Prédiction computationnelle des préférences en acides aminés de domaines de liaison à des peptides potentiellement multispécifiques impliqués dans des interactions protéine-protéine

Nous proposons un protocole pour la prédiction computationnelle des préférences en acides aminés dans des interactions protéine-protéine plus spécifiques. Ce protocole peut être considéré comme une première étape dans la conception de médiateurs de ces interactions. Nous nous intéressons à l’utilisation de ces médiateurs comme inhibiteurs potentiels d’interactions spécifiques, en immunologie.

Notre outil de mise en œuvre utilisé pour caractériser les préférences en acides aminés entre les sites de liaison spécifiques est coûteux et fastidieux. Notre protocole est une technologie bio-soutenue basée sur l’efficacité et les opérations en série. Cette stratégie a le potentiel de traiter un grand nombre de séquences de lignes, fournissant une différence complète et cohérente des préférences en acides aminés.