Name: Analyse clinicopathologique de miRNA expression dans le cancer du sein à laide de tissus miRNA In Situ hybridation (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-06-07T15:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 1 s
Description: Découvrez l'hybridation in situ des miRNA pour analyser l'expression dans les tissus de cancer du sein. Cette méthode permet de localiser précisément les microARN et d'étudier leur rôle dans la suppression tumorale.

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Ce travail a été soutenu par la subvention NIH (5R01 CA178386-03) et la subvention USC ASPIRE-1 à HC. Nous tenons à remercier Vrushab Gowda pour son aide avec le manuscrit.

Cette étude a été approuvée par le comité d&#39;examen institutionnel de l&#39;Hôpital universitaire national Chonnam Hwasun et de l&#39;Université de Caroline du Sud. échantillons TMA composés de cancer du sein et des tissus appariés mammaires normaux adjacents ont été fournis par la Biobanque de l&#39;hôpital Hwasun Chonnam National University, membre de la Biobanque réseau Corée. 1. Préparation de la solution <ol><li> Préparer 1 L d&#39;eau libre de DNase et RNase. Faire toutes les solutions chimiques à l&#39;aide de diéthyle (DEPC) de l&#39;eau traitée. Traiter 1 litre d&#39;eau avec 500 ul de DEPC et laisser incuber pendant 3 heures à température ambiante. Autoclave l&#39;eau pour inactiver DEPC. Attention: Ne pas inhaler DEPC car il est connu cancérogène. </li><li> Préparer 1x PBS de 10x PBS en utilisant DEPC eau traitée. </li><li> Préparer 20x SSC (dissoudre 175,3 g de NaCl et 88,2 g de citrate de sodium dans 800 ml d&#39;eau, ajuster le pH à 7,0 avec quelques gouttes de 14 N solution de HCl et ajuster le volume à 1 L avec water), 4% de paraformaldehyde, 95% d&#39;éthanol, 80% d&#39;éthanol en utilisant de l&#39;eau traitée au DEPC. </li><li> Ajouter 8 ml de triéthanolamine et 1,05 ml de HCl dans 590 ml d&#39;eau traitée au DEPC et ajouter 1,5 ml d&#39;anhydride acétique pendant acétylation. </li><li> Préparer 50 ug / ul de proteinase K dans un tampon (50 mM de Tris-HCl, pH 8,0 dans l&#39;eau traitée au DEPC). </li><li> Préparer un tampon d&#39;hybridation composée de 500 pi de formamide, 250 pi de 20x SSC, 100 pi de 50x solution de Denhardt, 12,5 pi de t-ARN, 2,5 pi d&#39;ADN de sperme de hareng, 30 pi de RVC, 0,02 g de réactif de blocage et de 50 pi de l&#39;eau DEPC. Préparer frais. </li></ol> 2. Les sections de tissus du sein <ol><li> Couper 5 um sections de paraffine fixés au formol avec microtome et appliquer la section pour charger la diapositive 14. Remarque: Le tissu mammaire utilisé ici a été préparé précédemment de la Biobanque réseau Corée. </li></ol> 3. Préparation des tissus <ol><li> Retirer la paraffine from le tissu en l&#39; immergeant les lames dans Coplin 2x jar dans le xylène frais pendant 10 minutes à chaque fois et réhydrater la section de tissu de 5 min d&#39; incubation à des concentrations décroissantes d&#39;éthanol (100%, 95% et 80%) dans le trou DDH 2 O. Effectuez cette étape dans une hotte. </li><li> Immerger le tissu dans DEPC eau traitée pendant 5 min. À ce stade, faire des limites autour de la section de tissu avec un stylo barrière hydrophobe. </li><li> Fixer le tissu avec 4% de PFA pendant 15 min suivie d&#39;un lavage avec du PBS. </li><li> Immerger