Name: Production et la visualisation des sphéroplastes bactériennes et de protoplastes de caractériser Peptide antimicrobien localisation (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-08-11T15:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 13 s
Description: Apprenez à produire des sphéroplastes d'Escherichia coli et des protoplastes de Bacillus megaterium pour visualiser la localisation des peptides antimicrobiens. Cette méthode permet d'étudier les interactions peptide-bactérie.

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Recherche a été financée par l’Institut National des allergies et maladies infectieuses (NIAID-NIH) prix R15AI079685.

1. préparation de la solution
NOTE : Préparer des solutions décrites aux étapes 1,1 et 1,9 et 1,8 – 1.11 afin de produire des sphéroplastes d’e. coli et b. megaterium protoplastes, respectivement.
<ol><li>Préparer 1 M Tris-Cl, pH 7,8 en dissolvant 10,34 Tris HCl et 4,17 g de Tris OH dans 50 mL de dH2O dans un flacon de 125 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à température ambiante.</li>
	<li>Préparer la solution A (20 mM MgCl2, 0,7 M de sucrose, 10 mM Tris-Cl, pH 7,8) en dissolvant 0,10 g MgCl2 (95,2 g/mol) et 11,98 g de saccharose (342.3 g/mol) à 25 mL dH2O dans une fiole de mL 125. Ajouter 500 µL 1 M Tris-Cl (pH 7,8) et régler le volume à 50 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à température ambiante.</li>
	<li>Préparer la solution B (10 mM MgCl2, 0,8 M de sucrose, 10 mM Tris-Cl, pH 7,8) dissoudre 0,05 g MgCl2 (95,2 g/mol) et 13,69 g de saccharose (342.3 g/mol) à 25 mL dH2O dans une fiole de mL 125. Ajouter 500 µL 1 M Tris-Cl (pH 7,8) et régler le volume à 50 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à température ambiante.</li>
	<li>Préparer 0,8 M de sucrose en dissolvant 13,69 g de saccharose (342.3 g/mol) dans 50 mL dH2O dans une fiole de mL 125. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à température ambiante.</li>
	<li>Préparer la désoxyribonucléase 5 mg/mL j’ai (DNase j’ai) en dissolvant 0,015 g DNase I dans 3 mL de dH2O dans un ballon jaugé de 50 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané. Solution aliquote dans des microtubes et conserver à-20 ° C.</li>
	<li>Préparer l’acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) de 0,125 M, pH 8,0 en dissolvant disodium EDTA g 0,698 déshydrater (372.2 g/mol) dans 15 mL dH2O dans un flacon de 125 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à température ambiante.</li>
	<li>Préparer 600 cephalexin µg/mL en dissolvant 0,03 g d’hydrate de la céfalexine (365.404 g/mol) dans 50 mL de dH2O dans un flacon de 125 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à 4 ° C.</li>
	<li>Préparer lysozyme de 5 mg/mL en dissolvant le lysozyme de 0,015 g dans 3 mL de dH2O dans un ballon jaugé de 50 mL. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané. Solution aliquote dans des microtubes et conserver à-20 ° C.</li>
	<li>Préparer 3 % p/v Trypticase Soy Broth (TSB) en dissolvant les 30 g de BST dans 1 L de dH2O dans un flacon de 2 L. Partie aliquote de la solution dans des fioles contenant 25 mL ou 100 mL du BST pour être utilisé dans la préparation des sphéroplastes d’e. coli ou les protoplastes megaterium b. , , respectivement. Flacons d’autoclave pour stériliser le milieu liquide. TSB stérile peut être conservé à température ambiante ou 4 ° C.</li>
	<li>Préparer la solution C (1 M de sucrose, maléate de 0,04 M, 0.04 M MgCl2, pH 6,5) en dissolvant 34,23 g de saccharose (342.3 g/mol), l’acide maléique 0,46 g (116.07 g/mol) et 0,38 g MgCl2 (95.21 g/mol) dans 100 mL de dH2O dans un ballon jaugé de 250 mL. Ajuster le pH à 6,5. Stériliser par filtration à travers un filtre de seringue 25 mm 0,2 µm de membrané et stocker dans un tube conique à température ambiante.</li>
	<li>Préparez 200 mL de milieu de protoplaste en mélangeant 100 mL 3 % p/v du BST et 100 mL solution C dans une bouteille de verre de 1 L. Autoclave pour stériliser la solution et stocker à température ambiante.</li>
</ol>2. préparation de la Culture au jour le jour
Remarque : Effectuez les articles 2-4 à l’aide des techniques appropriées de stériles. Si vous le souhaitez, une souche bactérienne peut contenir un plasmide de résistance aux antibiotique réduire la contamination potentielle. Si vous utilisez une souche avec la résistance aux antibiotique, ajouter les antibiotiques nécessaires aux étapes 2.1, 3.1, 3.2 et 4.1-4.4.
<ol><li>Préparer une culture durant la nuit en choisissant une seule colonie de bactéries à l’aide d’un embout de la pipette stérile et de le placer dans un tube à culture 14 mL contenant de 2 à 3 mL de 3 % p/v du BST. Incuber à 37 ° C, et en agitant pendant 16 à 21 h.</li>
</ol>3. préparation des sphéroplastes Gram négatif Escherichia coli
<ol><li>Dans un ballon jaugé de 250 mL, diluer la nuit culture au 1/100 dans 25 mL de 3 % p/v TSB et incuber la solution bactérienne à 37 ° C, et en agitant pendant environ 2,5 h, jusqu'à ce que la solution a atteint une densité optique de 0,5 à 0,8 à 600 nm. Mesurer la densité optique à l’aide d’un spectrophotomètre.</li>
	<li>Dans un ballon jaugé de 250 mL, diluer cette culture 01:10 à 30 mL de 3 % p/v TSB et incuber à 37 ° C, et en agitant pendant 2,5 h en présence de 60 cephalexin de µg/mL (347,4 g/mol) pour produire des filaments unicellulaires d’environ 50 – 150 µm de longueur , qui sont observables sous un grossissement de X 1 000, à l’aide d’un microscope optique (Figure 1 b).</li>
	<li>Récolter les filaments en centrifugeant la solution bactérienne à x 1 500 g, 4 ° C pendant 4 min. décanter et éliminer le surnageant, réservant le culot.</li>
	<li>Laver les filaments en ajoutant doucement 1 mL de 0,8 M de sucrose, en veillant à ne pas déranger le culot. Incuber pendant 1 min et puis jeter le liquide surnageant sans déranger le culot.</li>
	<li>Ajouter 150 µL de 1 M Tris-Cl (pH 7,8), 120 µL du lysozyme de 5 mg/mL, 30 µL de 5 mg/mL DNase I, ainsi que 120 µL de 0,125 M EDTA dans leurs respectifs afin de la pastille et incuber la solution à température ambiante pendant 10 min.</li>
	<li>Ajouter 1 mL de solution A progressivement pendant 1 min dans la solution préparée dans 3.5 à l’aide d’une micropipette tandis que doucement, agitant la solution à la main. Incuber la solution pendant 4 min à température ambiante.</li>
