Isolement et analyse des communautés microbiennes dans le sol, rhizosphère et racines dans des expériences de graminée vivace

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24 juillet 2018

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Excavation des racines des plantes sur le terrain, ainsi que traitement d’échantillons dans la rhizosphère, endosphère et le sol sont décrites en détail, y compris les méthodes d’analyse de données et extraction de l’ADN. Cet article est conçu pour permettre aux autres laboratoires d’utiliser ces techniques pour l’étude du sol, endosphère et rhizosphère microbiomes.

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Analyse des communautés microbiennes

Chapters in this video

0:04

Titre

0:36

Excavation des plantes, retrait du sol et collecte du sol nu

1:46

Collecte des racines et de la rhizosphère

2:44

Stérilisation de surface des racines

3:54

Traitement des échantillons de rhizosphère

5:02

Extraction d'ADN et traitement de l'analyse du sol

6:33

Extraction d'ADN au format 96 puits

7:45

Chargement des échantillons de rhizosphère

8:47

Résultats : la visualisation et les méthodes statistiques mettent en évidence des différences dans la composition et la diversité des communautés microbiennes entre les types d'échantillons et les espèces de graminées

10:03

Conclusion

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