Cartographie de tout le génome de chromatine Accessible dans les Lymphocytes T humains primaires par ATAC-Seq

17.7K vues

Cité 10 fois

09:08 min

13 novembre 2017

10.3791/56313-v

13 novembre 2017

17.7K vues

Dosage pour la Transposase Accessible chromatine couplé avec le séquençage haut-débit (ATAC-seq) est une méthode de Génome-large pour découvrir la chromatine accessible. Il s’agit d’un protocole étape par étape de ATAC-seq, du moléculaire à la dernière analyse computationnelle, optimisé pour les lymphocytes humains (Th1/Th2). Ce protocole peut être adopté par les chercheurs sans expérience préalable dans les méthodes de séquençage de prochaine génération.

Explorer plus de vidéos

Accessibilit de la chromatine

Chapters in this video

0:05

Title

0:54

Purification of Naïve Human CD4+ Cells, Polarization to Th1 and TH2 Cells, and Nuclei Extraction

3:18

Transposition Reaction and Library Amplification

4:33

Size Selection of ATAC-seq Libraries

6:48

Results: Quality Control and Next Generation Sequencing Reads

8:07

Conclusion

Related Videos