	<li>Mettre 7 mL de la solution B de 4 ° C en deux tubes coniques 15 mL. Ajouter une quantité égale de la solution préparée en 3,6 millions à chacun de ces deux tubes. Centrifuger la solution à 1 500 g, 4 ° C pendant 4 min.</li>
	<li>À l’aide d’une pipette sérologique, retirez soigneusement tous sauf 1–2 mL du surnageant sans déranger le culot. Resuspendre le culot de pipetage doucement et descendre à l’aide d’une micropipette P1000. Examinez-la pour voir la formation de sphéroplastes en observant l’échantillon à un grossissement de X 1 000, à l’aide d’un microscope optique (Figure 1).</li>
	<li>Stocker les sphéroplastes à-20 ° C pendant une semaine ou jusqu'à ce qu’ils ont passé par 3 cycles de gel-dégel.</li>
</ol>4. préparation des protoplastes de Gram positif megaterium b.
<ol><li>Dans un ballon jaugé de 250 mL, diluer la nuit culture 1 : 1 000 dans 100 mL de 3 % p/v TSB et incuber la solution bactérienne à 37 ° C, tout en agitant pendant environ 4,5 h, jusqu'à ce que la solution a atteint une densité optique de 0,9–1.0 à 600 nm. Mesurer la densité optique à l’aide d’un spectrophotomètre.</li>
	<li>Versez la culture liquide dans deux tubes conique de 50 mL et centrifuger à 2 000 x g, 4 ° C pendant 10 min.</li>
	<li>À l’aide d’une pipette sérologique, jeter le surnageant de deux tubes coniques. Resuspendre chaque culot dans 2,5 mL de milieu de protoplastes et combiner les solutions remises en suspension dans un tube conique unique. Distribuer la solution combinée de remises en suspension dans un flacon de 125 mL.</li>
	<li>Ajouter 1 mL de lysozyme de 5 mg/mL et incuber pendant 1 heure à 37 ° C, et en agitant.</li>
	<li>Surveiller la croissance des protoplastes sous un grossissement de x 1 000, à l’aide d’un microscope optique, notant toute irrégularité, tels que les bactéries qui apparaissent comme des tiges gonflées au lieu de sphères (Figure 2). À l’aide d’une pipette sérologique, transvaser la solution dans un tube conique de 15 mL et centrifuger à 2 000 x g, 4 ° C pendant 10 min.</li>
	<li>Éliminer le surnageant et remettre en suspension l’extrait concentré dans 5 mL de milieu de protoplastes. Stocker des protoplastes à-20 ° C pendant une semaine ou jusqu'à ce qu’ils ont passé par 3 cycles de gel-dégel.</li>
</ol>5. préparation de la Solution de Peptide et Membrane colorant pour l’imagerie
<ol><li>
Solution de peptide
	<ol>
<li>Dans un tube à centrifuger enveloppé dans du papier d’aluminium, dissoudre 2 mg de FITC étiqueté BF2 P11A 800 µL dH2O. utilisation d’un peptide contenant au moins un résidu tryptophane afin de réaliser des mesures de concentration de protéine.</li>
		<li>Par spectrophotométrie, mesurer l’absorbance de la solution de peptide à 280 nm en triple exemplaire. Calculer la concentration de peptide en utilisant le coefficient d’extinction molaire pour le tryptophane (5 700/Mcm).</li>
		<li>Diluer la concentration de peptide dans dH2O à une concentration finale de 100 – 200 µM. entreposer dans un tube à centrifuger à-20 ° C enveloppé dans du papier d’aluminium pour protéger de la lumière.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Colorant de membrane
	<ol>
<li>Dans un tube à centrifuger, préparation d’un stock de 10 mM de di-8-ANEPPS (592.9 g/mol) en dissolvant 5 mg de di-8-ANEPPS en 843.3 µL de DMSO. Conserver à 4 ° C, enveloppé dans du papier d’aluminium pour protéger de la lumière.</li>
		<li>Dans un tube à centrifuger, préparer 1 mL de 0,03 mM di-8-ANEPPS en ajoutant 3 µL de 10 mM di-8-ANEPPS à 997 µL DMSO. Stocker dans un tube à centrifuger à 4 ° C, enveloppé dans du papier d’aluminium pour protéger de la lumière.</li>
	</ol>
</li>
</ol>6. visualisation des sphéroplastes d’e. coli et des protoplastes megaterium b. à l’aide de la microscopie confocale
<ol><li>Pipetter 5 µL de sphéroplastes ou protoplastes sur une lame de verre revêtu de poly-L-lysine. Ajouter 2 µL de FITC étiqueté AMP (100 à 200 µM) à la diapositive et incuber pendant 3 min, abri de la lumière.</li>
	<li>Ajouter 1 µL de la membrane colorant di-8-ANEPPS (0,03 mM) dans la diapositive et incuber pendant 3 min, abri de la lumière. Couvrir avec une lamelle de verre et sceller avec le vernis à ongles.</li>
	<li>Allumer le laser confocal de microscope et argon. Ajuster le laser à argon pour 20 % de la puissance et de transmission de 20 %.</li>
	<li>Définissez les gammes de longueur d’onde d’émission de 499 – 532 nm et 670 – 745 nm pour le canal d’émission peptide marqué FITC et la membrane di-8-ANEPPS-étiqueté colorant d’émission canal, respectivement.</li>
	<li>Les protoplastes image ou sphéroplastes (Figure 1 et Figure 2) avec un objectif X 63. Utiliser des logiciels d’imagerie pour obtenir 8 bits, 512 x 512 composite z-empiler les images composées de 0,5 µm de tranches de l’intégralité des sphéroplastes ou des protoplastes. Remarque : Prendre un examen attentif pour réduire l’émission cordeau tout en imagerie de sphéroplastes et de protoplastes. Voir la discussion pour plus de détails.</li>
</ol>7. caractérisation de la localisation de l’AMP
<ol><li>Ouvrez l’image composite z-pile dans les logiciels d’imagerie. Repérez la tranche du centre-la plupart des sphéroplastes ou protoplaste et placez une région circulaire d’intérêt (ROI) (0,3 µm de diamètre) sur la membrane (1 ROI), un au centre des sphéroplastes ou protoplaste (retour sur investissement 2) et un de sphéroplastes ou protoplaste à mesurer la fluorescence de fond (3 ROI) (Figure 5). Éviter d’inclure des pixels saturés. L’intensité de fluorescence à chaque ROI peut être calculée par le logiciel d’imagerie. Remarque : Dans les instances lorsque peptide ne pas localiser à la totalité de la membrane, tirer les ROI 1 sur une surface de la membrane où le peptide est localisé.</li>
	<li>Utiliser l’équation suivante pour déterminer le ratio d’intensité de fluorescence du peptide intracellulaire à l’intensité de fluorescence de peptide membrane : <img alt="Equation" src="/files/ftp_upload/57904/57904eq1.jpg"> Remarque : L’intensité de fluorescence en ROI 3 est soustraite d’intensités de fluorescence en 2 de ROI et ROI 1 pour tenir compte de la fluorescence de fond.</li>
</ol>

