Name: En utilisant les outils de compilation FishSim Animation pour enquêter sur le comportement du poisson : une étude de cas sur la copie de-choix d’un partenaire en Sailfin Mollies (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-11-08T13:00:00.000+00:00
Duration: 10 min 50 s
Description: Découvrez la méthode FishSim pour étudier le comportement de copie de choix de partenaire chez les mollies voilés. Cette technique permet de contrôler précisément les stimuli visuels animés pour les expériences comportementales non invasives.

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Ce travail a été soutenu par la Deutsche Forschungsgemeinschaft DFG (WI 1531/12-1 KW et SG) et KU 689/11-1 à KDK, KM et JMH. Nous remercions sincèrement le programme DAAD RISE Allemagne pour offre et organisation d’un stage de stage de recherche entre SG et DB (financement-ID : 57346313). Nous sommes reconnaissants à Mitacs pour financement DB avec une bourse de stage de recherche de lieu-Globalink (FR21213). Nous vous prions remercier Aaron Berard pour nous invitant à présenter FishSim le lectorat de JoVE et Alisha DSouza ainsi que trois évaluateurs anonymes pour leurs précieux commentaires sur une version antérieure du manuscrit.

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

L’endroit gravide chez les femelles de sailfin molly a été décrit précédemment pour servir comme moyen de publicité de fertilité vers mâles conspécifiques59,60. Si une tache gravide peut-être aussi fournir des informations aux femelles conspécifiques dans le cadre du choix d’un partenaire n'avait pas été testé jusqu'à présent. Dans la présente étude de cas, nous avons examiné le rôle potentiel d’un spot gravide comme source d’information du public pour l’observat...

