Name: Agrobacterium tumefaciens et Agrobacterium rhizogenes-Mediated Transformation des pommes de terre et de l’activité du promoteur d’un gène de subérine par GUS Staining (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-03-29T13:30:00.000+00:00
Duration: 8 min 31 s
Description: Découvrez la transformation de pommes de terre par Agrobacterium tumefaciens et Agrobacterium rhizogenes pour étudier l'activité des promoteurs géniques. Cette méthode permet d'évaluer rapidement la fonction des gènes dans les racines transgéniques.

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Ce travail a été soutenu par le Ministerio de Innovación y Ciencia (AGL2009-13745, bourse de FPI à PB), le Ministerio de Economía y Competitividad et FEDER fonds (AGL2012-36725, AGL2015-67495-C2-1-R) et l’Université de Girona (Ph.d concession de SF et subvention SING11/1). Les auteurs sont reconnaissants envers le Dr Inge Broer (Institut d’aménagement, Université de Rostock, Rostock, Allemagne) et m. Salomé Prat (Centro Nacional de Biotecnología, Madrid, Espagne) pour fournir le a. rhizogenes et la souche d’a. tumefaciens , respectivement et Dr Marçal Soler et Dr Anna Plasencia pour l’aide et le soutien reçu en initiant les expériences de transformation a. rhizogenes (Université Toulouse III Paul Sabatier, CNRS, laboratoire de recherche plante (LRSV), Castanet Tolosan, France). Les auteurs remercient Sara Gómez (Departament de Biologia, UdG, Girona) pour son aide précieuse dans la réalisation des travaux de laboratoire et de prendre soin des plantes et de Ferran Fontdecaba et de Carla Sánchez, qui a assisté avec quelques-unes des expériences alors qu’ils faisaient leurs projets de diplôme final.

