Combinant l’analyse de l’ADN dans une Extraction de Virion brut avec l’analyse de l’ARN des feuilles infectées pour découvrir de nouveaux génomes de Virus

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08:56 min

27 juillet 2018

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27 juillet 2018

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Nous présentons ici une nouvelle approche pour identifier les virus végétaux avec les génomes d’ADN double brin. Nous utilisons des méthodes standard pour extraire l’ADN et l’ARN de feuilles infectées et de réaliser le séquençage de prochaine génération. Outils bioinformatiques assemblent des séquences en contigs, identifient des contigs représentant les génomes de virus et affecter des génomes aux groupes taxonomiques.

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Découverte du génome viral

Chapters in this video

0:04

Titre

0:58

Purification générale des virus par centrifugation différentielle

4:03

Isolement de l'ADN virion par extraction organique

5:46

Résultats : génomes de deux espèces de badnavirus identifiés à partir de cannas infectés

7:34

Conclusion

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