Name: Utilisation de résonance paramagnétique électronique dans des échantillons biologiques à température ambiante et à 77 K (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-01-11T13:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 45 s
Description: Découvrez une méthode pratique de spectroscopie RPE pour détecter les radicaux libres dans des échantillons biologiques à température ambiante et à 77 K. Ces protocoles utilisent des sondes à spin sélectives pour la biologie redox.

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Ce travail a été soutenu par la faculté de l’Université du Colorado de médecine Dean award de l’Infrastructure de recherche stratégique, R01 HL086680-09 et 1R35HL139726-01, à la bourse E.N.G. et UCD CFReT (HE). Les auteurs remercient Dr Sandra Eaton et Dr. Gareth Eaton (Université de Denver), Dr Gerald Rosen et Dr. Joseph P. Kao (Université du Maryland) et Dr Sujatha Venkataraman (Université du Colorado, Denver) pour des discussions utiles et Joanne Maltzahn, Ashley Trumpie et Ivy McDermott (Université du Colorado, Denver) pour le support technique.

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<li>Dikalov, S. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+roles+of+Nox1+and+Nox4+in+basal+and+angiotensin+II-stimulated+superoxide+and+hydrogen+peroxide+production%5BTitle%5D)+AND+%22Free+Radical+Biology+and+Medicine%22%5BJournal%5D)">Distinct roles of Nox1 and Nox4 in basal and angiotensin II-stimulated superoxide and hydrogen peroxide production.</a> Free Radical Biology and Medicine. 45 (9), 1340-1351 (2008).</li>
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<li>Dikalov, S. I., Polienko, Y. F., Kirilyuk, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Electron+Paramagnetic+Resonance+Measurements+of+Reactive+Oxygen+Species+by+Cyclic+Hydroxylamine+Spin+Probes%5BTitle%5D)+AND+%22Antioxidants+%26+Redox+Signaling%22%5BJournal%5D)">Electron Paramagnetic Resonance Measurements of Reactive Oxygen Species by Cyclic Hydroxylamine Spin Probes.</a> Antioxidants & Redox Signaling. , (2017).</li>
<li>Sharma, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((L-Carnitine+preserves+endothelial+function+in+a+lamb+model+of+increased+pulmonary+blood+flow%5BTitle%5D)+AND+%22Pediatric+Research%22%5BJournal%5D)">L-Carnitine preserves endothelial function in a lamb model of increased pulmonary blood flow.</a> Pediatric Research. 74 (1), 39-47 (2013).</li>
<li>Berg, K., Ericsson, M., Lindgren, M., Gustafsson, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+High+Precision+Method+for+Quantitative+Measurements+of+Reactive+Oxygen+Species+in+Frozen+Biopsies%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">A High Precision Method for Quantitative Measurements of Reactive Oxygen Species in Frozen Biopsies.</a> PloS One. 9 (3), (2014).</li>
<li>Kozlov, A. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EPR+analysis+reveals+three+tissues+responding+to+endotoxin+by+increased+formation+of+reactive+oxygen+and+nitrogen+species%5BTitle%5D)+AND+%22Free+Radical+Biology+and+Medicine%22%5BJournal%5D)">EPR analysis reveals three tissues responding to endotoxin by increased formation of reactive oxygen and nitrogen species.</a> Free Radical Biology and Medicine. 34 (12), 1555-1562 (2003).</li>
<li>Van Rheen, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lung+Extracellular+Superoxide+Dismutase+Overexpression+Lessens+Bleomycin-Induced+Pulmonary+Hypertension+and+Vascular+Remodeling%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Respiratory+Cell+and+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Lung Extracellular Superoxide Dismutase Overexpression Lessens Bleomycin-Induced Pulmonary Hypertension and Vascular Remodeling.</a> American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 44 (4), 500-508 (2011).</li>
<li>Mouradian, G. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superoxide+Dismutase+3+R213G+Single-Nucleotide+Polymorphism+Blocks+Murine+Bleomycin-Induced+Fibrosis+and+Promotes+Resolution+of+Inflammation%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Respiratory+Cell+and+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Superoxide Dismutase 3 R213G Single-Nucleotide Polymorphism Blocks Murine Bleomycin-Induced Fibrosis and Promotes Resolution of Inflammation.</a> American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 56 (3), 362-371 (2017).</li>
<li>Dikalov, S. I., Li, W., Mehranpour, P., Wang, S. S., Zafari, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Production+of+extracellular+superoxide+by+human+lymphoblast+cell+lines%3A+comparison+of+electron+spin+resonance+techniques+and+cytochrome+C+reduction+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Pharmacol%22%5BJournal%5D)">Production of extracellular superoxide by human lymphoblast cell lines: comparison of electron spin resonance techniques and cytochrome C reduction assay.</a> Biochem Pharmacol. 73 (7), 972-980 (2007).</li>
<li>Kozuleva, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+superoxide+radical+production+in+thylakoid+membrane+using+cyclic+hydroxylamines%5BTitle%5D)+AND+%22Free+Radical+Biology+and+Medicine%22%5BJournal%5D)">Quantification of superoxide radical production in thylakoid membrane using cyclic hydroxylamines.</a> Free Radical Biology and Medicine. 89, 1014-1023 (2015).</li>
<li>Chen, K., Swartz, H. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oxidation+of+Hydroxylamines+to+Nitroxide+Spin+Labels+in+Living+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22Biochimica+Et+Biophysica+Acta%22%5BJournal%5D)">Oxidation of Hydroxylamines to Nitroxide Spin Labels in Living Cells.</a> Biochimica Et Biophysica Acta. 970 (3), 270-277 (1988).</li>
</ol>