<ol><li>Baltzer, S. A., Brown, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+peptides%3A+promising+alternatives+to+conventional+antibiotics%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Molecular+Microbiology+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial peptides: promising alternatives to conventional antibiotics.</a> Journal of Molecular Microbiology Biotechnology. 20 (4), 228-235 (2011).</li>
<li>Hancock, R. E., Sahl, H. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+and+host-defense+peptides+as+new+anti-infective+therapeutic+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial and host-defense peptides as new anti-infective therapeutic strategies.</a> Nature Biotechnology. 24 (12), 1551-1557 (2006).</li>
<li>Jenssen, H., Hamill, P., Hancock, R. E. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16847082">Peptide antimicrobial agents.</a> Clinical Microbiology Reviews. 19 (3), 491-511 (2006).</li>
<li>Toke, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+peptides%3A+new+candidates+in+the+fight+against+bacterial+infections%5BTitle%5D)+AND+%22Biopolymers%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial peptides: new candidates in the fight against bacterial infections.</a> Biopolymers. 80 (6), 717-735 (2005).</li>
<li>Wang, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+peptides+in+2014%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmaceuticals%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial peptides in 2014.</a> Pharmaceuticals. 8 (1), 123-150 (2015).</li>
<li>Epand, R. M., Vogel, H. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Diversity+of+antimicrobial+peptides+and+their+mechanisms+of+action%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Diversity of antimicrobial peptides and their mechanisms of action.</a> Biochim Biophys Acta. 1462, 11-28 (1999).</li>
<li>Drin, G., Rousselle, C., Scherrmann, J. -M., Rees, A. R., Temsamani, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Peptide+Delivery+to+the+Brain+via+Adsorptive-Mediated+Endocytosis%3A+Advances+With+SynB+Vectors%5BTitle%5D)+AND+%22AAPS+PharmSciTech%22%5BJournal%5D)">Peptide Delivery to the Brain via Adsorptive-Mediated Endocytosis: Advances With SynB Vectors.</a> AAPS PharmSciTech. 4 (4), 61-67 (2002).</li>
<li>Splith, K., Neundorf, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+peptides+with+cell-penetrating+peptide+properties+and+vice+versa%5BTitle%5D)+AND+%22European+Biophysics+Journal%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial peptides with cell-penetrating peptide properties and vice versa.</a> European Biophysics Journal. 40 (4), 387-397 (2011).</li>
<li>Bustillo, M. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modular+analysis+of+hipposin%2C+a+histone-derived+antimicrobial+peptide+consisting+of+membrane+translocating+and+membrane+permeabilizing+fragments%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Modular analysis of hipposin, a histone-derived antimicrobial peptide consisting of membrane translocating and membrane permeabilizing fragments.</a> Biochim Biophys Acta. 1838 (9), 2228-2233 (2014).</li>
<li>Koo, Y. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structure-activity+relations+of+parasin+I%2C+a+histone+H2A-derived+antimicrobial+peptide%5BTitle%5D)+AND+%22Peptides%22%5BJournal%5D)">Structure-activity relations of parasin I, a histone H2A-derived antimicrobial peptide.</a> Peptides. 29 (7), 1102-1108 (2008).</li>
<li>Libardo, M. D., Cervantes, J. L., Salazar, J. C., Angeles-Boza, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Improved+bioactivity+of+antimicrobial+peptides+by+addition+of+amino-terminal+copper+and+nickel+%28ATCUN%29+binding+motifs%5BTitle%5D)+AND+%22ChemMedChem%22%5BJournal%5D)">Improved bioactivity of antimicrobial peptides by addition of amino-terminal copper and nickel (ATCUN) binding motifs.</a> ChemMedChem. 9 (8), 1892-1901 (2014).</li>
<li>Park, C. B., Kim, H. S., Kim, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanism+of+Action+of+the+Antimicrobial+Peptide+Buforin+II%3A+Buforin+II+Kills+Microorganisms+by+Penetrating+the+Cell+Membrane+and+Inhibiting+Cellular+Functions%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemical+and+Biophysical+Research+Communications%22%5BJournal%5D)">Mechanism of Action of the Antimicrobial Peptide Buforin II: Buforin II Kills Microorganisms by Penetrating the Cell Membrane and Inhibiting Cellular Functions.</a> Biochemical and Biophysical Research Communications. , 253-257 (1998).</li>
<li>Park, C. B., Yi, K. -S., Matsuzaki, K., Kim, M. S., Kim, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structure-activity+analysis+of+buforin+II%2C+a+histone+H2A-derived+antimicrobial+peptide%3A+The+proline+hinge+is+responsible+for+the+cell-penetrating+ability+of+buforin+II%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Structure-activity analysis of buforin II, a histone H2A-derived antimicrobial peptide: The proline hinge is responsible for the cell-penetrating ability of buforin II.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (15), 8245-8250 (2000).</li>
<li>Pavia, K. E., Spinella, S. A., Elmore, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+histone-derived+antimicrobial+peptides+use+different+antimicrobial+mechanisms%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Novel histone-derived antimicrobial peptides use different antimicrobial mechanisms.</a> Biochim Biophys Acta. 1818 (3), 869-876 (2012).</li>
<li>Wei, L., LaBouyer, M. A., Darling, L. E., Elmore, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+Spheroplasts+as+a+Model+for+Visualizing+Membrane+Translocation+of+Antimicrobial+Peptides%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrobial+Agents+and+Chemotherapy%22%5BJournal%5D)">Bacterial Spheroplasts as a Model for Visualizing Membrane Translocation of Antimicrobial Peptides.</a> Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 60 (10), 6350-6352 (2016).</li>
<li>Chassy, B. M., Giuffrida, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Method+for+the+Lysis+of+Gram-Positive%2C+Asporogenous+Bacteria+with+Lysozyme%5BTitle%5D)+AND+%22Appl.+Environ.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Method for the Lysis of Gram-Positive, Asporogenous Bacteria with Lysozyme.</a> Appl. Environ. Microbiol. 39 (1), 153-158 (1980).</li>
