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Préparation de graines de palmier dur pour l’analyse par spectrométrie de masse par désorption/io...
Préparation de graines de palmier dur pour l’analyse par spectrométrie de masse par désorption/io...
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Biochemistry
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JoVE Journal Biochemistry
Preparation of Hard Palm Seeds for Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization-Imaging Mass Spectrometry Analysis

Préparation de graines de palmier dur pour l’analyse par spectrométrie de masse par désorption/ionisation laser assistée par matrice

Full Text
1,509 Views
07:55 min
June 30, 2023

DOI: 10.3791/65650-v

Gabriel R. Martins*1,2, Felipe L. Brum*1,2,3, Davi Marconi Miranda Carvalho da Silva*1,2, Livia C. Barbosa3, Ronaldo Mohana-Borges3, Ayla Sant'Ana da Silva1,2

1Laboratório de Biocatálise (LABIC),Instituto Nacional de Tecnologia, 2Departamento de Bioquímica, Instituto de Química,Universidade Federal do Rio de Janeiro, 3Centro de Espectrometria de Massas de Biomoléculas, Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho,Universidade Federal do Rio de Janeiro

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Ce protocole visait à décrire des directives détaillées sur la préparation de sections d’échantillons de graines dures à faible teneur en eau pour l’analyse MALDI-IMS, en maintenant la distribution et l’abondance d’origine des analytes et en fournissant un signal de haute qualité et une résolution spatiale.

Nos recherches portent sur la valorisation de la biomasse végétale issue de la biodiversité tropicale. Pour cela, il est très important de bien caractériser ces matériaux afin de pouvoir leur donner le meilleur rapport qualité-prix et proposer les meilleures destinations. Pour cela, dans ce travail, nous utilisons l’analyse par spectrométrie de masse par imagerie MALDI comme technique de caractérisation car c’est une méthode très précise qui peut nous donner une imagerie moléculaire spécifique du tissu biologique.

Grâce aux résultats, nous pouvons avoir une vue d’ensemble des principaux composants de cette biomasse végétale et de leur localisation, ce qui peut guider notre exploration de nouveaux produits et processus à partir de ce matériau. Cependant, pour avoir une très bonne analyse par spectrométrie de masse d’images MALDI, il est très important d’avoir une bonne méthode de préparation des échantillons, et c’est exactement ce que nous décrivons dans ce travail. Les progrès technologiques ont entraîné de nombreux défis dans l’analyse par spectrométrie de masse par imagerie.

Les tissus végétaux, en particulier, posent un défi complexe en raison de leurs organes spécialisés. C’est crucial pour cette technique, cette préparation d’échantillons, si la préparation d’échantillons est effectuée de manière inadéquate, les signaux ne seront pas détectés ou des artefacts apparaîtront, ce qui entraînera des résultats inexacts. Ces protocoles nous permettent de préparer une fine tranche de graines de palmier résistantes à l’intestin, servant de preuve de concept pour la cartographie moléculaire dans un tissu de semence vivant.

Cette technique offre donc des informations précieuses sur les oligosaccharides présents dans ces graines. Nous espérons donc que cette technique sera utile aux chercheurs confrontés à des obstacles similaires. Cette technique peut aider à l’étude d’autres graines dures ou de tout autre matériel biologique qui impose un défi à couper en tranches de nageoires.

Par exemple, ce protocole peut être un outil pour l’étude du développement et de la germination des graines si l’on étudie une graine dure.

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Biochimie numéro 196 Préparation d’échantillons Matériaux botaniques Tranches minces Euterpe oleracea Cartographie moléculaire Graines Enrobage de gélatine Coupe de cryostat Dépôt de matrice Ionisation par électronébulisation Acide 2 5-dihydroxybenzoïque Solution de méthanol Acide trifluoroacétique E. precatoria E. edulis Profils de métabolites Oligomères d’hexose

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