Name: Lecture automatique Interactive Video pour les études de la communication animale (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-02-09T16:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 21 s
Description: Découvrez un système de lecture vidéo interactif automatisé pour étudier les comportements de parade chez les femelles de poissons épées. Cette méthode permet d'analyser les préférences d'accouplement en temps réel grâce à un modèle numérique réactif.

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Nous sommes redevables à Stephan Schwartz et Christian Gutzen des Biobserve GmbH pour le parrainage de cet article et de l&#39;assistance technique beaucoup. Nous remercions Olivia Ochoa, Christian Kaufmann, et Zachary Cress de l&#39;aide pour les soins de poissons; nous sommes reconnaissants envers le gouvernement fédéral mexicain pour la permission de recueillir les poissons. Nous sommes redevables à Glen Vigus, Frédéric Parke, et le Laboratoire de visualisation à la Texas A &amp; M. Athéna Mason et Ryan Easterling aidé à préparer cette publication. Le financement a été fourni par Texas A &amp; M University et NSF IOS-1045226.

1. Mise en place du matériel et du système Viewer. Le système se compose d'un réservoir de tests encadrée par deux moniteurs. Une caméra vidéo connectée au système Viewer BIOBSERVE enregistre le mouvement du sujet en temps réel. Données de mouvement est transmis à la lecture de la vidéo interactive (IVP) programme sur un serveur distinct, qui détermine le mouvement du stimulus animés sur l'écran. <ol><li> Placez deux moniteurs CRT aux extrémités opposées d'un aquarium de 80 l rempli d'eau propre; sortie moniteur match. </li><li> Placez l'appareil photo aérienne pour capturer la vue de l'aquarium; connecter à BIOBSERVE carte vidéo. </li><li> Configurer le système de visionneuse de recevoir des informations de suivi de la caméra. </li><li> Activer le plug-in l'Observateur qui envoie les coordonnées du museau de l'animal, le corps et la queue vers le serveur d'animation en temps réel via une adresse IP du réseau spécifié. </li><li> Allumez le serveur de l'animation. </li></ol> 2. Etalonnage. <ol><li> Sur le serveur animation, ouvrez InteractiveDisplaySetup.txt. Entrer la largeur et la hauteur d'écran écran en pixels sous la rubrique «Infos Moniteur". Sous la rubrique «ProgramType" entrer "calibrage". Enregistrer les modifications au fichier. </li><li> Double-cliquez sur l'icône du programme IVP pour démarrer le programme. </li><li> Entrez dans l'étendue de la dimension du réservoir de mettre en place dans le système de visionneuse à l'étape 2.3. Cela permettra d'assurer la correspondance entre les données de sortie Viewer et interactive à partir IVP. </li><li> Comme les extrémités des réservoirs de poissons sont plus petits que les moniteurs, le logiciel permet à l'utilisateur d'utiliser le clavier (A et S pour la largeur, Z et X pour la hauteur, et les touches directionnelles pour la position) pour déplacer la zone de visualisation (viewport) du stimuli pour s'aligner avec les extrémités de la cuve d'essai. Consultés sur le serveur de l'animation, la fenêtre rose est fait l'écho sur un moniteur d'essai et la fenêtre bleue sur l'autre (figure 1). </li><li> Utilisez z et x sur le clavier à l'échelle de l'affichage des poissons mâles sur les deux fenêtres jusqu'à ce qu'elle corresponde à la taille désirée de relance. </li><li> Déplacez les boîtes affiché afin de les aligner sur les bords de la cuve d'essai. L'utilisateur utilise les touches Q ou W pour déplacer les boîtes rapproche ou s'éloigne du centre du poisson. </li><li> Entrez les informations expérience lorsque vous êtes invité par le programme. L'utilisateur a la possibilité de choisir parmi les modèles préchargés (dans notre démonstration, courtiser mâles Xiphophorus birchmanni, X. Malinche). L'utilisateur spécifie également le comportement de chaque poisson dans chaque étape (non-interactif ou interactif), le côté et le stade dans lequel chaque stimulus apparaît, et la taille désirée (longueur standard) de chaque stimulus. </li><li> La question suivante vous demande si l'utilisateur souhaite les mouvements des poissons à mettre en miroir, c'est à dire que le mouvement du modèle de chaque côté de l'aquarium seront exactement les mêmes. Ceci n'est utilisé que lorsque les poissons sont à la fois en mode animation. Les dernières questions concernent le mouvement de la nageoire dorsale. L'utilisateur peut sélectionner par défaut dorsale, ce qui rendrait la dorsale ne soulèvent lors d'une parade nuptiale latérale. Si la dorsale n'est pas réglé par défaut, l'utilisateur peut décider si le modèle soulève sa nageoire dorsale, selon la distance du sujet par le moniteur. </li></ol> 3.Starting IVP pour les maté-test à choix. <ol><li> InteractiveDisplaySetup.txt et réglez "ProgramType" à liveTesting et mettre 'experimentName' au nom même fichier qui contient les données d'expérimentation. </li><li> Placez délicatement les poissons dans l'aquarium sous réserve et attendre 10 min. </li><li> Démarrez le 2.0 et le