Le test de bioluminescence utilisant l'ATP

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The ATP Bioluminescence Assay

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08:32 min
April 30, 2023

Overview

Lucioles, l’enzyme luciférase convertit un composé appelé la luciférine en oxyluciferin, en produit de lumière ou « luminescence » en conséquence. Cette réaction utilise l’énergie issue de ATP afin d’aller de l’avant, donc les chercheurs ont exploité l’interaction de la luciférine-luciférase afin de mesurer les niveaux d’ATP dans les cellules. Étant donné le rôle de monnaie de la cellule d’énergie de l’ATP, le test de bioluminescence ATP peut donnent un aperçu de métabolisme cellulaire et la santé globale de cellule.

Dans cette vidéo, JoVE discute de la respiration cellulaire, examinant plus précisément comment le métabolisme du glucose entraîne la production d’ATP. Il est suivi par les principes qui sous-tendent le test de bioluminescence ATP et un protocole généralisé pour cette technique. Enfin, une étude de comment les chercheurs utilisent actuellement le test de bioluminescence ATP pour évaluer la viabilité des cellules dans une variété de conditions expérimentales.

Procedure

Le test de bioluminescence ATP est une technique courante utilisée pour quantifier les niveaux d’ATP et de détecter les cellules vivantes, métaboliquement actives. ATP ou adénosine triphosphate est la principale source d’énergie pour tous les organismes vivants, et par « tout » ce que nous entendons tous. Au niveau cellulaire, l’ATP est généré grâce à un ensemble de processus métaboliques, appelé respiration cellulaire.

Aujourd’hui, nous discuterons brièvement les voies impliquées dans la respiration cellulaire. Ensuite, nous allons introduire les principes qui sous-tendent le test de bioluminescence ATP et passent par un protocole étape par étape pour réaliser ce procédé. Enfin, nous verrons comment les scientifiques sont appliqué cette technique dans leurs recherches en cours.

Permet de commencer par l’introduction de la respiration cellulaire. Ce phénomène implique plusieurs processus métaboliques, mais nous allons nous concentrer sur l’un traitant du métabolisme du glucose.

Dans le cytoplasme, la voie de la glycolyse transforme le glucose en pyruvate et dans le processus génère deux molécules d’ATP. Pyruvate est transporté dans la mitochondrie, où il est converti en acétyl-coenzyme A, un processus qui génère également du dioxyde de carbone. Tout en restant dans les mitochondries, l’acétyl-coenzyme A puis pénètre dans l’acide tricarboxylique ou cycle de Krebs, au cours de laquelle le dioxyde de carbone est encore une fois généré, comme sont les molécules à haute énergie du NADH et FADH2. Ces molécules en fin de compte « transportent » électrons dans la chaîne de transport d’électrons ou ETC.

Au sein de l’ETC, les électrons sont séquentiellement transférés entre complexes de différentes protéines dans la membrane mitochondriale interne, avant de convertir l’oxygène en eau. Au cours de ce processus, les protons sont « pompés » dans l’espace intermembranaire de la mitochondrie. ATP se produit effectivement lorsque ces protons entrez dans la matrice mitochondriale pendant qu’ils traversent une protéine appelée ATP synthase. Ensemble, le cycle de Krebs et etc. entraînent la synthèse de 36 molécules d’ATP. Ventilation d’autres molécules d’éléments nutritifs, tels que les lipides et les protéines, peut aussi alimenter le cycle de Krebs et etc., conduisant à la production d’ATP.

Maintenant que nous savons comment les cellules génèrent de l’ATP, nous allons connaître les principes qui sous-tendent le test ATP bioluminescence, qui est couramment utilisé pour mesurer les concentrations intracellulaires de cette molécule.

Structurellement, l’ATP a une base adénine, un sucre ribose et trois groupements phosphate — laquelle est reliées par des liaisons à haute énergie. Ces obligations libèrent de l’énergie si cassé, et le test de bioluminescence ATP capitalise sur cette énergie.

Fondamentalement, ce test nécessite la luciférine composé, qui est obtenu à partir des organismes « rougeoyant » comme les lucioles, et l’enzyme catalyseur correspondant appelé luciférase. En présence d’oxygène, la luciférase tire l’énergie de l’ATP et convertit la luciférine en oxyluciferin. Sous-produits de cette réaction sont pyrophosphate, c’est-à-dire deux groupes phosphate obtenus à partir d’ATP — convertissant en adénosine monophosphate ou AMP — dioxyde de carbone et de lumière ou de luminescence. Luminescence est lu par un luminomètre, une machine qui quantifie l’émission de lumière. Puisque la quantité de luminescence produit est directement proportionnelle à la quantité d’ATP, c’est un bon indicateur de la viabilité cellulaire et le métabolisme.

