Une roman Animal unique motricité Tracking System à l’aide d’un logiciel Simple, facilement accessible

La présente étude vise à automatiser la quantification des déficits moteurs chez le rat. Le modèle d’évaluation initiale évalue la perte moteur résultant d’une implantation intracortical microélectrode dans le cortex moteur. Nous rapportons sur le développement et l’utilisation d’un algorithme de suivi à l’aide de facilement adaptable, simple et facilement disponible, logiciel de codage.

Cette méthode peut aider à améliorer la cohérence des tests comportementaux sur les petits animaux en créant des mesures objectives de la fonction motrice. L’avantage de cette technique est que, contrairement aux méthodes conventionnelles, les résultats sont quantifiés par un système informatique qui réduit l’erreur humaine, l’effort et le temps. Marina Yu et Sydney Lindner, chercheuses de premier cycle du laboratoire Capadona, feront la démonstration de cette procédure.

Commencez à filmer et placez l’animal au centre de la grille, face au chercheur pour commencer le test de la grille. Laissez l’animal courir librement pendant trois minutes pendant qu’il est filmé d’en haut. Arrêtez de filmer lorsque la période de trois minutes est écoulée et retournez l’animal dans sa cage d’origine.

Nettoyez la grille avec un stérilisant à base de dioxyde de chlore, en prenant soin de bien sécher les surfaces avant de les tester. Ensuite, pour le test de l’échelle, placez l’animal dans une cage temporaire propre. Installez l’appareil à échelle pour qu’il s’étende sur deux cages, où la cage de départ est une cage propre et la cage d’extrémité est la cage vivante de l’animal, une incitation à terminer la course.

Placez l’appareil photo sur un trépied, centré sur la longueur de l’échelle. Étendez jusqu’au trépied de sorte que l’objectif de l’appareil photo soit à la hauteur de l’échelon de l’échelle. Positionnez la caméra de manière à ce que les échelons soient exactement alignés avec l’objectif, car cela est important pour l’algorithme de détection de glissement dans le code BVAS.

Démarrez l’enregistrement vidéo et laissez l’animal commencer la course en tenant ses pattes avant au-dessus du premier échelon de l’échelle. Laissez l’animal se déplacer sur l’échelle sans aide. Permettez à l’animal de se déplacer de la ligne de départ à la ligne d’arrivée à son propre rythme pendant le tournage.

Enfin, terminez l’enregistrement vidéo et retirez l’animal de l’échelle une fois qu’il a terminé sa course. Commencez par nommer chaque vidéo avec la désignation de l’animal pour toutes les vidéos de test de grille. Prenez les vidéos qui portent maintenant le nom de chaque animal et placez les fichiers dans leur propre dossier de stockage.

Ensuite, créez un nouveau fichier tableur vide pour stocker les données de chaque mode d’étude et de test. Ensuite, installez la dernière version de BVAS en double-cliquant sur l’icône du programme d’installation. Une fois l’installation terminée, double-cliquez sur l’icône du programme BVAS pour faire apparaître le menu principal BVAS, qui permet les options suivantes : Analyse de la grille, Analyse de l’échelle, Révision de l’échelle ou Quitter.

Dans le programme BVAS, commencez par sélectionner Analyse de grille dans l’écran du menu supérieur. Ensuite, utilisez le bouton Points de suspension à côté de la zone de saisie supérieure pour parcourir le système de fichiers afin de trouver le fichier de vidéos à analyser. Sélectionnez le bouton Points de suspension en regard de la zone de saisie inférieure pour parcourir le système de fichiers et sélectionner le fichier de feuille de calcul dans lequel stocker les données.

Cliquez sur OK pour démarrer le processus d’analyse. Examinez les images de chaque vidéo sur l’écran Réviseur. Sélectionnez le bouton Modifier s’il n’y a pas de lignes vertes ou si la ligne verte ne semble pas se trouver dans le bon carré autour de la zone de test.

Pour modifier les coins, sélectionnez le bouton Modifier les coins. Suivez les instructions à droite de l’image représentative pour sélectionner la zone de test et appuyez sur Entrée pour terminer le processus de sélection. Enfin, sélectionnez Terminé pour enregistrer la sélection et revenir à l’écran Réviseur.

