Une procédure normalisée pour la surveillance des proliférations d’algues nuisibles au Chili par analyse par métacodage à barres

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26 août 2021

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Kyoko Yarimizu¹ , So Fujiyoshi¹ , Mikihiko Kawai² , Jacquelinne J. Acuña³ , Joaquin-Ignacio Rilling³ , Marco Campos³ , Jonnathan Vilugrón⁴ , Henry Cameron⁵ , Karen Vergara⁶ , Gonzalo Gajardo⁶ , Oscar Espinoza-González⁴ , Leonardo Guzmán⁴ , Satoshi Nagai⁷ , Carlos Riquelme⁵ , Milko A. Jorquera³ , Fumito Maruyama¹

¹Office of Research and Academia-Government-Community Collaboration, Hiroshima University, ²Graduate School of Human and Environmental Studies, Kyoto University, ³Scientific and Biotechnological Bioresource Nucleus, Universidad de La Frontera, ⁴Centro de Estudios de Algas Nocivas, Instituto de Fomento Pesquero, ⁵Ciencias del Mar y Recursos Biologicos, Universidad de Antofagasta, ⁶Departamento de Ciencias Biológicas y Biodiversidad, Universidad de Los Lagos, ⁷Japan Fisheries Research and Education Agency, Fisheries Resources Institute

Ce protocole introduit des étapes d’analyse de métabarcodage, ciblant les gènes de l’ARNr 16S et de l’ARNr 18S, pour surveiller les proliférations d’algues nocives et leur microbiome associé dans les échantillons d’eau de mer. C’est un outil moléculaire puissant mais qui nécessite plusieurs procédures, qui sont expliquées visuellement ici étape par étape.