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DOI: 10.3791/60990-v
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Nous présentons un flux de travail librement disponible construit pour l’exploration rapide et l’analyse précise des corps cellulaires dans des compartiments cellulaires spécifiques dans des images de microscopie de fluorescence. Ce flux de travail convivial est conçu sur le logiciel open-source Icy et utilise également les fonctionnalités ImageJ. Le pipeline est abordable sans connaissance dans l’analyse d’image.
L’analyseur de sous-structure est un workflow convivial qui effectue l’analyse automatique de plusieurs mesures de microscopie de processus. Cela ne signifie pas zéro tonne de logiciels open source glacé et aussi en utilisant les fonctionnalités de la machine. Fait important, ce flux de travail est abordable resort produire des connaissances et l’analyse des images.
Les images multicanaux sont chargées dans le flux de travail et pré-traitées afin d’améliorer le rapport signal/bruit et d’éliminer l’imagerie ou les défauts. Ensuite, la segmentation de l’image isole les régions d’intérêt, également connues sous le nom d’IA de l’arrière-plan. Plusieurs méthodes de segmentation sont disponibles en fonction du niveau de regroupement et de la nature des objets d’intérêt.
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