visualiseur IVP. </li></ol> 4. Mate-choix procès. La séquence globale d'expérimentation suit des études antérieures utilisant des stimuli vidéo non-interactif 1-4. Les femelles sont présentés avec deux stimuli différents sur des écrans aux extrémités opposées d'un aquarium de tests. Le comportement des femmes est suivi en temps réel par le système Viewer Biobserve. Le test de réponse est le temps d'association, la quantité de temps qu'une femme consacre moins de 10 cm d'un moniteur ou l'autre. Temps de l'Association est automatiquement calculée par le spectateur. <ol><li> Les stimuli vidéo sont affichés à des sujets dans un essai consistant en deux, de 20 minutes étapes. Une étape se compose de quatre segments de 5 minutes: <ol><li> Le premier segment acclimate la femelle à la cuve de test pendant cinq minutes en affichant un écran monochrome sur les deux moniteurs. </li><li> Dans le deuxième segment, deux stimuli vidéo différents sont affichés à la femelle, l'un sur l'écran de gauche et l'autre sur le droit pendant cinq minutes. </li><li> Immédiatement après l'affichage des stimuli vidéo, un écran monochrome est de nouveau affiché sur les deux moniteurs pendant cinq minutes. </li><li> Dans le quatrième et dernier segment, les stimuli du deuxième segment sont présentées, mais la position de chaque stimulus est allumé. Cela fournit un contrôle au sein-femme pour le biais de côté. </li></ol></li><li> Le secstade de deuxième répète le même schéma, avec un ensemble différent de stimuli simultanément présentés. </li><li> Des essais supplémentaires sont gérés par un retour à l'étape 2 et varier systématiquement côté et ordre de présentation. </li></ol> 5. Des résultats représentatifs. Nous avons évalué l'efficacité de la lecture interactive en comparant la réponse des femmes à des animations interactives et non interactives de mâles courtisent. Le stimulus non-interactif réalisé un stimulus séduction à l'écran, indépendamment du comportement des femmes, comme dans de précédentes études 1-4. Le stimulus interactives suivies de la position horizontale de la femelle à travers l'écran. La position du poisson soit simulée ou le poisson a été soumise opérationnellement défini comme le milieu de la ligne reliant le centre de gravité et le museau. Les trois règles qui guident le comportement des hommes étaient comme suit, où la direction X se réfère à la longueur de la cuve, et la direction Z se réfère à la largeur de la cuve (figure 2): Règle 1: Les hommes de simulation suit toujours le sujet à travers l'écran, son suivi dans la direction Z. Règle 2: la nageoire dorsale du mâle simulé n'est soulevée quand il effectue une parade nuptiale latérale. Règle 3: Le poisson xipho simulées mâle uniquement effectuer une parade nuptiale latérale pour 50% du temps total qu'il est affiché à la femelle. La parade nuptiale latérale est déclenchée par le poisson mâle étant au sein d'un quart la longueur du corps masculin de la femelle dans la direction Z. La parade nuptiale latéraux est indépendante de la proximité de la femelle est à l'écran dans la direction X. Le stimulus interactifs suivi de près la position de la femelle en temps réel (figure 3). Des travaux antérieurs utilisant des stimuli non-interactive a montré que 4,5 X. féminine birchmanni fortement préféré des signaux visuels de leur propre espèce. Les stimuli non-interactif créé par l'IVP ont été tout aussi efficace à connaître les préférences du compagnon conspécifiques (t = 1,923, N = 9, p = 0,046). Lorsque les femelles ont été testés sur des simulations interactives mâles conspécifiques et hétérospécifiques immédiatement avant ou après dans le même procès, cependant, ils ont échoué à montrer une préférence (figure 4). <img src="/files/ftp_upload/2374/2374fig1.jpg" alt="Figure 1" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 1"> Figure 1. Moniteur d'installation pour l'étalonnage. <img src="/files/ftp_upload/2374/2374fig2.jpg" alt="Figure 2" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 2"> Figure 2. Vue schématique du réservoir et de configuration du moniteur, indiquant les axes utilisés pour décrire la position. <img src="/files/ftp_upload/2374/2374fig3.jpg" alt="Figure 3" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 3"> Figure 3. Position horizontale du modèle d'animation et représentant sujet féminin dans le temps. <img src="/files/ftp_upload/2374/2374fig4.jpg" alt="Figure 4" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 4"> Figure 4. Temps de l'Association (s) de femmes ayant interactifs et non interactifs conspécifiques et hétérospécifiques stimuli masculins. Chaque parcelle est créée à partir d'un record de cinq minutes de la sortie de postes par le prototype. Dans ces parcelles, le temps progresse dans la direction Y verticale de 0 à 5 minutes. <img src="/files/ftp_upload/2374/2374fig5.jpg" alt="Figure 5" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 5"> Figure 5. Données représentatives du temps d'association et de suivi par deux stimuli interactifs. Deux segments de cinq minutes pour les deux femelles sont affichées.