Les auteurs n’ont rien à divulguer.

L’évaluation de la production de radicaux libres dans les milieux biologiques est importante redox compréhension réglementés de signalisation de santé et la maladie, mais la mesure de ces espèces est très difficile en raison de la courte demi-vie des radicaux libres et technique limites avec les méthodes couramment utilisées. RPE est un outil précieux et puissant en biologie de l’oxydo-réduction, comme c’est la méthode seulement sans ambiguïté pour la détection des radicaux libres. Dans ce projet, nous démontrons des mét...

Alors que les mesures du stress oxydatif et les espèces réactives de l’oxygène sont importants pour l’étude de diverses maladies à travers tous les systèmes organiques, la détection des espèces réactives de l’oxygène (ROS) est difficile en raison d’une courte demi-vie et forte réactivité. Une technique de résonance paramagnétique (RPE) des électrons est la méthode la plus claire pour la détection des radicaux libres. Sondes de spin ont des avantages sur des sondes fluorescentes plus couramment utilisés. Bien que des sondes fluorescentes sont relativement peu coûteux et facile à utiliser et offrant une détection rapide et sensible de ROS, ils ont de sérieuses limites à cause des signaux artéfactuelle, une incapacité à calculer les concentrations de ROS et un manque général de spécificité1 .
Pour faciliter l’utilisation de l’EPR pour des études biologiques, une variété de spin sondes ont été synthétisés qui permet de mesurer une gamme d’espèces radicalaires biologiquement pertinente ainsi que pO2, pH et redox indique2,3, 4,5,6,7. Pièges à spin ont également été développés pour capter les radicaux éphémères et forme longue durée de vie des adduits, qui facilite la détection par RPE8. Les deux classes (sondes de spin et pièges à spin) ont des avantages et des limites. Une classe couramment utilisée des sondes de spin sont des hydroxylamines cycliques, qui sont des EPR en silence et réagissent avec des radicaux pour former un nitroxyde stable de courte durée. Hydroxylamines cycliques réagissent avec le superoxyde 100 fois plus vite que les pièges à spin, ce qui leur permet de rivaliser avec les antioxydants cellulaires, mais ils manquent de spécificité et nécessitent l’utilisation de contrôles appropriés et les inhibiteurs d’identifier les espèces radicalaires ou source responsable pour le signal nitroxyde. Tandis que spin intercepte la spécificité de la pièce, avec distinctes spectrale que modèles selon l’espèce pris au piège, ils ont cinétique lente pour superoxyde spin piégeage et sont sujette à la biodégradation du radical adduits. Demandes de piégeage de spin ont été bien étudiées dans la recherche biomédicale9,10,11,12,13.
L’objectif de ce projet est de démontrer les méthodes pratiques d’EPR pour concevoir des expériences et préparation des échantillons pour détecter des superoxyde à l’aide de spin des sondes dans les différents compartiments cellulaires in vitro et dans des tissus différents compartiments in vivo. Plusieurs manuscrits ont publié les protocoles pertinents à atteindre ces objectifs, en utilisant des sondes de spin ciblées perméable à la cellule et cellule-imperméable mitochondriale au tissu de cible différents compartiments cellulaires in vitro et processus pour analyse dans des modèles murins 14 , 15. nous inspirer de ce corpus de textes en validant une approche pour mesurer la superoxyde en utilisant une sonde de spin (CMH) 1-hydroxy-3-methoxycarbonyl-2,2,5,5-tetramethylpyrrolidine dans différents compartiments cellulaires in vitro afin d’assurer la précision mesures, mettant en évidence les éventuels problèmes techniques qui peuvent biaiser les résultats. Nous fournissons également des méthodes permettant d’effectuer des mesures de l’EPR dans le sang, le liquide de lavage broncho-alvéolaire et du tissu pulmonaire à l’aide de la sonde de spin CMH. Ces études comparent différentes méthodes pour traiter les tissus ainsi que pour présenter une méthode pour injecter une autre sonde de spin, CPH, à des souris avant la récolte de tissus. Enfin, nous développons une méthode pratique pour stocker les échantillons dans un tube de polytétrafluoroéthylène (PTFE) pour permettre le stockage et le transfert des échantillons avant mesures EPR à 77 K.