Récemment, utilisant des techniques modernes pour la création de stimuli artificiels, tels que des animations informatiques et réalité virtuelle, a trouvé sa popularité en recherche1. Ces méthodes offrent plusieurs avantages par rapport aux approches expérimentales classiques avec stimulation vivants animaux1,2. Animation par ordinateur permet une manipulation non invasif de l’aspect (taille, couleur) et le comportement des animaux virtuels stimulus d’expérimentation. Par exemple, l’ablation chirurgicale de l’épée en xiphophore vert mâle (Xiphophorus helleri) pour tester les préférences de compagnon dans les femelles3 rendait inutile à l’aide d’animation par ordinateur dans une étude ultérieure sur cette espèce4. En outre, animations informatiques peuvent créer des phénotypes qui sont rarement rencontrés dans la nature,5. Caractéristiques morphologiques des animaux virtuels peuvent même être modifiés au-delà de l’aire de répartition naturelle de cette espèce4. En particulier, la possible manipulation systématique du comportement est un avantage majeur de l’animation par ordinateur, puisqu’il est presque impossible avec animaux vivants6,7.
Diverses techniques existent à ce jour pour créer des animations informatiques. En général, des animations (2D) deux dimensions simples dérivent d’une photo d’un stimulus se déplaçant dans les deux seules dimensions et peuvent être créées avec un logiciel commun comme MS PowerPoint8 ou Adobe After Effects9. Les animations (3D) en trois dimensions, qui nécessitent plus sophistiqués graphiques 3D logiciel de modélisation, activez le stimulus être déplacé en trois dimensions, augmentant les possibilités de mouvement physique réaliste et complexe6,7 , 10 , 11 , 12. même de réalité virtuelle qui simulent un environnement 3D où naviguer dans les animaux vivants ont été utilisé13,14. Dans un récent examen Thuly-Chouinard et al. 2 discuter ces techniques une par une et mettre en évidence les avantages et les inconvénients sur leur mise en œuvre dans la recherche, qui dépend notamment de la portée de l’étude et les capacités visuelles de l’animal (voir « Discussion »). En outre, Powell et Rosenthal15 donner des conseils sur la conception expérimentale appropriée et quelles questions peuvent être adressées en utilisant des stimuli artificiels dans la recherche sur le comportement animal.
Étant donné que la création d’animation par ordinateur peut être longue et difficile, le besoin de logiciels faciliter et uniformiser le processus de conception de l’animation est née. Dans cette étude, nous introduisons la libre et open-source Toolchain Animation FishSim 16 (abrégé : FishSim ; https://bitbucket.org/EZLS/fish_animation_toolchain/), une approche multidisciplinaire combinant biologie et en sciences informatiques pour répondre à ces besoins. Semblable au plus tôt publié outil anyFish17,18, le développement de la chaîne d’outils de suivi le but de fournir aux chercheurs une méthode facile à utiliser pour la mise en œuvre des stimuli 3D animés dans des expériences avec des poissons. Notre logiciel est constitué d’un ensemble d’outils qui peut être utilisé pour : (1) créer des poissons virtuels 3D (FishCreator), (2) animer les chemins de nage des poissons virtuels avec un contrôleur de jeu vidéo (FishSteering) et (3) organisent et présentent préenregistrés animations sur les moniteurs de vivre poissons focal (FishPlayer). Notre chaîne d’outils fournit diverses fonctionnalités qui sont particulièrement utiles pour tester dans une situation de choix binaire mais également applicables à d’autres modèles expérimentaux. De plus, l’animation possible de deux ou plusieurs poissons virtuels permet la simulation de bancs ou de parade nuptiale. Les animations ne sont pas liées à un stimulus spécifique mais peuvent être rejouées avec autres stimuli permettant de modifier l’apparence d’un stimulus, mais garder son comportement constant. La nature open source de la chaîne de compilation, ainsi que le fait qu’il repose sur le système d’exploitation de robot ROS (www.ros.org), fournir la grande modularité du système et offrent des possibilités presque infinies pour inclure des dispositifs de rétroaction externe (comme le contrôleur ou un système de suivi) et d’adapter les outils de compilation pour ses propres besoins dans la recherche. Outre le molly sailfin, quatre autres espèces sont actuellement utilisables : l’Atlantique molly Poecilia mexicana, le guppy Poecilia reticulata, l’épinoche à trois épines Gasterosteus aculeatus et un cichlidé Haplochromis spp. Nouvelles espèces peuvent être créés dans un graphisme 3D modélisation outil (p. ex., Blender, www.blender.org). Pour illustrer le flux de travail avec FishSim et de fournir un protocole sur la façon de mener une expérience de copie-choix d’un partenaire avec l’animation par ordinateur, nous avons réalisé une étude de cas avec sailfin mollies.
Choix d’un partenaire est l’une des décisions plus importantes animaux font dans leur histoire de vie. Animaux ont développé des stratégies différentes pour trouver les meilleurs partenaires de l’accouplement. Ils peuvent se prévaloir des informations personnelles lors de l’évaluation de potentiel accouplement partenaires indépendamment, éventuellement selon les préférences de génétiques prédéterminés pour un certain caractère phénotypique19,20. Mais elles peuvent aussi observer le choix d’un partenaire de leurs congénères et ainsi utiliser l’information21. Si l’observateur décide alors de choisir le même maté (ou le même phénotype) comme le conspécifiques observés — le « modèle » — choisi précédemment, il s’agit alors la copie choix d’un partenaire (ci-après abrégé en MCC)22,23. Choix d’un partenaire copie est une forme d’apprentissage social et, partant, une stratégie de choix d’un partenaire dépendant24, qui a été observé dans les deux vertébrés25,26,27,28, 29 et invertébrés30,31,32. Jusqu'à présent, CMC a été étudié principalement dans le poisson et se trouve sous le laboratoire conditions33,34,35,36,37,38 et en le sauvage39,40,41,42. Choix d’un partenaire la copie est particulièrement utile pour un particulier, si deux ou plusieurs