Le protocole de transformation a. rhizogenes a été adapté et modifié du Horn et coll.7 et le génotype testé était S. tuberosum ssp. tuberosum (cultivar Désirée). Le protocole de transformation a. tumefaciens a été adapté et modifié du Banerjee et coll.22 et les génotypes testés étaient S. tuberosum ssp. tuberosum (cultivar Désirée) et S. tuberosum SSP andigena. Les principales étapes des deux procédures sont résumées dans Figure 1 et Figure 2, respectivement.
Remarque : Dans toutes les étapes de la procédure d’exécution en vitro transferts, faites-le rapidement et lorsque cela est possible, conserver les plaques ou les pots fermés, minimisant ainsi l’exposition de la plante pour éviter le flétrissement et la contamination de l’air. Indication contraire, tous les incubations d’usine ont été effectuées dans les armoires, dans les conditions des 12 h de h de lumière/12 24 ° C de 20 ° C sombre et 67 µmol m-1 s-1. Contraire, effectuer toutes les bactéries manipulation et in vitro végétales transferts dans des conditions aseptiques dans une hotte à flux laminaire. Toutes les recettes de médias pour les cultures de plantes Agrobacterium et in vitro sont fournis au Tableau S1.
Mise en garde : Déposer toutes les bactéries génétiquement modifiées et les plantes à la poubelle appropriée.
1. cultures de Agrobacterium utilisés pour la transformation
Remarque : La souche utilisée pour la transformation d’a. rhizogenes était le C58C1:Pri15837 (aimablement fourni par le Dr. Inge Broer) et que pour le a. tumefaciens était le GV2260 (aimablement fourni par le Dr Salomé Prat). A. rhizogenes a été transformée avec le vecteur binaire PK7GWIWG2_II-amarante (VIB-département de biologie des systèmes végétaux à l’Universiteit Gent ; http://gateway.psb.ugent.be) qui contient un ADN-T transportant un marqueur de transformation pour surveiller les racines chevelues formation. Pour comparer les racines transformées générés par a. rhizogenes et a. tumefaciens, tous deux ont été transformées avec les pKGWFS7 de vecteur binaire qui contient un ADN-T transportant le promoteur FHT conduite le gène rapporteur β-glucuronidase (GUS) et le gène de résistance de kanamycine comme un marqueur de sélection15.
<ol><li>Prélever une colonie d’Agrobacterium et développez-le pendant la nuit (O/N) dans 5 mL de milieu YEB additionné d’antibiotiques (Tableau S1) dans un tube à centrifuger 50 mL à 28 ° C sous agitation à 200 tr/min.</li>
	<li>Pour la transformation d’a. tumefaciens , mesurer la densité optique, qui doit être OD600 = 0,6 à 1,0.<ol>
<li>Si la densité optique est plus élevée, faire une sous-culture abaissant à OD600 = 0,3 avec supports neufs et attendre jusqu'à ce que la culture atteint OD600 = 0,6-1.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Centrifuger 1 mL de culture Agrobacterium à 3 000 x g dans une centrifugeuse de paillasse pendant 10 min à température ambiante.</li>
	<li>Retirez le surnageant en pipettant également et remettre en suspension des cellules dans 1 mL de milieu frais de YEB sans antibiotiques. Répétez cette étape pour assurer l’élimination complète des antibiotiques.<ol>
<li>Pour la transformation d’a. tumefaciens , dans la dernière remise en suspension ajouter le volume approprié de YEB pour obtenir une densité optique finale de OD600 = 0,8.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Garder les cellules sur la glace tout en préparant les plantes infectées.</li>
</ol>2. matériel pour la transformation des végétaux
<ol><li>Faire un ou deux boutures de tiges de nœud contenant soit l’apicale ou les bourgeons auxiliaires de stérile en vitro plants de pomme de terre (plantes de donateurs) ; cultivez-les dans un milieu solide 2MS dans des pots pendant 3 à 4 semaines (Figure 1 et Figure 2 a).</li>
</ol>3. usine de transformation à l’aide de a. rhizogenes (Figure 1)
Remarque : Cette procédure permet l’obtention de racines velues transformées. Afin d’évaluer l’expression du transgène, un contrôle négatif est nécessaire. Pour préparer le contrôle négatif, suivez la procédure à l’aide d’une souche d’a. rhizogenes , non transformé ou transformée avec le vecteur vide contenant le gène marqueur de transformation.
<ol><li>Utiliser des plaques supports neufs ; par ailleurs, les plaques peuvent être conservés à 4 ° C avec le côté du couvercle vers le haut, hermétiques avec un film transparent pour éviter la déshydratation des médias. Pour préparer les plaques supports carrés, leur inclinaison ~ 15°, remplissage avec 40 mL de MS et laissez-les se solidifier. Cela réduira le contact de la partie aérienne de la plante avec le milieu.</li>
	<li>Transférer très soigneusement une plante donneur du milieu 2MS dans une assiette carrée 120 x 120 mm.</li>
	<li>Injecter à une seule tige entre-nœud 3 μL de la culture a. rhizogenes , à l’aide d’une aiguille chirurgicale et répéter deux fois par la plante dans les entre-nœuds différents lorsque cela est possible. Remarque : Pensez à chaque injection comme un événement de transformation indépendant (Figure 1 b).</li>
	<li>Transférer immédiatement la plante entière à une assiette carrée avec solide milieu MS additionné de 0,1 mM acétosyringone. Accueillir 2 plants par plaque. Remarque : La solution 1 M acétosyringone est préparée dans le DMSO et peut être conservée à-20 ° C.</li>
	<li>Sceller la plaque à l’aide de ruban chirurgical et arranger verticalement à l’intérieur d’une placard de croissance pendant 4 jours.</li>
	<li>Transférer l’usine d’une nouvelle plaque carrée avec MS additionné de céfotaxime sodique [500 µg/mL] de tuer a. rhizogenes.</li>
	<li>Après 10 à 12 jours, racines velues commencera à apparaître (Figure 1,1D). Puis, d’accise les racines autochtones de la plante et transfert de l’usine vers une nouvelle plaque carrée avec MS additionné de céfotaxime sodique [500 µg/mL]. NOTE : Les racines velues transformées peuvent être vérifiées par fluorescence rouge lorsque vous utilisez un marqueur de transformation DsRed (Figure 3D).</li>
	<li>Pour obtenir une plante composite (Figure 1E), laisser les racines velues transgéniques pousser pendant 3-4 semaines dans MS additionné de céfotaxime sodique [500 μg/mL] (changer le milieu chaque semaine).</li>
	<li>Selon le but, propager les racines velues transgéniques et les témoins négatifs comme suit.<ol>
<li>Transférer l’usine ensemble composite à un hydroponique (Tableau S2) ou milieu de sol pour permettre le développement massif.</li>
		<li>Pour individuellement propager les racines velues transformées, à l’aide d’un scalpel coupe les racines exprimant le marqueur rouge fluorescent transformation (protéine DsRed) quand ils sont 4-8 cm de long (Figure 1E) et transférer dans un plat de pétri avec un milieu solide Gamborg B5 additionné de 2 % de sucrose et céfotaxime sodique [500 μg/mL]. Sceller les plaques avec du film plastique de laboratoire et cultivez-les dans l’obscurité à 20 ° C. Remarque : Les racines peuvent être manipulés sous un stéréomicroscope équipé pour détecter la fluorescence dans des conditions stériles (voir Table des matières).</li>
		<li>Pour la production de biomasse (c.-à-d., analyse de l’expression génique), couper une racine long poilu de 5 cm et propager dans un Erlenmeyer de 150 mL avec 20 mL de milieu liquide Gamborg B5 additionné de 2 % de sucrose et céfotaxime sodique [500 µg/mL]. Développez-le pendant 6 semaines dans l’obscurité à 20 ° C et 60 t/mn.</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59119/59119fig1v3.jpg"> Figure 1 : Chronologie d’obtenir des pommes de terre transgéniques racines velues à l’aide d’a. rhizogenes. Les semaines cumulées pour atteindre chaque étape du processus de transformation et les étapes ultérieures de croître les racines velues sont indiqués. Des images représentatives des différents stades sont représentés : l’initiation du processus à l’aide de 3 semaines in vitro de plantes (A), puis l’infection des plantes par injection a. rhizogenes (B), la formation de la prolifération tissus (C, flèches) avec de nouvelles racines velues (D) et les racines velues développés exprimant le marqueur rouge fluorescent transformation DsRed (E). <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59119/59119fig1v3large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.</a>
4. usine de transformation à l’aide de a. tumefaciens (Figure 2)
