Analyses basées sur la pharmacologie comportementale et de réseau pour la médecine traditionnelle mongole Zadi-5 dans un modèle de dépression chez le rat

L’efficacité thérapeutique de Zadi-5 dans le traitement de la dépression peut être établie par des tests comportementaux, tandis que la pharmacologie en réseau peut prédire les mécanismes potentiels qui sous-tendent sa puissance. La pharmacologie en réseau peut soutenir l’exploration de médicaments traditionnels qui présentent des mécanismes d’action complexes et minimiser davantage le temps et les dépenses nécessaires à l’investigation. Des tests tels que le test en plein champ, le test de consommation de saccharose et le labyrinthe d’eau de Morris sont l’étalon-or pour évaluer l’appétit, les niveaux de motivation, la capacité d’apprentissage et la mémoire, dans des modèles animaux de troubles neurologiques.

Ces tests sont des méthodes d’évaluation simples, objectives et raisonnables. L’établissement d’un modèle animal est crucial pour comprendre les mécanismes pathologiques et les effets d’un nouveau médicament dans une étude sur le trouble dépressif. Pour établir un bon modèle de dépression, les chercheurs doivent séquencer et ajuster de manière appropriée l’intensité des stimuli.

Pour commencer, appliquez les stimuli de dépression sélectionnés, combinés à l’isolement, pendant 28 jours à tous les rats, à l’exception des témoins, et élevez les rats dans des cages individuelles. Pour effectuer le test en champ ouvert, divisez une boîte noire en neuf régions carrées de surface égale. Équipez la box d’un système d’analyse de suivi vidéo.

Un jour après le dernier gavage, placez le rat dans la case centrale et enregistrez ses activités horizontales et verticales pendant trois minutes. Ensuite, marquez le nombre de cases croisées avec toutes les pauses comme une activité horizontale, et notez la position debout et le toilettage comme une activité verticale. Après chaque test, nettoyez la boîte avec de l’alcool à 75 % pour éliminer l’odeur du rat pour les tests ultérieurs.

Ensuite, effectuez le test de consommation de saccharose en pesant les bouteilles respectives avant et après la consommation. Et calculez les taux de préférence de saccharose sur 60 minutes les jours zéro, sept, 14, 21 et 28 à l’aide de cette équation. Pour effectuer le test du labyrinthe d’eau de Morris, divisez la piscine en quatre quadrants.

Classez les quadrants de un à quatre et placez la plate-forme cachée dans le troisième quadrant, à un centimètre sous la surface de l’eau. Ajoutez du lait à la piscine pour un certain niveau d’opacité. Placez ensuite le sujet rat dans le labyrinthe dans différents quadrants pour chercher la plate-forme pendant 120 secondes.

Et enregistrez le temps de latence à l’aide du système d’analyse de traces vidéo Morris Water Maze. Placez le sujet rat dans une position fixe dans la piscine. Si le sujet ne trouve pas la plate-forme cachée en 120 secondes, enregistrez la latence de 120 secondes.

Ensuite, délogez la plate-forme, placez le rat dans l’eau et notez le nombre de passages de zone pendant 120 secondes. Parcourez la page Web de pharmacologie du système de médecine traditionnelle chinoise et entrez les graines de sperme myristicae, les racines al-glandia-radiks et le piperis longi fructus dans la section des noms d’herbes pour obtenir les noms des produits chimiques. Définissez l’indice pharmacocinétique de biodisponibilité orale, ou OB, sur un taux supérieur à 30 % et un indice de type médicament supérieur à 0,18.

Recherchez les composants actifs dans la pharmacopée de la médecine chinoise pour identifier les noms chimiques de chaque composant. Ensuite, recherchez les noms chimiques identifiés dans Pub Chem pour trouver les sourires isomères, ou l’encre. Identifiez les protéines cibles des composants actifs à l’aide de la prédiction de cibles SEA, Batman et Swiss avec des sourires isomères ou de l’encre, et trouvez les protéines qui se chevauchent.

Copiez les données dans un fichier Excel. Ensuite, recherchez et identifiez les cibles protéiques potentielles de la dépression en utilisant les mots-clés dépression et trouble dépressif dans GeneCards, DisGeNET et DrugBank. Copiez les données dans un fichier Excel.

Parcourez le diagramme de Venn et téléchargez les cibles de la dépression dans la première liste. Ensuite, téléchargez les cibles des composants actifs de Zadi-5 dans la liste deux et soumettez-les. Procurez-vous le diagramme de Venn et filtrez les cibles candidates qui se chevauchent.

Construisez une feuille de calcul, appelée réseau. Construisez également une feuille de calcul, appelée type. Exportez la feuille vers Cytoscape pour construire le réseau, Zadi-5 herbes ingrédients maladies cibles.

Définissez les cibles communes dans la base de données de chaînes pour analyser leurs interactions. Définissez le type de protéine comme homo sapiens. Définissez la valeur du seuil d’interaction sur 0,9 pour sélectionner uniquement les types vérifiés expérimentalement et ne pas afficher les nœuds d’île solitaire.

Ouvrez l’outil DAVID et collez les 86 cibles antidépressives potentielles de Zadi-5 dans le support d’analyse de départ pour étudier les voies de signalisation associées. Téléchargez le document sur le parcours des fûts. Sélectionnez les gènes de la voie PI3k-AKT à partir de l’analyse d’enrichissement et collez-les sur la feuille de calcul pour construire un document de type et de réseau.

Exportez le type de document réseau vers Cytoscape pour générer le réseau de voies de cibles composées visualisées PI3K-AKT. Le groupe d’animaux testés n’a montré aucune différence significative avant le stress léger chronique imprévu ou la stimulation CUMS. Après l’établissement du modèle CUMS, les scores verticaux et horizontaux du groupe étaient inférieurs à ceux du témoin.

Par rapport au groupe modèle, les scores verticaux et horizontaux des groupes témoins positifs et Zadi-5 étaient significativement plus élevés. Le jour zéro, les groupes testés n’avaient pas de différence significative dans la consommation de saccharose. Les groupes Zadi-5 et témoin positif étaient plus élevés que le groupe modèle au jour 28.

Dans le labyrinthe aquatique de Morris, la latence du groupe de modèles pour trouver la plate-forme était significativement plus élevée que celle du contrôle. La latence des groupes témoins positifs et Zadi-5 était plus faible que dans le groupe modèle. En ce qui concerne le nombre de passages à niveau dans les zones, le groupe modèle a montré moins de passages que le groupe témoin.

Les groupes témoins positifs et Zadi-5 ont montré plus de croisements que le groupe modèle. L’analyse du diagramme de Venn a révélé que 86 cibles se chevauchaient en tant que cibles critiques liées à la dépression de Zadi-5 sur les 1000 cibles protéiques liées à la dépression. Sur la base de ces résultats, les cibles de la maladie des ingrédients des herbes Zadi-5 et une analyse du réseau d’interaction protéine-protéine des candidats cibles ont été construites.

Selon l’analyse de la voie KEG, la voie de signalisation PI3K-AKT a été classée septième. Il était associé à de nombreuses voies de signalisation. Par conséquent, la voie PI3K-AKT a été considérée comme relativement plus importante que les autres voies d’enrichissement.

Lors de cette procédure, il est crucial de s’abstenir de répéter le même type de stimuli pendant des jours consécutifs. Suite aux analyses des composants de Zadi-5 dans les bases de données en ligne, la qualité de la validation peut être assurée par chromatographie liquide, spectrométrie de masse et spectroscopie par résonance magnétique nucléaire.