Name: détection de la Trypanosoma brucei Switching Variant de glycoprotéine de surface par magnétique tri cellulaire activé et cytométrie de flux (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-10-19T15:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 45 s
Description: Découvrez une méthode rapide d'isolation de trypanosomes exprimant des glycoprotéines de surface variantes spécifiques par tri cellulaire magnétique activé. Cette technique permet de détecter efficacement les variants rares et d'étudier la variation antigénique chez Trypanosoma brucei.

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Nous tenons à remercier George Cross pour des conseils généraux sur la biologie des trypanosomes. Ce travail a également été soutenue par une subvention GCE Fondation Bill et Melinda Gates pour DS, un NSF Graduate Research Fellowship (DGE-1325261) pour MRM et une NIH / NIAID (subvention # AI085973) à FNP. Nous remercions Galadriel Masure-Miner pour l&#39;utilisation de la souche contenant le site de gène et de reconnaissance I-SCEI.

NOTE: Tout au long de la procédure, il est nécessaire de garder les cellules sur la glace. les médias froids doivent également être utilisés tout au long. 1. Récolte de l&#39;échantillon <ol><li> Cultivez Lister 427 trypanosomes souche de la circulation sanguine à une densité de 0,5 - 1 million / ml. Il est préférable de commencer les cultures avec un petit nombre de parasites. Isoler 50 x 10 6 cellules / échantillon pendant 10 min à 1500 x g. Assurez - vous de laisser 1 x 10 6 cellules en culture pour une utilisation ultérieure des contrôles d&#39; anticorps positifs et négatifs. NOTE: Ce protocole peut également être utilisé sur les trypanosomes isolés à partir du sang d&#39;animal (voir la discussion pour plus de détails). </li><li> Pipette ou videz la majeure partie du surnageant (laisser environ 750 pi). Transférer les cellules dans un tube de 1,5 ml. </li><li> Spin cellules à 4 ° C pendant 4 min à 5200 xg dans une microcentrifugeuse et retirer le surnageant. </li></ol> 2. Étiquetage magnétique <ol><li> Resuspendre les cellules dans 150 ul du milieu de culture (HMI-9 wie sérum par exemple) + anticorps anti-VSG primaire à la dilution appropriée. NOTE: L&#39;anticorps anti-VSG est faite dans la maison et utilisé à une dilution de 1:50. Il est important d&#39;utiliser un anticorps primaire anti-VSG qui ne sont pas marqués avec un fluorophore. </li><li> les cellules de vortex en utilisant un vortex adaptateur 60 à la vitesse de 6 - 8 dans une chambre froide à 4 ° C pendant 10 min. Laver avec 800 - 1000 pi HMI-9 à froid avec du sérum. </li><li> Spin à 4 ° C pendant 4 min à 5200 xg et aspirer le surnageant. Laver avec 1 ml HMI-9 avec du sérum et de spin comme ci-dessus. Aspirer le surnageant. Resuspendre le culot dans 100 ul de HMI-9 avec du sérum. </li><li> Ajouter 110 ul de cellules magnétique activé tri (MSC) microbilles. Utiliser anti-souris et anti-lapin ou des billes anti-biotine comme il convient pour l&#39;anticorps anti-VSG primaire. Bien mélanger. les cellules de vortex dans une chambre froide à 4 ° C pendant 10 min. </li><li> Alors que les cellules sont vortex, mis en place une colonne de séparation / échantillon magnétique activé sur un aimant de séparation. Assurez-vous d&#39;avoir un reréceptacle (on utilise un tube de centrifugation de 15 ml) dans la colonne pour recueillir l&#39;écoulement. Mettre en place l&#39;appareil dans une chambre froide. </li><li> Ajouter 2 ml de HMI-9 avec du sérum à la colonne principale. Après amorçage place un tube de centrifugation de 15 ml dans la colonne pour recueillir l&#39;écoulement à travers chaque échantillon. </li><li> Après 10 minutes d&#39;incubation à l&#39;étape 2.4, ajouter 800-1000 ul HMI-9 à froid avec du sérum. Spin à 4 ° C pendant 4 min à 5200 xg et retirer le surnageant pour éliminer l&#39;anticorps non lié. Laver avec 1 ml de HMI-9 avec du sérum et répétez laissant 100 pi du surnageant. </li><li> Flick le tube de centrifugation vigoureusement et inspecter visuellement le tube pour faire en sorte que la pastille est complètement remis en suspension. Ajouter 1 ml de HMI-9 avec du sérum et la pipette de haut en bas pour vous assurer que les cellules sont bien remises en suspension. </li></ol> 3. Séparation magnétique <ol><li> Faire en sorte que les colonnes sont amorcées, comme décrit ci-dessus. Appliquer les cellules à la colonne. Collecter accréditives avec des cellules exprimant la VS non-dominanteG. 