Name: Mince couche chromatographique (CCM) Séparations et essais biologiques dextraits végétaux pour identifier des composés antimicrobiens (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-03-27T22:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 4 s
Description: Découvrez la chromatographie sur couche mince pour identifier des métabolites antimicrobiens dans les extraits végétaux. Cette méthode utilise la bioautographie de contact pour évaluer l'activité contre les bactéries anaérobies du rumen.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Nous remercions le regretté Dr Norm Taylor, Département des plantes et de la science du sol à l&#39;Université du Kentucky, pour nous permettre d&#39;utiliser des échantillons de ses parcelles de trèfle rouge pour cette étude. Ce projet a été financé par le ministère de l&#39;Agriculture des États-Unis.

Une. Préparation de l&#39;extrait de la plante <ol><li> Voir Kagan et Flythe 10 pour l&#39;extraction des composés phénoliques de Trifolium pratense cv. Kenland. </li><li> Pour extraire d&#39;autres composés dans d&#39;autres usines, consultez la documentation de l&#39;analyse phytochimique des méthodes d&#39;extraction de plantes ou spécifique-métabolites (beaucoup sont décrits), ou chercher des protocoles tels que ceux de Khurram et al. 7,8 qui isolent de nombreux composés d&#39;un grand gamme de polarités. </li></ol> 2. Préparation de couche mince Plaques <ol><li> Nettoyer les plaques de CCM par le développement dans un ou plusieurs solvants polaires neutres, afin de déplacer les contaminants adsorbés hors de la zone de développement. <ol><li> Dans une hotte de laboratoire, préparer suffisamment de solvant de nettoyage (par exemple 15 à 100 ml d&#39;acétate d&#39;éthyle-méthanol 2:1, v / v) pour couvrir le fond de la chambre de développement TLC, ainsi que le bord inférieur d&#39;une plaque de CCM lors de consigne à l&#39;intérieur de la chambre. </li><li> Utilisez comverre ment disponible TLC développer chambres (différentes tailles disponibles, avec des couvercles) ou béchers en pyrex recouvert de papier aluminium ou bocaux. </li><li> Utilisez des ciseaux pour couper (flexibles) des plaques de gel de silice en plastique à des créances, qui viennent dans différentes tailles (20 cm x 20 cm et plus petits), pour s&#39;adapter à la chambre de développement disponible en aluminium ou. (Attention: la silice peut provoquer une atteinte des poumons en cas d&#39;inhalation Travailler dans une hotte, et manipuler des plaques de CCM avec des gants pour éviter d&#39;avoir des huiles de la peau sur la silice..) </li><li> Insérez les plaques dans la chambre, avec les sommets appuyé contre les parois de la chambre. Elles ne doivent pas se toucher. Couvrir la chambre et laissez le solvant déplacer la plaque par capillarité. </li><li> Lorsque le solvant a atteint le sommet des plaques, enlever les plaques de la chambre et les disposer dans une position debout dans la hotte jusqu&#39;à évaporation du solvant. </li><li> Vérifiez si des impuretés ont migré vers le haut de la plaque de CCM par la recherche d&#39;une bande jaune sous visiblelumière, ou une bande fluorescente sous rayonnement ultraviolet (UV) (voir le «front d&#39;impureté&quot; ou SI sur la figure 2B). Si la majorité de la plaque a encore une teinte jaunâtre, répétez le processus de nettoyage. </li><li> Après avoir enlevé les plaques CCM de la chambre, jeter le solvant. Laisser le solvant résiduel s&#39;évaporer complètement avant d&#39;utiliser la chambre pour le protocole 2. </li><li> Pour éliminer l&#39;humidité résiduelle qui peut affecter la migration des composés de silice 16, prop les plaques en position verticale dans un four de séchage à 100 ° C (10-15 min pour un 20 cm x 20 cm plaque, et 5 min pour 7 cm x 10 cm plaques ). </li><li> Si un séchage à l&#39;étuve à 100 ° C n&#39;est pas disponible, les plaques de chaleur pour une période de temps plus longue à des températures plus basses (par exemple 40 min à 60 ° C). </li><li> Après que les plaques sont sèches, les laisser refroidir à température ambiante avant de le charger. </li></ol></li></ol> 3. Préparation de développement Chambers pour Extrait séparation <ol&gt; <li> Utilisez des ciseaux pour couper un morceau de papier filtre légèrement en dessous de la hauteur de la chambre, et environ la moitié du périmètre de la chambre de largeur. Ce papier agit comme une mèche pour tirer solvant jusqu&#39;à la paroi de la chambre et de saturer la chambre avec les vapeurs de solvant et d&#39;améliorer ainsi la reproductibilité des séparations 1. </li><li> Dans une hotte, mélanger de solvants (acétate d&#39;éthyle-méthanol 4:1, v / v, pour cette étude). Verser le mélange de solvant dans la chambre et couvrir. Attendez jusqu&#39;à ce que toute la mèche est mouillée avec un solvant, ce qui indique la saturation de la chambre, de mettre des plaques dans la chambre. </li></ol> 4. Chargement en cours et le développement de Plaques CCM <ol><li> Légèrement marquer l&#39;origine avec un crayon. Si la plaque adsorbant TLC est tendre et fragile, des notes sur les bords. Les composés doivent être au-dessus de la surface du solvant de développement lorsque les plaques sont insérées