme de la voie, la valeur p ajustée indiquant la signification statistique de l'enrichissement, ainsi que les gènes spécifiques en intersection impliqués dans chaque voie.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 7 : Analyse d'enrichissement de l'ontologie génique du sous-ensemble de protéines centrales surexprimées. Ce tableau présente l'annotation fonctionnelle selon l'ontologie génique (GO) pour les 27 protéines surexprimées par EA. Le format et les définitions des colonnes (ONTOLOGIE [BP, CC, MF], Description, p.adjust, geneID) sont identiques à ceux décrits dans le tableau S5.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 8 : Analyse d'enrichissement des voies de l'Encyclopédie de Kyoto des gènes et des génomes pour le sous-ensemble de protéines centrales surexprimées. Ce tableau illustre les cascades de signalisation enrichies pour les 27 protéines surexprimées. Le format et les définitions des colonnes (Terme, valeur p ajustée, Gènes) sont identiques à ceux détaillés dans le tableau S6.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 9 : Scores de connectivité topologique des 18 protéines centrales dérivées du réseau d'interactions protéine-protéine. Ce tableau résume les paramètres topologiques du réseau utilisés pour identifier les gènes centraux. Les colonnes principales incluent le nom du gène et des métriques centrales du réseau telles que le degré, la centralité d'intermédiarité et la centralité de proximité, qui quantifient l'importance relative et la connectivité de chaque nœud au sein du réseau biologique.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Tableau supplémentaire 10 : Analyse d'enrichissement des voies de la base de données Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pour les 18 protéines centrales du réseau. Ce tableau présente les voies de signalisation spécifiques enrichies exclusivement par les 18 protéines centrales identifiées. Les colonnes principales incluent le terme de la voie, la valeur p ajustée indiquant la significativité, ainsi que les gènes responsables de l'enrichissement fonctionnel.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.
Fichier supplémentaire 1 : Scripts R utilisés pour l'analyse et la visualisation des données, ainsi que les images de western blot non recadrées. Le fichier supplémentaire contient les scripts R utilisés pour l'analyse de corrélation de Pearson, la génération de double diagramme en volcan et l'identification des protéines inversées par l'EA, l'analyse d'enrichissement en ontologie génique (GO), la génération de cartes thermiques de clustering hiérarchique, la visualisation de l'enrichissement dans l'Encyclopédie de Kyoto des gènes et des génomes (KEGG), l'analyse discriminante orthogonale des moindres carrés partiels (OPLS-DA) et les tests de permutation, l'analyse discriminante des moindres carrés partiels (PLS-DA), la génération de cartes thermiques de corrélation des échantillons protéomiques, ainsi que l'analyse de diagramme de Venn.Veuillez cliquer ici pour télécharger ce fichier.