1 ml de milieu + trypanosomes prend généralement de 6 - 7 min à circuler à travers la colonne. </li><li> Laver 2x avec 1 ml de HMI-9 avec du sérum et de recueillir accréditives dans le même tube que dans l&#39;étape 3.1. </li><li> Diviser écoulement (3 ml) dans deux tubes de 1,5 ml de microcentrifugation. REMARQUE: Ceux - ci peuvent être combinés ou plus tard moitié peuvent être utilisées pour isoler l&#39; ARN, etc. </li><li> Retirer la colonne de l&#39;aimant. Ajouter 3 ml de HMI-9 avec du sérum à la colonne et plonger colonne dans un tube de 15 ml de centrifugeuse pour obtenir des cellules qui expriment le départ, dominante VSG. Retirer 300 pi de matériel élue pour une analyse ultérieure. Gardez ces cellules sur la glace. </li><li> Pour une utilisation comme un positif et un contrôle négatif, prendre environ 1 million de cellules provenant de la culture à partir de cellules de contrôle de plus en plus à 37 ° C (ceux qui ne devraient changer fréquemment) et la pipette eux dans un tube de 1,5 ml. REMARQUE: Les cellules témoins positives seront colorées avec un anticorps marqué par un fluorophore à l&#39;étape 4.1. Négatif cellules témoins remadans souillures dans le reste du protocole. </li><li> Des échantillons de Spin accréditives et positif échantillon témoin d&#39;anticorps à 4 ° C pendant 4 min à 5200 xg et retirer le surnageant. Remarque: une autre partie aliquote de 300 ul de cellules éluées peut être utilisé comme témoin positif pour l&#39;anti-coloration VSG. </li></ol> 4. Coloration pour identifier les contaminants et les Switchers <ol><li> échantillons accréditives Resuspendre et des cellules de contrôle positif dans 100 pi de HMI-9 avec du sérum + primaire, marqué par un fluorophore, un anticorps anti-VSG à la dilution appropriée. NOTE: L&#39;anticorps anti-VSG marqué est fait maison et utilisé à une dilution de 1: 1000. Le fluorophore marqué, anti-VSG peut être de la même source que l&#39;anticorps non marqué dans la séparation MACS step.There devrait être de 3 ml d&#39;échantillon d&#39;écoulement dans deux tubes à centrifuger suivants étape 3.5. </li><li> Pour analyser l&#39;ensemble de l&#39;écoulement par cytométrie en flux, combiner les pastilles dans les deux tubes de microcentrifugation tout re-susen attendant les échantillons dans 100 pi de HMI-9 avec du sérum d&#39;anticorps + anti-VSG. Bien mélanger. </li><li> les cellules de vortex dans une chambre froide à 4 ° C pendant 10 min. Ajouter 800 - 1000 pi HMI-9 à froid avec du sérum. Des échantillons de Spin à 4 ° C pendant 4 min à 5200 xg et retirer le surnageant pour éliminer l&#39;anticorps non lié. </li><li> Laver les cellules avec 1 ml de HMI-9 avec du sérum. Des échantillons de Spin à 4 ° C pendant 4 min à 5200 xg et retirer le surnageant. Au cours de cette dernière rotation, centrifuger les échantillons élues de l&#39;étape 3.4 et l&#39;échantillon de contrôle négatif. </li><li> Resuspendre tous accréditive et échantillons élues dans: solution (175 pl au total) 148,5 pi HMI-9 avec du sérum, 25 pi de comptage absolue perles et 1,5 pi l&#39;iodure de propidium. La remise en suspension des échantillons de contrôle positifs et négatifs anticorps dans 175 pi de HMI 9 avec du sérum. Assurez-vous d&#39;enregistrer le nombre de comptage absolu des perles / 25 pi pour le lot particulier utilisé. </li><li> Exécutez tous les échantillons au moyen d&#39;un cytomètre de flux et de recueillir des données. Les cellules mortes tacher comme PI <sup&gt; +. Contaminants tachent comme PI - VSG +. Switchers tachent comme PI - VSG - 8. </li><li> Calculer les fréquences de commutation en utilisant la cytométrie de flux de données. REMARQUE: Pour obtenir des instructions sur la façon de calculer les fréquences de commutation, s&#39;il vous plaît se référer au fichier supplémentaire <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54715/Flow_Cytometry_Calculations.docx" target="_blank">cytométrie</a> de <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54715/Flow_Cytometry_Calculations.docx" target="_blank">flux Calculations.docx</a> et le tableau 1. </li></ol>

