Cartographie de tout le génome de chromatine Accessible dans les Lymphocytes T humains primaires par ATAC-Seq

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13 novembre 2017

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Dosage pour la Transposase Accessible chromatine couplé avec le séquençage haut-débit (ATAC-seq) est une méthode de Génome-large pour découvrir la chromatine accessible. Il s’agit d’un protocole étape par étape de ATAC-seq, du moléculaire à la dernière analyse computationnelle, optimisé pour les lymphocytes humains (Th1/Th2). Ce protocole peut être adopté par les chercheurs sans expérience préalable dans les méthodes de séquençage de prochaine génération.

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Accessibilité de la chromatine

Chapters in this video

0:05

Titre

0:54

Purification de cellules CD4+ humaines naïves, polarisation en cellules Th1 et Th2 et extraction des noyaux

3:18

Réaction de transposition et amplification de la banque

4:33

Sélection de taille des banques ATAC-seq

6:48

Résultats : contrôle qualité et lectures de séquençage de nouvelle génération

8:07

Conclusion

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