dans la chambre de TLC. </li><li> Dissoudre les extraits dans suffisamment de solvant organique (en l&#39;occurrence, le methanol) à une solution concentrée à la place d&#39;un troublesuspension. </li><li> Charger les échantillons et les normes que des bandes étroites avec une seringue microlitre ou micropipettes capillaires, laissant un 1 cm frontière sur les côtés de la plaque. Laissez les bandes sécher (attisant la plaque ou le charger dans une hotte aide). </li><li> Si une plus grande concentration de l&#39;échantillon est nécessaire sur une plaque, &quot;overspot» en chargeant des échantillons de nouveau sur les bandes séchées. </li><li> Avec des pinces ou des pinces, la plaque de fixation (s) à l&#39;intérieur de la chambre TLC saturé. Elles ne doivent pas toucher la mèche, car il peut fournir solvant pour les plaques aux points de contact, modifiant ainsi le chemin de la migration de composé. Couvrez et laissez chambre plaques se développent. </li></ol> 5. Préparation des plaques pour les essais biologiques <ol><li> Retirer la plaque (s) de réservoir CCM avant le front de solvant atteigne le haut de la plaque, et marquer la hauteur du front de solvant avec un crayon. Laissez plaque sèche dans une hotte. <ol><li> Développer des plaques de CCM restant dans la même chambre TLC, qui est geralement utilisable pour une journée entière si gardé fermé. Refaire un mélange de solvants pour chromatographie sur couche mince chambre si la quantité de solvant dans la chambre diminue notablement. </li></ol></li><li> Après plaques sont sèches, visualiser les bandes à la lumière visible ou UV, et de délimiter les bandes avec un crayon. Une chambre d&#39;observation avec une lampe UV portable est pratique, surtout si la lampe peut détecter des composés à la fois 254 nm (ondes courtes UV) et 365 nm (longueur d&#39;onde UV). Remarque: À ce stade ou après la prochaine étape, les plaques peuvent être enveloppés dans une pellicule de plastique, recouverts d&#39;une feuille, et conservés à -20 ° C. Durée maximale de conservation dépend de la stabilité de composé. Parce que la silice n&#39;est pas neutre, certains composés peuvent se dégradent tandis que sur la plaque de CCM. </li><li> Photographier ou dessiner plaques. <ol><li> Utilisez un système de gel photodocumentation si une équipée d&#39;UV-dessus et / ou les lumières visibles est disponible. </li><li> Si aucun système d&#39;photodocumentation commerciale est disponible, plaques de photographie à l&#39;intérieur d&#39;une boîte doublés de papier noir ou tissu, wie Un jeu de caméra sur un trépied et une lumière UV portable bloqué à un support annulaire 17. Lorsque vous photographiez des plaques qui n&#39;ont pas un indicateur fluorescent, utiliser un filtre de la lumière bleue sur la lentille de la caméra pour améliorer l&#39;apparence de la bande 17. </li></ol></li><li> Pour aider à la caractérisation des bandes, calculer le facteur de rétention (Rf) en mesurant les valeurs de distances parcourues par le composé et le front de solvant, et en divisant la première par la seconde (Figure 2A). </li></ol> 6. Culture bactérienne et dosage <ol><li> Préparer et inoculer médias dans des conditions anaérobies. La culture utilisée dans ce cas était Clostridium sticklandii souche SR, qui a été obtenu à partir de la collection de cultures de James B. Russell, Cornell University, Ithaca, NY. <ol><li> Voir Flythe et Kagan 13 et la liste des matériaux pour une description des HAB médias. </li></ol></li><li> Cultiver la culture à la phase exponentielle ou stationnaire. Utilisez anaérobie techniqu stérilees lorsqu&#39;on travaille avec des micro-organismes anaérobies. </li><li> Inoculer la culture (1% v / v) dans de la gélose en fusion après que la température de la gélose (0,75% p / v) a diminué à moins de 60 ° C. Mélanger délicatement et mettre immédiatement dans une chambre anaérobie (95% de CO 2 -5% H 2 atmosphère HAB médias) à verser. </li><li> Verser dans 15 mm x 100 mm en plastique des boîtes de Petri, et laisser se solidifier. </li><li> Avec des ciseaux, couper la plaque de CCM dans les zones contenant groupe (s) d&#39;intérêt. Lay bandes face vers le bas sur des plaques d&#39;agar-agar, le marquage des bandes sur le support de plaque pour garder une trace de l&#39;orientation originale sur plaque de CCM. Posez une bande TLC utilisé sur une plaque de gélose en tant que témoin. </li><li> Incuber les boîtes de gélose, côté agar en bas, dans la chambre anaérobie (24 h, 39 ° C). </li></ol> 7. Visualisation de testées biologiquement plaques de gélose <ol><li> Avec une pince, enlever les bandes à partir de plaques de gélose pendant qu&#39;ils sont dans la chambre anaérobie. </li><li> Ajouter 1% (p / v) tetrazolium rouge, préparée dans de l&#39;eau, goutte à goutte sur les surfaces des plaques de gélose. Laisser la coloration se développer pendant au moins 20 minutes, ou jusqu&#39;à ce que la plaque de commande tourne complètement rouge, avant de retirer de la chambre anaérobie. Les bactéries anaérobies commencent à perdre leur viabilité immédiatement après le retrait de la chambre anaérobie, mais la couleur est stable pendant plus de 24 heures. </li><li> Photographier à la lumière visible. </li></ol>