<table><tbody><tr><td>DMEM</td><td>LifeTech</td><td>10566-016</td><td>milieux de culture cellulaire</td></tr><tr><td>Acide diéthylènetriaminepentaacétique (DTPA)</td><td>Sigma Aldrich</td><td>D6518-5G</td><td></td></tr><tr><td>chlorure de sodium (NaCl)&nbsp ;</td><td>Fisher Scientific&nbsp ;</td><td>&nbsp ; BP358-212</td><td>utilisé pour préparer un tampon salin phosphaté de 50 mM selon Sigma aldrish &nbsp ;</td></tr><tr><td>phosphate dibasique de potassium (HK2PO4 )</td><td>Fisher Scientific&nbsp ;</td><td>&nbsp ; BP363-500</td><td>utilisé pour préparer un tampon salin phosphaté de 50 mM selon Sigma aldrish &nbsp ;</td></tr><tr><td>phosphate de potassium monobasique (KH2PO4 )</td><td>Sigma Aldrich</td><td>P-5379</td><td>utilisé pour préparer un tampon salin phosphaté de 50 mM selon Sigma aldrish &nbsp ;</td></tr><tr><td>Tampon de Krebs-Henseleit (KHB)&nbsp ;</td><td>(Alfa Aesar, Hill)</td><td>J67820</td><td></td></tr><tr><td>Superoxyde dismutase érythrocytaire bovine (SOD)</td><td>Sigma Aldrich</td><td>&nbsp ; S7571-30KU</td><td></td></tr><tr><td>Phorbol 12-myristate 13-acétate (PMA)&nbsp ;</td><td>Sigma Aldrich</td><td>P1585-1MG</td><td>Dissoudre dans du DMSO</td></tr><tr><td>Antimycine A (AA)</td><td>Sigma Aldrich</td><td>A8674-25MG</td><td>Dissoudre dans de l’éthanol et stocker dans des flacons en verre (MW utilisé est la masse moléculaire moyenne pour quatre lots)</td></tr><tr><td>1-Hydroxy-3-méthoxycarbonyl-2,2,5,5-tétraméthylpyrrolidine . HCl (CMH)</td><td>Enzo Life Sciences</td><td>ALX-430-117-M050</td><td></td></tr><tr><td>1-Hydroxy-3-carboxy-2,2,5,5-tétraméthylpyrrolidine . HCl (CPH)</td><td>Enzo Life Sciences</td><td>ALX-430-078-M250</td><td></td></tr><tr><td>1-Hydroxy-4-[2-triphenylphosphonio)-acétamido]-2,2,6,6-tétraméthylpipéridine, 1-Hydroxy-2,2,6,6-tétraméthyl-4-[2-(triphénylphosphonio)acétamido]dichlorure de pipéridinium ( mito-TEMPO-H)</td><td>Enzo Life Sciences</td><td>ALX-430-171-M005</td><td></td></tr><tr><td>1-hydroxy-2,2,6,6-tétraméthylpipéridine-4-yl-chlorure de triméthylammonium . HCl (CAT1H)</td><td>Enzo Life Sciences</td><td>ALX-430-131-M250</td><td></td></tr><tr><td>Héparine&nbsp ;</td><td>Sagent Pharmaceuticals</td><td>NDC 25021-400-10</td><td></td></tr><tr><td>Chlorure de diphényliodonium&nbsp ;</td><td>Sigma Aldrich</td><td>43088</td><td></td></tr><tr><td>Déféroxamine sel de mésylate</td><td>Sigma Aldrich</td><td>D9533-1G</td><td></td></tr><tr><td>Critoseal</td><td>Leica</td><td>39215003</td><td></td></tr><tr><td>MARQUE jetable BLAUBRAND&nbsp ; micropipettes, intraMark</td><td>Sigma Aldrich</td><td>708733</td><td>Capillaries</td></tr><tr><td>PTFE TUBE FLUOROPOLYMÈRE FRACTIONNÉ 3/16" Diamètre extérieur x 1/8 po ID</td><td>NORELL</td><td>1598774A</td><td>Tube en téflon&nbsp ;</td></tr><tr><td>BOUCHONS EN CAOUTCHOUC DE SILICONE POUR TUBES D’ÉCHANTILLONS RMN POUR TUBES À PAROI MINCE AYANT UN DIAMÈTRE EXTÉRIEUR DE 4 mm-5 mm (3,2 mm À 4,2 mm DE DIAMÈTRE) TS-4-5-SR</td><td>NORELL</td><td>94987</td><td></td></tr><tr><td>EMXnano Bench-Top EPR spectrometer&nbsp ;</td><td>Bruker BioSpin GmbH</td><td>E7004002</td><td></td></tr><tr><td>EMX NANO TISSUE CELL</td><td>Bruker BioSpin GmbH</td><td>E7004542</td><td></td></tr></tbody></table>