Remarque : Cette procédure permet l’obtention de plantes transformées. Pour évaluer l’effet du transgène, un contrôle négatif est nécessaire. Une option consiste à suivre la procédure à l’aide d’un a. tumefaciens transformée avec le vecteur vide. Par ailleurs, les plantes de type sauvage peuvent être utilisés.
<ol><li>Couper et placer une feuille de la plante de 3-4-week-old (Figure 2 a) dans une boîte de pétri. À l’aide d’un scalpel exclure le pétiole et faire des coupes transversales (1-3 selon la taille de la feuille) depuis le centre de la feuille aux bords en évitant de les couper (Figure 2 b).</li>
	<li>Placer les feuilles flottant sur 10 mL de 2MS fraîches des milieux liquides dans une boîte de pétri avec la face abaxiale vers le haut immédiatement et fermer la plaque. Répétez l’étape pouvant accueillir jusqu'à 15 feuilles de cultivar Désirée et 25 feuilles pour SSP. unndigena (selon la taille de la feuille).</li>
	<li>Immédiatement ajouter 80 µL de la culture a. tumefaciens OD600 = 0,8 dans les milieux liquides et homogénéiser la plaque manuellement pendant 1 min distribuer la solution bactérienne.</li>
	<li>Soigneusement sceller avec film d’étanchéité, couvrir avec du papier aluminium et incuber pendant 2 jours dans une chambre à 24 ° C pour permettre la transformation se produisent.</li>
	<li>Transférer les feuilles en gardant un côté abaxial jusqu'à milieu de CIM (Figure 2 b) et les incuber pendant une semaine dans une placard de croissance.<ol>
<li>Grattez le milieu CIM avec la pince à épiler afin que les feuilles peuvent être mieux adaptées sur les médias.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Transférer les feuilles en gardant un côté abaxial jusqu'à milieu SIM (Figure 2) et les incuber dans une armoire, rafraîchissant la moyenne tous les 7-10 jours, jusqu'à ce que les pousses sont d’environ 2 cm de hauteur de la croissance.<ol>
<li>Gratter le support SIM avec la pince à épiler afin que les feuilles peuvent être entièrement entourés par les médias. Lorsque les pousses émergés atteignent le couvercle, travailler avec grands plats de pétri (100 x 20 mm, hauteur x diamètre). Remarque : Le Cal se forme après 2-3 semaines en milieu SIM (Figure 2D) et les pousses après 6 à 7 semaines (Figure 2E). Les pousses sont considérées comme des événements de transformation indépendant lorsqu’ils sortent de cals formés à partir de plaies indépendants.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Coupe trois pousses émergée de chaque cals (considéré comme l’événement de transformation même) (Figure 2E), transfert à des flacons de culture avec milieu de MG additionnés de céfotaxime sodique [250 mg/L] pour permettre l’enracinement, étiqueter le sous-ensemble avec un certain nombre et incuber à une croissance du cabinet pendant 3 à 4 semaines ou jusqu'à ce que les tiges sont vigoureuses (Figure 2F). Remarque : Lorsque vous coupez les pousses, retirez bien Cal sinon que la racine ne sera pas incluse.<ol>
<li>Répétez l’étape autant de fois que des lignes indépendantes sont nécessaires. Jusqu'à 5 transformation différents événements peuvent être placés dans un flacon de culture avec un diamètre de 8 cm pour travailler en toute confiance que les plantes de différents événements ne sont pas mélangés.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Sélectionnez la plante plus vigoureuse de chaque événement, couper le segment apical de la tige avec 3-4 entre-nœuds et placez-le dans un nouveau flacon de culture avec 2MS additionné de céfotaxime sodique [250 mg/L]. Remarque : Dans les 3 à 6 semaines, que la plante poussera efficacement, développant une pousse vigoureuse et les racines.<ol>
<li>Faire revenir à la chambre les pousses non retenus jusqu'à ce que la plante sélectionnée a entièrement développé.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Coupez des segments de tige de la plante avec au moins un entre-noeud ou avec le bourgeon apical et de les transférer à nouveau 2MS additionné à la céfotaxime [250 mg/L]. Les incuber dans la croissance du cabinet.<ol>
<li>Reproduire toutes les 3-4 semaines pour établir les lignes en vitro transformé. Remarque : Le céfotaxime sodique est nécessaire au moins trois transferts ultérieurs au milieu de 2 ms pour être sûr de tuer le a. tumefaciens; par la suite, si surcroissance d’a. tumefaciens est observée, transférer les plantes à nouveau aux médias de 2MS additionné de céfotaxime sodique.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Afin de caractériser le phénotype de la plante, transférer les plantes dans le sol pour leur caractérisation complète ou à la culture hydroponique pour l’inspection de la racine.<ol>
<li>Garder les tubercules produits dans le sol à propager et à maintenir les lignes établies.</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/59119/59119fig2.jpg"> Figure 2 : Chronologie d’obtenir des pommes de terre transformées plantes à l’aide d’a. tumefaciens. Les semaines cumulées pour atteindre chaque étape du processus de transformation et les étapes ultérieures à cultiver les plantes apparaissent. Des images représentatives des différents stades sont représentés : l’initiation du processus à l’aide laisse partir 3 - semaine vieux in vitro de plantes (A), le transfert des blessés et infectées laisse aux médias CIM (B), les feuilles lorsque transféré à Médias SIM (C), la visualisation du Cal autour des zones blessés après 2-3 semaines dans les médias (D), la formation de la tige après 9-11 semaines dans les médias (E) de la carte SIM et les pousses après avoir été transféré aux médias MG (F) SIM. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/59119/59119fig2large.jpg" target="_blank">S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.</a>
5. hydroponique
<ol><li>Préparer la solution de Hoagland à une moitié de la traction (0,5 x) (Tableau S2) dans un seau de 10 L.</li>
	<li>Immerger une pompe d’aquarium pour maintenir l’homogénéité et des conditions d’oxygène adéquat.</li>
	<li>Couvrir les parois du seau avec du papier d’aluminium à s’enraciner dans l’obscurité.</li>
	<li>Évitant les dommages racinaires, transfert in vitro de plantes de culture hydroponique. Remarque : Retirez tout restant dans vitro support de racines pour éviter la prolifération de micro-organismes pendant l’incubation en agitant soigneusement les racines immergées dans l’eau.</li>
	<li>Couvrir les plantes avec une pellicule transparente comme une serre pour permettre l’acclimatation adéquate et incuber dans la chambre de croissance.</li>
	<li>Faites des trous dans le film après 3 jours et retirez-le complètement une semaine après.</li>
	<li>Remplacez les supports neufs tous les 10 jours.</li>
</ol>6. test de gène GUS journaliste histochimiques
Remarque : Dans notre cas le GUS analyse a été réalisée avec des racines de 2 à 3 semaines, cultivés en culture hydroponique ou in vitro.
<ol><li>Difficulté les racines avec de l’acétone 90 % réfrigérés (v/v) et il incuber pendant 20 minutes sur la glace.</li>
	<li>Effectuer deux lavages à l’eau distillée.</li>
	<li>Ajouter frais GUS coloration solution (tableau 1) et appliquer sous vide (-70 Pa) pendant 20 min.</li>
	<li>Incuber à 37 ° C dans l’obscurité, afin de protéger le GUS photosensible pendant 4 h ou jusqu'à ce qu’une couleur bleue est visible. Remarque : La présence de ferrocyanure en solution de GUS et ferri - réduire au minimum la diffusion des produits de réaction et fournir une localisation plus précise. Attention : Utiliser une hotte aspirante et porter des vêtements de protection pour manipuler les dérivés toxiques de cyanure en solution de GUS (le ferricyanure de potassium et ferrocyanure de potassium). Le substrat de GUS et le matériel d’évacuation doivent être éliminés en toute sécurité.</li>
	<li>Retirez les GUS solution de coloration et jetez-le dans un emballage adéquat.</li>
	<li>Effectuer deux lavages avec l’éthanol 70 % (v/v).</li>
	<li>Observer au microscope champ lumineux. NOTE : GUS la coloration est stable pendant quelques semaines ; Cependant, durant la première semaine, le signal de GUS est clair et diffuse moins dans les cellules voisines. Pour une conservation plus longue, fermer le tube et conserver à 4 ° C.</li>
</ol><img alt="Table 1" src="/files/ftp_upload/59119/59119tbl1.jpg" style="opacity: 0.9; font-size: 14px;"> Tableau 1 : Recette de la solution coloration GUS.