<ol><li>Stahl, E., Ashworth, M. R. F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aStahl%2C+E+%22Thin-layer+chromatography%22">Thin-layer chromatography</a>. , Springer. (1969).</li>
<li>Marston, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Thin-layer+chromatography+with+biological+detection+in+phytochemistry%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Chromatogr.+A%22%5BJournal%5D)">Thin-layer chromatography with biological detection in phytochemistry.</a> J. Chromatogr. A. 1218 (19), 2676-2683 Forthcoming.</li>
<li>Homans, A. L., Fuchs, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+bioautography+on+thin-layer+chromatograms+as+a+method+for+detecting+fungitoxic+substances%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Chromatogr%22%5BJournal%5D)">Direct bioautography on thin-layer chromatograms as a method for detecting fungitoxic substances.</a> J. Chromatogr. 51, 327-329 Forthcoming.</li>
<li>Lund, B. M., Lyon, G. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+inhibitors+of+Erwinia+carotovora+and+E.+herbicola+on+thin-layer+chromatograms%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Chromatogr%22%5BJournal%5D)">Detection of inhibitors of Erwinia carotovora and E. herbicola on thin-layer chromatograms.</a> J. Chromatogr. 110, 193-196 (1975).</li>
<li>Betina, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bioautography+in+paper+and+thin-layer+chromatography+and+its+scope+in+the+antibiotic+field%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Chromatogr.+A%22%5BJournal%5D)">Bioautography in paper and thin-layer chromatography and its scope in the antibiotic field.</a> J. Chromatogr. A. 78, 41-51 (1973).</li>
<li>Weltzien, H. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ein+biologischer+Test+f%C3%BCr+fungizide+Substanzen+auf+dem+Papierchromatogramm%5BTitle%5D)+AND+%22Naturwissenschaften%22%5BJournal%5D)">Ein biologischer Test für fungizide Substanzen auf dem Papierchromatogramm.</a> Naturwissenschaften. 45, 288-289 (1958).</li>
<li>Khurram, M., Khan, A. M., Hameed, A., Abbas, N., Quayum, A., Inayat, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antibacterial+activities+of+Dodonaea+viscosa+using+contact+bioautography+technique%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Antibacterial activities of Dodonaea viscosa using contact bioautography technique.</a> Molecules. 14 (3), 1332-1341 (2009).</li>
<li>Khurram, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+anticandidal+potential+of+Quercus+baloot+Griff.+using+contact+bioautography+technique%5BTitle%5D)+AND+%22Afr.+J.+Pharm.+Pharmacol%22%5BJournal%5D)">Evaluation of anticandidal potential of Quercus baloot Griff. using contact bioautography technique.</a> Afr. J. Pharm. Pharmacol. 5 (12), 1538-1542 (2012).</li>
<li>Robinson, T. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aRobinson%2C+T+%22The+Organic+Constituents+of+Higher+Plants%22">The Organic Constituents of Higher Plants</a>. , Burgess Publishing Co. (1963).</li>
<li>Kagan, I. A., Flythe, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Factors+affecting+the+separation+and+bioactivity+of+red+clover+%28Trifolium+pratense%29+extracts+assayed+against+Clostridium+sticklandii%2C+a+ruminal+hyper+ammonia-producing+bacterium%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Prod.+Commun%22%5BJournal%5D)">Factors affecting the separation and bioactivity of red clover (Trifolium pratense) extracts assayed against Clostridium sticklandii, a ruminal hyper ammonia-producing bacterium.</a> Nat. Prod. Commun. 7 (12), 1605-1608 (2012).</li>
<li>Mattila, P., Kumpulainen, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determination+of+free+and+total+phenolic+acids+in+plant-derived+foods+by+HPLC+with+diode-array+detection%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Agric.+Food+Chem%22%5BJournal%5D)">Determination of free and total phenolic acids in plant-derived foods by HPLC with diode-array detection.</a> J. Agric. Food Chem. 50 (13), 3660-3667 (2002).</li>
<li>Hamburger, M. O., Cordell, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+direct+bioautographic+TLC+assay+for+compounds+possessing+antibacterial+activity%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Nat.+Prod%22%5BJournal%5D)">A direct bioautographic TLC assay for compounds possessing antibacterial activity.</a> J. Nat. Prod. 50 (1), 19-22 (1987).</li>