partenaires potentiels d’accouplements sont apparemment semblables en qualité et un choix d’un « bon » partenaire — en termes de maximisation de remise en forme, est difficile de faire43. La qualité d’un modèle féminin elle-même peut affecter si les femelles focales copier son choix ou pas44,45,46,47. Respectivement, modèle « bonne » ou « mauvaise » qualité féminine a été attribuée à son étant plus ou moins connu dans le choix d’un partenaire, par exemple en ce qui concerne la taille et l’âge44,45,46, ou par son être un congénère ou un hétérospécifiques47. Dans sailfin mollies que copier le choix d’un partenaire de leurs congénères39,48,49,50,51, on a constaté que les femelles focales même copier le rejet d’un mâle52 . Étant donné que le MCC est censé jouer un rôle important dans l’évolution des caractères phénotypiques ainsi que la spéciation et hybridation21,23,53,54, les conséquences de la copie une » » faux dilemme peut être considérable dans la réduction de l’aptitude du copieur55. Si un individu décide de copier le choix d’un autre individu, qu'il est important d’évaluer si le modèle observé est une source fiable d’information, c'est-à-dire que le modèle lui-même fait un « bon » choix à cause de lui ou elle est bien connu dans Second choix. Ici se pose la question : Quelles sont les caractéristiques visuelles susceptibles de caractériser un modèle fiable pour copier à partir chez les femelles de sailfin molly ?
Une particularité visuelle sailfin femelle mollies et autres Poeciliidae est l’endroit gravide (également connu sous le nom de « anal spot », « plaque incubatrice » ou « grossesse spot »). Cette zone fortement pigmentée dans leur région anale dérive de mélanisation du tissu tapissant le sac ovarien56. La taille et la présence de la tache gravide varient à travers les femelles conspécifiques et peuvent changer plus individuellement au cours de la progression des cycles ovariens56,,57. Taches gravides peuvent servir à attirer les mâles et faciliter l’orientation de l’intromission pour insémination interne58 ou comme moyen de publicité fertilité59,60. Compte tenu du lien entre l’endroit gravide et statut reproductif de la femelle, nous avons prédit que l’endroit gravide sert comme un signe de la qualité des modèles féminins en fournissant des informations sur son état actuel de reproduction pour observer les femelles focales. Nous avons étudié deux hypothèses de rechange. Tout d’abord, si l’endroit gravide est un signe général de maturité, tel que prédit par Farr et Travis59, il dénote un modèle sans doute fiable et expérimenté par rapport à un modèle immature (sans la tache). Ici, les femmes focales sont plus susceptibles de copier le choix d’un modèle avec une tache, mais pas celle d’un modèle sans un endroit. Deuxièmement, si l’endroit gravide marque non-réceptivité à cause déjà des couvées, tel que prédit par Sumner et al. 60, le modèle est sans doute moins fiable puisqu’une femelle non réceptive serait considérée moins exigeants. Dans ce cas, focales femelles ne copiera pas leur choix mais celui de modèles sans tache. Jusqu’ici, le rôle du spot gravide pour MCC chez les femelles de sailfin molly a jamais été testé, ni manipulé expérimentalement.
Nous permettant de réaliser une expérience MCC en présentant des stimulus virtuel mâles et femelles de le mannequin virtuel sur des écrans d’ordinateur au lieu d’utiliser la stimulation direct et le modèle poisson tel qu’utilisé dans la procédure expérimentale classique49,50 FishSim ,51,,61. La facilité d’utilisation générale de notre logiciel a été préalablement validée pour tester des hypothèses sur le choix d’un partenaire en sailfin mollies12. Ici, nous avons vérifié si l’absence ou la présence d’une tache gravide chez les femelles mannequin virtuel influe sur le choix d’un partenaire d’observer les femelles focales direct. Nous laissons tout d’abord les femelles focales s’acclimater à la cuve d’essai (Figure 1.1) et laissez-les choisir entre deux mâles différents stimulus virtuel dans un test de second choix (Figure 1.2). Par la suite, au cours de la période d’observation, le préalable mâle virtuel non préférés a été présenté avec une femme mannequin virtuel (Figure 1.3). Dans un essai subséquent de choix d’un partenaire deuxième, focales femelles a choisi à nouveau entre les mâles mêmes (Figure 1.4). Nous avons analysé si focales femelles avaient copié le choix d’un partenaire de la femelle modèle observée en comparant sa décision choix d’un partenaire dans le critère de choix d’un partenaire premier et deuxième. Nous avons effectué deux différents traitements expérimentaux dans lequel nous avons manipulé visuellement la qualité de la femelle du mannequin virtuel. Au cours de la période d’observation, nous avons présenté soit le préalable non préférés virtuel mâle (1) avec une femme mannequin virtuel avec une tache gravide (traitement « spot ») ; ou (2) avec une femme mannequin virtuel sans un endroit gravide (traitement « sans tache »). En outre, dans un contrôle sans n’importe quelle femelle modèle, nous avons vérifié si les femelles focales choisi systématiquement quand aucune information publique a été fournie.
<img alt="Diagramme d’expérience du choix du partenaire de poisson ; la configuration comprend des écrans LCD, des mâles virtuels, des zones de choix de partenaire." class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/58435/58435fig1.jpg" data-altupdatedat="1754922859000" data-alt="Figure 1"> Figure 1. Aperçu général des mesures expérimentales plus importantes pour une expérience MCC à l’aide de stimuli poissons virtuels. (1) période d’acclimatation. Test de second choix (2) : femelle focale direct choisit entre mâles virtuels stimulation. Période d’observation (3) : focal montres préalable non préférés mâle avec une femelle de modèle virtuel avec spot gravides. (4) -choix d’un partenaire deuxième essai : la femelle focale choisit à nouveau entre mâles de stimulation virtuelle. Dans cet exemple, elle copie le choix du modèle. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/58435/58435fig1large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.</a>