le tissu dans 0,3% de Triton X-100 / PBS pendant 10 min suivi d&#39;un lavage avec du PBS. </li><li> Incuber l&#39;échantillon avec une solution / ul Proteinase K 50 ug pendant 15 min à 37 ° C. Puis incuber des coupes de tissu avec de la triéthanolamine et de l&#39;anhydride acétique pendant 5 min à température ambiante, suivie d&#39;un lavage avec du PBS. Pas de lavage PBS est nécessaire entre le traitement Proteinase K et triéthanolamine / acide acétique traitement anhydride. </li></ol> 4. hybridation <ol><li> Laver le tissu à fond et incubate la section de tissu avec du tampon d&#39;hybridation pendant 2 à 3 heures à la température ambiante. Typiquement 120 tampon d&#39;hybridation ul est suffisant pour couvrir la section de tissu. </li><li> Diluer 5&#39;-DIG marqué sonde LNA à la concentration finale de 15 heures dans 120 ul solution d&#39;hybridation. Comme la concentration des stocks est habituellement de 40 ng / pl, ajouter 3 pi de stock à un tampon d&#39;hybridation de 120 pi et incuber le mélange à 95 ° C pendant 5 min. </li><li> Incuber section de tissu avec la sonde pendant une nuit à 54 ° C (Tm) dans une chambre humide. Typiquement 120 ul est suffisant pour couvrir une section. Créer l&#39;humidité en utilisant deux serviettes en papier humide. La taille idéale de la chambre est de 10 pouces par 8 pouces. </li><li> Remarque: Tm peut être différent pour différents miARN. 54 ° C est fait mention pour miR-489. </li></ol> 5. Stringency Wash <ol><li> Laver le tissu avec 5x SSC pendant 7 min (après l&#39;étape d&#39;hybridation, de RNase conditions libres ne sont plus requis). </li><li> Laver la section de tissu d&#39;esprith 1x SSC pendant 7 min à deux reprises à 57 ° C. </li><li> Laver la section de tissu avec 0,2x SSC pendant 7 minutes à 57 ° C. </li><li> Laver la coupe tissulaire avec du SSC 0,2x pendant 7 minutes à la température ambiante. </li><li> Incuber section de tissu dans du PBS pendant 10 min. </li></ol> 6. Blocage <ol><li> Incuber la section de tissu avec un tampon bloquant à la température ambiante pendant 1 h dans une chambre humide (Pour faire un tampon de blocage ajouter 2 ml de FBS, 10 pi de Tween-20 et 3 pi de BSA à 18 m de PBS. Magasin tampon de blocage à 4 ° C). </li></ol> 7. Anticorps primaire d&#39;incubation et le développement <ol><li> Diluer 1: 300 d&#39;anticorps anti-DIG-AP dans un tampon de blocage et on incube la section de tissu avec l&#39;anticorps à 4 ° C pendant une nuit. </li><li> Laver les sections avec un tampon de lavage 3 fois, pendant 5 minutes chacun (tampon fourni par le kit de développement). </li><li> Développer la section de tissu avec un kit commercial pour la phosphatase alcaline qui produit CY-3 florescent lumière. </li> &lt;li&gt; Laver la section avec un tampon de lavage pendant 5 min. la section des taches avec 100 ul de 2,5 ng / ul de colorant Hoechst pendant 5 min, suivie d&#39;un lavage de 5 minutes avec du tampon de lavage. </li><li> Monter la section de montage avec un tampon selon le protocole du fabricant. Utilisez 15 pi par section de tissu et essuyez solution excessive de montage avec le tissu essuyez. Sceller la lame avec vernis à ongles transparent pour éviter les fuites. </li><li> Observer le microscope section florescent utilisant avec un grossissement 10X lentille de manière totale est 100X. </li></ol>

