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JoVE Journal Biochemistry
Investigation of Microbial Cooperation via Imaging Mass Spectrometry Analysis of Bacterial Colonies Grown on Agar and in Tissue During Infection

Étude de la coopération microbienne par imagerie par spectrométrie de masse Analyse de colonies bactériennes cultivées sur gélose et dans les tissus pendant l’infection

Full Text
2,830 Views
09:49 min
November 18, 2022

DOI: 10.3791/64200-v

Jonathan T. Specker1, Alexander B. Smith2, Orlaith Keenan2, Joseph P. Zackular2,3, Boone M. Prentice1

1Department of Chemistry,University of Florida, 2Division of Protective Immunity,Children’s Hospital of Philadelphia, 3Department of Pathology and Laboratory Medicine, Perelman School of Medicine,University of Pennsylvania

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Une nouvelle méthode de préparation d’échantillons est démontrée pour l’analyse de macrocolonies bactériennes à base d’agar par spectrométrie de masse par imagerie par désorption/ionisation laser assistée par matrice.

Notre protocole permet de visualiser le métabolisme spatial des interactions microbiennes qui se produisent pendant l’infection. Nous avons développé ce flux de travail de spectrométrie de masse d’imagerie pour les co-cultures bactériennes cultivées sur gélose et modèles tissulaires. L’analyse de substrats non traditionnels tels que les cultures bactériennes cultivées sur gélose présente de nombreux défis.

En utilisant notre protocole, les échantillons bactériens peuvent être séchés de manière appropriée pour faciliter l’application de la matrice MALDI dans l’analyse ultérieure par spectrométrie de masse par imagerie. Cette méthode est largement applicable à une variété de métabolites, d’agents pathogènes microbiens ou de maladies, et de types d’échantillons pour lesquels une mesure spatiale de la biochimie cellulaire ou tissulaire est souhaitée, en particulier lors de l’étude de types d’échantillons nécessitant une déshydratation avant l’analyse. Après avoir préparé les macrocolonies de culture bactérienne, retirez du matériau d’emballage les colonies bactériennes d’agarose montées sur des lames de microscope revêtues d’ITO.

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