<ol><li>Fisher, H. S., Mascuch, S., Rosenthal, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multivariate+male+traits+misalign+with+multivariate+female+preferences+in+the+swordtail+fish%2C+Xiphophorus+birchmanni%5BTitle%5D)+AND+%22Anim.+Behav%22%5BJournal%5D)">Multivariate male traits misalign with multivariate female preferences in the swordtail fish, Xiphophorus birchmanni.</a> Anim. Behav. 78, 265-269 (2009).</li>
<li>Fisher, H. S., Rosenthal, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hungry+females+show+stronger+mating+preferences%5BTitle%5D)+AND+%22Behavioral+Ecology%22%5BJournal%5D)">Hungry females show stronger mating preferences.</a> Behavioral Ecology. 17, 979-981 (2006).</li>
<li>Fisher, H. S., Rosenthal, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Male+swordtails+court+with+an+audience+in+mind%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+Letters%22%5BJournal%5D)">Male swordtails court with an audience in mind.</a> Biology Letters. 3, 5-7 (2007).</li>
<li>Wong, B. B. M., Rosenthal, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Female+disdain+for+swords+in+a+swordtail+fish%5BTitle%5D)+AND+%22American+Naturalist%22%5BJournal%5D)">Female disdain for swords in a swordtail fish.</a> American Naturalist. 167, 136-140 (2006).</li>
<li>Fisher, H. S., Wong, B. B. M., Rosenthal, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Alteration+of+the+chemical+environment+disrupts+communication+in+a+freshwater+fish%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+Royal+Society+B-Biological+Sciences%22%5BJournal%5D)">Alteration of the chemical environment disrupts communication in a freshwater fish.</a> Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences. 273, 1187-1193 (2006).</li>
<li>Rosenthal, G. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Design+considerations+and+techniques+for+constructing+video+stimuli%5BTitle%5D)+AND+%22Acta+Ethol%22%5BJournal%5D)">Design considerations and techniques for constructing video stimuli.</a> Acta Ethol. 3, 49-54 (2000).</li>
<li>Turnell, E. R., Mann, K. D., Rosenthal, G. G., Gerlach, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mate+choice+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29+analyzed+with+video-stimulus+techniques%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Bull%22%5BJournal%5D)">Mate choice in zebrafish (Danio rerio) analyzed with video-stimulus techniques.</a> Biol. Bull. 205, 225-226 (2003).</li>
<li>Rosenthal, G. G., Ryan, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assortative+preferences+for+stripes+in+danios%5BTitle%5D)+AND+%22Animal+Behaviour%22%5BJournal%5D)">Assortative preferences for stripes in danios.</a> Animal Behaviour. 70, 1063-1066 (2005).</li>
<li>Flocks, herds and schools: A distributed behavioral model. Reynolds, C. W. Proceedings of the 14th annual conference on Computer graphics and interactive techniques, 1985, , ACM Press. New York, NY. 256 (1985).</li>
<li>Reynolds, C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Steering+Behaviors+For+Autonomous+Characters%5BTitle%5D)+AND+%22%22%5BJournal%5D)">Steering Behaviors For Autonomous Characters.</a> Game Developers Conference, 1999, San Jose, California, , Miller Freeman Game Group. San Francisco, California. (1999).</li>
<li>Hoare, D. J., Couzin, I. D., Godin, J. -G. J., Krause, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Context-dependent+group+size+choice+in+fish%5BTitle%5D)+AND+%22Animal+Behaviour%22%5BJournal%5D)">Context-dependent group size choice in fish.</a> Animal Behaviour. 65, 663-669 (2004).</li>
<li>Hoare, D. J. &amp, Krause, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Social+organisation%2C+shoal+structure+and+information+transfer%5BTitle%5D)+AND+%22Fish+and+Fisheries%22%5BJournal%5D)">Social organisation, shoal structure and information transfer.</a> Fish and Fisheries. 4, 269-279 (2003).</li>
</ol>