<li>Flythe, M., Kagan, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+effect+of+red+clover+%28Trifolium+pratense%29+phenolic+extract+on+the+ruminal+hyper+ammonia-producing+bacterium%2C+Clostridium+sticklandii%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial effect of red clover (Trifolium pratense) phenolic extract on the ruminal hyper ammonia-producing bacterium, Clostridium sticklandii.</a> Curr. Microbiol. 61, 125-131 Forthcoming.</li>
<li>Rahalison, L., Hamburger, M., Hostettmann, K., Monod, M., Frenk, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+bioautographic+agar+overlay+method+for+the+detection+of+antifungal+compounds+from+higher+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Phytochem.+Anal%22%5BJournal%5D)">A bioautographic agar overlay method for the detection of antifungal compounds from higher plants.</a> Phytochem. Anal. 2 (5), 199-203 (1991).</li>
<li>Chomnawang, M. T., Trinapakul, C., Gritsanapan, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+antigonococcal+activity+of+Coscinium+fenestratum+stem+extract%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Ethnopharmacol%22%5BJournal%5D)">In vitro antigonococcal activity of Coscinium fenestratum stem extract.</a> J. Ethnopharmacol. 122, 445-449 (2009).</li>
<li>Stahl, E., Kaldewey, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spurenanalyse+physiologisch+aktiver%2C+einfacher+Indolderivate%5BTitle%5D)+AND+%22Hoppe-Seyler%E2%80%99s+Z.+Physiol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Spurenanalyse physiologisch aktiver, einfacher Indolderivate.</a> Hoppe-Seyler’s Z. Physiol. Chem. 323, 182-191 Forthcoming.</li>
<li>Kagan, I. A., Hammerschmidt, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Arabidopsis+ecotype+variability+in+camalexin+production+and+reaction+to+infection+by+Alternaria+brassicicola%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Chem.+Ecol%22%5BJournal%5D)">Arabidopsis ecotype variability in camalexin production and reaction to infection by Alternaria brassicicola.</a> J. Chem. Ecol. 28 (11), 2121-2140 (2002).</li>
<li>Kline, R. M., Golab, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+technique+in+developing+thin-layer+bioautographs%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Chromatogr%22%5BJournal%5D)">A simple technique in developing thin-layer bioautographs.</a> J. Chromatogr. 18, 409-411 (1965).</li>
<li>Wedge, D. E., Nagle, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+new+2D-TLC+bioautography+method+for+the+discovery+of+novel+antifungal+agents+to+control+plant+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Nat.+Prod%22%5BJournal%5D)">A new 2D-TLC bioautography method for the discovery of novel antifungal agents to control plant pathogens.</a> J. Nat. Prod. 63 (8), 1050-1054 (2000).</li>
<li>Beck, A. B., Knox, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+acylated+isoflavone+glycosides+from+subterranean+clover+and+red+clover%5BTitle%5D)+AND+%22Aust.+J.+Chem%22%5BJournal%5D)">The acylated isoflavone glycosides from subterranean clover and red clover.</a> Aust. J. Chem. 24 (7), 1509-1518 (1971).</li>
<li>Kahn, R. A., Bak, S., Svendsen, I., Halkier, B. A., Møller, B. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+and+reconstitution+of+cytochrome+P450ox+and+in+vitro+reconstitution+of+the+entire+biosynthetic+pathway+of+the+cyanogenic+glucoside+dhurrin+from+sorghum%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Isolation and reconstitution of cytochrome P450ox and in vitro reconstitution of the entire biosynthetic pathway of the cyanogenic glucoside dhurrin from sorghum.</a> Plant Physiol. 115 (4), (1997).</li>
<li>Peterson, C. A., Edgington, L. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+estimation+of+the+fungicide+benomyl+using+a+bioautograph+technique%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Agr.+Food+Chem%22%5BJournal%5D)">Quantitative estimation of the fungicide benomyl using a bioautograph technique.</a> J. Agr. Food Chem. 17 (4), 898-899 (1969).</li>
</ol>