<ol><li>Gelvin, S. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Traversing+the+Cell%3A+Agrobacterium+T-DNA%27s+journey+to+the+host+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Traversing the Cell: Agrobacterium T-DNA's journey to the host genome.</a> Frontiers in Plant Science. 3, 1-11 (2012).</li>
<li>Lacroix, B., Citovsky, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+roles+of+bacterial+and+host+plant+factors+in+Agrobacterium-mediated+genetic+transformation%5BTitle%5D)+AND+%22The+International+Journal+of+Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">The roles of bacterial and host plant factors in Agrobacterium-mediated genetic transformation.</a> The International Journal of Developmental Biology. 57 (6-8), 467-481 (2013).</li>
<li>Lee, L. Y., Gelvin, S. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((T-DNA+binary+vectors+and+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">T-DNA binary vectors and systems.</a> Plant Physiology. 146 (2), 325-332 (2008).</li>
<li>Ishida, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+efficiency+transformation+of+maize+%28Zea+mays+L.%29+mediated+by+Agrobacteriumtumefaciens%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">High efficiency transformation of maize (Zea mays L.) mediated by Agrobacteriumtumefaciens.</a> Nature Biotechnology. 14 (6), 745-750 (1996).</li>
<li>White, F. F., Taylor, B. H., Huffman, G. A., Gordon, M. P., Nester, E. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+and+genetic+analysis+of+the+transferred+DNA+regions+of+the+root-inducing+plasmid+of+Agrobacterium+rhizogenes%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Bacteriology%22%5BJournal%5D)">Molecular and genetic analysis of the transferred DNA regions of the root-inducing plasmid of Agrobacterium rhizogenes.</a> Journal of Bacteriology. 164 (1), 33-44 (1985).</li>
<li>Dinh, P. T. Y., Brown, C. R., Elling, A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA+Interference+of+effector+gene+Mc16D10L+confers+resistance+against+Meloidogyne+chitwoodi+in+Arabidopsis+and+Potato%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">RNA Interference of effector gene Mc16D10L confers resistance against Meloidogyne chitwoodi in Arabidopsis and Potato.</a> Phytopathology. 104 (10), 1098-1106 (2014).</li>
<li>Horn, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Composite+potato+plants+with+transgenic+roots+on+non-transgenic+shoots%3A+a+model+system+for+studying+gene+silencing+in+roots%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">Composite potato plants with transgenic roots on non-transgenic shoots: a model system for studying gene silencing in roots.</a> Plant Cell Reports. 33 (12), 1977-1992 (2014).</li>
<li>Plasencia, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Eucalyptus+hairy+roots%2C+a+fast%2C+efficient+and+versatile+tool+to+explore+function+and+expression+of+genes+involved+in+wood+formation%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Biotechnology+Journal%22%5BJournal%5D)">Eucalyptus hairy roots, a fast, efficient and versatile tool to explore function and expression of genes involved in wood formation.</a> Plant Biotechnology Journal. 14 (6), 1381-1393 (2015).</li>
<li>Ron, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hairy+root+transformation+using+Agrobacteriumrhizogenes+as+a+tool+for+exploring+cell+type-specific+gene+expression+and+function+using+tomato+as+a+model%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Hairy root transformation using Agrobacteriumrhizogenes as a tool for exploring cell type-specific gene expression and function using tomato as a model.</a> Plant Physiology. 166 (2), 455-469 (2014).</li>
<li>Zhang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+and+application+of+a+universal+and+simplified+multiplex+RT-PCR+assay+to+detect+five+potato+viruses%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+General+Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">Development and application of a universal and simplified multiplex RT-PCR assay to detect five potato viruses.</a> Journal of General Plant Pathology. 83 (1), 33-45 (2017).</li>
<li>Almasia, N. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Successful+production+of+the+potato+antimicrobial+peptide+Snakin-1+in+baculovirus-infected+insect+cells+and+development+of+specific+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Successful production of the potato antimicrobial peptide Snakin-1 in baculovirus-infected insect cells and development of specific antibodies.</a> BMC Biotechnology. 17 (1), 1-11 (2017).</li>
<li>Serra, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Silencing+of+StKCS6+in+potato+periderm+leads+to+reduced+chain+lengths+of+suberin+and+wax+compounds+and+increased+peridermal+transpiration%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Botany%22%5BJournal%5D)">Silencing of StKCS6 in potato periderm leads to reduced chain lengths of suberin and wax compounds and increased peridermal transpiration.</a> Journal of Experimental Botany. 60 (2), 697-707 (2009).</li>
<li>Serra, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CYP86A33-Targeted+gene+silencing+in+potato+tuber+alters+suberin+composition%2C+distorts+suberin+lamellae%2C+and+impairs+the+periderm%27s+water+barrier+function%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">CYP86A33-Targeted gene silencing in potato tuber alters suberin composition, distorts suberin lamellae, and impairs the periderm's water barrier function.</a> Plant Physiology. 149 (2), 1050-1060 (2008).</li>
<li>Serra, O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+feruloyl+transferase+involved+in+the+biosynthesis+of+suberin+and+suberin-associated+wax+is+required+for+maturation+and+sealing+properties+of+potato+periderm%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Journal%22%5BJournal%5D)">A feruloyl transferase involved in the biosynthesis of suberin and suberin-associated wax is required for maturation and sealing properties of potato periderm.</a> The Plant Journal. 62 (2), 277-290 (2010).</li>
<li>Boher, P., Serra, O., Soler, M., Molinas, M., Figueras, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+potato+suberin+feruloyl+transferase+FHT+which+accumulates+in+the+phellogen+is+induced+by+wounding+and+regulated+by+abscisic+and+salicylic+acids%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Botany%22%5BJournal%5D)">The potato suberin feruloyl transferase FHT which accumulates in the phellogen is induced by wounding and regulated by abscisic and salicylic acids.</a> Journal of Experimental Botany. 64 (11), 3225-3236 (2013).</li>
<li>Serra, O., Chatterjee, S., Figueras, M., Molinas, M., Stark, R. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deconstructing+a+plant+macromolecular+assembly%3A+chemical+architecture%2C+molecular+flexibility%2C+and+mechanical+performance+of+natural+and+engineered+potato+suberins%5BTitle%5D)+AND+%22Biomacromolecules%22%5BJournal%5D)">Deconstructing a plant macromolecular assembly: chemical architecture, molecular flexibility, and mechanical performance of natural and engineered potato suberins.</a> Biomacromolecules. 15 (3), 799-811 (2014).</li>
<li>Vulavala, V. K. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+genes+related+to+skin+development+in+potato%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Identification of genes related to skin development in potato.</a> Plant Molecular Biology. 94 (4-5), 481-494 (2017).</li>
<li>Landgraf, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+ABC+transporter+ABCG1+is+required+for+suberin+formation+in+potato+tuber+periderm%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">The ABC transporter ABCG1 is required for suberin formation in potato tuber periderm.</a> The Plant Cell. 26 (8), 3403-3415 (2014).</li>
<li>Verdaguer, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Silencing+of+the+potato+StNAC103+gene+enhances+the+accumulation+of+suberin+polyester+and+associated+wax+in+tuber+skin%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Botany%22%5BJournal%5D)">Silencing of the potato StNAC103 gene enhances the accumulation of suberin polyester and associated wax in tuber skin.</a> Journal of Experimental Botany. 67 (18), 5415-5427 (2016).</li>
<li>Molina, I., Li-Beisson, Y., Beisson, F., Ohlrogge, J. B., Pollard, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+an+Arabidopsis+feruloyl-coenzyme+A+transferase+required+for+suberin+synthesis%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Identification of an Arabidopsis feruloyl-coenzyme A transferase required for suberin synthesis.</a> Plant Physiology. 151 (3), 1317-1328 (2009).</li>
<li>Gou, J. Y., Yu, X. -H., Liu, C. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+hydroxycinnamoyltransferase+responsible+for+synthesizing+suberin+aromatics+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">A hydroxycinnamoyltransferase responsible for synthesizing suberin aromatics in Arabidopsis.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106 (44), 18855-18860 (2009).</li>