<ol><li>Shah, N. R., Chen, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MicroRNAs+in+pathogenesis+of+breast+cancer%3A+Implications+in+diagnosis+and+treatment%5BTitle%5D)+AND+%22World+J+Clin+Oncol%22%5BJournal%5D)">MicroRNAs in pathogenesis of breast cancer: Implications in diagnosis and treatment.</a> World J Clin Oncol. 5, 48-60 (2014).</li>
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<li>Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Paraffin+embedding+tissue+samples+for+sectioning%5BTitle%5D)+AND+%22CSH+Protoc%22%5BJournal%5D)">Paraffin embedding tissue samples for sectioning.</a> CSH Protoc. 2008, (2008).</li>
<li>Li, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequential+expression+of+miR-182+and+miR-503+cooperatively+targets+FBXW7%2C+contributing+to+the+malignant+transformation+of+colon+adenoma+to+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Sequential expression of miR-182 and miR-503 cooperatively targets FBXW7, contributing to the malignant transformation of colon adenoma to adenocarcinoma.</a> J Pathol. 234, 488-501 (2014).</li>
</ol>

Il n’y a rien à divulguer.

Le but de cette étude était de déterminer le niveau d&#39;expression de miARN dans les tissus du cancer du sein en utilisant des miARN hybridation in situ. Il convient de noter que dans cette expérience, toutes les conditions sont optimisées pour le tissu du cancer du sein. Une optimisation supplémentaire peut être nécessaire pour d&#39;autres types de tissus. Toutes les solutions doivent être faites avec de l&#39;eau DEPC et tous les conteneurs à utiliser doivent être rincés à l&#39;eau traitée au DEPC et ensu...

Le cancer du sein est parmi les tumeurs malignes les plus courantes qui touchent la population féminine à travers le monde. Plus de 1,3 millions de cas de cancer du sein sont signalés chaque année dans le monde 1,2. Bien que les cellules tumorales ont été traditionnellement considéré comme biologiquement homogène et hautement prolifératifs, il est devenu évident que le cancer du sein est génétiquement hétérogène et cliniquement. La résistance aux médicaments anti - cancéreux qui prévalent est une caractéristique des cancers du sein avancés, ce qui conduit à la mortalité chez la majorité des patients grâce à la facilitation de la progression du cancer et des métastases 3 minutes. Les microARN (miARN) sont une classe de petites molécules d&#39; environ 22 nucléotides de long ARN qui régulent l&#39; expression des gènes en bloquant la traduction de l&#39; ARNm ou de médiation ARNm dégradation 4. Plus de 2.000 miARN différents ont jusqu&#39;à présent été identifiés chez l&#39; homme, qui sont liés à des maladies humaines 5. Un tableau croissant d&#39;études VHAe démontré que les miARN peuvent fonctionner comme oncogènes et suppresseurs de tumeurs et sont souvent dérégulée dans les tumeurs 6. miARN incidence fortement tous les tumorigenèse primaires en contrôlant les principaux régulateurs de la progression du cycle cellulaire, de la sénescence, l&#39; apoptose et autophagy, ainsi que ceux de la motilité des cellules tumorales, l&#39; invasion et les métastases 7. Expression Aberrant miRNA a également été associée à des implications cliniques telles que le stade, la différenciation, le pronostic et la réponse au traitement adjuvant 8. En particulier, l&#39; augmentation de l&#39; expression de miR-146 est corrélée à un mauvais pronostic chez les patients atteints de cancer du poumon 9. Une autre étude a démontré que l&#39; expression perdue de miARN-let7b est liée à des phénotypes malignes et, par conséquent, une faible survie 6. Comprendre les types de cellules et de structures qui expriment miARN est une partie importante de comprendre les mécanismes à travers lesquels des altérations de miRNA influence d&#39;expression cellulaire ettissus phénotypes 10. Certains miARN révélées être sécrétées dans les cellules stromales sont pris en charge par les cellules épithéliales et agissent spécifiquement sur leurs cibles. Dans la même veine, miR-212 et miR-132 sont sécrétées par stroma et régulent les interactions épithéliales-stromal nécessaires à l&#39; excroissance canalaire au cours du développement de la glande mammaire 11. L&#39;objectif global de cet article est d&#39;expliquer un protocole détaillé pour détecter l&#39; expression de miARN dans les tissus du cancer du sein par miRNA hybridation in situ. Nous avons optimisé toutes les conditions pour tester les niveaux d&#39;expression des miARN-489 dans le cancer du sein des échantillons de patients. À cette fin, nous avons utilisé un DIG marqué verrouillé acide (LNA) sonde nucléique dans notre expérience. Certains de ses nucléotides a eu une modification de LNA, qui est un pont méthylène connectant &#39;atome d&#39;oxygène et 4 du 2 atome de carbone du squelette ribose qui fixe le nucleotide de telle sorte qu&#39;il reste &quot;bloque&quot; après hybridation. Par conséquent, il est beaucoup plus difficilepour le complexe hybride pour dénaturer 12,13.