La mention de noms commerciaux ou de produits commerciaux dans l&#39;article est uniquement dans le but de fournir des informations spécifiques et n&#39;implique pas une recommandation ou une approbation par l&#39;USDA. Les auteurs déclarent aucun intérêt financier concurrent.

Ce protocole décrit un procédé simple pour la séparation d&#39;un extrait en sous-ensembles de composés et de dosage de ces sous-ensembles contact par bioautographie. Le procédé est tout à fait similaire à celui utilisé par Chomnawang et al. 15 pour cribler des inhibiteurs de métabolites de plantes à des bactéries responsables de la gonorrhée. Le type de bioautographie employé à l&#39;écran pour les composés de plantes antimicrobiens dépend de nombreux facteurs, y compris la micro-organisme test, la ...

Le dosage de composés antimicrobiens dans des plantes nécessite la séparation des constituants d&#39;un extrait de plante, l&#39;exposition d&#39;un micro-organisme d&#39;essai à ces composants, et pour déterminer si la croissance du micro-organisme est inhibée par l&#39;un quelconque des composés. Séparations par papier ou chromatographie sur couche mince (CCM ou PC) sont pratiques car de nombreux composés peuvent être séparés sur une surface plane. La séparation est basée sur la polarité, avec des composés de liaison étanche à l&#39;adsorbant (cellulose dans le cas de PC, et une variété d&#39;adsorbants dans le cas de la Chromatographie sur couche mince) et la migration de moins que les autres une. Figure 1 donne un exemple de la position relative des des composés phénoliques polaires et non polaires après la séparation sur une plaque de TLC de silice. <img alt="Figure 1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/51411/51411fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/51411/51411fig1.jpg" /> Figure 1. Diagramme illustrant la répartition des composés de polarités différentes après la séparation sur une couche mince de silice chromatographique (CCM) plaque. Composés phénoliques de trèfle rouge (Trifolium pratense L.) sont utilisés comme un exemple. Des composés polaires tels que le clovamide, ont une forte affinité pour un adsorbant polaire comme le silice et restent près de l&#39;origine (OR), alors que moins de composés polaires, tels que les trois isoflavones près du front de solvant (SF), partition plus facilement dans les solvants (qui sont moins polaires que la silice à moins que l&#39;eau, des acides ou des bases sont incluses) et de migrer plus haut sur la plaque. Après séparation de l&#39;extrait sur ​​une plaque de CCM, les micro-organismes d&#39;essai peuvent être exposés à tous les composés de la plaque, en accélérant ainsi l&#39;identification des composants actifs de l&#39;extrait 2. Si une culture fongique ou bactérienne est exposé au chromatogramme, la croissance microbienne se produit partout sauf sur les zones où la croissance inhibiteurcomposés y. Zones d&#39;inhibition peuvent ensuite être visualisées en observant le contraste entre la croissance du mycélium et les zones de libre-croissance si les champignons ont été appliquées 3 ou par pulvérisation avec des composés qui changent de couleur lorsqu&#39;ils sont réduits ou hydrolysé par des cellules vivantes 4. Bien que l&#39;utilisation de papier ou couche mince chromatogrammes pour les tests antimicrobiens a été d&#39;abord appliquée aux antibiotiques et fongicides 5 3,6, extraits de plantes sont maintenant souvent masqués pour les composés antimicrobiens avec cette méthode, souvent appelés bioautographie. Les protocoles décrits ici s&#39;appliquent à bioautographie de chromatogrammes en couche mince. TLC est largement utilisé parce qu&#39;il est relativement rapide et peut être effectué sur les différents adsorbants (par exemple, la silice, l&#39;amidon, l&#39;alumine), ainsi que de fournir une bonne résolution et une sensibilité. Les extraits de plantes peuvent être préparés pour TLC dans de nombreuses façons. Les méthodes courantes comprennent le matériel végétal extraction dans alcdes mélanges tels que l&#39;éthanol à 80% 7,8, éventuellement avec l&#39;addition d&#39;acide ou de base 9 ohol à l&#39;eau. Suite à une extraction dans de tels solvants, qui contiennent un peu d&#39;eau et sont peut-être acide ou basique, les extraits doivent être concentrées de sorte qu&#39;ils peuvent être appliqués à des plaques de CCM dans un volume minimal. La concentration des extraits d&#39;alcool dans l&#39;eau peut être obtenue en divisant l&#39;aide de solvants organiques non miscibles à l&#39;eau 8 ou avec un mélange de tels solvants, tels que l&#39;éther éthylique-acétate d&#39;éthyle (1:1, v / v) 10,11. Métabolites de plantes différentes sont extraits dans différents solvants organiques, en fonction de leur polarité. Pour s&#39;assurer que les acides ou les bases organiques végétaux sont extraits dans des solvants organiques, à ce stade, le pH d&#39;un extrait d&#39;alcool dans l&#39;eau peut être élevé ou abaissé avec un acide ou une base soluble dans l&#39;eau pour convertir les analytes dissociées en leurs formes non dissociée, qui sont ensuite soluble dans les solvants organiques neutres 9. La phase organique peut alors être evaporated sous pression réduite ou sous atmosphère d&#39;azote et on ajuste le volume souhaité pour la CCM. Le pH de l&#39;extrait est peu susceptible d&#39;être létale pour les micro-organismes dans les essais biologiques en raison de la séparation des analytes dans des solvants neutres, petit volume final, et l&#39;évaporation de l&#39;extrait sur la plaque de CCM avant la séparation. Les champignons et les bactéries sont utilisées comme des micro-organismes d&#39;essai dans bioautographie d&#39;extraits de plantes 2. Les spores de certains champignons tels que Cladosporium cucumerinum, germent sur ​​des plaques de CCM (en dehors des zones avec des composés inhibiteurs) si pulvérisée sur les plaques dans une solution nutritive et on les incube dans un environnement humide pendant plusieurs jours 3. Le mycélium foncé de C. cucumerinum sur les zones non inhibitrice offre un contraste frappant avec les zones franches de la croissance du mycélium. Bien que les bactéries ont été appliquées à une Chromatographie sur couche mince (CCM) des plaques de la même manière 4,12, les bactéries sont également versé sur TLCsurfaces de la plaque de gélose superpositions 13,14. Levure, telle que Candida albicans, peut être appliquée dans les superpositions de gélose ainsi 14. Alternativement, des plaques de CCM peuvent être placés face vers le bas sur une gélose inoculée avec des bactéries ou des levures 10,15 8, un procédé connu sous le nom de contact bioautographie 2. Nous décrivons une méthode pour le contact bioautographie pour cribler des composés phénoliques antimicrobiens du trèfle rouge (Trifolium pratense cv. Kenland). Le micro-organisme test est Clostridium sticklandii, une bactérie du rumen hyper ammoniac-production (HAB) et obliger anaérobie. Bien que les séparations utilisées ne résolvent pas tous les composants de l&#39;extrait, elles facilitent l&#39;identification des zones d&#39;activité antimicrobienne, réduisant ainsi la piscine de composés antimicrobiens possibles. Le protocole utilise des procédures standard pour la CCM 1. Le protocole décrit également certaines des techniques requises pour la culture obligationsgrille anaérobies pour un tel essai, l&#39;utilisation d&#39;un bio-autographie de contacts 15 et un procédé de visualisation avec un sel de tétrazolium, qui colore les cellules vivantes 2,4.

