Name: Rejet de fond de fluorescence de résonance et spontanée microspectroscopie Raman (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-05-18T12:00:00.000+00:00
Duration: 15 min 4 s
Description: Apprenez à construire une porte optique tout-optique qui isole les signaux Raman du bruit de fluorescence en utilisant une commutation ultrarapide. Cette méthode permet une quantification biochimique précise avec des rapports signal/bruit élevés.

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Ce travail a été financé par la NSF prix DBI 0852891. Une partie de ce travail a également été financée par le Centre pour la science et la technologie biophotonique, un désigné NSF Science et Technology Center géré par l&#39;Université de Californie, Davis, sous l&#39;accord de coopération n ° PHY0120999.

1. Certaines précautions doivent être prises dans la préparation et à placer un échantillon Raman dans ce système. <ol><li> Parce que le système permet généralement l'utilisation d'objectifs très élevés ouverture numérique avec de très courtes distances de travail, les échantillons sont placés sur une lamelle. Les échantillons biologiques sont généralement placés sur une lamelle d'épaisseur n ° 1 monté dans une chambre de la cellule Attofluor (Invitrogen, Carlsbad, CA). </li><li> Les échantillons liquides, en particulier ceux toxique pour les humains, sont placés dans une petite bouteille de verre avec une lamelle collée à l'ouverture au moyen d'une résine époxy de silicone. La bouteille est ensuite inversé pour la mesure. </li><li> Parce que notre système repose sur le calendrier précis de la pompe et impulsions du signal, nous sommes contraints de ne pas utiliser le réglage du tirage optique conventionnelle de notre microscope, ce qui traduit l'objectif de haut en bas. Cela ajoute et soustrait du chemin optique de notre système. Au lieu de cela, nous mettons nos échantillons sur une scène secondaire, monté sur le dessus de la platine du microscope qui a son propre contrôle de discussion indépendant. </li></ol> 2. Afin de prendre le temps-dépendants spectres Raman, le faisceau d'excitation doivent être correctement préparés. <ol><li> Nous commençons avec la lumière émergeant d'un 2,4 W accordable Ti pulsée: Sapph laser (Chameleon, des systèmes cohérents, Santa Clara, CA). Chaque impulsion dans le train d'impulsions de 80 MHz a 30 nJ d'énergie, a une largeur temporelle de 140 fs, et a un spectre centré à 808 nm avec une bande passante spectrale de ~ 6 nm. </li><li> Pour éviter de back-reflets de revenir dans la cavité du laser, la lumière est passée à travers un isolateur de Faraday. Une lame demi-onde placée avant l'isolateur de Faraday permet de régler en continu de la puissance totale envoyée dans le système. </li><li> Parce que 6 nm est trop large bande passante pour résoudre la plupart des modes Raman, le faisceau est envoyé à travers un filtre passe-bande (0,8 nm FWHM, Andover Corporation, Salem, NH), très étroite centrée à 808 nm. </li><li> La lumière est ensuite focalisée par un doublet achromatique (f = 100 mm) sur une 5 mm β-borate de baryum (BBO) cristal (CASIX, Fuzhou, Fujian, Chine) pour réduire de moitié la longueur d'onde de 808 à 404 nm nm. Le cristal de BBO est placé dans une monture avec des contrôles pointe et d'inclinaison, et également montés sur une platine de translation. Pour maximiser l'efficacité de la conversion de longueur d'onde, le cristal doit être placé exactement symétrique par rapport à l'objectif du pourpoint, et avec son axe de cristal aligné à la polarisation du faisceau entrant. </li><li> Parce que l'efficacité de la conversion de longueur d'onde est dépendant de la polarisation, le contrôle sur la quantité de lumière envoyée sur l'échantillon peut être obtenue en plaçant une seconde lame demi-onde, après l'isolateur de Faraday. En tournant ce waveplate, l'intensité de la lumière envoyée sur l'échantillon peut être ajusté indépendamment de l'intensité envoyée dans le faisceau de pompe (à discuter ci-dessous). </li><li> La longueur d'onde de lumière est convertie recollimated par un doublet achromatique seconde (f = 500 mm) choisi de telle sorte que le faisceau sortant est assez grand pour remplir l'ouverture arrière de l'objectif du microscope, et dirigé dans un microscope inversé (IX-71, Olympus, Center Valley, Pennsylvanie) au moyen de deux miroirs de pilotage. </li><li> L'objectif de microscope, étant l'élément optique logé dans la composante la plus monolithique du système, définit l'axe optique. Pour aligner le faisceau d'excitation à cet axe, un miroir est placé dans le plan de l'échantillon du microscope. Les deux miroirs de pilotage sont ensuite itérativement à l'écoute tout en observant l'arrière-reflété faisceau laser sur une caméra CCD de l'époque (μEye, IDS, Obersulm, Allemagne) connecté au port d'imagerie du microscope. En supposant que l'image de la caméra est centrée sur le microscope champ de vue, la poutre est dans l'axe lorsque la tache focale est centrée sur la puce de microscope et de traduction de l'objectif le long de l'axe z ne change pas le point central du faisceau défocalisé. </li><li> Quand un échantillon est placé dans le plan de l'échantillon et irradiée avec une