<ol><li>Horn, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antigenic+variation+in+African+trypanosomes%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+%26+Biochemical+Parasitology%22%5BJournal%5D)">Antigenic variation in African trypanosomes.</a> Molecular & Biochemical Parasitology. 195 (2), 123-129 (2014).</li>
<li>Lamont, G. S., Tucker, R. S., Cross, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+antigen+switching+rates+in+Trypanosoma+brucei%5BTitle%5D)+AND+%22Parasitology%22%5BJournal%5D)">Analysis of antigen switching rates in Trypanosoma brucei.</a> Parasitology. 92 (Pt 2), 355-367 (1986).</li>
<li>Rudenko, G., McCulloch, R., Dirks-Mulder, A., Borst, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Telomere+exchange+can+be+an+important+mechanism+of+variant+surface+glycoprotein+gene+switching+in+Trypanosoma+brucei%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biochem+Parasitol%22%5BJournal%5D)">Telomere exchange can be an important mechanism of variant surface glycoprotein gene switching in Trypanosoma brucei.</a> Mol Biochem Parasitol. 80 (1), 65-75 (1996).</li>
<li>Turner, C. M., Barry, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+frequency+of+antigenic+variation+in+Trypanosoma+brucei+rhodesiense+infections%5BTitle%5D)+AND+%22Parasitology%22%5BJournal%5D)">High frequency of antigenic variation in Trypanosoma brucei rhodesiense infections.</a> Parasitology. 99 (Pt 1), 67-75 (1989).</li>
<li>Miller, E. N., Turner, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+antigenic+types+appearing+in+first+relapse+populations+of+clones+of+Trypanosoma+brucei%5BTitle%5D)+AND+%22Parasitology%22%5BJournal%5D)">Analysis of antigenic types appearing in first relapse populations of clones of Trypanosoma brucei.</a> Parasitology. 82 (1), 63-80 (1981).</li>
<li>Horn, D., Cross, G. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+Trypanosoma+brucei+vsg+expression+site+switching+in+vitro%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biochem+Parasitol%22%5BJournal%5D)">Analysis of Trypanosoma brucei vsg expression site switching in vitro.</a> Mol Biochem Parasitol. 84 (2), 189-201 (1997).</li>
<li>Figueiredo, L. M., Janzen, C. J., Cross, G. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+histone+methyltransferase+modulates+antigenic+variation+in+African+trypanosomes%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biol%22%5BJournal%5D)">A histone methyltransferase modulates antigenic variation in African trypanosomes.</a> PLoS Biol. 6 (7), e161(2008).</li>
<li>Boothroyd, C. E., Dreesen, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+yeast-endonuclease-generated+DNA+break+induces+antigenic+switching+in+Trypanosoma+brucei%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">A yeast-endonuclease-generated DNA break induces antigenic switching in Trypanosoma brucei.</a> Nature. 459 (7244), 278-281 (2009).</li>
<li>Engstler, M., Pfohl, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hydrodynamic+Flow-Mediated+Protein+Sorting+on+the+Cell+Surface+of+Trypanosomes%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Hydrodynamic Flow-Mediated Protein Sorting on the Cell Surface of Trypanosomes.</a> Cell. 131 (3), 505-515 (2007).</li>
<li>Mugnier, M. R., Cross, G. A. M., Papavasiliou, F. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+in+vivo+dynamics+of+antigenic+variation+in+Trypanosoma+brucei%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">The in vivo dynamics of antigenic variation in Trypanosoma brucei.</a> Science. 347 (6229), 1470-1473 (2015).</li>
</ol>

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

En ce qui concerne la technique expérimentale, le composant le plus critique du protocole est de garder tous les échantillons froids. Les trypanosomes intérioriser très rapidement anticorps lié à leur surface 9, mais ce processus dépend de la motilité, et n&#39;a pas d&#39; influence l&#39;essai aussi longtemps que les cellules sont maintenues à 4 ° C. Tous les échantillons doivent toujours être sur la glace, et pipetage devraient être effectués rapidement pour minimiser l&#39;exposition à l&#39;environnement...

