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DOI: 10.3791/59630-v
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Cette approche moléculaire pour déterminer la forme physique bactérienne facilite la détection précise et précise des micro-organismes à l'aide de codes-barres d'ADN génomique uniques qui sont quantifiés par l'intermédiaire du PCR numérique. Le protocole décrit le calcul de l'indice concurrentiel des souches de Salmonella; cependant, la technologie est facilement adaptable aux protocoles exigeant la quantification absolue de n'importe quel organisme génétiquement malléable.
Cette technique permet une quantification précise et précise des micro-organismes à partir d’une population mixte de souches très similaires utilisant des techniques moléculaires rapides et à haut débit. En fin de compte, en permettant des comparaisons de la condition physique à faire entre les souches. La capacité d’évaluer simultanément de nombreuses souches dans un seul pool réduit considérablement la variabilité bien-à-puits ou d’organisme à organisme parce que toutes les souches sont exposées exactement aux mêmes conditions.
L’adaptabilité de cette technique lui permet d’être utilisé pour presque n’importe quel organisme génétiquement malléable et presque n’importe quelle conception expérimentale qui nécessite une quantification précise des microbes. Commencez cette procédure par l’ingénierie de marqueurs génétiques sur les chromosomes bactériens, tel que décrit dans le protocole de texte. Créez un pool d’ADN génomique qui contient tous les codes à barres sauf un.
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