La production de cette vidéo article a été parrainé par la recherche Biobserve.

Les méthodes précédentes pour la lecture vidéo interactive dans le comportement des animaux se sont appuyés sur un opérateur humain pour fournir les réponses aux indices comportementaux chez les sujets. Avec IVP, nous avons créé un programme qui applique les règles de l&#39;interactivité basée en réponse à temps réel, des données automatisée sur le comportement des sujets. Nous brièvement les étapes de la création du programme ci-dessous. La première étape était de créer numériques exemplaires mâles de X. birchmanni et X. Malinche. Nous avons pris une approche semblable à celle des études précédentes 6. Nous avons créé des maillages 3D qui sont calquées sur les textures à partir de photographies du réel x. birchmanni et X. Malinche. Pour capturer les textures réalistes du vrai poisson, les mêmes photographies utilisées pour modéliser les formes de poissons ont été utilisées comme textures pour les poissons. Une carte planaire appliquées à leurs coordonnées UV aligné la carte UV avec la texture photo. Deuxièmement, le maillage des poissons numérique doit se déforment comme un vrai poisson. Pour ce faire, un squelette virtuel a été créé pour le corps et les nageoires et les «écorchés» pour la maille. Le processus de dépouillement permet le maillage de se déformer lorsque les articulations sont en rotation. Deuxièmement, nous avons ajouté motion pour le poisson numérique. Six mouvements clés qui un poisson xipho mâle fait ont été animés. Trois de ces mouvements ont été utilisées pour représenter les différentes vitesses au cours de laquelle un poisson nager. Les trois autres mouvements ont été les poissons restants encore, le tournage, ou présentant une parade nuptiale latérale. Comme les hommes peuvent élever ou abaisser leur nageoire dorsale conformément à savoir si les récepteurs masculins ou féminins sont présents 3, nous avons découplé du mouvement de la nageoire dorsale de celui de la parade nuptiale latérale. La nageoire dorsale a été saisi afin qu&#39;il puisse être relevé ou abaissé à tout moment pendant le cycle. Un total de cycles d&#39;animation de vingt à quatre ont été utilisés. Chaque cycle a commencé et s&#39;est terminée avec le poisson dans la même posture afin que les cycles d&#39;animation pourraient facilement se fondre ensemble. Tous les cycles d&#39;animation de vingt à quatre ont été créées par rotoscopie 7,8 le mouvement souhaité de la vidéo-dessus d&#39;un live, courtiser mâles X. birchmanni. Troisièmement, nous avons permis à l&#39;interactivité. Nous avons utilisé le système Viewer Biobserve de suivre en temps réel la position du museau, le corps et la queue du xipho femelle et de transmettre cette information en temps réel pour le programme IVP. Cela a été fait séparément pour chaque mâle courtise sur chaque moniteur. L&#39;animation des hommes suivis de position des poissons sujet. Nous avons modélisé suivant à l&#39;aide de Reynolds est arrivé 9,10 comportement de la direction, qui a permis aux hommes de suivre les femmes et ralentir à l&#39;approche de la femelle. Pour calculer la position du poisson xipho mâle à chaque pas de temps, le système a été fourni avec la position actuelle de la femelle, ce qui a permis au programme de calculer les forces qui animent le mâle. Tout d&#39;abord, le vecteur-cible offset a été calculé en soustrayant la position des poissons mâles de la position de la femelle. Deuxièmement la distance entre le poisson mâle à la femelle a été déterminé en prenant de l&#39;ampleur du vecteur cible de compensation. Troisièmement, la vitesse désirée du poisson mâle a été déterminée en divisant la distance par une valeur de décélération constante. Cela a permis aux poissons mâles à ralentir à l&#39;approche du poisson femelle. Dernière, l&#39;accélération souhaitée a été calculé en soustrayant la vitesse du courant du mâle de la vitesse désirée. Comme les animations sont rendus comme des cadres discrets de la vidéo à 60 Hz, les calculs ont été effectués pour chaque étape de temps discrets, à des intervalles de 0,016 secondes. Vitesse maximale a été fixée à une valeur de 10 cm / s pour ces expériences. Si l&#39;ampleur de la nouvelle vitesse était supérieure à la vitesse maximale, la vitesse a été réglée au maximum. Pour cette simulation particulière, les poissons mâles interactifs soulevé sa nageoire dorsale 50% du temps, et seulement pendant les interactions cour. Le comportement de cour latérale d&#39;affichage a été déclenchée lorsque le stimulus masculin était de moins de 0,25 longueurs corps du poisson xipho femmes dans la dimension Z. Nous avons été surpris que l&#39;interactivité aboli la préférence des femmes pour les congénères, malgré le fait que les animations non-interactif a suscité une forte préférence et étant donné que les femmes ont passé la majorité du temps de s&#39;associer avec les stimuli interactifs. Une possibilité est que suit de près la femelle peut l&#39;emporter sur des indices visuels utilisés pour évaluer les mâles, comme l&#39;épée et la nageoire dorsale. Alternativement, les femelles peuvent être moins susceptibles de perdre de l&#39;intérêt chez un homme de cour, et donc moins susceptibles de l&#39;échantillon à la fois les individus (figure 5). Néanmoins, nos résultats montrent que le principe de fonctionnement de la technologie du jeu vidéo à savoir, piloté par logiciel, fondé sur des règles agents répondant à l&#39;entrée utilisateur peut être appliquée avec succès à la lecture interactive dans des études dele comportement animal. Ce type de règles basé lecture interactive devrait s&#39;avérer utile pour les études de mouvement et collectif shoaling 11,12. En particulier, la capacité de manipuler les règles qu&#39;un exemplaire virtuel utilise des bancs devrait nous donner un aperçu des processus qui utilisent les animaux pour prendre des décisions bancs.