utilisation de résonance paramagnétique électronique dans des échantillons biologiques à température ambiante et à 77 k

Use of Electron Paramagnetic Resonance in Biological Samples at Ambient Temperature and 77 K

La détection précise et spécifique des espèces réactives de l’oxygène (ROS) dans les différents compartiments cellulaires et tissulaires est essentielle à l’étude de l’oxydo-réduction réglementées de signalisation dans les milieux biologiques. Spectroscopie de résonance paramagnétique électronique (RPE) est la méthode directe d’évaluer sans ambiguïté les radicaux libres. Son avantage est qu’il détecte des niveaux physiologiques des espèces spécifiques avec une grande spécificité, mais elle requiert la technologie spécialisée, préparation minutieuse et des contrôles appropriés afin d’assurer une interprétation précise des données. Sondes de spin hydroxylamine cyclique réagissent sélectivement avec superoxyde ou autres radicaux pour générer un signal nitroxyde pouvant être quantifiées par spectroscopie RPE. Sondes de spin perméable à la cellule et sondes de spin conçus pour accumuler rapidement dans les mitochondries permettent la détermination de la concentration de superoxyde dans les différents compartiments cellulaires.
Dans les cellules cultivées, l’utilisation de 1-hydroxy-3-methoxycarbonyl-2,2,5,5-tetramethylpyrrolidine cellulaires perméables (CMH) avec et sans prétraitement de cellule-imperméable superoxyde dismutase (SOD) ou de cellules perméables PEG-SOD, permet la différenciation des extracellulaire de superoxyde cytosolique. Le 1-hydroxy-4-[2-triphenylphosphonio)-acetamido]-2,2,6,6-tetramethyl-piperidine,1-hydroxy-2,2,6,6-tetramethyl-4-[2-(triphenylphosphonio)acetamido mitochondrial] pipéridinium dichlorure (mito-TEMPO-H) permet de mesurer des ROS mitochondriale (principalement le superoxyde).
Sondes de spin et spectroscopie RPE peuvent également être appliquées en vivo modèles. Superoxyde peut être détectée en fluides extracellulaires comme le sang et le liquide alvéolaire, ainsi que les tissus tels que les tissus pulmonaires. Plusieurs méthodes sont présentées pour traiter et stocker les tissus pour les mesures de l’EPR et livrer de sonde 1-hydroxy-3-carboxy-2,2,5,5-tetramethylpyrrolidine en intraveineuse (CPH) spin in vivo. Tandis que les mesures peuvent être réalisées à température ambiante, échantillons obtenus à partir des modèles in vitro et in vivo peuvent également être stockées à-80 ° C et analysés par EPR à 77 K. Les échantillons peuvent être stockés dans l’écurie de tubes spécialisés à-80 ° C et exécutées à 77 K pour permettre une pratique, efficace et une méthode reproductible qui facilite le stockage et transfert des échantillons.