<table><tbody><tr><td>Silice F254 Plaques TLC, dos aluminium, 0,2 mm d’épaisseur, 20 cm x 20 cm</td><td>EMD Chemicals</td><td>5554/7</td><td>Ces plaques sont recouvertes de silice qui contient un indicateur fluorescent à 254 nm. Les composés absorbants à cette longueur d’onde apparaissent sombres sur un fond vert fluorescent. Les sources alternatives incluent Analtech, Selecto Scientific, Fluka. Des adsorbants autres que la silice peuvent être nécessaires. Les plaques à support plastique peuvent convenir, en fonction des solvants à utiliser.</td></tr><tr><td>Ciseaux tranchants et robustes&nbsp ;</td><td>toute entreprise de fournitures de couture</td><td>similaire à Fiskars 175800-1002</td><td>Pour couper des plaques TLC.&nbsp ; Un coupe-papier avec une lame tranchante peut également être utilisé. N’inhalez pas de poussière de silice.</td></tr><tr><td>Four de séchage à 100 &deg ; C (convection mécanique)</td><td>Thermo Scientific</td><td>PR305225M</td><td>Quincy Lab, Inc, Chicago, IL (www.quincylab.com) ; Cascade Technical Sciences, Hillsboro, OR (www.cascadetek.com)</td></tr><tr><td>Chambre TLC</td><td>Kimble Chase</td><td>416180-0000</td><td>Sources alternatives :&nbsp ; Aldrich. Des béchers ou des bocaux en pyrex peuvent être utilisés pour de petites assiettes (c’est-à-dire 5 cm x 10 cm).&nbsp ; Couvrir d’une feuille d’aluminium (les couvercles des bocaux peuvent contenir des matériaux extractibles par des vapeurs de solvants).</td></tr><tr><td>50 et micro ; l Seringue à pointe d’aiguille plate</td><td>Hamilton</td><td>80965</td><td>Pour le chargement de quantités d’étalon ou d’échantillon supérieures à 5-10 &micro ;l.&nbsp ; D’autres sources sont équivalentes.</td></tr><tr><td>Micropipettes</td><td>Drummond</td><td>2-000-001</td><td>Pour le chargement de petites quantités d’étalons ou d’échantillons. Sources alternatives :&nbsp ; VWR.&nbsp ; De plus, les pipettes Pasteur peuvent être étirées à un diamètre plus fin à l’aide d’un chalumeau au butane. &nbsp ;</td></tr><tr><td>Papier filtre (grade #1)</td><td>Whatman</td><td>1001 917</td><td>Sert de mèche de chambre. Les autres qualités de papier filtre sont acceptables. Cette taille peut être ajustée pour les chambres contenant des plaques de 20 cm x 20 cm. &nbsp ; &nbsp ; &nbsp ;</td></tr><tr><td>Pince à bécher</td><td>Fisher Scientific</td><td>15-186</td><td>Pour mettre des plaques dans et hors d’une grande chambre de CCM. Autres sources : VWR&nbsp ;</td></tr><tr><td>Pince à bord plat</td><td>Fisher Scientific</td><td>10-275</td><td>Pour mettre des plaques dans et hors d’une petite chambre. Autres sources : VWR </td></tr><tr><td>Petite lampe UV portable avec ampoules de 4 W ou 6 W pour l’éclairage de la lumière UV à ondes courtes et longues (254 et 365 nm, respectivement)</td><td>Produits ultraviolets</td><td>95-0271-01</td><td>Sources alternatives : Spectronics Corporation (www.spectroline.net)</td></tr><tr><td>Armoire de visualisation à utiliser avec une lampe UV portative</td><td>Produits ultraviolets</td><td>Chromato-Vue C-10E</td><td>Les bandes actives aux UV sont plus facilement encerclées si les plaques peuvent être placées ici. Autres sources : Spectronics Corporation.</td></tr><tr><td>Système de photodocumentation avec lampe UV zénithale et lampe visible</td><td>Kodak</td><td>Gel Logic 200</td><td>&nbsp ; Autres sources : Produits ultraviolets (www.uvp.com).&nbsp ; Voir le protocole pour une alternative faite maison.</td></tr><tr><td>Chambre anaérobie, type A, Vinyl</td><td>Coy</td><td>7150000</td><td>Cette chambre convient aux bactéries anaérobies, comme Clostridium sticklandii, comme décrit. Cependant, les conditions de croissance doivent être adaptées à l’organisme utilisé dans l’essai. Une enceinte de sécurité biologique et d’autres précautions doivent être prises si des organismes pathogènes sont utilisés. Sources alternatives : Anaerobe Systems, BioRad, Plas Labs, autres.</td></tr><tr><td>Rouge de tétrazolium</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T8877</td><td>Sources alternatives : MP Biomedicals, Santa Cruz Biotechnology, Alfa Aesar</td></tr><tr><td colspan="4">Ingrédients pour les milieux HAB</td></tr><tr><td>Pyridoxamine &middot ; 2HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9380</td><td>Pour ce réactif et pour tous les autres réactifs de ce tableau, d’autres sources sont équivalentes.</td></tr><tr><td>Riboflavine</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>R4500</td><td></td></tr><tr><td>Thiamine HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T3902</td><td></td></tr><tr><td>Nicotinamide</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>N3376</td><td></td></tr><tr><td>D-Pantothénate de calcium</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C8731</td><td></td></tr><tr><td>Acide lipoïque&nbsp ;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T5625</td><td></td></tr><tr><td>Acide p-aminobenzoïque&nbsp ;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9878</td><td></td></tr><tr><td>Acide folique</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F8798</td><td></td></tr><tr><td>Biotine</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B4639</td><td></td></tr><tr><td>Cobalamine&nbsp ;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C3607</td><td></td></tr><tr><td>Pyridoxal HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P9130</td><td></td></tr><tr><td>Pyridoxine</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P5669</td><td></td></tr><tr><td>EDTA</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E6758</td><td></td></tr><tr><td>Sulfate de fer &middot ; 7H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>F8263</td><td></td></tr><tr><td>Sulfate de zinc &middot ; 7H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>Z0251</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de manganèse &middot ; 4H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M8054</td><td></td></tr><tr><td>Acide borique</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B6768</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de cobalt &middot ; 6H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C8661</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de cuivre &2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td></td><td></td>459097</tr><tr><td>Chlorure de nickel &middot ; 6H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>203866</td><td></td></tr><tr><td>Molybdate de sodium &middot ; 2H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>331058</td><td></td></tr><tr><td>Trypticase (digestion pancréatique de la caséine)</td><td>Thermo Fisher</td><td>B11921</td><td></td></tr><tr><td>Phosphate de potassium monobasique anhydre</td><td>Thermo Fisher</td><td>P284</td><td></td></tr><tr><td>Carbonate de sodium & middot ; H2O&nbsp ;</td><td>Thermo Fisher</td><td>S636</td><td></td></tr><tr><td>Agar</td><td>Thermo Fisher</td><td>50841063</td><td></td></tr><tr><td>Sulfate de magnésium &middot ; 6H2O</td><td>Thermo Fisher</td><td>7791-18-6</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de calcium &2O</td><td>Thermo Fisher</td><td>BP510</td><td></td></tr><tr><td>Cystéine HCl</td><td>Thermo Fisher</td><td>19464780</td><td></td></tr><tr><td>Potassium phosphate dibasique anhydre</td><td>Thermo Fisher</td><td>P290</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de sodium</td><td>Thermo Fisher</td><td>BP358</td><td></td></tr></tbody></table>