Le parasite protozoaire, Trypanosoma brucei, est un agent causal de maladies qui affectent les humains (via Trypanosoma brucei gambiense et Trypanosoma brucei rhodesiense) et les animaux (via Trypanosoma brucei brucei) dans toute l&#39; Afrique sub-saharienne. Elle est transmise à l&#39;hôte de mammifère par la salive du vecteur de la mouche tsé-tsé. Les deux humains et de la trypanosomiase animale africaine causent un fardeau économique sévère dans les régions endémiques, et peu de médicaments sont disponibles ou en développement pour traiter soit la maladie. mécanismes d&#39;évasion immunitaire Comprendre est critique pour le développement de médicaments pour la trypanosomiase. La variation antigénique du dense, la variante glycoprotéine de surface (VSG) manteau qui couvre le parasite est l&#39; un des principaux moyens par lesquels T. brucei soustrait la réponse d&#39;anticorps de mammifère. Environ 2,000 variants du gène de VSG existent dans le génome du trypanosome, mais un seul est transcrit à un moment donné de l&#39; une des ~ 15 expressites sion. «Switching» de la VSG exprimée peut se produire soit par copie d&#39; un gène de VSG dans le site actif d&#39;expression, soit par activation de la transcription d&#39;un site d&#39;expression précédemment silencieux (passé en revue dans 1). Bien que beaucoup de travail a été consacrée à la compréhension de la variation antigénique de T. brucei, les facteurs qui influent sur la fréquence de commutation sont encore mal compris. Les études menées à ce jour ont été entravés par le fait que , bien que la commutation se produit stochastiquement in vitro, des fréquences de commutation sont très faibles, de l&#39;ordre de 1 à environ 10 6 cellules 2. Cela rend difficile de mesurer si une augmentation de facteurs donnés ou diminue la fréquence de commutation, étant donné que la commutation est difficile à détecter en premier lieu. Avant 2009, les méthodes d&#39;isolement switchers dans une population donnée étaient longues et de main-d&#39;œuvre. Ces cellules repiquage trypanosomes par des souris immunisées contre la VSG dominante et récolte inclusun jour plus tard 3, ou de compter des centaines de cellules par immunofluorescence 4,5. Une autre stratégie repose sur la sélection pour la résistance aux médicaments pour isoler switchers 6. Parce que les trypanosomes africains cultivées in vitro sont généralement constitués d&#39;une grande population exprimant une variante importante, et une population beaucoup plus petite de switchers exprimant des variantes alternatives, nous nous référons à la principale variante dans le présent document comme, VSG à partir dominante. Ce faisant, nous voulons en aucun cas impliquer que cette variante majeure a une plus grande remise en forme que d&#39;autres variantes dans la population. Nous décrivons ici une méthode qui peut mesurer de manière fiable le nombre de trypanosomes exprimant une VSG non dominante dans une population donnée dans 3 - 4 h. Cette méthode est particulièrement utile lorsque l&#39;on veut déterminer si une manipulation génétique donnée ou un traitement médicamenteux augmente le nombre de cellules commutées dans une population. Au lieu de se débarrasser de la population de cellules exprimant le dominant, à partir VSG par des médicaments ou par des moyens immunologiques, ces cellules sont éliminées en premier les enrobant avec des billes magnétiques couplées à un anticorps dirigé contre la VSG dominante, puis de les isoler dans une colonne magnétique. La population commuté est ensuite recueillie dans le flux continu et coloré à nouveau avec un anticorps marqué anti-VSG fluorophore pour identifier les contaminants. La quantification est obtenue en ajoutant un nombre défini de billes de comptage absolu de chaque échantillon de telle sorte que le rapport des billes aux cellules peut être déterminée et utilisée pour quantifier le nombre de commutateurs dans la population 7.

