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Cancer Research
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JoVE Journal Cancer Research
A Chromatin Immunoprecipitation Assay to Identify Novel NFAT2 Target Genes in Chronic Lymphocytic Leukemia

Une analyse d’immunoprécipitation de la chromatine pour identifier les gènes cibles de nouveaux NFAT2 dans la leucémie lymphoïde chronique

Full Text
8,034 Views
09:52 min
December 4, 2018

DOI: 10.3791/58270-v

Alexander R. Fuchs1, Melanie Märklin1, Jonas S. Heitmann1, Stefan Futterknecht1, Michael Haap2, Stefan Wirths1, Hans-Georg Kopp1, Clemens Hinterleitner1, Daniela Dörfel1, Martin R. Müller1

1Dept. of Hematology, Oncology and Immunology,University of Tübingen, 2Dept. of Endocrinology, Diabetology, Clinical Pathology and Metabolism,University of Tübingen

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Leucémie lymphoïde chronique (LLC) est la leucémie la plus courante dans le monde occidental. Facteurs de transcription NFAT sont des régulateurs importants de développement et l’activation de nombreux types de cellules. Nous présentons ici un protocole pour l’utilisation de l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) dans les cellules humaines de CLL pour identifier les gènes de la nouvelle cible de NFAT2.

Cette méthode peut aider à fournir des informations clés dans le domaine de l’oncologie telles que l’identification des gènes cibles putatifs et des mécanismes pathogènes pour développer des interventions thérapeutiques potentielles. Le principal avantage de cette technique est que l’on peut détecter l’interaction de NFAT2 et d’autres facteurs de transcription avec des gènes cibles connus et nouveaux. En général, les personnes nouvelles à cette méthode auront du mal parce que les conditions optimales de fixation et de cisaillement sont difficiles à établir.

Pour commencer à remplir un tube de 1,5 millilitre avec un millilitre de formaldéhyde de 37%. Remplissez ensuite un autre tube de 1,5 millilitre d’un millilitre de 1,25 glycine molaire dans un tube de cinq millilitres avec quatre millilitres de PBS. Ensuite, après la stimulation des cellules tourner les cellules selon le protocole de texte, et re-suspendre les cellules dans 500 microlitres de PBS et placer le tube dans une boîte remplie de glace.

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