<li>Fitz-James, P. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytological+and+Chemical+Studies+of+the+Browth+of+Protoplasts+of+Bacillus+megaterium%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biophysic.+and+Biochem.+Cytol%22%5BJournal%5D)">Cytological and Chemical Studies of the Browth of Protoplasts of Bacillus megaterium.</a> J. Biophysic. and Biochem. Cytol. 4 (3), 257-266 (1958).</li>
<li>Martinac, B., Buechner, M., Delcour, A. H., Adler, J., Kung, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pressure-sensitive+ion+channel+in+Escherichia+coli%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Pressure-sensitive ion channel in Escherichia coli.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 84, 2297-2301 (1986).</li>
<li>Martinac, B., Rohde, P. R., Cranfield, C. G., Nomura, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patch+clamp+electrophysiology+for+the+study+of+bacterial+ion+channels+in+giant+spheroplasts+of+E.+coli%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Patch clamp electrophysiology for the study of bacterial ion channels in giant spheroplasts of E. coli.</a> Methods Mol Biol. 966, 367-380 (2013).</li>
<li>Nadeau, J. L. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNadeau%2C+JL+%22Introduction+to+Experimental+Biophysics%3A+Biological+Methods+for+Physical+Scientists%22">Introduction to Experimental Biophysics: Biological Methods for Physical Scientists</a>. , CRC Press. (2016).</li>
<li>Sun, Y., Sun, T. L., Huang, H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physical+properties+of+Escherichia+coli+spheroplast+membranes%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Physical properties of Escherichia coli spheroplast membranes.</a> Biophysical Journal. 107 (9), 2082-2090 (2014).</li>
<li>Branco, P., Viana, T., Albergaria, H., Arneborg, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antimicrobial+peptides+%28AMPs%29+produced+by+Saccharomyces+cerevisiae+induce+alterations+in+the+intracellular+pH%2C+membrane+permeability+and+culturability+of+Hanseniaspora+guilliermondii+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Food+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Antimicrobial peptides (AMPs) produced by Saccharomyces cerevisiae induce alterations in the intracellular pH, membrane permeability and culturability of Hanseniaspora guilliermondii cells.</a> Int J Food Microbiol. 205, 112-118 (2015).</li>
<li>Kobayashi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Membrane+Translocation+Mechanism+of+the+Antimicrobial+Peptide+Buforin+2%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Membrane Translocation Mechanism of the Antimicrobial Peptide Buforin 2.</a> Biochemistry. 43 (49), 15610-15616 (2004).</li>
<li>Spinella, S. A., Nelson, R. B., Elmore, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+peptide+translocation+into+large+unilamellar+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Measuring peptide translocation into large unilamellar vesicles.</a> J Vis Exp. (59), e3571(2012).</li>
<li>van der Kraan, M. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lactoferrampin%3A+a+novel+antimicrobial+peptide+in+the+N1-domain+of+bovine+lactoferrin%5BTitle%5D)+AND+%22Peptides%22%5BJournal%5D)">Lactoferrampin: a novel antimicrobial peptide in the N1-domain of bovine lactoferrin.</a> Peptides. 25 (2), 177-183 (2004).</li>
<li>Sun, Y., Sun, T. L., Huang, H. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Patch+clamp+electrophysiology+for+the+study+of+bacterial+ion+channels+in+giant+spheroplasts+of+E.+coli%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Patch clamp electrophysiology for the study of bacterial ion channels in giant spheroplasts of E. coli.</a> Biophys J. 111 (1), 132-139 (2016).</li>
<li>Xie, Y., Fleming, E., Chen, J. L., Elmore, D. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+proline+position+on+the+antimicrobial+mechanism+of+buforin+II%5BTitle%5D)+AND+%22Peptides%22%5BJournal%5D)">Effect of proline position on the antimicrobial mechanism of buforin II.</a> Peptides. 32 (4), 677-682 (2011).</li>
<li>Kobayashi, S., Takeshima, K., Park, C. B., Kim, S. C., Matsuzaki, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interactions+of+the+Novel+Antimicrobial+Peptide+Buforin+2+with+Lipid+Bilayers%3A+Proline+as+a+Translocation+Promoting+Factor%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem%22%5BJournal%5D)">Interactions of the Novel Antimicrobial Peptide Buforin 2 with Lipid Bilayers: Proline as a Translocation Promoting Factor.</a> Biochem. 39 (29), 8648-8654 (2000).</li>
<li>Decad, G. M., Nikaido, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Outer+Membrane+of+Gram-Negative+Bacteria+XII.+Molecular-Sieving+Function+of+Cell+Wall%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Outer Membrane of Gram-Negative Bacteria XII. Molecular-Sieving Function of Cell Wall.</a> J. Bacteriol. 128 (1), 325-336 (1976).</li>
<li>Choi, H., Yang, Z., Weisshaar, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-cell%2C+real-time+detection+of+oxidative+stress+induced+in+Escherichia+coli+by+the+antimicrobial+peptide+CM15%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Single-cell, real-time detection of oxidative stress induced in Escherichia coli by the antimicrobial peptide CM15.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 112 (3), E303-E310 (2015).</li>
<li>Yang, Z., Choi, H., Weisshaar, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melittin-Induced+Permeabilization%2C+Re-sealing%2C+and+Re-permeabilization+of+E.+coli+Membranes%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Melittin-Induced Permeabilization, Re-sealing, and Re-permeabilization of E. coli Membranes.</a> Biophys J. 114 (2), 368-379 (2018).</li>
<li>Ruthe, H. J., Adler, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fusion+of+bacterial+spheroplasts+by+electric+fields%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim.+Biophys.+Acta%22%5BJournal%5D)">Fusion of bacterial spheroplasts by electric fields.</a> Biochim. Biophys. Acta. 819 (1), (1985).</li>
</ol>

