High-throughput Identification des séquences régulatrices du gène à l’aide de prochaine génération séquençage du Chromosome circulaire Conformation Capture (4C-seq)

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5 octobre 2018

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L’identification des interactions physiques entre les gènes et les éléments de régulation est difficile, mais a été facilitée par les méthodes de capture de conformation du chromosome. Cette modification du protocole 4C-seq atténue la partialité de la PCR en réduisant au minimum l’amplification excessive des modèles PCR et maximise la mappability se lit en y incorporant une étape digest d’enzyme de restriction addition.

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Protocole 4C-seq

Chapters in this video

0:04

Titre

0:45

Réticulation au formaldéhyde et lyse cellulaire

1:59

Première digestion par enzyme de restriction et première ligation

5:07

Inversion de la réticulation, isolation de la chromatine et analyses complémentaires

7:42

Résultats : Piste génomique représentative de la couverture des lectures 4C-seq

8:29

Conclusion

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