Détection de superoxyde par CMH a été validée à l’aide de le X / superoxyde XO centrale système de démontrer que le signal nitroxyde (CM.) est totalement inhibé par SOD, tandis que catalase n’a eu aucun effet (Figure 1 a). Le superoxyde total, extracellulaire était alors évaluée en 264.7 cellules crues par incubation des cellules avec la sonde de spin CMH perméable à la cellule +/-un prétraitement SOD. La concentration de nitroxyde a été mesurée da...

Par spectroscopie de résonance paramagnétique (EPR) est une méthode non équivoque pour mesurer des radicaux libres. L’utilisation de sondes de spin sélectif permet une détection des radicaux libres dans les différents compartiments cellulaires. Nous présentons une méthode pratique et efficace pour collecter des échantillons biologiques qui facilitent le traitement, stockage et transfert des échantillons pour des mesures de l’EPR.

Utilisation de résonance paramagnétique électronique dans des échantillons biologiques à température ambiante et à 77 K

The accurate and specific detection of reactive oxygen species (ROS) in different cellular and tissue compartments is essential to the study of ...

La signalisation de redox dysregulated est impliquée dans la pathogénie de diverses maladies. L’étude de la biologie du redox nécessite la détection précise d’espèces réactives d’oxygène dans différents compartiments cellulaires et tissulaires. La spectroscopie EPR est la seule méthode qui mesure sans ambiguïté les radicaux libres.Ce protocole démontre une méthode pratique pour la manipulation et le stockage d’échantillons biologiques pour la spectroscopie EPR. Ces protocoles illustrent l’utilisation d’EPR et de sondes spin dans deux modèles représentatifs. Bien qu’ils puissent être adaptés pour évaluer les espèces actives dans d’autres milieux biologiques.La conception de l’expérience et la manipulation de l’échantillon sont essentielles à sa reproductibilité. Nous vous recommandons d’envisager la densité cellulaire et d’assurer des contrôles adaptés au temps. Commencez par laver doucement les cellules brutes de 264,7 avec un millilitre de Tampon Krebs-Henseleit ou KHB, par puits.Et traiter les cellules avec 500 microlitres de KHB, complétées par 100 micromil de DTPA par puits. Pour prétraiter avec la dismutase de superoxyde, ajoutez 15 microlitres de stock de dismutase de superoxyde, ou véhicule, à chaque puits, et placez la plaque à 37 degrés Celsius pendant 10 minutes. À la fin du prétraitement de dismutase de superoxyde, ajoutez 12,5 microlitres de CMH de 10 millimolaires et 40 microlitres de 125 micromolar PMA solution de travail aux puits appropriés, et incuber à 37 degrés Celsius pendant 50 minutes.Placez immédiatement les plaques sur la glace et recueillez le tampon de chaque puits dans des tubes individuels de 1,5 millilitre sur la glace. Ensuite, ajoutez 100 microlitres de KHB frais plus DTPA à chaque puits et grattez doucement les cellules du fond de chaque puits. Puis résuspendez les suspensions cellulaires avec pipetting et transférez les cellules dans des tubes individuels de 1,5 millilitre sur la glace.Pour la détection du superoxyde à température ambiante, chargez d’abord 50 microlitres d’un tampon ou d’un échantillon cellulaire dans un tube capillaire et scellez le tube. Placez immédiatement le tube dans le spectromètre paramagnetic électronique, ou EPR, et définissez les paramètres d’acquisition de l’EPR pour les mesures de température ambiante. Testez toujours un échantillon vierge de tampon contenant la même concentration de sonde traitée dans les mêmes conditions