<table><tbody><tr><td>Maya 8.0</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Programme C# utilisant XNA Game Studio 2.0 de Microsoft&amp;rsquo;s</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>BIOBSERVE Viewer 2</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Moniteur CRT Dell 15&amp;#8221; (2)</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Aquarium de test en Plexiglas de 20 x 20 x 80 cm</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Ordinateur Dell Latitude (serveur d'animation)</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

lecture automatique interactive video pour les études de la communication animale

Automated Interactive Video Playback for Studies of Animal Communication

Lecture vidéo est une technique largement utilisée pour la manipulation contrôlée et la présentation des signaux visuels dans la communication animale. En particulier, basé sur des paramètres d&#39;animation par ordinateur offre la possibilité de manipuler indépendamment n&#39;importe quel nombre de caractéristiques comportementales, morphologiques ou spectrales dans le contexte des réalistes, des images animées d&#39;animaux à l&#39;écran. Une limitation importante de la lecture classique, cependant, est que le stimulus visuel n&#39;a pas la capacité d&#39;interagir avec l&#39;animal vivant. Empruntant la technologie du jeu vidéo, nous avons créé un système automatisé et interactif pour la lecture vidéo qui contrôle les animations en réponse à des signaux en temps réel à partir d&#39;un système de suivi vidéo. Nous avons démontré cette méthode en menant compagnon de choix des essais sur les poissons porte-épée féminine, Xiphophorus birchmanni. Les femelles ont reçu un choix simultané entre un mâle courtisant conspécifiques et un mâle courtisant hétérospécifiques (X. Malinche) sur les côtés opposés d&#39;un aquarium. Le stimulus virtuel masculine a été programmé pour suivre la position horizontale de la femme, en tant que mâles courtisent faire dans l&#39;état sauvage. Mate-le choix des essais sur les sauvages X. femelles birchmanni ont été utilisés pour valider la capacité du prototype efficacement générer un stimulus réaliste visuelle.