<table><tbody><tr><td>anticorps anti-VSG non marqué</td><td>n/a n</td><td>/a</td><td>L’anticorps VSG est fabriqué en maison</td></tr><tr><td>fluorophore Anticorps anti-VSG marqué</td><td>n/a</td><td>n/a l’anticorps</td><td>VSG est fabriqué en maison</td></tr><tr><td>HMI-9 support n</td><td>/a</td><td>n/a</td><td>HMI-9 est fabriqué en interne</td></tr><tr><td>Propidium Iodide</td><td>BD Pharmingen</td><td>556463</td><td></td></tr><tr><td>CountBright billes de comptage absolu</td><td>Thermofisher Scientific</td><td>C36950</td><td></td></tr><tr><td>LD colonnes</td><td>Miltenyi Biotech</td><td>130-042-901</td><td></td></tr><tr><td>Aimant MACS</td><td>Miltenyi Biotech</td><td>130-042-303</td><td></td></tr><tr><td>Séparateur magnétique MACS</td><td>Miltenyi Biotech</td><td>130-042-302</td><td></td></tr><tr><td>adaptateur vortex-60</td><td>ThermoFisher scientific</td><td>AM10014</td><td></td></tr><tr><td>cytomètre en flux</td><td>Coulter</td><td>n/a</td><td></td></tr><tr><td>logiciel d’analyse de cytomètre en flux</td><td>FloJo</td><td>n/a</td><td></td></tr></tbody></table>

détection de la<em&gt; trypanosoma brucei</em&gt; switching variant de glycoprotéine de surface par magnétique tri cellulaire activé et cytométrie de flux

Detection of Trypanosoma brucei Variant Surface Glycoprotein Switching by Magnetic Activated Cell Sorting and Flow Cytometry

Trypanosoma brucei, un parasite protozoaire qui provoque à la fois la trypanosomiase africaine humaine et animale (connue sous le nom de maladie du sommeil et de nagana, respectivement) circule entre un vecteur de tsé-tsé et un hôte mammifère. Il échappe au système immunitaire de l’hôte mammifère en changeant périodiquement la glycoprotéine de surface dense et variante (VSG) qui recouvre sa surface. La détection de la variation antigénique chez Trypanosoma brucei peut être à la fois lourde et laborieuse. Ici, nous présentons une méthode pour quantifier le nombre de parasites qui ont « changé » pour exprimer une nouvelle VSG dans une population donnée. Les parasites sont d’abord colorés avec un anticorps contre le VSG de départ, puis colorés avec un anticorps secondaire attaché à une bille magnétique. Les parasites exprimant la VSG de départ sont ensuite séparés du reste de la population en faisant passer les parasites sur une colonne attachée à un aimant. Les parasites exprimant la VSG dominante et initiale sont conservés sur la colonne, tandis que la circulation contient des parasites qui expriment une nouvelle VSG ainsi que certains contaminants exprimant la VSG de départ. Cette population est à nouveau colorée avec un anticorps marqué par fluorescence contre le VSG de départ pour marquer les contaminants, et de l’iodure de propidium (PI), qui marque les cellules mortes. Un nombre connu de billes de comptage absolu visibles par cytométrie en flux est ajouté à la population à flux continu. Le rapport entre les billes et le nombre de cellules collectées peut ensuite être utilisé pour extrapoler le nombre de cellules dans l’échantillon entier. La cytométrie en flux est utilisée pour quantifier la population de commutateurs en comptant le nombre de cellules PI négatives qui ne se colorent pas positivement pour le VSG dominant de départ. La proportion de commutateurs dans la population peut ensuite être calculée à l’aide des données de cytométrie en flux.

La méthode décrite ici a été utilisé pour démontrer que les cassures double brin dans le site d&#39;expression de VSG augmenté le nombre de switchers dans une population 8. Ici, nous montrons des résultats représentatifs d&#39;une population de trypanosomes qui ont été induites de manière similaire pour générer une cassure double brin au niveau du site d&#39;expression. Nous comparons ces trypanosomes à ceux qui ne l&#39; ont pas été amené à générer une cassure double brin. La...

<classe p='jove_content'>Les trypanosomes africains cultivés in vitro subissent une variation antigénique à un faible taux, de sorte que les populations sont constituées de parasites exprimant un variant dominant de type glycoprotéine de surface (VSG) et d’une petite population de variants « commutés ». Ce protocole décrit une méthode rapide de détection et de quantification de ces populations.

détection de la<em&gt; Trypanosoma brucei</em&gt; Switching Variant de glycoprotéine de surface par magnétique tri cellulaire activé et cytométrie de flux

Trypanosoma brucei, a protozoan parasite that causes both Human and Animal African Trypanosomiasis (known as sleeping sickness and nagana, respectively) ...