<li>Banerjee, A. K., Prat, S., Hannapel, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+production+of+transgenic+potato+%28S.+tuberosum+L.+ssp.+andigena%29+plants+via+Agrobacterium+tumefaciens-mediated+transformation%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Efficient production of transgenic potato (S. tuberosum L. ssp. andigena) plants via Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation.</a> Plant Science. 170 (4), 732-738 (2006).</li>
<li>Sunil Kumar, G. B., Ganapathi, T. R., Srinivas, L., Revathi, C. J., Bapat, V. a <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+hepatitis+B+surface+antigen+in+potato+hairy+roots%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Expression of hepatitis B surface antigen in potato hairy roots.</a> Plant Science. 170 (5), 918-925 (2006).</li>
<li>Schmidt, J. F., Moore, M. D., Pelcher, L. E., Covello, P. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+efficiency+Agrobacteriumrhizogenes-mediated+transformation+of+Saponariavaccaria+L.+%28Caryophyllaceae%29+using+fluorescence+selection%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">High efficiency Agrobacteriumrhizogenes-mediated transformation of Saponariavaccaria L. (Caryophyllaceae) using fluorescence selection.</a> Plant Cell Reports. 26 (9), 1547-1554 (2007).</li>
<li>Petti, C., Wendt, T., Meade, C., Mullins, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+of+genotype+dependency+within+Agrobacteriumtumefaciens+in+relation+to+the+integration+of+vector+backbone+sequence+in+transgenic+Phytophthorainfestans-tolerant+potato%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Bioscience+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Evidence of genotype dependency within Agrobacteriumtumefaciens in relation to the integration of vector backbone sequence in transgenic Phytophthorainfestans-tolerant potato.</a> Journal of Bioscience and Bioengineering. 107 (3), 301-306 (2009).</li>
<li>Gaudin, V., Vrain, T., Jouanin, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bacterial+genes+modifying+hormonal+balances+in+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology+and+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Bacterial genes modifying hormonal balances in plants.</a> Plant Physiology and Biochemistry. 32 (1), 11-29 (1994).</li>
<li>Nemoto, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Function+of+the+aux+and+rol+genes+of+the+Ri+plasmid+in+plant+cell+division+in+vitro.+Plant+Signaling+%26amp%5BTitle%5D)+AND+%22Behavior%22%5BJournal%5D)">Function of the aux and rol genes of the Ri plasmid in plant cell division in vitro. Plant Signaling &amp.</a> Behavior. 4 (12), 1145-1147 (2009).</li>
<li>Visser, R. G. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+and+inheritance+of+inserted+markers+in+binary+vector+carrying+Agrobacteriumrhizogenes-transformed+potato+%28Solanumtuberosum+L.%29%5BTitle%5D)+AND+%22Theoretical+and+Applied+Genetics%22%5BJournal%5D)">Expression and inheritance of inserted markers in binary vector carrying Agrobacteriumrhizogenes-transformed potato (Solanumtuberosum L.).</a> Theoretical and Applied Genetics. 78 (5), 705-714 (1989).</li>
<li>Guillon, S., Trémouillaux-Guiller, J., Pati, P. K., Rideau, M., Gantet, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hairy+root+research%3A+recent+scenario+and+exciting+prospects%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Hairy root research: recent scenario and exciting prospects.</a> Current Opinion in Plant Biology. 9 (3), 341-346 (2006).</li>
<li>Georgiev, M. I., Agostini, E., Ludwig-Müller, J., Xu, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetically+transformed+roots%3A+from+plant+disease+to+biotechnological+resource%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+in+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Genetically transformed roots: from plant disease to biotechnological resource.</a> Trends in Biotechnology. 30 (10), 528-537 (2012).</li>
<li>Ooms, G., Lenton, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((T-DNA+genes+to+study+plant+development%3A+precocious+tuberisation+and+enhanced+cytokinins+in+A.+tumefaciens+transformed+potato%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">T-DNA genes to study plant development: precocious tuberisation and enhanced cytokinins in A. tumefaciens transformed potato.</a> Plant Molecular Biology. 5 (4), 205-212 (1985).</li>
<li>de Vries-Uijtewaal, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fate+of+introduced+genetic+markers+in+transformed+root+clones+and+regenerated+plants+of+monohaploid+and+diploid+potato+genotypes%5BTitle%5D)+AND+%22TAG.+Theoretical+and+applied+genetics%22%5BJournal%5D)">Fate of introduced genetic markers in transformed root clones and regenerated plants of monohaploid and diploid potato genotypes.</a> TAG. Theoretical and applied genetics. 78 (2), 185-193 (1989).</li>
<li>Bird, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+Arabidopsis+ABCG11%2FWBC11%2C+an+ATP+binding+cassette+%28ABC%29+transporter+that+is+required+for+cuticular+lipid+secretion%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Journal%3A+For+Cell+and+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Characterization of Arabidopsis ABCG11/WBC11, an ATP binding cassette (ABC) transporter that is required for cuticular lipid secretion.</a> The Plant Journal: For Cell and Molecular Biology. 52 (3), 485-498 (2007).</li>
<li>Luo, B., Xue, X. Y., Hu, W. L., Wang, L. J., Chen, X. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+ABC+transporter+gene+of+Arabidopsis+thaliana%2C+AtWBC11%2C+is+involved+in+cuticle+development+and+prevention+of+organ+fusion%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Cell+Physiology%22%5BJournal%5D)">An ABC transporter gene of Arabidopsis thaliana, AtWBC11, is involved in cuticle development and prevention of organ fusion.</a> Plant and Cell Physiology. 48 (12), 1780-1802 (2007).</li>
<li>Panikashvili, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Arabidopsis+DESPERADO%2FAtWBC11+transporter+is+required+for+cutin+and+wax+secretion%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">The Arabidopsis DESPERADO/AtWBC11 transporter is required for cutin and wax secretion.</a> Plant Physiology. 145 (4), 1345-1360 (2007).</li>
<li>Panikashvili, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Arabidopsis+DSO%2FABCG11+transporter+affects+cutin+metabolism+in+reproductive+organs+and+suberin+in+roots%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Plant%22%5BJournal%5D)">The Arabidopsis DSO/ABCG11 transporter affects cutin metabolism in reproductive organs and suberin in roots.</a> Molecular Plant. 3 (3), 563-575 (2010).</li>
<li>Bjelica, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fatty+acid+%CF%89-hydroxylases+from+Solanum+tuberosum%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">Fatty acid ω-hydroxylases from Solanum tuberosum.</a> Plant Cell Reports. 35 (12), 2435-2448 (2016).</li>
<li>Ding, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Abscisic+acid+coordinates+nod+factor+and+cytokinin+signaling+during+the+regulation+of+nodulation+in+Medicago+truncatula%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">Abscisic acid coordinates nod factor and cytokinin signaling during the regulation of nodulation in Medicago truncatula.</a> The Plant Cell. 20 (10), 2681-2695 (2008).</li>
<li>Isayenkov, S., Mrosk, C., Stenzel, I., Strack, D., Hause, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Suppression+of+allene+oxide+cyclase+in+hairy+roots+of+Medicagotruncatula+reduces+jasmonate+levels+and+the+degree+of+mycorrhization+with+glomus+intraradices+1%5Bw%5D%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Suppression of allene oxide cyclase in hairy roots of Medicagotruncatula reduces jasmonate levels and the degree of mycorrhization with glomus intraradices 1[w].</a> Plant Physiology. 139 (3), 1401-1410 (2005).</li>
<li>Dalton, D. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physiological+roles+of+glutathione+S-Transferases+in+soybean+root+Nodules+1%5BC%5D%5BW%5D%5BOA%5D%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Physiological roles of glutathione S-Transferases in soybean root Nodules 1[C][W][OA].</a> Plant Physiology. 150 (1), 521-530 (2009).</li>
<li>Limpens, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA+interference+in+Agrobacteriumrhizogenes-transformed+roots+of+Arabidopsis+and+Medicago+truncatula%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Botany%22%5BJournal%5D)">RNA interference in Agrobacteriumrhizogenes-transformed roots of Arabidopsis and Medicago truncatula.</a> Journal of Experimental Botany. 55 (399), 983-992 (2004).</li>
</ol>