Lecture vidéo est une technique largement utilisée dans le comportement animal. Nous avons créé et évalué un programme qui s&#39;applique à base de règles, la lecture interactive en 3-D des animations par ordinateur en réponse à temps réel, des données automatisée sur le comportement des sujets.

Lecture automatique Interactive Video pour les études de la communication animale

La lecture de vidéos est une technique largement utilisée pour la manipulation et la présentation contrôlées de signaux visuels dans la communication animale. En particulier, ...

L'objectif général de l'expérience suivante est d'utiliser un système automatisé de lecture vidéo interactif pour étudier le comportement de parade chez les femelles de poisson-épée. Cela est réalisé en modélisant un poisson numérique mâle, en y ajoutant des mouvements et une interactivité, puis en établissant des règles déterminant son comportement par rapport au poisson sujet. Dans cette démonstration, un mâle virtuel suivra les déplacements d'une femelle réelle afin de configurer le système.Un aquarium flanqué de deux écrans est conçu et relié au système d'observation des spectateurs afin de suivre les sujets en temps réel. Les données de mouvement sont ensuite transmises au programme de lecture vidéo interactive sur un serveur distinct pour déterminer le mouvement du stimulus animé à l'écran. Une fois le système en place, les femelles ont le choix simultanément entre un mâle conspécifique et un mâle hétérospécifique situés de part et d'autre de l'aquarium.En fin de compte, la préférence en matière de comportement de parade que les femelles de poisson manifestent envers les mâles d'une espèce similaire peut être influencée par l'ajout d'un stimulus mâle interactif. La procédure sera démontrée par Tricia Bakowski, ancienne étudiante diplômée de mon laboratoire et actuellement employée chez Dreamworks SKG. Positionnez une caméra au-dessus du réservoir et connectez-la à une carte vidéo d'observation.Effectuez les ajustements nécessaires pour que tout l'aquarium soit visible. Configurez le système de visualisation Byob Observe afin de recevoir les informations de suivi en provenance de la caméra. Ensuite, activez le module complémentaire du visualiseur BYOB Observe qui envoie les coordonnées au serveur d'animation via une adresse IP réseau spécifiée.Pour commencer l'étalonnage, allumez le serveur d'animation et ouvrez le fichier txt de configuration de l'affichage interactif. Saisissez la largeur d'écran et la hauteur d'écran en pixels sous le numéro du moniteur, puis, sous le champ du type de programme, saisissez l'information « calibration ». Veillez à enregistrer ces modifications.Ensuite, double-cliquez sur l'icône du programme de lecture vidéo interactive ou IVP pour lancer le programme et garantir une correspondance correcte entre les données du visualiseur et la sortie interactive de l'IVP. Saisissez les dimensions du réservoir telles qu'elles ont été configurées précédemment dans le système de visualisation, afin de corriger le fait que les extrémités de l'aquarium soient plus petites que les écrans. Utilisez le clavier pour déplacer la zone de visualisation ou le champ de vision des stimuli afin de l'aligner sur les extrémités de l'aquarium de test affichées sur le serveur d'animation.Le port d’affichage rose est reproduit sur un moniteur de test et le port d’affichage bleu sur l’autre. Ajustez ensuite l'affichage du poisson mâle sur les deux ports d’affichage jusqu’à ce qu’il atteigne la taille de stimulus souhaitée. Utilisez le stimulus de calibration standard et réglez-le à 66,7 millimètres à l’aide d’un repère standard.Déplacez les boîtes à l’écran de manière à les aligner sur les bords du réservoir d’essai. Utilisez les touches q ou w pour déplacer les boîtes vers ou loin du centre du poisson afin de configurer le système. Placez un moniteur CRT à chaque extrémité d’un aquarium de 80 litres rempli d’eau propre et assurez-vous que la luminosité des deux moniteurs est identique.Chargez le modèle à tester dans cette démonstration. Les fichiers correspondant aux mâles selon