L'objectif général de cette méthode est d'isoler les trypanosomes exprimant une glycoprotéine de surface variante particulière, ou VSG, parmi l'ensemble de la population et d'identifier les parasites ayant effectué un changement depuis la VSG dominante initiale vers une autre VSG. Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés en biologie des trypanosomes, telles que : quels sont les facteurs ou événements qui influencent le changement de VSG dans une population de parasites ? Le principal avantage de cette technique est qu'elle est plus rapide que les méthodes publiées précédemment et permet une quantification facile des cellules ayant changé par rapport à celles qui n'ont pas changé.Lorsque le laboratoire a commencé à travailler sur la variation antigénique, le premier problème était de savoir comment détecter les cellules ayant changé de variante rarement. Ce type de problème avait en réalité déjà été résolu en immunologie plusieurs années auparavant, grâce à l'utilisation du tri cellulaire activé par magnétisme pour enrichir les cellules négatives pour un caractère particulier. Adapter ce procédé sans sélection à la variation antigénique semblait être une idée particulièrement prometteuse.Pour commencer, les trypanosomes sanguins de la souche Lister 427 doivent être cultivés jusqu'à une densité de 0,5 à 100 000 par millilitre. Prélevez un échantillon de 50 fois 10 à la puissance 6 cellules dans un tube de 15 millilitres, puis centrifugez. Conservez 1 fois 10 à la puissance 6 cellules en culture pour les utiliser ultérieurement comme témoins positif et négatif d'anticorps.Éliminer par pipette la majeure partie du surnageant en laissant environ 750 microlitres dans le tube. Transférer les cellules dans un tube de centrifugation de 1,5 millilitre. Enfin, centrifuger les cellules à quatre degrés Celsius pendant quatre minutes à 2800 ×g.Ensuite, aspirez complètement le surnageant. Resuspendez les cellules dans 150 microlitres de milieu de culture, additionné d'anticorps primaire dirigé contre la glycoprotéine de surface variante ou anti-VSG à la dilution appropriée. Incubez ensuite les cellules en vortex à quatre degrés Celsius pendant 10 minutes.Lavez avec 800 à 1000 microlitres de milieu de culture froid. Centrifugez les cellules à quatre degrés Celsius pendant quatre minutes à 5200 ×g. Après avoir aspiré le surnageant, lavez les cellules avec un millilitre de milieu de culture et centrifugez à nouveau.Éliminer le surnageant et resuspendre le culot dans 100 microlitres de milieu de culture. Ajouter 110 microlitres de microbilles pour tri cellulaire activé par champ magnétique du type approprié pour l'anticorps primaire. Mélanger soigneusement par aspiration et expulsion à l’aide d’une pipette, puis par vortex. Pendant que les cellules sont vortexées, préparez une colonne de séparation activée par aimant. Placez un tube de 15 millilitres en dessous pour recueillir le milieu de mise en route. Ajoutez deux millilitres de milieu de culture pour amorcer la colonne.Ensuite, retirez l'échantillon du vortex et ajoutez de 800 à 1000 microlitres de milieu de culture froid. Centrifugez l'échantillon, puis retirez le surnageant afin d'éliminer l'anticorps non lié. Lavez les cellules en culot avec un millilitre de milieu de culture et centrifugez à nouveau.Cette fois, aspirez le surnageant mais laissez 100 microlitres dans le tube. Agitez vigoureusement le tube à centrifuger jusqu'à ce que le culot soit complètement resuspendu. Ajoutez un millilitre de milieu de culture et pipetez plusieurs fois pour resuspendre complètement les cellules.Retirez le tube conique de 15 millimètres utilisé pour recueillir le milieu de mise en marche et remplacez-le par un nouveau tube conique de 15 millilitres afin de recueillir l'écoulement sortant contenant les parasites commutés. Appliquez la suspension cellulaire sur la colonne préparée. Recueillez l'écoulement sortant dans un tube de 15 millilitres placé en dessous, ce qui prend généralement de six à sept minutes pour un millilitre de milieu additionné de trypanosomes.Ensuite, lavez la colonne deux fois avec un millilitre de milieu de culture et récupérez l'écoulement dans le même tube. Répartissez l'écoulement, qui doit représenter environ trois millilitres, dans deux tubes microcentrifuge de 1,5 millilitre. Puis, placez les tubes sur de la glace.Ajoutez trois millilitres de milieu de culture dans la colonne et plongez la colonne dans un tube centrifuge de 15 millilitres. Cette étape permet d'obtenir les cellules exprimant