<table><tbody><tr><td>Technologie ELF-97</td><td>Life&nbsp ;</td><td>E6604</td><td></td></tr><tr><td>50x Denhard’t&nbsp ;</td><td>Technologie de la vie&nbsp ;</td><td></td><td></td>750018</tr><tr><td>ARN-t</td><td>Roche</td><td>109541</td><td>Reconstituer dans l’eau DEPC</td></tr><tr><td>Hareng Sperme ADN</td><td>Promega&nbsp ;</td><td>D1815</td><td></td></tr><tr><td>Roche Blocking&nbsp ;</td><td>Roche</td><td>11096176001</td><td></td></tr><tr><td>RVC</td><td>Fisher</td><td>50-812-650</td><td>Avant utilisation, abaissez-le à 16,1 RCF et prenez le surnageant&nbsp ;</td></tr><tr><td>sonde miR-489&nbsp ;</td><td>Exiqon</td><td>38599-01</td><td></td></tr><tr><td>Sans nucléase BSA</td><td>Roche&nbsp ;</td><td></td><td></td>711454</tr><tr><td>Anticorps primaire-anti DIG</td><td>Roche&nbsp ;</td><td></td><td></td>11093274910</tr><tr><td>Pyrocarbonate de diéthyle&nbsp ;</td><td>Sigma</td><td>1609478</td><td></td></tr></tbody></table>

analyse clinicopathologique de mirna expression dans le cancer du sein à l&#39;aide de tissus mirna<em&gt; in situ</em&gt; hybridation

Clinicopathological Analysis of miRNA Expression in Breast Cancer Tissues by Using miRNA In Situ Hybridization

Dans cet article, nous décrivons un protocole détaillé pour la détection des miARN dans les tissus cancéreux du sein en utilisant l’hybridation in situ avec une sonde LNA (Locked Nucleic Acid) marquée à la digoxigénine. La sonde a été reconnue par des anticorps anti-phosphatase alcaline DIG et développée plus tard à l’aide d’un substrat de phosphatase alcaline produisant des signaux de fluorescence. Ici, nous avons utilisé la technique d’hybridation in situ des miARN (MISH) pour analyser l’expression de miR-489 dans les tissus de patientes atteintes d’un cancer du sein. Cette technique permet de détecter la localisation de miARN d’intérêt dans des échantillons de tissus individuels. Cette technique peut être utilisée pour comparer l’expression du miARN souhaité dans le tissu tumoral avec celle du tissu normal adjacent et pour identifier les structures spécifiques responsables de l’expression de ce miARN. Cette technique peut être très utile pour répondre à certaines questions cliniques, comme le rôle de miARN spécifiques dans le développement du cancer. Nos résultats indiquent que les cellules épithéliales mammaires expriment des niveaux significativement plus élevés de miR-489 que les cellules tumorales adjacentes.

tissu de cancer du sein humain a été utilisé pour déterminer l&#39;expression des miARN-489. Glande mammaire conduit de cellules épithéliales et se sont révélés exprimer significativement plus élevés miARN-489 niveaux que le tissu adjacent à la tumeur chez deux patients (Figure 1A et 1B). Cela démontre clairement que l&#39;expression du miARN-489 a été perdu dans le tissu tumoral, ce qui suggère une tumeur activité suppressive de miARN-489. Pour confirme...