Aucun conflit d’intérêts ne sont déclarés.

Les protocoles présentés ici rendent possible pour les chercheurs d’obtenir plus rapidement grandes tailles d’échantillon d’images bactériennes parce que les bactéries sphériques, élargies sont beaucoup plus faciles à repérer, orienter et l’image. Cette capacité accrue pour recueillir des données est utile à plusieurs égards. Tout d’abord, elle permet une analyse quantitative plus systématique des schémas de localisation de peptide. Alors que les tendances qualitatives peuvent démontrer de plus petits ensembles d’images,...

Peptides antimicrobiens (ampères) ont attiré l’attention en raison de leur utilisation potentielle comme alternatives aux antibiotiques conventionnels1,2,3,4,5. Ampères tuent les bactéries soit translocation à travers la membrane cellulaire et en interaction avec des composants intracellulaires tels que les acides nucléiques ou de perméabiliser la membrane provoquer des fuites de cellule contenu6. Outre leur utilisation comme les antibiotiques, les ampères de translocation peut-être être adaptée pour les demandes de livraison de drogue parce qu’ils peuvent traverser sans interruption de la membrane cellulaire imperméable7,8. Nous, donc, chercher à comprendre les mécanismes fondamentaux d’AMP d’action pour jeter les bases pour leur utilisation dans la conception de médicaments.
Microscopie confocale offre un moyen d’évaluer les modèles de localisation des amplis fluorescent étiquetés dans des cellules bactériennes pour mieux comprendre leur mécanisme d’action9,10,11,12, 13 , 14. par marquage de la membrane des bactéries, on peut déterminer si un peptide fluorescent étiqueté se localise à la membrane ou l’espace intracellulaire d’une cellule bactérienne. Cependant, cette technique est limitée par la petite taille et la tige forme des bactéries, ce qui peut rendre difficile en raison des limites de résolution des microscopes lumière conventionnelles et l’orientation variable des bactéries sur la diapositive15d’imagerie.
L’objectif de la méthode présentée est de permettre d’améliorer la visualisation des modèles de localisation peptide fluorescent étiquetés à l’aide de la microscopie confocale. Visualisation est renforcée en tournant la petite, mince, en forme de bâtonnet Gram-négatif Escherichia coli (e. coli) et Gram-positives Bacillus megaterium (b. megaterium) bactéries dans des formes sphériques, élargies dénommé sphéroplastes (pour les souches Gram-négatifs) et protoplastes (pour les souches Gram positifs)16,17,18,19,20,21. Sphéroplastes et protoplastes sont plus faciles à l’image à cause de leur augmentation de la taille et leur forme symétrique, ce qui rend l’orientation d’une bactérie sur une lame non pertinents pour son imagerie. En outre, nous présentons une approche systématique pour analyser quantitativement les données de microscopie confocale afin de caractériser les amplis comme une membrane localisation ou de translocation. Application de ces méthodes rend plus facile à distinguer fluorescent étiqueté modèles de localisation de peptide. Les protocoles présentés ici peuvent servir à évaluer la localisation d’une variété de membrane active agents autres que les amplis, y compris les peptides de pénétration cellulaire.
Un avantage de cette technique est qu’il permet de mieux comprendre le mécanisme d’action des amplis sur le plan de cellule unique, qui peut révéler la hétérogénéité de cellule-à15, par opposition à d’autres essais de fluorescence communément utilisé pour identifier les mécanismes d’action des amplis, qui fournissent seulement en vrac estimations9,22,23,24,25. L’utilisation de sphéroplastes et de protoplastes afin d’évaluer l’entrée de cellule de AMP est notamment utile26 parce qu’ils sont plus physiologiquement pertinents15 que les autres modèles utilisés pour évaluer l’entrée de cellule, tels que les lipides vésicules24.