mince couche chromatographique (ccm) séparations et essais biologiques d&#39;extraits végétaux pour identifier des composés antimicrobiens

Thin-layer Chromatographic (TLC) Separations and Bioassays of Plant Extracts to Identify Antimicrobial Compounds

Un écran commun pour les composés antimicrobiens de plantes consiste en la séparation d&#39;extraits de plantes en papier ou en chromatographie sur couche mince (PC ou TLC), ce qui expose les chromatogrammes de suspensions microbiennes (par exemple, de champignons ou de bactéries dans un bouillon ou la gélose), laissant du temps pour les microbes de se développer en un environnement humide, et la visualisation des zones de pas de croissance microbienne. L&#39;efficacité de cette méthode de dépistage, connu sous le nom bioautographie, dépend à la fois de la qualité de la séparation chromatographique et le soin apporté aux conditions de cultures microbiennes. Ce document décrit les protocoles standards pour la CCM et le contact bioautographie avec une nouvelle application aux acides des bactéries d&#39;acide de fermentation. L&#39;extrait est séparé sur flexibles (support aluminium) des plaques de CCM de silice, et les bandes sont visualisées sous lumière ultraviolette (UV). Les zones sont découpées et incubées visage vers le bas sur de la gélose inoculé avec le micro-organisme d&#39;essai. Bandes inhibitrices sont visualisés par coloration de la plaque de géloses avec tétrazolium rouge. Le procédé est appliqué à la séparation de trèfle rouge (Trifolium pratense cv. Kenland) des composés phénoliques et leur criblage pour l&#39;activité contre Clostridium sticklandii, une bactérie produisant de l&#39;ammoniac hyper (HAB) qui est natif de la panse de bovin. Les procédés de CCM s&#39;appliquent à de nombreux types d&#39;extraits de plantes et d&#39;autres espèces bactériennes (aérobie ou anaérobie), ainsi que les champignons, peuvent être utilisés comme organismes d&#39;essai, si les conditions de culture sont modifiées pour être compatibles avec les exigences de l&#39;espèce de croissance.

Représentant séparations TLC de silice de trèfle rouge (Trifolium pratense cv. Kenland) d&#39;extraits, contenant des composés phénoliques, sont présentés dans la figure 2. Séparation de l&#39;extrait de trèfle rouge dans l&#39;acétate d&#39;éthyle-hexane (9:1, v / v), plus de 8,5 cm, a donné cinq bandes, une incomplètement résolu à partir de l&#39;origine (figure 2A). Cependant, la figure 2B montre que près de deux fois plus de bandes ont été révélées lors d&#...

Des méthodes sont décrites pour chromatographie sur couche mince (CCM) la séparation d&#39;extraits de plantes et le contact bioautographie pour identifier les métabolites antibactériens. Les méthodes sont appliquées à la sélection de composés phénoliques de trèfle rouge inhibant les bactéries hyper-production d&#39;ammoniac (HAB) originaires de la panse de bovin.

Mince couche chromatographique (CCM) Séparations et essais biologiques d&#39;extraits végétaux pour identifier des composés antimicrobiens

A common screen for plant antimicrobial compounds consists of separating plant extracts by paper or thin-layer chromatography (PC or TLC), exposing the ...

L'objectif général de cette procédure est d'identifier des métabolites végétaux qui possèdent une activité antimicrobienne contre les bactéries anaérobies. Cela est réalisé en séparant d'abord un extrait végétal par chromatographie sur couche mince, ou CCM. Ensuite, le chromatogramme est découpé en zones comprenant un ou plusieurs composés.Les zones sont ensuite placées sur un milieu gélosé inoculé avec des bactéries anaérobies et incubées. Après l'incubation, les zones sont retirées et les plaques sont colorées afin d'identifier les composés qui inhibent la croissance bactérienne. Les données obtenues révèlent la présence ou l'absence de métabolites végétaux antimicrobiens.Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés dans le domaine de la nutrition des ruminants, comme quels sont les effets des métabolites secondaires des plantes sur l'utilisation des nutriments par des microorganismes spécifiques. Bien que cette méthode mette en évidence les composés végétaux qui sont inhibiteurs pour les bactéries du rumen, elle peut également être appliquée à la mise en évidence de composés inhibiteurs d'autres bactéries ou de champignons.Dans ce protocole, des composés phénoliques

thin-layer-chromatographic-tlc-separations-bioassays-plant-extracts

Research

Recherche

JoVE Journal

Chemistry

Chimie

Composition des extraits lipidiques polaires et la composition en acides gras de glycérolipides individuels sont déterminés dans une expérience de profilage des lipides simples et robustes. À cette fin, glycérolipides sont isolés par chromatographie sur couche mince et soumis à transméthylation de leurs groupes acyle. Fatty acyl esters méthyliques sont quantifiés par chromatographie gaz-liquide.