Ici, nous présentons un protocole pour détecter l’expression de miARN dans des échantillons de patientes atteintes d’un cancer du sein en utilisant l’hybridation in situ de miARN.

Analyse clinicopathologique de miRNA expression dans le cancer du sein à l&#39;aide de tissus miRNA<em&gt; In Situ</em&gt; hybridation

In this article, we describe a detailed protocol for miRNA detection in breast cancer tissue using in situ hybridization with a digoxigenin-labelled LNA ...

L'objectif général de cette hybridation in situ d'ARN micro est de détecter la localisation de l'ARN micro d'intérêt dans un tissu de cancer du sein. Ainsi, le résultat peut répondre à une question clé dans le domaine du cancer du sein, par exemple si l'ARN micro d'intérêt joue un rôle oncogène ou suppresseur de tumeur.Le principal avantage de cette technique est qu'elle permet de détecter la nucléarisation cellulaire d'intérêt dans le tissu cancéreux du sein. Commencez la préparation du tissu en éliminant le paraffine des coupes de tissu mammaire préparées au préalable. Plongez les lames dans un bocal de Coplin contenant du xylène frais, deux fois pendant dix minutes chacune.Hydrater à nouveau la section de tissu en effectuant des incubations dans des concentrations décroissantes d'éthanol dans de l'eau doublement distillée, cinq minutes chacune. Ensuite, plonger le tissu dans de l'eau traitée au diéthylpyrocarbonate (DEPC) pendant cinq minutes. Pendant que le tissu est immergé, tracer des limites autour de la section de tissu à l'aide d'un stylo à barrière hydrophobe.Après l'immersion dans le DEPC, fixer le tissu avec du PFA à 4 % pendant 15 minutes. Procéder à un lavage au PBS après la fixation. Ensuite, immerger le tissu dans du PBS contenant 0,3 % de Triton X-100 pendant dix minutes.Incuber l'échantillon avec une solution de protéinase K à 50 microgrammes par microlitre pendant 15 minutes à 37 degrés Celsius. Ensuite, incuber les sections de tissu avec de la triéthanolamine et de l'anhydride acétique pendant cinq minutes à température ambiante. Puis effectuer un lavage au PBS.Lavez soigneusement le tissu. Incubez ensuite la section de tissu avec 120 microlitres de tampon d'hybridation pendant deux heures à température ambiante. Ensuite, diluez la sonde NLA marquée avec DIG en 5' à une concentration finale de 3 picomolaire dans 120 microlitres de solution d'hybridation.Ensuite, ajouter trois microlitres de la solution mère à 40 nanogrammes par microlitre au tampon d'hybridation de 120 microlitres. Incuber le mélange à 95 degrés Celsius pendant cinq minutes. Insérer la coupe de tissu dans un récipient de dix pouces sur huit et recouvrir le tissu de 120 microlitres de la sonde de manière à ce qu'il soit entièrement couvert.Humidifiez deux essuie-tout et recouvrez le récipient afin de créer une chambre d'humidité. Incubez la section de tissu toute la nuit à 54 degrés Celsius. Après l'hybridation, lavez le tissu avec un tampon SSC (chlorure de sodium et citrate de sodium) 5 X pendant sept minutes à 57 degrés Celsius.Ensuite, laver la section de tissu deux fois avec du SSC 1 X. Et laver la section de tissu avec du SSC 0,2 X. Puis, laver la section de tissu avec du SSC 0,2 X pendant sept minutes à température ambiante.Incuber la section de tissu dans du PBS pendant dix minutes. Incuber la section de tissu avec le tampon de blocage pendant une heure à température ambiante dans une chambre humide. Diluer l'anticorps anti-DIG AP au 1/300 dans le tampon de blocage.Et incuber la coupe de tissu avec l'anticorps à 4 degrés Celsius toute la nuit. Le jour suivant, laver les coupes trois fois avec le tampon de lavage, cinq minutes à chaque fois. Suivre les instructions du kit commercial ELF 97 pour révéler la coupe de tissu avec la phosphatase alcaline, qui produit une lumière fluorescente de taille trois.Ensuite, lavez la section avec du tampon de lavage pendant cinq minutes. Coloriez la section avec 100 microlitres de colorant Hoeshct à 2,5 nanogrammes par microlitre pendant cinq minutes. Puis effectuez un lavage de cinq minutes avec le tampon de lavage après la coloration.Utilisez 15 microlitres de tampon de montage par section de tissu. Essuyez ensuite l'excès de solution de montage avec un chiffon. Puis, scellez la lame avec du vernis incolore afin d'éviter toute fuite.Enfin, observer la coupe au microscope fluorescent avec un grossissement total de 100 X. Un tissu humain de cancer du sein provenant de deux patientes a été utilisé pour déterminer l'expression du microARN 489. Les cellules épithéliales et les canaux des glandes mammaires ont montré une expression significativement plus élevée du microARN 489 que le tissu tumoral adjacent. Après avoir visionné cette vidéo, vous devriez avoir une bonne compréhension de la manière d'effectuer une hybridation in situ du microARN en utilisant des échantillons de patientes atteintes d'un cancer du sein.