<table><tbody><tr><td>Hydrocloride de Trizma (Tris HCl)</td><td>Sigma</td><td>T3253</td><td></td></tr><tr><td>Base Trizma (Tris OH)</td><td>Sigma</td><td>T1503</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de magnésium</td><td>Sigma</td><td>M8266</td><td></td></tr><tr><td>Saccharose</td><td>Sigma</td><td>S7903</td><td></td></tr><tr><td>Lysozyme</td><td>Sigma</td><td>L6876</td><td></td></tr><tr><td>Déoxyribonucléase I</td><td>Sigma</td><td>D4527</td><td></td></tr><tr><td>Acide éthylènediaminetétraacétique</td><td>Sigma</td><td>106361</td><td>Sigma utilisé 106361 dans le développement du protocole original ; 106361 abandonné avec ED2SS en remplacement</td></tr> de <tr><td>l’hydrate de céphalexine</td><td>Sigma</td><td>C4895</td><td></td></tr><tr><td>Ampicilline</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP1760</td><td></td></tr><tr><td>BBL Trypticase bouillon de soja</td><td>Fisher Scientific</td><td>B11768</td><td></td></tr><tr><td>BF2 P11A FITC</td><td>NeoScientific</td><td>Commandé</td><td></td>sur mesure</tr><tr><td>di-8-ANEPPS</td><td>Biotium</td><td>61012</td><td></td></tr><tr><td>DMSO</td><td>Sigma</td><td>34869</td><td>Utilisé Sigma D8779 dans le développement du protocole d’origine ; D8779 abandonné avec 34869 en remplacement de</td></tr><tr><td>l’acide maléique</td><td>Sigma</td><td>M0375</td><td></td></tr><tr><td>Acrodisc 25 mm Filtre seringue avec 0,2 &mu ; m HT Tuffryn Membrane</td><td>Pall Corporation</td><td>4192</td><td></td></tr><tr><td>Microscope confocal à balayage laser</td><td>Leica Microsystems</td><td>TCS SP5 II</td><td>Pour l’acquisition d’images</td></tr><tr><td>Leica Application Suite, Advanced Fluorescence</td><td>Leica Microsystems</td><td></td><td>Pour le traitement d’images</td></tr></tbody></table>

production et la visualisation des sphéroplastes bactériennes et de protoplastes de caractériser peptide antimicrobien localisation

Production and Visualization of Bacterial Spheroplasts and Protoplasts to Characterize Antimicrobial Peptide Localization

L’utilisation de la microscopie confocale comme une méthode pour évaluer les modèles de localisation de peptide au sein de bactéries est généralement inhibée par les limites de résolution des microscopes légers classiques. Comme la résolution d’un microscope donnée ne peut être facilement améliorée, nous présentons des protocoles afin de transformer le petit bâtonnet Gram-négatif Escherichia coli (e. coli) et Gram-positives Bacillus megaterium (b. megaterium) en plus, facilement imagés des formes sphériques appellent sphéroplastes ou protoplastes. Cette transformation permet aux observateurs de rapidement et clairement déterminer si les peptides se loger dans la membrane bactérienne (c.-à-d., localisation de membrane) ou traversent la membrane pour entrer dans la cellule (c.-à-d., translocation). Avec cette approche, nous présentons aussi une méthode systématique pour caractériser les peptides comme membrane de localisation ou de translocation. Bien que cette méthode peut être utilisée pour une variété de peptides actifs membrane et souches bactériennes, nous démontrent l’utilité de ce protocole en observant l’interaction de Buforin II P11A (BF2 P11A), un peptide antimicrobien (AMP), à e. coli sphéroplastes et b. megaterium protoplastes.

En agrandissant les bactéries et en les rendant sphérique, nous pouvons facilement distinguer peptides localiser à la membrane bactérienne ou déplacer facilement à travers la membrane bactérienne. Les limites de résolution des microscopes lumière conventionnelles rendent difficile de distinguer si les peptides signaux proviennent de la membrane ou l’espace intracellulaire chez les bactéries normales parce que les signaux localisées dans la membrane seront semblent se chevaucher avec la es...

Nous présentons ici un protocole pour produire des Gram négatif Escherichia coli (e.coli) sphéroplastes et Gram positif Bacillus megaterium (b. megaterium) protoplastes pour visualiser clairement et rapidement caractériser interactions peptide-bactéries. Cela fournit une méthode systématique pour définir la membrane localisation et translocation des peptides.

Production et la visualisation des sphéroplastes bactériennes et de protoplastes de caractériser Peptide antimicrobien localisation

The use of confocal microscopy as a method to assess peptide localization patterns within bacteria is commonly inhibited by the resolution limits of ...