Arabidopsis thaliana profilage glycolipides polaires par chromatographie sur couche mince (CCM) couplée à la chromatographie gaz-liquide (GLC)

Les produits naturels représentent des points de départ prometteurs pour le développement de nouveaux médicaments et agents thérapeutiques. Cependant, en raison de la grande diversité chimique, trouver de nouveaux composés thérapeutiques à partir des plantes est une tâche difficile et longue. Nous décrivons une approche simplifiée pour identifier les molécules antimicrobiennes et antibiofilms à partir d’extraits de plantes et de fractions.

Approche systématique pour identifier les nouvelles molécules antimicrobiennes et antibiofilms à partir d’extraits et de fractions de plantes pour prévenir les caries dentaires

Le présent protocole a développé une méthode pour estimer le rendement des composés sur la plaque TLC en utilisant la technique d’éclairage bleu-LED. Les avantages de cette approche sont qu’elle est sûre, efficace, peu coûteuse et permet au chercheur de mesurer plusieurs échantillons simultanément.

Estimation du rendement des composés sur la plaque TLC via la technique d’éclairage Blue-LED

Nous décrivons l’utilisation de la chromatographie sur couche mince, du test de bioautographie directe et de la chromatographie liquide-spectrométrie de masse pour identifier les produits naturels microbiens qui présentent un antagonisme contre les agents pathogènes fongiques, en utilisant l’agent pathogène Sclerotinia sclerotiorum et les isolats biopesticides de Bacillus comme système modèle.

Identification guidée par bioessai de produits naturels pour le biocontrôle par chromatographie sur couche mince-bioautographie directe

Cette étude a développé une chromatographie liquide haute performance couplée à la spectrométrie de masse quadrupolaire triple (HPLC-QQQ-MS) pour identifier et quantifier les alcaloïdes tropanes (hyoscyamine, anisodamine, scopolamine) chez Anisodus tanguticus. La méthode s’est révélée rapide, précise et fiable pour l’analyse à haut débit des plantes médicinales.

Une méthode HPLC-QQQ-MS efficace et rapide pour la quantification des alcaloïdes tropanes dans les plantes médicinales

Tégument des mammifères contient des lipides solvant extractible qui peuvent fournir des compositions chimiques caractéristiques de chaque espèce. Cet article présente une méthode de routine pour la séparation de larges classes de lipides isolés à partir de tissus tégumentaires en utilisant la chromatographie en couche mince et détermination du profil de triacylglycéride par désorption / ionisation laser à temps de vol par spectrométrie de masse assistée par matrice.

Profilage des matières triacylglycéride à Bat tégumentaire lipides par chromatographie sur couche mince préparative et MALDI-TOF spectrométrie de masse

Deux méthodes d’attribution des signaux de résonance magnétique nucléaire α- et ε-diméthylamine d’une lysine N-terminale 13C-méthylée réductrice sont décrites. Une méthode utilise la sélectivité induite par le pH de la réaction de méthylation réductrice, et l’autre utilise l’aminopeptidase pour éliminer sélectivement la lysine N-terminale.

Méthodes d’identification des résonances RMN de l’amine 13C-diméthyl N-terminale sur des protéines méthylées de manière réductrice

Cette vidéo présente un protocole pour l'analyse par spectrométrie de masse des composés sensibles à l'oxydation et à l'aide volatils ionisation par impact électronique. La technique présentée est particulièrement intéressant pour les chimistes inorganiques, en collaboration avec organyles métalliques, des silanes, des phosphines ou qui doivent être manipulés dans des conditions inertes, tels que la technique de Schlenk.

L&#39;analyse des composés volatils et sensibles oxydation en utilisant un système à froid d&#39;entrée et impact électronique spectrométrie de masse

Ce protocole décrit les techniques spécifiques utilisées pour la caractérisation structurale de l’extrémité réductrice (RE) et de la (les) séquence(s) glycosylique(s) de la région interne des hétéroxylanes en marquant l’ER avec 2 aminobenzamides avant l’hydrolyse enzymatique (endoxylanase), puis en analysant les oligosaccharides résultants à l’aide de la spectrométrie de masse (MS) et de la résonance magnétique nucléaire (RMN).

Le séquençage de l&#39;usine mur hétéroxylanes Utilisation enzymatique, chimique (méthylation) et physiques (spectrométrie de masse, résonance magnétique nucléaire) Techniques

Un procédé combinant la Chromatographie gazeuse complète en deux dimensions avec la détection de la chimioluminescence d'azote a été développée et appliquée à l'analyse en ligne des composés contenant de l'azote dans une matrice hydrocarbonée complexe.

Analyse en ligne de composés azotés dans les Matrices d&#39;hydrocarbures complexes

Découvrez la chromatographie sur couche mince pour identifier des métabolites antimicrobiens dans les extraits végétaux. Cette méthode utilise la bioautographie de contact pour évaluer l'activité contre les bactéries anaérobies du rumen.

Mince couche chromatographique (CCM) Séparations et essais biologiques dextraits végétaux pour identifier des composés antimicrobiens (Vidéo) | JoVE Journal

Mince couche chromatographique (CCM) Séparations et essais biologiques d'extraits végétaux pour identifier des composés antimicrobiens

Explorer plus de vidéos