expérimentales qu’un contrôle.Pour la détection du superoxyde à 77 degrés Kelvin, chargez 150 microlitres d’un échantillon dans un morceau de polytétrafluoroéthylène droit d’un à deux pouces, ou PTFE, tube, avec un bouchon en caoutchouc à une extrémité. Sceller l’autre extrémité du tube à l’intérieur d’un deuxième bouchon et congeler l’échantillon dans de l’azote liquide. Retirez ensuite rapidement les bouchons et placez le tube PTFE dans un cryotube étiqueté pour le stockage de l’azote liquide.Pour les mesures EPR, remplissez le déwar doigt du spectromètre EPR avec de l’azote liquide et placez le tube PTFE contenant l’échantillon dans l’azote liquide. Placez le bout des doigts dans le spectromètre EPR et définissez les paramètres d’acquisition de l’EPR pour les mesures à 77 degrés Kelvin. Pour la détection ros dans les tissus pulmonaires congelés, placez le tissu sur la glace sèche et utilisez des pinces à épiler pour stabiliser le tissu flash-congelé sur la glace sèche.Couper l’échantillon en cinq morceaux de 15 milligrammes et peser les morceaux dans un tube goudronné de 1,5 millilitre. Ajouter 196 microlitres de KHB plus DTPA et quatre microlitres de CMH à l’échantillon, et incuber l’échantillon pulmonaire pendant une heure dans un bain d’eau de 37 degrés Celsius avant de pelleter les fragments de tissu avec une brève centrifugation. Placez ensuite l’échantillon sur la glace avant de transférer 150 microlitres du supernatant dans un morceau de tube PTFE pour le gel flash en préparation de la mesure epr comme nous venons de le démontrer.L’évaluation de la production totale de superoxyde dans les cellules brutes de 264,7 stimulées par la PMA comme démontré, révèle que la concentration de nitroxide dans la suspension cellulaire et le tampon des cellules traitées par pma est similaire, en raison de la nature perméable et de l’équilibrage rapide de la sonde spin. Le signal des radicaux nitroxides augmente dans les cellules brutes de 264,7 stimulées par pma, par rapport aux cellules de contrôle, mais pas dans les cellules prétraitées avec la dismutase de superoxyde cellule-imperméable. La concentration de nitroxide obtenue à basse température dans 264,7 cellules brutes après stimulation par PMA est également atténuée en présence d’une dismutase de superoxyde compatible avec les données sur la température ambiante.La concentration de nitroxide est augmentée dans le sang et le liquide de lavage bronchoalveolar des souris bleo et des souris traitées, aussi bien qu’à l’intérieur des supernatants des morceaux récoltés de tissu de poumon des souris de bleo et des animaux blessés, comparés aux contrôles PBS-traités. En outre, après injection rétro-orbitale de sonde de spin, les souris de bleo et les animaux traités démontrent un signal plus élevé de sonde de spin comparé aux contrôles. Ces protocoles pratiques permettront aux chercheurs de tester la production de radicaux libres dans différents compartiments cellulaires et échantillons biologiques par EPR, y compris des mesures à basse température.

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Cette vidéo décrit la technique de spectroscopie par résonance magnétique nucléaire permettant d’étudier les interactions protéine-protéine entre 15 protéines d’envoplakine de type sauvage et mutantes 15N-marquées et la protéine vimentine non marquée. L’interaction réussie entre l’envoplakine de type sauvage et la vimentine conduit à un élargissement important des raies et à la disparition des pics dans les spectres RMN, tandis que l’absence d’interaction entre l’envoplakine mutée et la...