Cette méthode peut aider à répondre à des questions clés dans le domaine des peptides antimicrobiens : est-ce que les peptides se localisent ou se translocalisent à travers la membrane cellulaire. L’utilisation de sphéroplastes et de protoplastes permet de visualiser et d’analyser la localisation des peptides dans un système modèle physiologiquement pertinent sans les problèmes de résolution rencontrés avec l’imagerie cellulaire bactérienne. Bien que cette méthode puisse fournir des informations sur les peptides antimicrobiens, elle peut également être appliquée à d’autres agents actifs membranaires tels que les peptides pénétrant dans les cellules.Les sphéroplastes à Gram négatif d’E. coli et les protoplastes à Gram positif à B. megaterium doivent être préparés dans une enceinte de sécurité biologique ou une hotte à flux laminaire en utilisant une technique stérile appropriée. Si vous le souhaitez, les souches bactériennes peuvent contenir un plasmide résistant aux antibiotiques, et les sphéroplastes et protoplastes peuvent être préparés sur une paillasse de laboratoire ouverte. Dans cette vidéo, des sphéroplastes et des protoplastes sont préparés sur une paillasse de laboratoire ouvert à l’aide de souches bactériennes résistantes aux antibiotiques.Pour mettre en place une culture de nuit, utilisez une pointe de micropipette stérile pour transférer une seule colonie bactérienne d’une plaque de culture de gélose solide dans un tube de culture de 14 millilitres, contenant deux à trois millilitres de bouillon de soja à trois pour cent de trypticase, TSB, pour une incubation de 16 à 21 heures à 37 degrés Celsius avec agitation. Pour préparer des sphéroplastes à E. coli à Gram négatif, diluez la culture de nuit dans un rapport de un à 100, et 25 millilitres de TSB dans une fiole de 250 millilitres, et retournez les bactéries dans l’incubateur en secouant pendant encore 2,5 heures. Lorsque la solution a atteint une densité optique de 0,5 à 0,8 à 600 nanomètres, diluer la culture dans un rapport de un à dix dans du TSB frais dans un nouveau ballon de 250 millilitres pour une deuxième incubation de 2,5 heures avec une concentration effective finale de 60 microgrammes par millilitre de céphalexine.Pour produire des filaments unicellulaires d’environ 50 à 150 micromètres de longueur, tels que visualisés au microscope optique à un grossissement de 1000x. Centrifuger la solution bactérienne pour récolter les filaments et décanter le surnageant. Lavez les filaments avec l’ajout doux d’un millilitre de saccharose 0,8 molaire, en prenant soin de ne pas déranger la pastille.Au bout d’une minute, jetez le surnageant sans déranger la pastille et ajoutez les réactifs indiqués dans leur ordre respectif aux filaments. Après dix minutes à température ambiante, ajoutez progressivement un millilitre de solution A sur une période d’une minute, tout en remuant doucement la solution à la main. Incuber la solution pendant quatre minutes à température ambiante, puis diviser la suspension du filament en deux aliquotes égales entre deux tubes coniques de 15 millilitres contenant sept millilitres de solution à quatre degrés Celsius. Ensuite, granulez les filaments par centrifugation et utilisez une pipette assyriologique pour retirer soigneusement tous les millilitres sauf un à deux millilitres de surnageant sans déranger les granules.À l’aide d’une micropipette p1000, les granulés sont remis en suspension délicatement. Vérifiez une petite aliquote de l’échantillon pour la formation de sphéroplaste par microscopie optique. Le sphéroplaste peut ensuite être stocké à moins 20 degrés Celsius pendant une semaine ou jusqu’à ce qu’il ait subi trois cycles de congélation et de dégel.Pour préparer des protoplastes de B. megaterium à Gram positif, diluez la culture bactérienne de nuit dans un rapport de un à 1000 dans 100 millilitres de trois pour cent de TSB dans un ballon de 250 millilitres pour une incubation de 4,5 heures à 37 degrés Celsius avec agitation. Lorsque la culture liquide atteint une densité optique de 0,9 à 1,0 à 600 nanomètres, répartissez les bactéries entre deux tubes coniques de 50 millilitres pour leur centrifugation, et utilisez une pipette asyriologique pour aspérer les surnageants. Remettre les granulés en suspension dans 2,5 millilitres de milieu protoplast par tube, et tirer la suspension dans un seul tube conique pour la culture dans une fiole de 125 millilitres.Ajouter un millilitre de lysozyme de cinq milligrammes par millilitre à la culture pour une incubation d’une heure à 37 degrés Celsius en agitant. Surveiller la croissance du protoplaste au microscope optique et noter toute irrégularité, comme les bactéries qui apparaissent sous forme de bâtonnets gonflés au lieu de sphères. À la fin de l’incubation, transférez la suspension dans un tube conique de 15 millilitres pour la centrifugation, et remettez la pastille en suspension dans cinq millilitres de milieu protoplaste.Le protoplaste peut ensuite être stocké à moins 20 degrés Celsius jusqu’à une semaine ou jusqu’à ce qu’il ait subi trois cycles de congélation et de dégel. Pour visualiser le sphéroplaste ou le protoplaste, transférez cinq microlitres de la suspension d’intérêt sur une lame de verre revêtue de poly L Lysine, suivie de deux microlitres de fitc étiqueté 100 à 200 peptide antimicrobien micromolaire ou AMP. Après une incubation de trois minutes à l’abri de la lumière, ajoutez un microlitre d’une matrice de membrane appropriée à l’échantillon pour une autre incubation de trois minutes dans l’obscurité.À la fin de l’incubation, couvrez le sphéroplaste ou le protoplaste étiqueté avec une lamelle en verre et scellez la lamelle avec le vernis à ongles. Pour imager les cellules, allumez le microscope confocal et le laser approprié et sélectionnez l’objectif 63x, puis utilisez le logiciel d’imagerie approprié pour obtenir des images composites Z de huit bits 512 par 512 composées de coupes de 0,5 micromètre de l’intégralité de chaque cellule bactérienne d’intérêt. Pour visualiser la localisation de l’AMP marqué par fluorescence, ouvrez les images de l’empilement Z composite dans un programme d’analyse d’imagerie approprié et localisez la tranche la plus centrale du premier sphéroplaste ou protoplaste d’intérêt.Placez une région circulaire d’intérêt de 0,3 micromètre de diamètre sur la membrane, une au centre de la cellule, et une à l’écart de la cellule pour mesurer la fluorescence de fond, en prenant soin d’éviter les pixels saturés. L’intensité moyenne de fluorescence dans chaque région d’intérêt peut ensuite être calculée par le logiciel. Les limites de résolution des microscopes optiques conventionnels rendent difficile de distinguer si les signaux peptidiques marqués par fluorescence proviennent de la membrane ou de l’espace intracellulaire chez les bactéries normales.Au fur et à mesure que les signaux se localisent à la membrane, ils semblent se chevaucher avec l’espace intracellulaire. En revanche, la taille plus grande du sphéroplaste et du protoplaste par rapport aux bactéries normales se traduit par une résolution claire entre le marqueur membranaire et l’espace intracellulaire. Faciliter la distinction de la localisation des peptides.Par exemple, la localisation dans la membrane et la translocation à travers la membrane cellulaire d’un peptide marqué par fluorescence peuvent être visualisées à la fois dans le sphéroplaste d’E. coli et le protoplaste de B. megaterium, par microscopie confocale à fluorescence, comme nous venons de le démontrer. Le placement des régions d’intérêt sur la membrane et l’espace intracellulaire du sphéroplaste ou du protoplaste et en arrière-plan, permet de calculer le rapport entre l’intensité de fluorescence du peptide intracellulaire et l’intensité de fluorescence du peptide sur la membrane de chaque sphéroplaste ou protoplaste interagissant avec l’AMP. Par exemple, cette méthode peut être utilisée pour visualiser les interactions d’un mutant peptidique microbien dérivé d’une histones avec le sphéroplaste d’E. coli et les protoplastes de B. megaterium.Dans cette expérience, l’AMP a démontré un modèle de localisation similaire dans les deux souches de bactéries. Mise en évidence de sa translocation réduite par rapport au peptide de type sauvage. En fin de compte, cette technique permet aux chercheurs d’explorer les modèles de localisation des peptides au niveau d’une seule cellule.Offrir un aperçu du mécanisme d’action d’un peptide d’intérêt. En plus de permettre aux chercheurs de collecter un plus grand nombre d’images pour la caractérisation systématique des mécanismes peptidiques, les images de sphéroplastes et de protoplastes plus grands sont plus gérables pour l’analyse quantitative que celles de cellules bactériennes plus petites.