lumière laser Raman se produit. Un filtre dichroïque placé sous l'objectif du microscope sépare la longueur d'onde de lumière décalée Raman diffusée (et fluorescence) à partir du faisceau d'excitation, de diriger la lumière Raman éparpillés sur le port côté du microscope. Le microscope a été modifié pour enlever les lentilles dans cette voie, tels que le signal lumineux émerge du microscope collimaté. </li><li> Parce que le faisceau signal sortant de la loupe est plus grand que l'ouverture claire des polariseurs Glan-Thompson, un télescope 0.47x construit de deux doublets achromatiques (f1 = 75 mm, f2 = 35 mm) est utilisé pour réduire la poutre. </li><li> Le signal lumineux est alors polarisée par un polariseur de Glan-Thompson orientés à 0 ° par rapport à la verticale dans le cadre du laboratoire, et dirigé vers un miroir dichroïque où il est recombiné avec le faisceau de pompe. </li></ol> 3. Pour que la porte optique pour fonctionner à plein rendement, il faut prendre soin dans la préparation du faisceau de pompe (Kerr faisceau) aussi bien. <ol> L'impulsion de la pompe est d'abord amplifié par 0.35x avec un télescope construit avec deux doublets achromatiques (f1 = 35 mm, f2 = 100 mm) pour correspondre à la taille finale du faisceau signal. <li> Le faisceau pompe est ensuite envoyé dans une ligne à retard composée d'un prisme à angle droit placé sur une platine de translation linéaire qui peut être réglé pour assurer chevauchement temporel de la pompe et les impulsions du signal (réglage d'être discutés ci-dessous). </li><li> Après la ligne de retard, le faisceau est envoyé à travers une lame demi-onde et le polariseur orienté à 45 ° par rapport à la verticale dans le cadre du laboratoire. Cela garantit l'état de polarisation correcte du faisceau de pompe quand elle atteint le milieu non linéaire. </li><li> La lumière est ensuite réfléchie sur deux miroirs de pilotage, l'un avec piézo-électriques de contrôle, qui sont utilisés pour ajuster finement la position du faisceau de pompe de telle sorte qu'il recouvre spatialement avec le faisceau de signal. Le chevauchement est obtenue en observant la pompe et des poutres de signal à deux endroits, un proche et un loin d'un miroir dichroïque où les poutres sont combinés. En utilisant le miroir de pilotage premier à chevaucher les deux faisceaux au point près, et le miroir piézoélectrique à se chevaucher les poutres au point jusqu'à présent, le faisceau de pompe peut être fait exactement colinéaire avec le faisceau signal. </li><li> Avec les deux faisceaux combinés, la porte de Kerr et le système de collecte sont mis en place pour maximiser le temps-dépendants recueillies signal. </li></ol> 4. Avec les deux faisceaux combinés, la porte de Kerr et le système de collecte sont mis en place pour maximiser le temps-dépendants recueillies signal. <ol><li> Les poutres de la pompe et le signal sont d'abord passés par un filtre dichroïque qui a un diamètre extérieur de 6 à 404 nm pour empêcher toute lumière d'excitation résiduelle de diffusion Raman passionnante au sein du milieu non linéaire. </li><li> La pompe et le signal de poutres sont ensuite focalisés par deux un doublet achromatique (f = 35 mm) dans une cuvette de 1 cm de trajet optique de quartz contenant le matériau non linéaire. Tout matériel non linéaires ayant une convenablement haut indice non linéaire (plus élevé que CS 2), et convenablement courte réponse temporelle (&lt;2 PS), peut être utilisé ici. Pour ces expériences, nous utilisons le disulfure de carbone, CS 2, qui a un indice non linéaire n 2 = 3,1 x 10 -18 m 2 / W. La lumière est ensuite recollimated par un second doublet avec une longueur focale identique à la première. </li><li> Les poutres sont ensuite passé à travers et de Glan-Thompson analyseur sur une monture tournante, et ensuite à travers un ensemble de filtres d'absorption et les interférences qui ont combiné une DO de 10 à 808 nm. </li><li> Enfin, le signal lumineux est focalisée par un doublet achromatique (f = 35 mm) dans une fibre de 50 um optique multimode, où la fibre est montée dans un stade qui permet la traduction en x, y et z. La fibre est ensuite couplé à un spectrographe d'imagerie commerciale avec joint caméra CCD (SP2300i et Pixis 100B, respectivement, tous deux fabriqués par Princeton Instruments, Trenton, NJ). </li><li> Pour aligner le système de collecte afin de maximiser le signal recueilli, l'analyseur est réglé à 0 ° et un échantillon test de toluène est placée dans le plan de l'échantillon. En ajustant les x, y, z et les commandes de la monture en fibre, le signal recueilli Raman est optimisé. </li><li> Pour assurer le bon chevauchement spatial et temporel de la pompe et les poutres du signal, un miroir est placé dans le plan de l'échantillon du microscope. Le filtre 404 nm, est retiré du système. Avec l'analyseur de rotation à 90 ° le faisceau 404 nm rétroréfléchie est envoyé dans le spectrographe avec l'intensité ajustée de telle sorte qu'il ne sature pas la caméra. Avec le faisceau pompe, l'analyseur est tourné pour minimiser le signal transmis 404 nm. Avec le faisceau pompe rallumé, le stade de retard est réglé lentement jusqu'à ce que la transmission de la lumière 404 nm commence à