Méthodes d’électroporation et de confirmation de transformation chez Limosilactobacillus reuteri DSM20016

L.Reuteri, et en particulier la souche, DSM20016 est un commensal intestinal humain robuste et naturel, très prometteur pour l’administration thérapeutique et la détection des maladies dans tout le tractus gastro-intestinal. Ce travail aidera à positionner DSM20016 en tant que châssis de biologie synthétique pour ce type d’applications. Les lactobacillales n’ont pas d’organisme modèle spécifique.

Les espèces préférées existent, mais elles sont généralement choisies avec un parti pris pour des objectifs de recherche particuliers. La variation au sein de la famille bactérienne a conduit à des protocoles fragmentés, certains avec des itérations de modifications remontant à travers les publications. Il est très difficile pour les personnes qui débutent de filtrer exactement ce qui est utile et ce qui ne l’est pas.

Un document pour la transformation de DSM20016 existe, mais il n’est pas moderne. Des protocoles modernes pour d’autres membres de la famille Lactobacillales existent, mais ils ne sont pas DSM20016. Ici, nous nous efforçons de fournir un ensemble complet de protocoles faciles à utiliser, centralisés, modernisés et complets pour l’électroporation DSM20016.

Cet ensemble de protocoles offre une modernisation substantielle par rapport au protocole d’exploration DSM20016 précédent, et élucide certains fils suspendus, tout en mettant l’accent sur des parties qui étaient auparavant moins claires. L’ensemble de protocoles est également complet, et spécifiquement pour DSM20016, une souche pour laquelle d’autres protocoles non DSM20016 ne sont pas totalement compatibles. L’un de nos principaux objectifs est d’utiliser les microbes comme capteurs et systèmes de livraison peu coûteux.

Nous travaillons avec des experts en maladies intestinales pour utiliser DSM20016 pour détecter les conditions dans le tractus gastro-intestinal et administrer des traitements au besoin.