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Évaluation de la résection finale globale de l’ADN double brin à l’aide du marquage BrdU-ADN coup...
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Biology
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JoVE Journal Biology
Assessment of Global DNA Double-Strand End Resection using BrdU-DNA Labeling coupled with Cell Cycle Discrimination Imaging

Évaluation de la résection finale globale de l’ADN double brin à l’aide du marquage BrdU-ADN couplé à l’imagerie de discrimination du cycle cellulaire

Full Text
4,661 Views
06:44 min
April 28, 2021

DOI: 10.3791/62553-v

Julia O'Sullivan*1,2, Sofiane Y. Mersaoui*1,2, Guy Poirier2,3, Jean-Yves Masson1,2

1Oncology Division,Genome Stability Laboratory, CHU de Québec Research Center, HDQ Pavilion, 2Department of Molecular Biology, Medical Biochemistry, and Pathology,Laval University Cancer Research Center, 3Oncology Division,CHU de Québec Research Center, CHUL Pavilion

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a detailed protocol to visualize DNA double-strand end resection in the S/G2 phases of the cell cycle, utilizing an immunofluorescence-based approach in HeLa cells. The method enables quantification of DNA damage responses post-irradiation, specifically focusing on the dynamics of resection during the initial stages of homologous recombination.

Key Study Components

Research Area

  • DNA damage response and repair mechanisms
  • Cell cycle regulation
  • Immunofluorescence microscopy techniques

Background

  • Understanding DNA repair is crucial for insights into cancer biology and genetic stability.
  • Double-strand breaks in DNA are critical lesions that trigger repair pathways.
  • The S and G2 phases are key periods for studying DNA resection processes.

Methods Used

  • Immunofluorescence staining for visualization of DNA resection foci.
  • HeLa cells as the biological model system.
  • CellProfiler software for image analysis and quantification of foci.

Main Results

  • The protocol effectively distinguishes between short-range and long-range DNA resection processes.
  • Quantification revealed significant differences in BrdU foci intensity based on cell cycle phase and PARP-1 knockdown.
  • Demonstrated the relevance of protein interactions in early homologous recombination.

Conclusions

  • This study provides a robust method for studying DNA damage repair mechanisms, particularly in relation to cell cycle dynamics.
  • The findings have implications for understanding the molecular basis of genetic stability and cancer therapy.

Frequently Asked Questions

What are the key phases of the cell cycle discussed in this study?
The S and G2 phases are the main focus in relation to DNA double-strand end resection.
What type of microscopy technique is used in this protocol?
An immunofluorescence-based microscopy technique is employed to visualize DNA lesions.
What cell line is utilized for this study?
HeLa cells are the biological model used in this research.
How does the knockdown of PARP-1 affect DNA resection?
Knockdown of PARP-1 results in an increase in BrdU foci intensity, indicating enhanced DNA resection.
What software is used for image analysis?
CellProfiler software is used for analyzing and quantifying the images obtained from the protocol.
What is the significance of PCNA in this study?
PCNA is used to identify cells in the S phase and assess the dynamics of DNA repair.
What is the potential impact of this research?
The results could provide insights into the mechanisms of DNA repair, contributing to advancements in cancer research and therapies.

Dans le présent protocole, nous montrons comment visualiser la résection de l’extrémité double brin de l’ADN pendant la phase S/G2 du cycle cellulaire à l’aide d’une méthode basée sur l’immunofluorescence.

Ce protocole permet la quantification cellulo de l’ADN et la résection suite à des dommages à l’ADN. Le principal avantage de cette technique est le marquage du cycle cellulaire qui limite les cellules à la phase S et G2, garantissant que le signal de bromodéoxyuridine résulte de l’ADN et de la résection. Jean-Yves Masson, chercheur principal, et Sofiane Y.Mersaoui, chercheur postdoctoral, feront la démonstration de la procédure.

En travaillant sous une hotte stérile, placez un seul couvercle dans chaque puits d’une plaque de six puits pour autant de conditions que nécessaire. Plaquez environ 150 000 cellules HeLa pour la transfection ou le traitement médicamenteux. Le troisième jour, après l’incubation de nuit avec BrdU à une concentration finale de 10 micromolaires, irradier les plaques avec une dose totale de cinq gris d’irradiation aux rayons X.

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