Maintenant que vous comprenez les principes qui sous-tendent le test de bioluminescence ATP, nous allons décrire un protocole général.

Tout d’abord, les cellules sont ensemencées dans une plaque à 96 puits contenant des milieux de culture. Les cellules sont plaquées à différentes densités en trois exemplaires, pour tenir compte de la variation de densité-dépendance. Étant donné que les puits plus externe ne sont pas entourés d’autres puits sur les quatre côtés, le taux d’évaporation et de la température dans ces puits peut être variable. Par conséquent, cellules ne sont pas plaqués dans les puits de l’extérieurs, et au lieu de cela, ils sont remplis d’eau pour éviter les variations évaporation et de la température à l’échelle de la plaque qui peuvent affecter la réaction. Plaques sont ensuite incubés durant une nuit à 37° C pour permettre à des cellules d’adhérer aux plaques de culture.

Ensuite, la presse est supprimée, luciférase et luciférine sont a ajouté à chaque puits et la plaque est placée sur un agitateur de 5 à 15 minutes afin de faciliter la réaction. Ensuite, une partie du mélange dans chaque puits est transférée à une plaque de 96 puits blanche ; plaques blanches sont souvent utilisés car ils réfléchissent la lumière vers le haut, permettant une lecture plus précise de luminescence. En outre, des bulles il faut éviter, car ils pourraient interférer avec les analyses subséquentes. Comme le signal de la luminescence peut diminuer au fil du temps, la plaque est lue dans les 10 à 12 minutes sur un luminomètre.

Pour analyser les résultats de luminomètre, une valeur moyenne de luminescence est calculée à partir de puits avec la même densité de cellules. En comparant les données de luminescence obtenues de cette manière à la fois des échantillons témoins sains et les cellules traitées, les chercheurs peuvent évaluer les effets d’un traitement spécifique sur la viabilité et le métabolisme — plus précisément par la recherche de luminescence a diminué dans le groupe expérimental.

Maintenant que vous avez vu comment effectuer un test de bioluminescence ATP, nous allons discuter de ses applications de recherche.

Les scientifiques cherchent toujours à développer de nouveaux antiviraux qui ne blesser ou tuer des cellules de l’hôte. Dans cette étude, les cellules de mammifères ont été ensemencées dans une plaque multipuite et infectés par un virus spécifique. Divers composés antiviraux ont été ajoutés à ces échantillons, et les courbes concentration-réponse de journal ont été générés pour calculer la concentration effective cinquante ou CE50. CE50 est la concentration du composé à cellule viabilité est 50 pour cent. Il s’agit d’un paramètre couramment utilisé pour évaluer la cytotoxicité d’un composé.

Taux d’ATP peuvent aussi donnent des indices sur l’activité mitochondriale dans diverses conditions. Ici, le test de bioluminescence ATP a été réalisé sur les préparatifs des mitochondries provenant du foie de rongeurs et des cellules musculaires, ce qui a aidé les chercheurs à évaluer l’étendue de la fonction mitochondriale dans les tissus normaux. Ce qui est important, ce protocole pourrait être étendu pour fournir un moyen d’examiner la fonction mitochondriale dans les états pathologiques.

Les scientifiques utilisent également ce dosage pour enquêter sur les éventuels traitements contre le cancer dans les systèmes de in vivo . Dans cet exemple, les cellules tumorales humaines ont été modifiées à la luciférase express et injectés dans le cerveau des souris vivantes. Après que les cellules tumorales s’établissent à ces animaux, ils ont été traités avec un médicament anticancéreux. Un test de bioluminescence subséquent en vivo ATP a révélé que les cellules tumorales chez des souris exposés au médicament des niveaux inférieurs d’ATP.

Vous avez juste regardé introduction de JoVE au test ATP bioluminescence. Vous devez maintenant être familiarisé avec les voies de la respiration cellulaire et le protocole utilisé pour mesurer l’ATP, qui est le produit final de ces voies. Le test de bioluminescence ATP sert comme un outil de dépistage excellent pour les biologistes cellulaires intéressé à étudier l’effet de facteurs physiologiques et pathologiques sur le métabolisme cellulaire et la viabilité. Comme toujours, Merci pour regarder !

Transcript

The ATP bioluminescence assay is a common technique used to quantify ATP levels and detect living, metabolically active cells. ATP or adenosine triphosphate is the primary source of energy for all living organisms, and by “all” we mean ALL. At the cellular level, ATP is generated through a set of metabolic processes called cellular respiration.

Today, we’ll briefly discuss the pathways involved in cellular respiration. Next, we’ll introduce the principles behind the ATP bioluminescence assay, and go through a step-by-step protocol for performing this method. Finally, we’ll see how scientists are applying this technique in their current research.

Lets begin by introducing cellular respiration. This phenomenon involves several metabolic processes, but we’ll focus on the one dealing with glucose metabolism.