Les auteurs n’ont aucun conflit d’intérêt à divulguer.

Dans la pomme de terre, le système le plus commun d’obtenir des plantes transgéniques complètes stables utilise la transformation par les souches d’Agrobacterium tumefaciens nécessitant l’organogenèse en utilisant les phytohormones exogènes. Bien que les protocoles d' Agrobacterium basé a le potentiel pour intégrer le vecteur non-T-DNA sequence25, cette méthodologie est toujours le plus facile et moins chère disponible pour transformer les plantes de pomme de terre. Au cours des ...

En dehors de l’intérêt économique, la génération de plantes transgéniques a sa propre pertinence dans la recherche pour démontrer la fonction ultime de gènes et de mieux comprendre la physiologie des plantes et le développement. Le plus largement utilisé la méthode pour plante insertion de l’ADN est Agrobacterium-mediated transformation. Agrobacterium tumefaciens est capable de générer des Galles de couronne dans les tissus infectés de nombreuses espèces végétales par l’action de son plasmide (Ti) inducteurs de tumeurs. Le plasmide contient une région de l’ADN-T avec un ensemble de gènes qui seront intégrés dans le génome de la plante et induisent des tissus dédifférenciation1,2. L’échange de ces gènes dans l’ADN-T par le transgène a permis à la génération des modifications de végétaux spécifiques en évitant les effets phénotypiques3. Pour faciliter le transgène clonage dans l’ADN-T, la région de l’ADN-T a été excisée dans un plasmide indépendant appelé un plasmide binaire, tandis que le reste des gènes du plasmide Ti (les gènes de virulence qui permettent les mécanismes de transfert et d’insertion d’ADN-T) ont été placé dans un plasmide d’assistance. Pour la recherche en biotechnologie végétale, transformation par a. tumefaciens a plusieurs avantages : il n’a pas besoin des dispositifs coûteux, est capable de générer la transformation des plantes stables et transitoires et faibles effectifs du gène copies sont intégrés dans le chromosome4. Cependant, pour la plupart des plantes, mais pas de, d’Arabidopsis, la génération des transformants stables nécessite régénération des plantes d’un seul ou quelques cellules en utilisant les phytohormones exogènes, rendant ce processus laborieux et fastidieux. A. rhizogenes est également en mesure de modifier le génome de la plante, produisant des racines velues ou racines adventives sur les sites d’infection due à l’expression des gènes rol (racine locus) encodé en induisant la racine (Ri) plasmide5. Bien que moins étudiées qu’a. tumefaciens, a. rhizogenes est également utilisé pour l’obtention de racines transgéniques. Dans ce cas, la a. rhizogenes contient original l’ADN-T dans le plasmide Ri et un plasmide binaire avec un ADN-T deuxième transportant le transgène. Lorsque le site de l’infection est dans les tiges ou les hypocotyles, une usine de composite peut être obtenue, avec les nouvelles racines transgéniques poilues qui sortent d’un type sauvage pousses. Alternativement, poilus racines transformées peuvent croître autonome in vitro dans les médias avec apports de sources de carbone. L’utilisation de a. rhizogenes , au lieu de a. tumefaciens pour produire des tissus transgéniques gagne en pertinence lorsque la racine est l’organe cible, parce que la régénération des plantes n’est pas nécessaire et il est donc plus rapide et moins coûteuse. Des études antérieures ont démontré cette méthodologie a ouvert pour la caractérisation phénotypique de la racine des gènes spécifiques6,7,8,9.
La pomme de terre (Solanum tuberosum) est la quatrième plus importante récolte dans le monde selon l’alimentation et l’Agriculture Organization (FAO) de l’ONU, étant donné que le tubercule a pertinence nutritionnelle pour la consommation humaine pour être une bonne source de vitamines et des minéraux. Pour cette raison, la pomme de terre a été mis à l’honneur de la biotechnologie agricole et aussi est considéré comme un bon modèle biologique pour la génétique et le développement d’études de10,11. Transformation de la pomme de terre a grandement contribué à la compréhension des mécanismes moléculaires des tissus sous-jacents subérifiées grâce à la caractérisation des gènes impliqués dans la subérine et cire biosynthèse12,13,14 ,15,16,17, subérine monomère transport18 et transcription règlement19. Le gène de subérine féruloyl transférase, ESF, est l’un de ces gènes de biosynthèse caractérisées ; la diminution de l’expression donne lieu à une forte altération de la protection périderme, qui est corrélée à une forte diminution des esters férulate de subérine et cires de tubercules de pommes de terre14. En même temps, dans les racines et les graines de l’Arabidopsis, la partie détachable de son putatif orthologue (ASFT/RWP1) a également démontré son rôle dans la production de ferulates d’alkyle en subérine20,21. En pomme de terre, la ligne de transcriptional journaliste FHT et l’anticorps FHT ont montré respectivement que l’activité du promoteur et les protéines sont trouvent dans l’exoderme, l’endoderme, les phellogène-dérivés et tissus blessés15.
Dans ce travail, nous détaillons un protocole à l’aide d’a. rhizogenes pour produire des racines velues transgéniques qui sont conservés dans un tournage de type sauvage, centrales de composite de pommes de terre ou excisées pour se développer de manière autonome in vitro. Nous fournissons également le protocole à l’aide d’a. tumefaciens afin d’obtenir des plantes de pomme de terre transgénique complet. Une étude de cas, a. rhizogenes et a. tumefaciens transformée avec le même vecteur binaire servent à obtenir des racines avec le promoteur FHT conduite d’expression du gène rapporteur GUS . Les résultats sont publiés et comparés.

