Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Sandra Deliard; Jianhua Zhao; Qianghua Xia; Struan F.A. Grant

doi:10.3791/50286

Génération de haute qualité Immunoprécipitation de la chromatine Patron de l'ADN pour le séqu...

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Generation of High Quality Chromatin Immunoprecipitation DNA Template for High-throughput Sequencing (ChIP-seq)

Génération de haute qualité Immunoprécipitation de la chromatine Patron de l'ADN pour le séquençage à haut débit (ChIP-seq)

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09:52 min

April 19, 2013

DOI: 10.3791/50286-v

Sandra Deliard¹, Jianhua Zhao¹, Qianghua Xia¹, Struan F.A. Grant^1,2

¹Division of Human Genetics,Children's Hospital of Philadelphia Research Institute, ²Department of Pediatrics, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

La combinaison de l'immunoprécipitation de la chromatine et le séquençage ultra-haut débit (chip-seq) permet d'identifier et de cartographier les interactions protéine-ADN dans une lignée de tissu ou de cellule donné. Décrit est de savoir comment générer un modèle de puce de haute qualité pour le séquençage ultérieur, en utilisant l'expérience avec le facteur de transcription TCF7L2 comme un exemple.

L’objectif global de cette procédure est d’identifier les régions de liaison aux protéines via la chromatine. Ceci est accompli en réticulant d’abord la protéine à l’ADN. La deuxième étape consiste à cisailler l’ADN.

Ensuite, la protéine cible liée à l’ADN est immunoprécipitée, puis évoquée. La dernière étape consiste à inverser la réticulation et à isoler l’ADN. En fin de compte, l’immunoprécipitation de la chromatine est utilisée pour montrer la localisation de la liaison aux protéines à travers le génome.

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