Électrophorèse de gel horizontal pour une détection améliorée des complexes protéine-ARN

L’objectif global de ce protocole est d’analyser les interactions ARN-protéines à l’aide de l’électrophorèse horizontale sur gel natif. Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés en biochimie de l’ARN, telles que la définition des caractéristiques d’interactions spécifiques entre les protéines de l’ARN. Le principal avantage de cette technique est qu’elle permet de surveiller plusieurs fois la formation complexe lors de l’électrophorèse.

Pour l’appareil de gel horizontal, utilisez une boîte de gel avec un plateau de coulée de 27 centimètres sur 21 centimètres et une capacité de deux peignes de 24 puits. Cette configuration fournit un total de 48 échantillons qui peuvent être analysés simultanément. Préparez deux litres de 1 tampon de coulée TBE en diluant 400 millilitres de 5 TBE avec 1 600 millilitres d’eau et en mélangeant.