La résonance magnétique nucléaire pour étudier les interactions protéine-protéine au niveau atomique

Une méthode, rapide balayage EPR (RS-EPR) nouvelle résonance paramagnétique électronique (EPR), est mise en évidence pour la 2D imagerie spatiale spectrale qui est supérieure à la technique traditionnelle onde continue (CW) et ouvre de nouveaux espaces pour l' imagerie in vivo. Les résultats sont démontrés à 250 MHz, mais la technique est applicable à toute fréquence.

Numérisation rapide résonance paramagnétique électronique ouvre de nouvelles voies pour l&#39;imagerie physiologiquement Paramètres importants<em&gt; In Vivo</em

Un protocole pour le suivi in situ de la diffusion de molécules invitées en milieu poreux à l’aide de l’imagerie par résonance paramagnétique électronique (EPR) est présenté.

In Situ Suivi de Diffusion des clients Molécules en Porous Media en utilisant l&#39; imagerie par résonance paramagnétique électronique

Structures des assemblages supramoléculaires protéine à résolution atomique sont de grande importance en raison de leur rôle crucial dans une variété de phénomènes biologiques. Ici, nous présentons un protocole pour effectuer des études structurales à haute résolution sur des ensembles de protéines macromoléculaire insoluble et non cristalline par magie-angle spinning spectroscopie RMN à l’état solide (MAS SSNMR).

Échelle atomique des études structurales des assemblages macromoléculaires par spectroscopie RMN à l’état solide

Nous présentons ici un protocole pour la production et la purification des protéines qui sont marqués avec des isotopes stables et ultérieure caractérisation des interactions protéine-protéine à l’aide de la spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) et micro-échelle Expériences de thermophorèse (MST).

Mesurer les Interactions des protéines globulaires et filamenteuses par spectroscopie de résonance magnétique nucléaire (RMN) et thermophorèse a petite Echelle (MST)

Ce protocole présente une procédure détaillée pour préparer des cryoéchantillons biologiques pour des expériences de spectroscopie d’absorption de rayons X basées sur le synchrotron. Nous décrivons toutes les étapes nécessaires pour optimiser la préparation des échantillons et la cryoconservation avec des exemples du protocole avec les cellules cancéreuses et phytoplanctoniques. Cette méthode fournit une norme universelle de cryo-préparation des échantillons.

Préparation d’échantillons biologiques pour la spéciation à température cryogénique à l’aide de la spectroscopie d’absorption de rayons X à haute résolution

Présenté ici est un protocole pour le transfert cryogénique d’échantillons congelés dans la sonde de polarisation nucléaire dynamique (DNP) à rotation d’angle magique (MAS) de résonance magnétique nucléaire (RMN). Le protocole comprend des instructions pour le stockage du rotor avant l’expérience et des instructions pour les mesures de viabilité avant et après l’expérience.

Chargement d’échantillons cryogéniques dans un spectromètre à résonance magnétique nucléaire à angle magique qui préserve la viabilité cellulaire

Les structures moléculaires et la dynamique des solides, des liquides, des gaz et des mélanges sont d’un intérêt critique pour divers domaines scientifiques. La NMR MAS NMR in situ à haute température et à haute pression permet de détecter l’environnement chimique des constituants dans des systèmes en phase mixte dans des environnements chimiques étroitement contrôlés.

Spectroscopie de résonance magnétique nucléaire à haute température et à haute pression in situ

Un protocole pour l’application de la spectroscopie RMN d’amélioration de la relaxation paramagnétique pour détecter les interactions inter- et intramoléculaires faibles et transitoires dans les protéines intrinsèquement désordonnées est présenté.

Amélioration de la relaxation paramagnétique pour détecter et caractériser des auto-associations de protéines intrinsèquement désordonnées

Découvrez une méthode pratique de spectroscopie RPE pour détecter les radicaux libres dans des échantillons biologiques à température ambiante et à 77 K. Ces protocoles utilisent des sondes à spin sélectives pour la biologie redox.

Utilisation de résonance paramagnétique électronique dans des échantillons biologiques à température ambiante et à 77 K

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