<table><tbody><tr><td>Hardware</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>2x 19 » Belinea</td><td>LCD displays Belinea GmbH, Allemagne</td><td>Modèle 1970 S1-P</td><td>1280 x 1024 pixels résolution</td></tr><tr><td>1x 24 » Écran LCD Fujitsu</td><td>Technology Solutions GmbH, Allemagne</td><td>Modèle B24-8 TS Pro</td><td>1920 x 1080 pixels résolution</td></tr><tr><td>Ordinateur</td><td></td><td></td><td>Intel Core 2 Quad CPU Q9400 @ 2,66 GHz x 4, GeForce GTX 750 Ti/PCIe/SSE2, 7,8 Gio de mémoire, 64 bits, 1 To ; clavier et souris</td></tr><tr><td>SONY Playstation 3 Manette sans fil</td><td>Sony Computer Entertainment Inc., Japon</td><td>N° de modèle. CECHZC2E</td><td>Câble USB pour la connexion à l’ordinateur</td></tr><tr><td>Aquarium</td><td></td><td></td> en verre <td>100 cm x 40 cm x 40 cm (L x H x L)</td></tr><tr><td>Cylindre en plexiglas</td><td>sur</td><td></td> mesure <td>49,5 cm de hauteur, 0,5 cm d’épaisseur, 12 cm de diamètre ; huit petits trous (environ 5 mm de diamètre) percés près de l’extrémité du cylindre réduisent la quantité de perturbation de l’eau tout en libérant le poisson</td></tr><tr><td>Gravier</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>2x OSRAM L58W/965</td><td>OSRAM GmbH, Allemagne</td><td></td><td>Éclairage de l’installation expérimentale</td></tr><tr><td>2x Chronomètres</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Nom</td><td>Entreprise</td><td>Numéro de catalogue</td><td>Comments</strong</td></tr><tr><td>>Software</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>ubuntu 16.04 LTS</td> Système d’exploitation de l’ordinateur<td></td><td></td><td> ; Télécharger à partir de : https://www.ubuntu.com/</td></tr><tr><td>FishSim Animation Toolchain v.0.9</td><td></td><td></td><td>Téléchargement du logiciel et manuel d’utilisation (PDF) à partir de : https://bitbucket.org/EZLS/fish_animation_toolchain</td></tr><tr><td>GIMP Gnu Image Manipulation Program (version 2.8.22)</td><td></td><td></td><td>Télécharger de : https://www.gimp.org/</td></tr></tbody></table>