<table><tbody><tr><td> acétone </td><td> Panreac </td><td> 1.310.071.21 </td><td></td></tr><tr><td> acétosyringone </td><td> Acros </td><td> 115540050 </td><td></td></tr><tr><td> Pompe d’aquarium </td><td> Prodac </td><td> MP350 </td><td></td></tr><tr><td> Autoclave </td><td> Ragpa Strelimatic </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> Gélose bactériologique </td><td> Lab Conda </td><td> 1800 </td><td></td></tr><tr><td> BAP </td><td> Duchefa </td><td> B0904 </td><td></td></tr><tr><td> Extrait de bœuf </td><td> Lab Conda < </td><td> p>1700 </td><td></td></tr><tr><td> Armoire de culture des plantes </td><td> Nuaire </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> Carbenicilline </td><td> Duchefa </td><td> C0109 </td><td></td></tr><tr><td> céfotaxime sodique </td><td> Duchefa </td><td> C0111 </td><td></td></tr><tr><td> DMSO </td><td> Merck </td><td> 1029310161 </td><td></td></tr><tr><td> Ecotron infors </td><td> HT </td><td> 29378 </td><td></td></tr><tr><td> éthanol </td><td> Merck </td><td> 1 009 831 011 </td><td></td></tr><tr><td> Falcon tube </td><td> Control tecnica </td><td> CFT011500 </td><td></td></tr><tr><td> Ferricyanate </td><td> Sigma </td><td> 101001081 < </td><td></td></tr> p <tr><td> >Ferrocyanate </td><td> Sigma </td><td> 100979088 </td><td></td></tr><tr><td> Flacon (8,06 cm de diamètre et 11,3 cm de hauteur) et couvercle en plastique pour culture in vitro </td><td> Apiglass </td><td> ref16 </td><td></td></tr><tr><td> GA3 </td><td> Sigma </td><td> G7645 < </td><td></td></tr><tr><td> p>Gamborg B5 media </td><td> Duchefa </td><td> G0210 </td><td></td></tr><tr><td> Gelrite </td><td> Duchefa </td><td> G1101 </td><td></td></tr><tr><td> Glucosa </td><td> Sigma </td><td> G5767 </td><td></td></tr><tr><td> Kanamycin </td><td> Sigma </td><td> K1377 </td><td></td></tr><tr><td> Leukopor tape </td><td> BSN Leukopor </td><td> BDF47467 </td><td></td></tr><tr><td> Lupe </td><td> Wild-Heerbrugg </td><td> M420 </td> <td></td></tr><tr><td>Agitateur magnétique </td><td> Agimatic </td><td> 7000243 </td><td></td></tr><tr><td> hydrate de MES </td><td> Sigma </td><td> M2933-25G </td><td></td></tr><tr><td>MgSO4</td><td> Panreac </td><td> 131404 </td><td></td></tr><tr><td> Microscope </td><td> Olympus </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> Minufugue centrifuge 5415R </td><td> Eppendorf </td><td> < </td><td></td></tr><tr><td> p>Murashige et Skoog media </td><td> Duchefa </td><td> M0254.0050 </td><td></td></tr><tr><td>Na2HPO4 <</td><td>p>Panreac </td><td> 131679 </td><td></td></tr><tr><td> NAA </td><td> Duchefa </td><td> N0903 </td><td></td></tr><tr><td> NaCl </td><td> Panreac </td><td> 131659 </td><td></td></tr><tr><td>NaH2PO4</td><td> Sigma <td> >58282 </td> <<td></td></tr><tr><td>p>NightSea Stereo </td><td> SFA Moonting Adapter </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> Parafilm < </td><td> p>Anorsa </td><td> PRFL-001-001 </td><td></td></tr><tr><td> Peptone </td><td> Lab Conda </td><td> 1616 </td><td></td></tr><tr><td> Boîtes de Pétri (90 x 14) </td><td> Anorsa < </td> p <td> >200200 </td><td></td></tr><tr><td> pHmetre </td><td> Crison < </td><td> p> </td><td></td></tr><tr><td> Phytotron </td><td> Inkoa </td><td> RFTI-R5485 </td><td></td></tr><tr><td> Gélose végétale </td><td> Duchefa </td><td> P1001 </td><td></td></tr><tr><td> Refrigeratot </td><td> Liebherr Medline </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> rifampicine<</td><td> > Duchefa </td><td> R0146 </td><td></td></tr><tr><td> Spectinomycine </td><td> Sigma </td><td> 59007 </td><td></td></tr><tr><td> Spectrophotomètre </td><td> Shimadzu </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> Plaques carrées (120 x 120) </td><td> Deltalab < </td><td> p>200204 </td><td></td></tr><tr><td> Streptomycine </td><td> Sigma </td><td> S6501 </td><td></td></tr><tr><td> Saccharose </td><td> Panréac </td><td> 131621 </td><td></td></tr><tr><td> Lames chirurgicales </td><td> Swann-Morton </td><td> 201 </td><td></td></tr><tr><td> Aiguille chirurgicale </td><td> NIPRO </td><td> 015/0204 </td><td></td></tr><tr><td> Triptone </td><td> Lab Conda </td><td> 1612 </td><td></td></tr><tr><td> Triton </td><td> Serva </td><td> 37240 </td><td></td></tr><tr><td> Unimax 1010 shaker </td><td> Heidolph </td><td> </td><td></td></tr><tr><td> vide </td><td> Dinko < </td><td> p> < </td><td></td></tr><tr><td> p>x-GlcA (acide 5-Bromo-4-chloro-3-indoxyl-bêta-D-glucuronique, sel de sodium anhydre) </td><td> Biosynth < </td><td> p>B-7398 </td><td></td></tr><tr><td> Extrait de levure </td><td> Lab Conda </td><td> 1702.00 </td><td></td></tr><tr><td> zéatine riboside </td><td> Sigma </td><td> 1001042850 </td><td></td></tr></tbody></table>

agrobacterium tumefaciens et agrobacterium rhizogenes-mediated transformation des pommes de terre et de l’activité du promoteur d’un gène de subérine par gus staining

Agrobacterium tumefaciens and Agrobacterium rhizogenes-Mediated Transformation of Potato and the Promoter Activity of a Suberin Gene by GUS Staining

Agrobacterium SP est l’une des méthodes plus largement utilisées pour obtenir des plantes transgéniques, car il a la capacité de transférer et d’intégrer son propre ADN-T dans le génome de la plante. Nous présentons ici les deux systèmes de transformation pour modifier génétiquement les plantes de pomme de terre (Solanum tuberosum). Dans la transformation d’a. tumefaciens , feuilles sont infectées, les cellules transformées sont sélectionnés et une nouvelle usine de transformation complète est régénérée en utilisant les phytohormones à 18 semaines. Dans la transformation d’a. rhizogenes , tiges sont infectés par la bactérie l’injection avec une aiguille, nouvelles racines velues transformés son apparition sont détectés à l’aide d’un marqueur fluorescent rouge et les racines non transformées sont supprimés. 5-6 semaines, la plante qui en résulte est un composite d’un tournage de type sauvage avec racines velues transformés entièrement développées. Pour augmenter la biomasse, les racines velues transformés peuvent être excisés et se propage. Nous avons appliqué les deux méthodes de transformation Agrobactérie -médié afin d’obtenir des racines exprimant le gène rapporteur GUS pilotée par un promoteur du gène biosynthétique de subérine. La procédure de marquage de GUS est fournie et permet la localisation cellulaire de l’induction du promoteur. Dans les deux méthodes, les racines de pommes de terre transformées ont montré GUS coloration dans l’endoderme subérifiée et l’exoderme et en outre, dans les racines de a. rhizogenes transformé l’activité GUS a aussi été détecté dans l’émergence des racines latérales. Ces résultats suggèrent qu’a. rhizogenes peut être un outil rapide alternatif pour étudier les gènes qui sont exprimés dans les racines.

Agrobacterium rhizogenes -médiée par la transformation de la pomme de terre
Dans ce manuscrit, la procédure étape par étape, mises en place pour obtenir des racines transformées avec a. rhizogenes est présentée. La figure 1 présente une vue d’ensemble de la procédure, qui prend au total environ 5-6 semaines (de l’injection d’a. rhizogenes ...

Nous présentons ici deux protocoles pour transformer les plantes de pomme de terre. La transformation par Agrobacterium tumefaciens mène à une plante transgénique complète tandis que l' Agrobacterium rhizogenes produit transgéniques racines velues lors d’un shooting de type sauvage pouvant être autonome propagés. Ensuite, nous détectons activité du promoteur par GUS coloration dans les racines transformées.

Agrobacterium tumefaciens et Agrobacterium rhizogenes-Mediated Transformation des pommes de terre et de l’activité du promoteur d’un gène de subérine par GUS Staining

Agrobacterium sp. is one of the most widely used methods to obtain transgenic plants as it has the ability to transfer and integrate its own T-DNA into ...