la VSG dominante initiale. Prélevez 300 microlitres de ce matériel élué et conservez-les sur de la glace ; le reste peut être éliminé.Pour créer un témoin positif, prélevez environ 100 000 cellules à partir de la culture initiale de cellules et transférez-les à l’aide d’une pipette dans un tube microcentrifuge de 1,5 millilitre. Répétez cette opération pour créer un témoin négatif. Centrifugez les échantillons de flux passant ainsi que l’échantillon témoin positif.Ensuite, retirez et jetez le surnageant. Resuspendez les cellules du témoin positif dans 100 microlitres de milieu de culture contenant l'anticorps primaire anti-VSG marqué par un fluorophore, à la dilution appropriée. Ensuite, resuspendez un culot de flux sortant dans 100 microlitres de milieu de culture contenant l'anticorps primaire anti-VSG marqué par un fluorophore, à la dilution appropriée.Utilisez la suspension pour resuspendre ensuite le culot dans le deuxième tube de flux sortant, ce qui donne un tube de regroupement. Mélangez soigneusement en aspirant et en expulsant plusieurs fois à l’aide d’une pipette. Vortexez les cellules, puis ajoutez de 800 à 1 000 microlitres de milieu de culture froid.Centrifuger les échantillons à quatre degrés Celsius pendant quatre minutes à 5200 ×g, puis éliminer le surnageant afin d'éliminer tout anticorps non lié. Laver les cellules avec un millilitre de milieu de culture, puis centrifuger les cellules. Les contrôles positif et négatif ainsi que les cellules éluées précédemment conservées sur glace.Jetez le surnageant. Ensuite, ajoutez 148,5 microlitres de milieu de culture aux échantillons. Puis, ajoutez 25 microlitres de billes de comptage absolues, suivis de 1,5 microlitre de solution de coloration par l’iodure de propidium.Resuspendez les pastilles de contrôle positif et négatif avec 175 microlitres de milieu de culture. Les échantillons peuvent maintenant être analysés par cytométrie en flux. Ces histogrammes de cytométrie en flux montrent les résultats de la séparation cellulaire à partir de populations de trypanosomes induites à produire une cassure double-brin de l'ADN par rapport aux cellules non induites.Les panneaux de gauche montrent la diffusion avant par rapport à la diffusion latérale, ce qui permet de distinguer les cellules vivantes des cellules mortes ainsi que les billes ajoutées à l'échantillon. Des fenêtres peuvent ensuite être définies pour identifier ces éléments en fonction de leurs caractéristiques de diffusion. Les panneaux de droite montrent uniquement les cellules qui peuvent être classées comme vivantes selon les fenêtres de diffusion établies dans les panneaux de gauche.La VSG initiale dominante dans ce cas était la VSG deux. Les cellules qui se colorent positivement au propidium iodure sont des cellules mortes. Elles apparaissent dans les régions Q un et Q deux du tracé.Les cellules qui se colorent positivement pour la VSG dominante et négativement pour l'iodure de propidium se situent dans le quadrant trois et sont considérées comme des contaminants. Enfin, les cellules du quadrant quatre sont des cellules vivantes qui se colorent négativement pour la VSG dominante et qui sont considérées comme des cellules ayant effectué un changement d'expression. Ce graphique montre les fréquences de commutation observées calculées pour les populations de trypanosomes avec ou sans cassures induites.Le niveau de commutation stochastique in vitro est assez faible. Induire une cassure entraîne toutefois un nombre significativement plus élevé de cellules passant au VSG non dominant. Une fois maîtrisée, cette technique peut être réalisée en environ trois heures.lors de la réalisation de cette procédure, il est important de maintenir les échantillons au froid en permanence et de bien resuspendre les culots, en particulier avant l'isolement sur la colonne. Après cette procédure, d'autres méthodes comme le séquençage de l'ARN peuvent être utilisées pour répondre à des questions supplémentaires, telles que les VSG exprimés dans une population en cours de commutation. Bien que cette méthode soit généralement utilisée pour mesurer la commutation des VSG, elle peut également servir à l'isolement et à la quantification de parasites exprimant toute protéine de surface d'intérêt.

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détection de la Trypanosoma brucei Switching Variant de glycoprotéine de surface par magnétique tri cellulaire activé et cytométrie de flux (Vidéo) | JoVE Journal

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