en utilisant les outils de compilation fishsim animation pour enquêter sur le comportement du poisson : une étude de cas sur la copie de-choix d’un partenaire en sailfin mollies

Using the FishSim Animation Toolchain to Investigate Fish Behavior: A Case Study on Mate-Choice Copying In Sailfin Mollies

Durant la dernière décennie, employant des animations informatiques pour la recherche sur le comportement animal a augmenté en raison de sa capacité à manipuler non invasive l’apparence et le comportement des stimuli visuels, par rapport à la manipulation des animaux vivants. Nous présentons ici la FishSim Animation Toolchain, un cadre logiciel mis au point pour fournir aux chercheurs une méthode facile à utiliser pour l’application des animations 3D par ordinateur dans des expériences comportementales avec poissons. Les outils de compilation propose des modèles pour créer des stimuli 3D virtuels de cinq espèces de poissons différents. Stimuli sont personnalisables en apparence et en taille, basée sur des photographies prises de poissons vivants. Plusieurs stimuli peuvent être animés en enregistrant la natation des chemins dans un environnement virtuel à l’aide d’un contrôleur de jeu vidéo. Pour accroître la normalisation du comportement simulé, le chemin d’accès de natation préenregistrés peut-être être relu avec différents stimuli. Plusieurs animations plus tard peuvent être organisées en playlist et présentées sur les écrans au cours d’expériences avec des poissons vivants.
Dans une étude de cas avec sailfin mollies (Poecilia latipinna), nous fournissons un protocole sur la façon de mener une expérience de copie-choix d’un partenaire avec FishSim. Nous utilisé cette méthode pour créer et animer virtuels mâles et femelles de mannequin virtuel et ensuite présenté ces pour vivre les femmes focales dans une expérience de choix binaire. Nos résultats démontrent que l’animation par ordinateur peut-être être utilisée pour simuler des poissons virtuels dans une expérience de copie-choix d’un partenaire pour enquêter sur le rôle des femelles gravides taches comme une indication de qualité pour une femme modèle à la copie choix d’un partenaire.
En appliquant cette méthode n’est pas limitée aux expériences de copie-choix d’un partenaire, mais peut être utilisé dans différents modèles expérimentaux. Pourtant, sa facilité d’utilisation dépend des capacités visuelles de l’espèce étudiée et a tout d’abord besoin de validation. Dans l’ensemble, animations informatiques offrent un degré élevé de contrôle et de normalisation dans les expériences et garder le potentiel pour « réduire » et « remplacer » animaux vivants relance ainsi quant à « affiner » les procédures expérimentales.

Suite au protocole, nous avons utilisé FishSim pour créer des animations d’ordinateur virtuel sailfin molly mâles et femelles. Plus loin, nous avons utilisé les outils de compilation de présenter des animations à vivre les femmes focales dans une situation de choix binaire pour réaliser une expérience MCC conformément à la procédure expérimentale décrite dans la Figure 1 et l’étape 5 du protocole.
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En utilisant les nouveaux outils de compilation FishSim Animation, nous présentons un protocole pour une manipulation visuelle non invasif de l’information dans le contexte du choix d’un partenaire copie dans sailfin mollies. FishSim Animation Toolchain fournit un cadre facile à utiliser pour la conception, l’animation et la présentation de stimuli poisson animation par ordinateur pour les expériences comportementales poissons vivants.

En utilisant les outils de compilation FishSim Animation pour enquêter sur le comportement du poisson : une étude de cas sur la copie de-choix d’un partenaire en Sailfin Mollies

Over the last decade, employing computer animations for animal behavior research has increased due to its ability to non-invasively manipulate the ...

