Analyse multiplexée de l’expression génique rétinienne et de l’accessibilité de la chromatine à l’aide de scRNA-Seq et scATAC-Seq
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12 mars 2021
DOI :10.3791/62239-v
12 mars 2021
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1Solomon H. Snyder Department of Neuroscience, Johns Hopkins University School of Medicine, 2Department of Psychiatry and Behavioral Science, The Johns Hopkins Hospital, 3Department of Ophthalmology, The Johns Hopkins Hospital, 4Department of Neurology, The Johns Hopkins Hospital, 5Institute for Cell Engineering, Johns Hopkins University School of Medicine, 6Kavli Neuroscience Discovery Institute, Johns Hopkins University School of Medicine
* These authors contributed equally
Ici, les auteurs démontrent l’utilité de MULTI-seq pour le phénotypage et les scRNA-seq et scATAC-seq appariés ultérieurs dans la caractérisation des profils d’accessibilité transcriptomique et chromatine dans la rétine.
Chapters in this video
0:04
Introduction
0:47
Cell Barcoding
3:23
Paired scRNA-seq and scATAC-seq
4:40
Results: Multiplexed Analysis Using scRNA-Seq and scATAC-Seq for Characterization of Cell Origin, Phenotype and Gene Regulatory Networks
5:45
Conclusion
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