augmenter. Puis, par itération tuning au stade de retard, le miroir piézo-électriques, et les x, y, z et les commandes de la fibre, on maximise le signal. </li><li> Parce que la rétro-réfléchie du faisceau 404 nm et la lumière Raman dispersés peuvent prendre des chemins légèrement différents à travers le système, les derniers ajustements sont réalisés en plaçant une forte Raman diffuseur (comme le toluène) sur la scène de l'échantillon et le tordant légèrement l'alignement en modifiant les étage de retard, piezeo-électrique miroir, et les commandes x, y et z de la fibre pour optimiser le signal Raman. </li></ol> 5. Collection d'un seul temps-dépendants spectre Raman nécessite l'acquisition de plusieurs spectres pour corriger les artefacts du système. <ol><li> Avec l'analyseur à 0 °, le faisceau d'excitation et de la poutre sur la pompe, un «non synchronisées" spectre est prise, ce qui représente le spectre qui seraient acquis sans l'avantage du système de temps de déclenchement. </li><li> Avec l'analyseur réglé à 90 °, le faisceau d'excitation et le faisceau de pompe toujours éteint, un large arrière-plan est prise, ce qui représente la quantité de lumière parasite qui fuit à travers les polariseurs et d'autres éléments dans le système. </li><li> Avec l'analyseur reste à 90 °et toutes les poutres sur les "gated" spectre est prise, ce qui représente la lumière Raman dispersés autorisé par la polariseurs croisés par la présence du faisceau de pompe. </li><li> Enfin, avec l'analyseur reste à 90 °, le faisceau d'excitation hors tension et le faisceau pompe sur un spectre de fond seconde est prise, ce qui représente la contribution à la "gated" spectre des quantités résiduelles de la lumière 808 nm pénétrant dans le spectrographe. </li><li> De plus, un spectre est pris avec tous les lasers off, caractérisant le niveau de référence au niveau "sombre" du signal de la caméra et l'électronique. </li><li> Parce que les spectres ont souvent besoin de temps d'intégration longs, il est impératif de briser ce temps d'intégration en plusieurs morceaux (frames) pour permettre la correction appropriée des rayons cosmiques - un problème commun lors de l'acquisition de données sur des portées de plusieurs minutes. </li></ol> 6. Une fois acquis, plusieurs étapes de traitement sont utiles pour améliorer la qualité et l'apparence des données. <ol><li> Premièrement, tous les spectres sont sombres corrigée en soustrayant au large de la "sombre" du spectre. </li><li> Pour corriger les rayons cosmiques, les cadres de plusieurs constituant une acquisition sont comparées les unes aux autres sur une base pixel par pixel. Pour chaque pixel d'une trame qui tombe en dehors de 2 écarts médians de la valeur médiane pour ce pixel dans tous les cadres, la valeur de ce pixel est remplacé par la valeur médiane pour tous les cadres. </li><li> Les cadres de rayons cosmiques corrigées sont ensuite moyennées et lissée par un filtre Savitzky-Golay 1. </li><li> Pour extraire le "vrai" spectre fermée, on soustrait le «excitation-only" et "pompe seule" spectres du spectre mesuré fermée. </li><li> Enfin, les spectres fermé et non synchronisées sont ensuite fond corrigée en soustrayant une 5 ème ordre polynomial, déterminée selon la méthode de Lieber et Mahadevan-Jansen 2. </li></ol> 7. Les résultats représentatifs: <img src="/files/ftp_upload/2592/2592fig1.jpg" alt="Figure 1" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 1"> Figure 1. Schéma du système de déclenchement Kerr. La trajectoire du faisceau pompe est représentée en rouge, tandis que le chemin SHG est représentée en bleu. Le chemin où Raman et de fluorescence sont superposées est représenté en vert, tandis que le chemin où la fluorescence a été temporellement filtré est représenté en jaune. Abréviations comme suit: BPF, filtre passe-bande; CCD, charge-coupled device; DCM, miroir dichroïque; FI, Faraday isolateur; λ / 2, la plaque demi-onde; LPF, filtre passe-temps; NLM, milieu non linéaire; P, polariseur ; SHG, cristal génération de second harmonique. <img src="/files/ftp_upload/2592/2592fig2.jpg" alt="Figure 2" data-altupdatedat="1787634011000" data-alt="Figure 2"> Figure 2 Haut:. Spectres bruts de coumarine dissous dans l'huile d'immersion. La courbe rouge représente le spectre d'prises avec le portail ouvert (analyseur fixé pour une transmission maximale). Courbe noire montre le spectre pris avec l'analyseur aligné pour la transmission minimum et un faisceau de pompe appliquée (le spectre gated). Courbe bleue montre les spectum prises avec l'analyseur aligné pour la transmission minimum et aucun faisceau de pompe appliquée (portail maintenu fermé). Courbe verte montre le spectre pris avec seulement le faisceau de pompe appliquée. Lignes magenta pointillés indiquent la région spectrale représentée dans le panneau ci-dessous. Tous les spectres ont été lissés avec un point 11, 3ème ordre Savitzky-Golay filtre. En bas: spectres de coumarine dissous dans de l'huile d'immersion après la fluorescence soustraction du fond. La courbe rouge est le spectre avec la porte maintenue ouverte, et la courbe bleue est le spectre fermée. Le spectre montre clairement les gated pic caractéristique alambiqué haute onde d'huiles.