Cette méthode peut aider à répondre aux questions clés dans l’étude du comportement des poissons en particulier dans le domaine du choix du partenaire et ici pour étudier la stratégie fascinante de la copie mate-choix. Le principal avantage de notre technique est que nous avons le contrôle total de l’apparence et le comportement des stimuli de poissons que nous utilisons pour présenter des poissons vivants au cours d’expériences. La démonstration visuelle de cette méthode est essentielle car les différentes étapes nécessaires pour créer, animer et présenter des stimuli de poissons animés par ordinateur à l’aide de notre chaîne d’outils doivent être précises pour assurer un flux de travail approprié.Commencez cette procédure avec la préparation des textures du corps féminin avec et sans tache gravid comme détaillé dans le protocole de texte. Pour ajuster le point de vue et définir la scène pour l’animation, commencez FishSim en sélectionnant l’icône FishSim dans le lanceur sur le côté gauche du bureau. Configurez la résolution pour les moniteurs de présentation et cliquez sur Lancer.Appuyez sur F1 sur le clavier pour passer du mode de visualisation au mode d’édition. Ajustez le point de vue pour correspondre aux dimensions des moniteurs de présentation en ajustant l’angle de la caméra. Faites pivoter l’appareil photo en tenant le bouton de la souris gauche et en déplaçant le curseur.Pour panoramique de l’appareil photo, maintenez le bouton de la souris droite et déplacez le curseur. Effectuez un zoom avant et arrière en tenant le bouton de la souris du milieu et en déplaçant le curseur. Cliquez sur Paramètres de la caméra dans la barre d’outils d’édition et cliquez sur copie à la came statique pour définir le point de vue.Cliquez sur Fichier, Enregistrer scène, et enregistrer la scène ajustée que la nouvelle scène par défaut. Pour la conception d’un stimulus masculin virtuel pour la présentation lors des tests de choix masculin, cliquez sur Fichier, Charger le modèle de poisson à partir du menu dropdown, et charger le modèle molly sailfin mâle par défaut en le sélectionnant parmi les modèles de dossier. Gauche double clic sur le poisson chargé pour le sélectionner.Il sera mis en évidence dans le maillage. Cliquez sur l’icône de vitesse dans la barre d’outils pour ouvrir l’ensemble d’outils de poisson. Une boîte apparaîtra avec les options d’édition utilisées pour personnaliser le mâle virtuel.Untick montrer maille pour une meilleure vue du poisson. Changez le nom en mâle. Modifiez l’échelle du mâle en changeant les valeurs pour X, Y et Z si nécessaire et cliquez sur Appliquer.Modifiez la texture du mâle en cliquant sur Textures dans la boîte à outils de modification. Cliquez sur une caractéristique du poisson pour le changer. Cliquez sur une texture affichée dans la liste et elle apparaîtra directement et remplacera la texture antérieure sur le poisson.Lorsque le mâle désiré est créé, cliquez sur Appliquer sous config dans la boîte à outils de modification et cliquez enregistrer le poisson sur disque. Enregistrez le nouveau mâle dans le dossier modèles. Pour les animations masculines virtuelles pour présentation lors des tests de choix de compagnon, branchez le contrôleur de jeu dans le port USB de l’ordinateur d’exploitation et ouvrez FishSim.Cliquez sur commencer à placer et utilisez le contrôleur pour placer le poisson à n’importe quelle position de départ dans le réservoir virtuel. Cliquez sur arrêter de placer. Commencez à enregistrer le chemin de natation du poisson en cliquant sur commencer l’enregistrement.Utilisez le contrôleur pour déplacer le poisson autour de la scène. Après avoir arrêté l’enregistrement et sauvé le chemin de natation, modifiez l’enregistrement pour ajouter le mouvement de la nageoire dorsale du mâle pour imiter le comportement de cour masculine pendant les tests de mate-choice. Pour ce faire, sélectionnez la nageoire dorsale dans le menu dropdown dans la fonction modifier.Sélectionnez l’édition de démarrage et le chemin de natation complet sera rejoué. Appuyez sur le bouton L1 sur le contrôleur pour soulever la nageoire dorsale à des moments précis. Cliquez sur Enregistrer pour enregistrer la version modifiée du chemin de natation comme un nouveau fichier de sac.Répétez ces étapes sauf pour sélectionner le gonopodium pour ajouter son mouvement. Pour l’animation féminine virtuelle masculine et modèle pour la présentation pendant la période d’observation, ouvrez FishSim. Appuyez sur F1 pour entrer dans le mode d’édition et cliquez sur Fichier, Scène de charge pour charger une scène avec mâle et femelle.Après avoir commencé la direction des poissons, sélectionnez mâle et femelle alternativement pour les placer en cliquant sur démarrer / arrêter de placer dans le réservoir virtuel. Pour l’enregistrement, sélectionnez d’abord les poissons femelles dans le menu de dropdown du panneau de direction et créez un chemin de baignade d’une durée de 10 minutes comme avant. Cliquez sur arrêter l’enregistrement et enregistrer le chemin de natation sur le lecteur.Modifiez ensuite successivement le chemin de natation du mâle, le mouvement des nageoires dorsales et le mouvement du gonopodium comme avant. Enregistrez la version finale pour une utilisation ultérieure dans FishPlayer. Préparez l’expérience MCC décrite dans le protocole texte.Ouvrez