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DOI: 10.3791/60646-v
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This protocol demonstrates an algorithm for testing the efficacy of targeted therapies based on the genomic makeup of tumors. It includes the identification of structural DNA rearrangements and the engraftment of patient tumors into mice for drug response testing.
Ici, nous présentons un protocole pour tester l’efficacité des thérapies ciblées sélectionnées basées sur la composition génomique d’une tumeur. Le protocole décrit l’identification et la validation des réarrangements structurels d’ADN, l’engraftment des tumeurs des patients dans les souris et les réponses d’essai aux drogues correspondantes.
Le protocole décrit ici vise à démontrer un algorithme pour tester l’efficacité du traitement à l’aide de modèles de cancer in vivo. Le protocole se compose d’une combinaison de plusieurs techniques. Le bio-séquençage du génome entier des spécimens de tumeurs humaines est utilisé pour identifier les altérations génomiques.
Il s’agit à la fois de réarrangements génétiques et de changements de numéro de copie génétique. Ainsi, l’analyse des altérations identifiées est effectuée afin de sélectionner les changements potentiellement médicamentables. Les médicaments sélectionnés sur la base de l’analyse génomique sont ensuite utilisés pour le traitement in vivo des tumeurs correspondantes cultivées chez les souris immunocompromisées.
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