phosphore, birman et mâle selon mécanique sont sélectionnés. Choisissez, parmi les ensembles non interactif ou interactif, le côté et le stade auxquels chaque stimulus apparaîtra, ainsi que la taille souhaitée de chaque stimulus.Ensuite, choisissez si les mouvements des deux stimuli doivent être en miroir ou non. Enfin, les affichages de parade nuptiale du mâle peuvent être rendus interactifs en choisissant soit le paramètre par défaut, dans lequel la nageoire dorsale est levée uniquement pendant une parade latérale, soit une distance. Le sujet doit provenir du mâle afin de déclencher une réponse.Pour commencer une session de test, ouvrez le programme de configuration de l'affichage interactif, txt, puis sélectionnez le type de programme « test en direct » et le numéro, et attribuez au nom de l'expérience le même nom de fichier que celui contenant les données de l'expérience. Activez le programme IVP, mais n'appuyez pas sur démarrer. Cela affichera un écran vide pendant la période d'acclimatation.Placer délicatement le poisson sujet dans l'aquarium et lui laisser 10 minutes pour s'acclimater. Avant le test, démarrer le logiciel By Observe Viewer 2.0 et l'IVP. Les stimuli vidéo sont présentés aux sujets lors d'un essai composé de deux phases de 20 minutes chacune.Une phase comprend des segments de quatre ou cinq minutes, dont un exemple est visible ici. Le premier segment permet d'acclimater la femelle au réservoir d'essai pendant cinq minutes en affichant un écran monochrome sur les deux moniteurs. Dans le deuxième segment, un stimulus vidéo différent est affiché sur le moniteur gauche et sur le moniteur droit pendant cinq minutes supplémentaires.Immédiatement après la présentation des stimuli vidéo, un écran monochrome est à nouveau affiché pendant cinq minutes sur les deux moniteurs. Dans le quatrième et dernier segment, les stimuli du deuxième segment sont présentés, mais la position de chaque stimulus est inversée. Cela permet un contrôle intrasujet chez chaque femelle pour un biais de côté.La deuxième étape peut répéter le même schéma avec un autre ensemble de stimuli présentés simultanément. Une fois toutes les étapes terminées, retirez le sujet et présentez le poisson suivant à tester afin de contrôler systématiquement les biais latéraux ainsi que les effets d'ordre en faisant varier la position et l'ordre de présentation entre les sujets. Le stimulus interactif affiché ici en rouge suit étroitement en temps réel la position horizontale de la femelle indiquée en bleu.Les trois règles qui régissent le comportement du mâle sont les suivantes, où la direction X correspond à la longueur du réservoir et la direction indique la largeur du réservoir. Règle n°1 : le mâle simulé suit toujours l'individu cible à travers l'écran en la traquant dans la direction Z. Règle n°2 : la nageoire dorsale du mâle simulé n'est relevée que lorsqu'il effectue un affichage de parade latérale.Règle trois : le poisson-mâle simulé à queue de sabre n'effectue un affichage latéral de parade nuptiale que pendant 50 % du temps total durant lequel il est exposé à la femelle. L'affichage latéral de parade nuptiale est déclenché lorsque le poisson-mâle se trouve à moins d'un quart de la longueur de son corps par rapport au poisson-femelle dans la direction Z. L'affichage latéral de parade nuptiale est indépendant de la proximité de la femelle par rapport à l'écran.Dans l'association en direction X, le temps est automatiquement calculé par l'observateur et est défini comme la durée pendant laquelle une femelle reste à moins de 10 centimètres d'un moniteur ou de l'autre stimulus non interactif. Les résultats obtenus avec le logiciel IVP montrent que les femelles de l'espèce X préfèrent fortement les signaux visuels de leur propre espèce. Toutefois, lorsque les femelles sont testées avec des mâles conspécifiques et hétérospécifiques interactifs, elles ne manifestent aucune préférence après le développement de cette méthode. Cette technique a permis aux chercheurs du domaine du comportement animal d'explorer les interactions sociales à l'aide d'algorithmes quantitatifs.