FishPlayer sur l’ordinateur d’exploitation et organisez les listes de lecture pour le test de premier choix. Placez une femelle focale vivante à l’intérieur du réservoir d’essai. Laissez-la nager librement, en s’acclimatant au réservoir et à la présentation des réservoirs vides sur les deux moniteurs pendant une période de 20 minutes.Après l’acclimatation, placez la femelle focale dans un cylindre acrylique clair au milieu du réservoir d’essai pour assurer une distance égale aux deux moniteurs. Exécutez les listes de lecture sur les deux moniteurs simultanément en cliquant sur Lecture, en commençant par le test de premier choix. Avant que la minuterie n’atteigne deux minutes et 30 secondes, allez lentement au réservoir expérimental et libérez la femelle focale du cylindre en la soulevant doucement directement hors de l’eau.Retournez à l’ordinateur d’exploitation. Observez la femelle focale et avez deux chronomètres à portée de main pour mesurer le temps d’association avec chaque mâle stimulus virtuel. Arrêtez de mesurer le temps d’association lorsque la minuterie atteint sept minutes et 30 secondes.L’entrée de pause s’exécute alors pendant une minute et 30 secondes. Utilisez la pause comme temps de manipulation pour placer à nouveau la femelle focale à l’intérieur du cylindre et notez le temps pour chaque mâle virtuel sur une fiche de données. Avant que la minuterie n’atteigne 11 minutes et 30 secondes, relâchez la femelle focale du cylindre.Mesurez le temps d’association pendant les cinq prochaines minutes. Arrêtez de mesurer le temps d’association lorsque la minuterie atteint 16 minutes et 30 secondes. L’entrée de pause s’exécute pendant une minute.Utilisez ce temps de manipulation pour placer la femelle focale à l’intérieur du cylindre. Notez les temps d’association pour la deuxième mesure. Pour chaque mâle, résumez les temps d’association des deux moitiés du test de premier choix.Calculez si la femelle focale avait un biais latéral et quel partenaire a été préféré par la femelle focale tel que décrit dans le protocole de texte. Réarrangez les listes de lecture de sorte que le mâle préféré prieur soit animé seul pendant la période d’observation et que le mâle non privilégié antérieur soit animé avec la femelle modèle virtuelle. Cliquez sur Lecture pour continuer la deuxième partie de l’expérience et les entrées seront rejouées de haut en bas à partir de la période d’observation de 10 minutes.Après la période d’observation, une pause de 30 secondes commence. Pendant chaque pause, un réservoir virtuel vide est visible par les femelles focales. Avant que la minuterie n’atteigne 10 minutes et 30 secondes, libérez la femelle focale du cylindre et commencez le deuxième test de choix avec un enregistrement de cinq minutes pour chaque mâle.Mesurer les temps d’association pendant les cinq prochaines minutes. Arrêtez de mesurer le temps d’association lorsque la minuterie atteint 15 minutes et 30 secondes. L’entrée de pause s’exécute alors pendant une minute et 30 secondes.Placez la femelle focale à l’intérieur du cylindre et notez le temps mesuré pour chaque mâle virtuel. Avant que la minuterie n’atteigne 19 minutes et 30 secondes, libérez la femelle focale du cylindre et mesurez le temps d’association pendant les cinq dernières minutes. Arrêtez de mesurer le temps d’association lorsque la minuterie atteint 24 minutes et 30 secondes et mettez fin à l’expérience.Comme prévu pour la copie de choix de compagnon, les scores de préférence pour le mâle virtuel non-préféré antérieur ont augmenté de manière significative du premier au deuxième test de mate-choix après que les femelles focales aient été présentées avec le choix simulé de compagnon d’une femelle virtuelle de modèle. Cet effet a été trouvé dans les deux traitements, mais pas dans le contrôle où aucune femelle modèle virtuel n’était présente pendant la période d’observation. Le score de copie pour le mâle non privilégié antérieur était significativement plus élevé dans les traitements avec une femelle modèle virtuel par rapport au contrôle.Cependant, il n’y avait aucune différence entre les traitements si la femelle modèle avait une tache gravid ou non. Par rapport au contrôle, beaucoup plus de femelles focales ont inversé leur choix initial de compagnon en faveur du mâle non-préféré antérieur après l’avoir observé avec une femelle virtuelle de modèle. Ce résultat a été à nouveau indépendamment de savoir si elle avait une tache gravid ou non.Tout en essayant cette procédure, il est important de savoir que l’animation du poisson virtuel d’une manière naturelle à l’aide d’un contrôleur de jeu prend la pratique. Par conséquent, cette étape peut effectivement être la plus longue. Bien que notre protocole soit très spécifique pour l’étude de la copie de choix du partenaire, notre chaîne d’outils offre des solutions pour étudier diverses autres questions sur le comportement des poissons et même la cognition, par exemple les décisions riveraines ou la détection prédateur-proie.L’utilisation de l’animation par ordinateur dans la recherche sur le comportement animal est une approche prometteuse pour manipuler l’expression des traits visuels et même des modèles comportementaux d’une manière non invasive. Il fournit un haut degré de contrôle et de normalisation par rapport à l’utilisation d’animaux vivants comme stimuli.