Sélectionnez ensuite le bouton central Terminé pour démarrer le processus d’analyse complète, une fois que la zone de grille de chaque vidéo est correctement sélectionnée. Laissez le programme s’exécuter et, une fois terminé, une invite de réussite apparaîtra. Ensuite, sélectionnez une analyse par échelle dans le menu supérieur pour ouvrir le menu d’analyse par échelle.

Sélectionnez le bouton Ellipses de saisie supérieur pour sélectionner le dossier contenant les vidéos Ladder nommé d’après chaque animal. Ensuite, sélectionnez le bouton Ellipses inférieur pour sélectionner un répertoire afin d’enregistrer un dossier avec les données des vidéos Ladder à consulter plus tard. Sélectionnez Aller pour commencer le processus d’analyse et répétez les mêmes étapes pour l’analyse de test sur le terrain ouvert.

Laissez le programme s’exécuter et, en cas de compétition, une invite de réussite apparaîtra. Dans le programme BVAS, sélectionnez une révision d’image Ladder dans le menu supérieur pour afficher l’écran de sélection du fichier Ladder Review. Sélectionnez le bouton Ellipses supérieur pour sélectionner le dossier de fichiers de données, puis sélectionnez le bouton Ellipses inférieur pour sélectionner le fichier tableur créé pour l’étude.

Appuyez ensuite sur Aller pour démarrer le processus de révision manuelle. Ensuite, affichez le menu Ladder Data Reviewer qui s’ouvre automatiquement. Si un glissement est détecté, utilisez les boutons Image suivante et Dernière image pour vérifier les images enregistrées consécutivement, le cas échéant.

Utilisez la bascule de glissement pour indiquer quel pied du rat a glissé. Laissez le bouton bascule sur No Slip si la détection est un faux positif. Cliquez sur Enregistrer et continuer pour passer à la détection suivante.

En cas d’échec, utilisez le bouton bascule pour indiquer si l’échec est dû à l’inversion ou à la stagnation. Enfin, cliquez sur Enregistrer et continuer pour passer à la détection suivante. Lors de la dernière détection, cliquez sur Enregistrer et continuer pour terminer l’analyse et enregistrer les données dans le fichier de feuille de calcul choisi précédemment.

Rejeter l’avis d’achèvement. Dans cette étude, les résultats du test de grille en champ ouvert ont montré que les examinateurs experts étaient plus cohérents que les examinateurs novices, mais lors de l’utilisation du BVAS, il y avait une variance nulle pour les utilisateurs experts et novices. De même, les résultats du test de l’échelle ont montré que les examinateurs experts étaient plus cohérents que les examinateurs novices, mais lors de l’utilisation du BVAS, il y avait, encore une fois, une variance nulle pour les utilisateurs experts et novices.

Pour le test de grille en champ ouvert, des tendances ont été observées au cours de l’étude d’une augmentation de la vitesse maximale atteinte, d’une augmentation de la distance totale parcourue et d’une augmentation du nombre de lignes de quadrillage franchies. Le pourcentage de virages à droite oscillait largement entre 40 et 50 %Enfin, pour le test de l’échelle, il y avait une tendance à la baisse du temps de franchissement de l’échelle, suivie d’une augmentation du temps, à partir de la quatrième semaine environ. Le logiciel détecte et compile automatiquement le nombre de glissades de patte lors d’un franchissement d’échelle.

Et dans le processus de révision vidéo, l’utilisateur peut trier les glissades détectées en glissades de patte gauche et droite, comme indiqué dans le graphique à barres. Une fois maîtrisée, cette technique peut être réalisée en 30 à 40 minutes par animal et par séance de test. Lors de cette procédure, il est important de filmer dans un environnement bien éclairé, sur le bon plan et avec un contraste élevé entre l’animal et l’arrière-plan.

À la suite de cette procédure, des tâches de comportement supplémentaires peuvent être effectuées afin de répondre à des questions spécifiques dans les modèles de maladie ou de blessure. Bien que nous utilisions cette méthode pour fournir un aperçu du déficit moteur causé par l’implantation du dispositif dans le cerveau, cette technique d’analyse pourrait être utilisée dans de nombreux autres modèles de maladies ou de blessures. Après avoir regardé cette vidéo, vous devriez avoir une bonne compréhension de la façon de filmer et d’analyser des vidéos comportementales à l’aide du logiciel BVAS du Capadona Lab, qui fournit une technique de quantification du comportement reproductible.