Analyse de l’hérédité épigénétique transgénérationnelle chez C. elegans à l’aide d’un rapporteur fluorescent et de l’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP)

Les recherches menées dans notre laboratoire examinent comment les protéines associées à la chromatine, les modifications des histones et les petits facteurs de voie de l’ARN fonctionnent ensemble dans le contexte du développement et de l’hérédité épigénétique transgénérationnelle. Le test d’hérédité de l’ARN, à l’aide d’un rapporteur GFP, est devenu un outil très puissant. Ce protocole décrit comment normaliser la préparation, le marquage et le passage des vers, ainsi que la préparation des échantillons ChIP, ce qui peut aider à générer des résultats reproductibles.

L’un des défis expérimentaux lors de l’étude des transgènes exprimés par la lignée germinale est d’isoler les effets dans la lignée germinale de l’animal. Nous utilisons actuellement des animaux entiers pour ChIP, mais à l’avenir, nous aimerions développer des tests pour examiner la chromatine, en particulier dans la lignée germinale. Notre laboratoire s’intéresse à la méthylation des histones et aux protéines qui reconnaissent ces marques.

À l’avenir, nous aimerions étudier l’interaction entre ces lecteurs de chromatine et les petites voies de l’ARN dans le contexte de l’hérédité de l’ARNi au niveau des transgènes et de la régulation des séquences endogènes.