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Capable de récupération fonctionnelle après une lésion de la moelle épinière, le poisson-zèbre adulte est un système modèle de premier plan pour élucider les mécanismes innés de la régénération neuronale. Ici, nous décrivons les tests d’endurance et de comportement de natation comme des lectures fonctionnelles de la régénération de la moelle épinière.

Évaluation de l’endurance à la nage et du comportement de nage chez le poisson-zèbre adulte

Cet article décrit deux méthodes rapides et efficaces pour collecter le sperme du petit poisson modèle medaka (Oryzias latipes), ainsi qu’un protocole pour évaluer de manière fiable la qualité du sperme à l’aide de l’analyse assistée par ordinateur du sperme (CASA).

Collecte de sperme et analyse assistée par ordinateur des spermatozoïdes dans le modèle téléostéen japonais Medaka (Oryzias latipes)

Les tâches de préférence sociale multi-chambres ont été adaptées des rongeurs au poisson-zèbre, facilitant l’étude du comportement social chez les organismes modèles. Ce protocole valide une tâche à faible coût en aquarium ouvert à 3 chambres utilisant des webcams et des logiciels open source pour mesurer la préférence sociale des poissons-zèbres, la rendant accessible à la recherche et à l’enseignement de premier cycle.

Alternative à faible coût pour examiner la préférence sociale chez le poisson-zèbre (Danio rerio) en utilisant la tâche de nage libre en aquarium ouvert à 3 chambres

Découvrez la méthode FishSim pour étudier le comportement de copie de choix de partenaire chez les mollies voilés. Cette technique permet de contrôler précisément les stimuli visuels animés pour les expériences comportementales non invasives.

En utilisant les outils de compilation FishSim Animation pour enquêter sur le comportement du poisson : une étude de cas sur la copie de-choix d’un partenaire en Sailfin Mollies (Vidéo) | JoVE Journal

En utilisant les outils de compilation FishSim Animation pour enquêter sur le comportement du poisson : une étude de cas sur la copie de-choix d’un partenaire en Sailfin Mollies

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