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Ce protocole décrit un procédé pour quantifier la sociabilité de la souris. Les souris sont filmés comme ils se déplacent et interagissent dans une cage spéciale. traitement de film permet la quantification automatique de sociabilité avec une excellente précision et de fiabilité.

Évaluation expérimentale de la souris Sociabilité L&#39;utilisation d&#39;un traitement automatisé Approche d&#39;image

Les vocalisations ultrasonores de souris sont utilisées comme substituts pour modéliser les bases génétiques des déficits de communication vocale dans les modèles murins pour les troubles neuropsychiatriques. Le présent protocole décrit trois contextes expérimentaux qui déclenchent de manière fiable des vocalisations ultrasonores chez les petits (tout au long du développement) et les souris adultes (interactions entre personnes du même sexe, interactions entre mâles et femelles avec œstrus).

Enregistrement souris vocalisations ultrasoniques pour évaluer la Communication Sociale

En utilisant les nouveaux outils de compilation FishSim Animation, nous présentons un protocole pour une manipulation visuelle non invasif de l’information dans le contexte du choix d’un partenaire copie dans sailfin mollies. FishSim Animation Toolchain fournit un cadre facile à utiliser pour la conception, l’animation et la présentation de stimuli poisson animation par ordinateur pour les expériences comportementales poissons vivants.

En utilisant les outils de compilation FishSim Animation pour enquêter sur le comportement du poisson : une étude de cas sur la copie de-choix d’un partenaire en Sailfin Mollies

Ici, nous présentons un protocole pour démontrer un analyse comportementale qui quantifie comment les caractéristiques visuelles alternatives, telles que les indices de mouvement, influencent les décisions directionnelles chez les poissons. Des données représentatives sont présentées sur la vitesse et la précision où Golden Shiner (Notemigonus crysoleucas) suivent les mouvements virtuels des poissons.

Intégration des essais psychophysiques visuels dans un labyrinthe Y pour isoler le rôle que jouent les caractéristiques visuelles dans les décisions de navigation

Nous présentons une méthode pour la stimulation chimique flexible et multimodale et l’enregistrement de l’activité neuronale simultanée de nombreux vers Caenorhabditis elegans . Cette méthode utilise la microfluidique, du matériel et des logiciels open source et une analyse automatisée supervisée des données pour permettre la mesure de phénomènes neuronaux tels que l’adaptation, l’inhibition temporelle et la diaphonie de stimulus.

Stimulation multimodale automatisée et enregistrement neuronal simultané à partir de plusieurs petits organismes

Voici un pipeline d’analyse vidéo qui permet de surmonter les défis de la surveillance comportementale dans les environnements IRM, permettant de détecter des réponses comportementales non instruites à des signaux externes. Cette analyse facilitera une compréhension plus complète des changements d’état interne évoqués et de l’activité à l’échelle du cerveau.

Profilage des réponses comportementales maternelles lors de l’imagerie du cerveau entier

Ici, nous présentons un protocole pour détecter et quantifier le comportement de poursuite prédatrice dans un modèle murin. Cette plate-forme fournit un nouveau paradigme de recherche pour l’étude de la dynamique et des mécanismes neuronaux du comportement de poursuite prédatrice chez la souris et fournira une plate-forme standardisée pour l’étude du comportement de poursuite.

Un système interactif en temps réel pour étudier le comportement de poursuite conflictuelle chez les rongeurs

Les vocalisations ultrasoniques de rat et souris de laboratoire (USV) sont utiles pour étudier les fonctions vocales et neuronales. Ce protocole décrit un paradigme nourriture-récompense qui provoque de manière fiable des USV appétitifs sans confusion liée à l’accouplement. Il détaille le conditionnement animal, la présentation des stimulus, l’enregistrement et l’analyse acoustique, fournissant une méthode reproductible pour étudier la fonction affective-motivationnelle et sensorimo-motrice...

Déclenchement anticipé de vocalisations ultrasoniques appétitives chez les rats et souris de laboratoire

Découvrez un système de lecture vidéo interactif automatisé pour étudier les comportements de parade chez les femelles de poissons épées. Cette méthode permet d'analyser les préférences d'accouplement en temps réel grâce à un modèle numérique réactif.

Lecture automatique Interactive Video pour les études de la communication animale

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