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Le domaine de la spectroscopie Raman biomédicale a constaté un intérêt croissant au cours des dernières années en raison de son potentiel démontré pour résoudre plusieurs défis difficiles dans le diagnostic biologique. Par exemple, les spectres Raman ont été montré pour avoir une valeur diagnostique dans le cancer de détection 3, 4, 5, 6. La spectroscopie Raman a également été utilisée dans la quantification bactérienne 7, 8 et 9 réponse aux médicaments bactérienne. Il a également trouvé...

<table border="1"><tbody><tr><th> Nom </th><th> Société </th><th> Nombre de catalogue </th><th> Commentaires </th></tr><tr><td> Lentilles </td><td> Thorlabs </td><td> Divers </td><td> Tous les verres traités à avoir des pertes de transmission maximale de 1% chaque </td></tr><tr><td> Accordable Ti: Sapph au laser </td><td> Cohérente </td><td> Caméléon </td><td> 30 nJ, 200 fs, 80 MHz </td></tr><tr><td> 40X objectif à immersion </td><td> Olympus </td><td> UApo/340 </td><td> NA = 1,35 </td></tr><tr><td> Microscope inversé </td><td> Olympus </td><td> IX-71 </td><td> Mise à jour pour enlever toutes les lentilles dans le port côté </td></tr><tr><td> La moitié lame d&#39;onde </td><td> Thorlabs </td><td> AHWP05M-600 </td><td></td></tr><tr><td> Polariseur Glan-Thompson </td><td> Thorlabs </td><td> GTH10M </td><td> ~ Perte de transmission de 10% </td></tr><tr><td> Spectromètre </td><td> PI Acton </td><td> SP2300i </td><td></td></tr><tr><td> CCD </td><td> PI Acton </td><td> Pixis 100B </td><td></td></tr><tr><td> Logiciels mathmatical </td><td> The MathWorks </td><td> MATLAB </td><td> Version 2008a </td></tr><tr><td> Faraday isolateur </td><td> EOT </td><td> BB8-5I </td><td></td></tr><tr><td> Piézo-électrique miroir </td><td> Newport </td><td> AG-M100 </td><td></td></tr><tr><td> BBO de cristal </td><td> CASIX </td><td> personnalisée </td><td> 1 mm d&#39;épaisseur </td></tr><tr><td> Filtre passe-bande 1 </td><td> Andover </td><td> 008FC14 </td><td> 808 ± 0,4 nm </td></tr><tr><td> Miroir dichroïque </td><td> Semrock </td><td> FF662-FDI01 </td><td> bord de bande à 662 nm </td></tr><tr><td> Longue filtre passe- </td><td> Semrock </td><td> BLP01-405R </td><td> bord de bande à 417 nm </td></tr><tr><td> Filtre passe-bande 2 </td><td> Semrock </td><td> FF02-447/60 </td><td> 417-447 nm </td></tr><tr><td> CS 2 </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 335266 </td><td> 99% de pureté </td></tr><tr><td> Coumarine 30 </td><td> Sigma-Aldrich </td><td> 546127 </td><td> 99% de pureté </td></tr><tr><td> Huile à immersion </td><td> Cargille </td><td> 16242 </td><td> Type de DF </td></tr></tbody></table>

