Hybridation in situ par fluorescence infrarouge photothermique optique (OPTIR-FISH)

Ici, nous présentons un protocole utilisant l’hybridation in situ par fluorescence infrarouge photothermique optique (OPTIR-FISH), également connue sous le nom de FISH PHOTOTHERMIQUE DANS L’INFRAROUGE MOYEN (MIP-FISH), pour identifier les cellules individuelles et comprendre leur métabolisme. Cette méthodologie peut être largement appliquée à diverses applications, notamment la cartographie du métabolisme cellulaire avec une résolution unicellulaire.

La portée de notre recherche est de développer et d’appliquer OPTIR-FISH pour identifier des cellules individuelles et analyser leur métabolisme au niveau de la cellule unique. Notre objectif est de comprendre comment les cellules individuelles interagissent dans un environnement complexe, et de comprendre leur physiologie et leurs routes. L’analyse du métabolisme au niveau des cellules individuelles, en particulier dans l’environnement natif, pourrait fournir des informations inestimables pour révéler les activités complexes hétérogènes dans les systèmes biologiques.

Cependant, la tâche concomitante de différencier l’identité cellulaire et d’élucider le métabolisme au niveau de la cellule unique reste un défi. Notre plateforme d’imagerie vibratoire avancée, Optical Photothermal Infrared offre l’étude du métabolisme d’une seule cellule. En même temps, il est naturellement très compatible avec l’hybridation in situ des forêts bien établies pour l’identification des espèces microbiennes.

Par conséquent, une intégration simple offre simultanément le métabolisme et l’identification à la même résolution d’imagerie.