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Cet article décrit un protocole d'hybridation in situ optimisé pour la détection colorimétrique de l'expression de micro-ARN dans des sections de rein fixés au formol.

MicroRNA<em&gt; In situ</em&gt; Hybridation pour les tissus rénaux fixés au formol

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micro-ARN (miARN) est des séquences d’ARN courts et très homologues, agissant comme organismes de réglementation post-transcriptionnelle des ARN messagers (ARNm). Les méthodes actuelles de détection de miRNA varient dans la sensibilité et la spécificité. Les auteurs décrivent un protocole qui combine l’hybridation in situ et immunostaining pour la détection simultanée de miRNA et protéine molécules sur des sections de tissu cardiaque souris.

Tissu-spécifique miRNA, profilage de l’Expression à l’aide de la souris coeur Sections en hybridation in Situ

Nous présentons un protocole pour évaluer les niveaux d’expression des microARN (miARN) en circulation dans les échantillons de plasma de patients atteints de cancer. En particulier, nous avons utilisé un kit disponible dans le commerce pour faire circuler l’extraction de miRNA et transcriptase inverse. Enfin, nous avons analysé un panel de 24 miARN sélectionnés à l’aide de plaques personnalisées sonde préalablement repéré en temps réel.

Détection d’un Panel de micro-ARN Custom circulant chez les Patients atteints de Cancer Colorectal métastatique

Le protocole décrit un test d’hybridation par immunofluorescence en tandem avec du tissu fixé au formol et inclus dans de la paraffine pour détecter et quantifier simultanément les microARN et les protéines multiplexées.

Amplification et reconnaissance de microARN par hybridation in situ d’acides nucléiques verrouillés en tant que nouvelle méthode de détection et de quantification

Nous présentons un protocole pour l'analyse structurelle et compositionnelle du biofilm naturel d'administration orale à partir d'appareils...

Analyse orale de biofilm palatine Expandeurs par fluorescence hybridation in situ et la microscopie confocale à balayage laser

Dans la pathogénie des métastases osseuses, l'angiogenèse est un processus crucial et représente donc une cible pour l'imagerie et la thérapie. Ici, nous présentons un modèle de rat spécifique au site des métastases osseuses du cancer du sein et de décrire les stratégies à l'angiogenèse image...

Multi-modale d&#39;imagerie de l&#39;angiogenèse dans un modèle de rat nu des métastases osseuses du cancer du sein par imagerie par résonance magnétique, la tomodensitométrie et volumétrique ultrasons

Découvrez l'hybridation in situ des miRNA pour analyser l'expression dans les tissus de cancer du sein. Cette méthode permet de localiser précisément les microARN et d'étudier leur rôle dans la suppression tumorale.

Analyse clinicopathologique de miRNA expression dans le cancer du sein à l'aide de tissus miRNA

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