rejet de fond de fluorescence de résonance et spontanée microspectroscopie raman

Rejection of Fluorescence Background in Resonance and Spontaneous Raman Microspectroscopy

Spectroscopie Raman est souvent en proie à un fond fluorescent intense, surtout pour les échantillons biologiques. Si un échantillon est excité par un train d&#39;impulsions ultra-rapides, un système qui peut séparer temporairement spectralement chevauchement des signaux sur une échelle de temps picoseconde permet d&#39;isoler rapidement arriver Raman de la lumière diffusée à partir de fin-lumière de fluorescence qui arrivent. Ici, nous discutons de la construction et l&#39;exploitation d&#39;un système optique complexe non linéaire qui utilise tout-optiques de commutation sous la forme d&#39;un portail de faible puissance Kerr optique d&#39;isoler les signaux Raman et de fluorescence. Une seule 808 nm laser avec 2,4 W de puissance moyenne et de 80 MHz taux de répétition est divisée, avec environ 200 mW de lumière 808 nm étant converti en &lt;5 mW de 404 nm de lumière envoyée sur l&#39;échantillon pour exciter la diffusion Raman. Le reste de lumière inconvertis 808 nm est ensuite envoyé à un milieu non linéaire où il agit comme la pompe pour l&#39;obturateur tout-optique. L&#39;obturateur s&#39;ouvre et se ferme en 800 fs avec une efficacité maximale d&#39;environ 5%. Grâce à ce système, nous sommes en mesure de séparer les signaux succès Raman et de fluorescence à un taux de répétition de 80 MHz en utilisant des énergies d&#39;impulsion et de puissances moyennes qui restent biologiquement sûrs. Parce que le système n&#39;a pas de capacité de réserve en termes de puissance optique, nous détaillons quelques considérations de conception et de l&#39;alignement que l&#39;aide à maximiser le débit du système. Nous discutons également de notre protocole pour l&#39;obtention du chevauchement spatial et temporel du signal et des poutres de pompe dans le milieu Kerr, ainsi que d&#39;un protocole détaillé pour l&#39;acquisition spectrale. Enfin, nous rapportons un des résultats représentatifs de quelques spectres Raman, obtenu en présence d&#39;une forte fluorescence à l&#39;aide de notre temps de déclenchement du système.