La transformation à base d’agrobactéries est une méthode facile pour produire des plants de pommes de terre génétiquement modifiés. Afin de comprendre les fonctions génétiques spécifiques et leur contribution à la physiologie des organes. La transformation par agrobactérie rhizogenes est un outil robuste pour évaluer rapidement les racines du fonctionnement des gènes, car des résultats similaires peuvent être obtenus par la transformation des tuméfaciens agrobactériens.Sandra Fernandez-Pinan, post-doc, et Jennifer Lopez, étudiante en maste5r de notre laboratoire, démontreront cette procédure. Commencez par cultiver une seule colonie d’agrobactéries pendant la nuit dans cinq millilitres de bouillon d’extrait de levure, ou milieu YEB, complété par des antibiotiques dans un tube de centrifugeuse de 50 millilitres à 28 degrés Celsius, à 200 rotations par minute. Pour une transformation a-tumefaciens, mesurer la densité optique le lendemain matin.Lorsque la densité optique à 600 nanomètres, ou OD 600 atteint 0,6 pour un, centrifugeuse d’un millilitre de la culture agrobactérienne et de resuspendre la pastille dans un millilitre de milieu frais YEB sans antibiotiques. Après le deuxième lavage, resuspendez la pastille dans le milieu frais de YEB sans antibiotiques, à la concentration appropriée pour obtenir un OD final 600 de 0,8, et placez les cellules bactériennes sur la glace. Pour la transformation des plantes à l’aide d’A.rhizogenes, transférez soigneusement une plante donneuse d’une culture moyenne 2MS à une plaque carrée de 120 x 120 millimètres, et utilisez une aiguille chirurgicale pour injecter trois microlitres d’une culture A.rhyzogenes à différentes internodes souches que possible.Ensuite, transférez immédiatement l’ensemble de la plante dans une nouvelle plaque carrée contenant du milieu solide de SP, complétée par de l’acétosyringone de 0,1 millimlaire. Après avoir placé une deuxième plante sur la même plaque, transformée de la même manière, sceller la plaque avec du ruban chirurgical, et placer la plaque verticalement à l’intérieur d’une armoire de croissance pendant quatre jours. Transférer la plante dans une plaque carrée avec un milieu de SP complété avec du sodium cefotaxime pour tuer les A.rhizogenes et placer la plaque scellée verticalement à l’intérieur d’une armoire de croissance pendant quatre jours.Après 10 à 12 jours, de nouvelles racines poilues apparaîtront. Leur transformation peut être confirmée par microscope stéréo fluorescent. À cette époque, exciser les racines indigènes de chaque plante, et transférer les plantes dans une nouvelle plaque carrée avec milieu MS, complétée par du sodium cefotaxime pour tuer les A.rhizogenes.Pour obtenir une plante composite, laissez pousser les racines poilues transgéniques pendant encore trois à quatre semaines dans le milieu de la SP, complétées par du sodium cefotaxime. Pour la transformation des plantes à l’aide d’A.tumefaciens. Couper et placer une feuille d’une plante de trois à quatre semaines dans une boîte de Pétri, et utiliser un scalpel pour faire une à trois coupes transversales du centre de la feuille aux bords sans couper les morceaux de la feuille.et d’exclure le pétiole. Placez immédiatement la feuille dans une boîte de Pétri contenant 10 millilitres de liquide frais 2MS moyen, côté abaxial vers le haut, et couvrir l’assiette. Ajouter rapidement 80 microlitres de la culture A.tumefaciens au milieu liquide et remuer doucement le milieu pendant une minute pour répartir homogènement la solution bactérienne.Ensuite, sceller soigneusement et couvrir la plaque de papier d’aluminium pour une incubation de deux jours dans une chambre de 24 degrés Celsius. À la fin de la période de transformation, transférer les feuilles abaxial-côté vers le haut, vers le milieu induisant indifféreux, gratté avec des pinces pour une incubation d’une semaine dans l’armoire de croissance. À la fin de l’incubation, transférer les feuilles, côté abaxial vers le haut, sur un milieu induisant des pousses grattées à la pince à épiler, et incuber les feuilles dans une armoire de croissance.Lorsque les chutes émergées sont d’environ deux centimètres de haut, couper trois chutes émergentes de chaque calleux. Placez jusqu’à cinq événements différents de transformation de chute en flacons de culture individuels contenant le milieu de MG complété avec le sodium de cefotaxime pour permettre l’enracinement, et étiquetez le sous-ensemble comme approprié pour une incubation de trois à quatre semaines dans l’armoire de croissance jusqu’à ce que les chutes soient vigoureuses. À la fin de l’incubation, sélectionnez la plante la plus vigoureuse de chaque événement et coupez les segments apicals de la goulotte de trois à quatre internodes de chaque plante.Placez les segments dans un flacon de culture contenant 2MS moyen complété avec du sodium cefotaxime et faire pousser les plantes jusqu’à ce qu’ils développent des chutes vigoureuses et des racines. Pour effectuer un test génétique de journaliste histochimique bêta-glucuronidase ou GUS, fixez les racines d’une culture végétale in vitro de deux à trois semaines avec de l’acétone réfrigérée à 90 % pendant 20 minutes sur la glace. À la fin de la fixation, laver les racines deux fois dans de l’eau distillée et traiter les racines avec une solution de coloration gus fraîche sous vide pendant 20 minutes.À la fin du traitement sous vide, placez les racines à 37 degrés Celsius dans l’obscurité pendant environ quatre heures. Lorsqu’une couleur bleue est visible, lavez les racines deux fois avec 70 % d’éthanol et visualisez la coloration sous un microscope à champ lumineux. Les racines poilues transformées présentent une florescence rouge lorsqu’elles sont éclairées par la lumière verte, tandis que l’agrobactérie non transformée de contrôle négatif ne démontre aucune florescence de ce genre, indiquant l’adéquation du marqueur de transformation rouge DS pour identifier les racines poilues transgéniques.Ici, les taches gus dans les racines des plantes transgéniques obtenues par A.tumefaciens et les racines poilues transgéniques obtenues par A.rhizogenes sont montrées. Comme on l’a observé, les racines transformées avec A, tumefaciens et cultivées in vitro, démontrent la coloration bleue dans l’endoderme, une couche cellulaire entre le cortex et la stèle. Dans les racines plus développées, l’étiquetage bleu est inégal dans la couche externe, correspondant à l’exodermis.Dans les racines poilues transformées obtenues par A.rhizogenes, et cultivées en culture hydroponique, le marqueur GUS est spécifiquement situé dans l’endoderme dans l’émergence de racines latérales dans les zones blessées et dans l’exodermis. En plus d’être une méthode rapide, les racines transgéniques obtenues avec l’agrobactérie rhizogenes ont également transporté l’ADN du plasmide induisant la racine, qui peut déréglementer certains processus directement contrôlés. Les racines poilues transgéniques obtenues avec des rhizogenes agrobactériens peuvent être maintenues pendant qu’elles tirent, mais peuvent alternativement être sur place jusqu’à ce qu’elles se propagent in vitro pour une production massive de transit.La transformation de la pomme de terre fournit un bon outil pour vérifier la fonction génique et l’activation du promoteur, ainsi que pour produire des règles méthodologiques chez une espèce d’intérêt agronomique élevé. L’organisme génétiquement modifié doit être jeté en toute sécurité après utilisation pour éviter la contamination de l’environnement. En outre, la solution de gaz contient dérivé toxique de cyanure, ainsi portez la protection et jetez la solution sans risque.

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Agrobacterium tumefaciens et Agrobacterium rhizogenes-Mediated Transformation des pommes de terre et de l’activité du promoteur d’un gène de subérine par GUS Staining (Vidéo) | JoVE Journal

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