In the cytoplasm, the glycolysis pathway converts glucose to pyruvate, and in the process generates two ATP molecules. Pyruvate is transported into the mitochondria, where it is converted to acetyl-coenzyme A—a process that also generates carbon dioxide. While still in the mitochondria, acetyl-coenzyme A then enters the tricarboxylic acid or TCA cycle, during which carbon dioxide is again generated, as are the high-energy molecules of NADH and FADH2. These molecules ultimately “carry” electrons into the electron transport chain or ETC.

Within the ETC, electrons are sequentially transferred between different protein complexes in the inner mitochondrial membrane, before converting oxygen to water. During this process, protons are “pumped” into the intermembrane space of mitochondria. ATP is actually produced when these protons enter back into the mitochondrial matrix as they pass through a protein called ATP synthase. Together, the TCA cycle and ETC result in the synthesis of 36 ATP molecules. Breakdown of other nutrient molecules, such as fats and proteins, can also feed into the TCA cycle and ETC, leading to ATP production.

Now that we know how cells generate ATP, let’s learn about the principles behind the ATP bioluminescence assay, which is commonly used to measure intracellular levels of this molecule.

Structurally, ATP has an adenine base, a ribose sugar, and three phosphate groups—the latter of which are connected by high-energy bonds. These bonds release energy when broken, and the ATP bioluminescence assay capitalizes on this energy.

Basically, this assay requires the luciferin compound, which is obtained from “glowing” organisms like fireflies, and its corresponding catalyst enzyme called luciferase. In the presence of oxygen, luciferase derives energy from ATP and converts luciferin into oxyluciferin. Byproducts of this reaction are pyrophosphate, which is two phosphate groups obtained from ATP—converting it to adenosine monophosphate or AMP—carbon dioxide, and light or luminescence. Luminescence is read by a luminometer, a machine that quantifies light emission. Since the amount of luminescence produced is directly proportional to the amount of ATP, this serves a good indicator of cell viability and metabolism.

Now that you understand the principles behind the ATP bioluminescence assay, let’s outline a general protocol.

First, cells are seeded in a 96-well plate containing culture media. Cells are plated at various densities in triplicate, to account for density-dependent variation. Since the outer-most wells are not surrounded by other wells on all four sides, the temperature and evaporation rate in these wells may be variable. Therefore, cells are not plated in the outer wells, and instead they are filled with water to avoid plate-wide evaporation and temperature variation that may affect the reaction. Plates are then incubated overnight at 37°C to allow the cells to adhere to the culture plates.

Then, the media is removed, luciferase and luciferin are added to each well, and the plate is placed on a shaker for 5–15 minutes to facilitate the reaction. Next, a portion of the mixture from each well is transferred to a white 96-well plate; white plates are often used as they reflect light upwards, allowing for more accurate luminescence readings. In addition, bubbles should be avoided, as they could interfere with subsequent analyses. As the luminescence signal can decrease over time, the plate is read within 10–12 minutes on a luminometer.

To analyze the luminometer results, an average luminescence value is calculated from wells with the same cell density. By comparing luminescence data collected in this manner from both healthy control samples and treated cells, researchers can evaluate the effects of a specific treatment on viability and metabolism—specifically by looking for decreased luminescence in the experimental group.

Now that you’ve seen how to perform an ATP bioluminescence assay, let’s discuss its research applications.

Scientists are always trying to develop new antivirals that don’t harm or kill host cells. In this study, mammalian cells were seeded in a multiwell plate and infected with a specific virus. Various antiviral compounds were added to these samples, and log concentration-response curves were generated to calculate the effective concentration fifty or EC50. EC50 is the concentration of compound at which cell viability is 50 percent. This is a commonly used parameter to assess a compound’s cytotoxicity.

ATP levels can also yield clues about mitochondrial activity under various conditions. Here, the ATP bioluminescence assay was performed on preparations of mitochondria derived from rodent liver and muscle cells, which helped researchers assess the extent of mitochondrial function in normal tissues. Importantly, this protocol could be extended to provide a way to examine mitochondrial function in disease states.

Scientists are also using this assay to investigate potential cancer treatments in in vivo systems. In this example, human tumor cells were modified to express luciferase and injected into the brains of living mice. After the tumor cells became established in these animals, they were treated with an anti-cancer drug. A subsequent in vivo ATP bioluminescence assay revealed that tumor cells in drug-exposed mice had lower ATP levels.

You’ve just watched JoVE’s introduction to the ATP bioluminescence assay. You should now be familiar with the cellular respiration pathways and the protocol used to measure ATP, which is the end product of these pathways. The ATP bioluminescence assay serves as an excellent screening tool for cell biologists interested in studying the effect of physiological and pathological factors on cell metabolism and viability. As always, thanks for watching!