Nous discutons de la construction et l&#39;exploitation d&#39;un système optique complexe non linéaire qui utilise ultrarapide tout-optiques de commutation pour isoler Raman de signaux de fluorescence. Grâce à ce système, nous sommes en mesure de séparer les signaux succès Raman et de fluorescence en utilisant des énergies d&#39;impulsion et de puissances moyennes qui restent biologiquement sûrs.

Rejet de fond de fluorescence de résonance et spontanée microspectroscopie Raman

La spectroscopie Raman est souvent entravée par un fond fluorescent intense, particulièrement pour les échantillons biologiques. Si un échantillon est excité par un train de...

L'objectif de cette procédure est de concevoir un dispositif optique complet pour la marche qui transmette la lumière diffusée Raman tout en rejetant les signaux fluorescents. Cela est réalisé en premier lieu en excitant et en polarisant la diffusion Raman. La deuxième étape de la procédure consiste à préparer le faisceau pompe afin de faire fonctionner la porte.Troisièmement, la pompe, le faisceau et les impulsions doivent être ajustées de manière à ce qu'elles se superposent. La dernière étape de la procédure consiste à acquérir des spectres avec une fenêtre temporelle. En fin de compte, des résultats peuvent être obtenus, montrant une quantification et une classification biochimiques grâce à l'analyse des signaux Raman avec des rapports signal sur bruit élevés.Le principal avantage de cette technique par rapport aux méthodes existantes, telles que la suppression logicielle du fond de fluorescence, réside dans la réduction significative du bruit de grenaille produit par la fluorescence. Cette méthode peut aider à répondre à des questions essentielles dans les domaines biologique et biomédical, telles que la caractérisation non invasive de la composition chimique de fluorogènes en

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Sans contact, sans étiquette de surveillance des cellules et la matrice extracellulaire en utilisant la spectroscopie Raman

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Resonance Raman Spectroscopy de Extreme nanofils et autres systèmes 1D

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Quasi-résonance à haute résolution Phonon assistée Fluorescence Spectroscopy

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Une nouvelle technique pour Raman Analyse des échantillons hautement radioactifs L&#39;utilisation d&#39;un standard Micro-Raman Spectromètre

Un protocole d’analyse étape par étape de spectroélectrochimiques Raman et infrarouge est présenté.

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Cet article compare directement la résolution, la sensibilité et les contrastes d’imagerie de la diffusion Raman stimulée (SRS) et de la diffusion Raman anti-Stokes cohérente (CARS) intégrées dans la même plate-forme de microscope. Les résultats montrent que CARS a une meilleure résolution spatiale, SRS donne de meilleurs contrastes et une meilleure résolution spectrale, et les deux méthodes ont une sensibilité similaire.

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Précis, quantification basée sur la causalité de la fonction diastolique global a été réalisé par l'analyse cinématique basée sur la modélisation des flux transmitral via le paramétrée diastolique de remplissage (PDF) de formalisme. PDF génère rigidité, la relaxation et les paramètres de charge unique et met en lumière «nouvelle» physiologie tout en fournissant des indices sensibles et spécifiques de la dysfonction.

Quantification de Global diastolique fonction de l&#39;analyse basée sur la modélisation cinématique de transmitral débit via le formalisme de remplissage diastolique paramétrée

Apprenez à construire une porte optique tout-optique qui isole les signaux Raman du bruit de fluorescence en utilisant une commutation ultrarapide. Cette méthode permet une quantification biochimique précise avec des rapports signal/bruit élevés.

Rejet de fond de fluorescence de résonance et spontanée microspectroscopie Raman

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