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Méthodes de purification du cholestérol contraignant toxine streptolysine O de...

Visualisation des réponses toxine bactérienne induite en utilisant direct microscopie de fluorescence cellulaire

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Préparation des sphéroplastes d’E. coli

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Génération de sphéroplastes à partir de bactéries à Gram négatif

Nous proposons une méthode permettant de cribler simultanément une bibliothèque de fragments d’anticorps pour l’affinité de liaison et la solubilité cytoplasmique en utilisant la voie de translocation jumelle-arginine d’Escherichia coli, qui a un mécanisme de contrôle de qualité inhérent pour le repliement des protéines intracellulaires, pour afficher les fragments d’anticorps sur la membrane interne.

Bacterial Affichage intérieur-membrane pour le criblage d&#39;une bibliothèque de fragments d&#39;anticorps

Le protocole présente l' Escherichia coli-basée d’incorporation de la pression sélective des acides aminés non canoniques (ANAC) dans la nisine de peptide antimicrobien lactocoques. Ses propriétés peuvent être modifiées au cours de l’expression recombinants par substitution avec désiré ANAC dans les milieux de culture définis. Les changements qui en résultent dans la bioactivité sont mappés par tests d’inhibition de la croissance et la microscopie de fluorescence.

Peptides antimicrobiens produites par l’Incorporation de la pression sélective d’amino-acides Non canoniques

Approches protéine fluorescentes pour surveiller les effecteurs sécrétées par des bactéries dans les cellules hôtes sont difficiles. Cela est dû à l’incompatibilité entre protéines fluorescentes et le système de sécrétion de type III. Ici, un système GFP superfolder split optimisé est utilisé pour la visualisation des effecteurs sécrétées par des bactéries dans la cellule de plante hôte.

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Les antibiotiques étiquetés fluorescents sont des outils puissants qui peuvent être utilisés pour étudier de multiples aspects de la résistance aux antimicrobiens. Cet article décrit la préparation des antibiotiques fluorescents marqués et leur application à l’étude de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries. Les sondes peuvent être utilisées pour étudier les mécanismes de résistance bactérienne (p. ex., efflux) par spectrophotométrie, cytométrie du débit et microscopie.

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Le présent protocole décrit une méthode détaillée pour la production bactérienne de protéines recombinantes, y compris des protéines typiquement insolubles ou contenant des liaisons disulfures, emballées à l’intérieur de vésicules extracellulaires liées à la membrane. Cela a le potentiel d’être appliqué à des domaines polyvalents de la recherche scientifique, y compris la biotechnologie appliquée et la médecine.

Production et analyse optimisées de vésicules remplies de protéines recombinantes à partir d’E. coli

Ce protocole décrit une méthode pour produire et évaluer l’activité antimicrobienne et la cytotoxicité du peptide cationique Mel4 et du mimétique du peptide RK758. En intégrant la synthèse chimique, l’expression recombinante et les tests fonctionnels standardisés, il offre un flux de travail simplifié pour la production et le test de peptides et de mimiques de petites molécules.

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Production et la visualisation des sphéroplastes bactériennes et de protoplastes de caractériser Peptide antimicrobien localisation (Vidéo) | JoVE Journal

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