Name: Évaluation glyco-qualitative rapide de protéines recombinantes à l’aide d’un système entièrement automatisé (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2024-06-28T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 19 s
Description: Découvrez l'analyse glyco-qualitative rapide de protéines recombinantes par un système entièrement automatisé utilisant des technologies à lectines. Cette méthode réduit la main-d'œuvre et facilite la découverte de biomarqueurs glycosylés spécifiques aux maladies.

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<meta charset="utf8"></head><body>Profilage automatisé des glycanes à base de lectines à l’aide d’un réseau de billes en une seule pointe (BIST)

<ol><li>Butler, M., Reichl, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+cell+expression+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Biochem+Eng+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Animal cell expression systems.</a> Adv Biochem Eng Biotechnol. 175, 1-36 (2021).</li>
<li>Silva, M. L. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chapter+One+-+Lectin+biosensors+in+cancer+glycan+biomarker+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Adv+Clin+Chem%22%5BJournal%5D)">Chapter One - Lectin biosensors in cancer glycan biomarker detection.</a> Adv Clin Chem. 93, 1-61 (2019).</li>
<li>Hiono, T., Nagai-Okatani, C., Kuno, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((4.07+-+Application+of+glycan-related+microarrays%5BTitle%5D)+AND+%22Comprehensive+Glycoscience+%28Second+Edition%29%22%5BJournal%5D)">4.07 - Application of glycan-related microarrays.</a> Comprehensive Glycoscience (Second Edition). , 134-148 (2021).</li>
<li>Shimazaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lectin+bead+array+in+a+single+tip+facilitates+fully+automatic+glycoprotein+profiling%29%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Lectin bead array in a single tip facilitates fully automatic glycoprotein profiling).</a> Anal Chem. 91 (17), 11162-11169 (2019).</li>
<li>Shimazaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((GlycoBIST%3A+A+System+for+automatic+glycan+profiling+of+a+target+protein+using+milli-bead+array+in+a+tip%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Protein+Sci%22%5BJournal%5D)">GlycoBIST: A System for automatic glycan profiling of a target protein using milli-bead array in a tip.</a> Curr Protoc Protein Sci. 99 (1), e103(2020).</li>
<li>Mahmood, T., Yang, P. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Western+blot%3A+Technique%2C+theory%2C+and+trouble+shooting%5BTitle%5D)+AND+%22N+Am+J+Med+Sci%22%5BJournal%5D)">Western blot: Technique, theory, and trouble shooting.</a> N Am J Med Sci. 4 (9), 429-434 (2012).</li>
<li>Bojar, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+useful+guide+to+lectin+binding%3A+machine-learning+directed+annotation+of+57+unique+lectin+specificities%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Chem+Biol%22%5BJournal%5D)">A useful guide to lectin binding: machine-learning directed annotation of 57 unique lectin specificities.</a> ACS Chem Biol. 17 (11), 2993-3012 (2022).</li>
<li>Nagai-Okatani, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((2.0%3A+An+integrated+visualization+for+lectin+microarray-based+mouse+tissue+glycome+mapping+data+with+lectin+histochemistry%5BTitle%5D)+AND+%22J+Proteome+Res%22%5BJournal%5D)">2.0: An integrated visualization for lectin microarray-based mouse tissue glycome mapping data with lectin histochemistry.</a> J Proteome Res. 20 (4), 2069-2075 (2021).</li>
<li>Geisler, C., Jarvis, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effective+glycoanalysis+with+Maackia+amurensis+lectins+requires+a+clear+understanding+of+their+binding+specificities%5BTitle%5D)+AND+%22Glycobiology%22%5BJournal%5D)">Effective glycoanalysis with Maackia amurensis lectins requires a clear understanding of their binding specificities.</a> Glycobiology. 21 (8), 988-993 (2011).</li>
<li>Noro, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((N+-glycan+structures+of+Wisteria+floribunda+agglutinin-positive+Mac2+binding+protein+in+the+serum+of+patients+with+liver+fibrosis%5BTitle%5D)+AND+%22Glycobiology%22%5BJournal%5D)">N -glycan structures of Wisteria floribunda agglutinin-positive Mac2 binding protein in the serum of patients with liver fibrosis.</a> Glycobiology. 31 (10), 1268-1278 (2021).</li>
<li>Rawitch, A. B., Pollock, H. G., Yang, S. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Thyroglobulin+glycosylation%3A+Location+and+nature+of+the+N-Linked+oligosaccharide+units+in+bovine+thyroglobulin%5BTitle%5D)+AND+%22Arch+Biochem+Biophys%22%5BJournal%5D)">Thyroglobulin glycosylation: Location and nature of the N-Linked oligosaccharide units in bovine thyroglobulin.</a> Arch Biochem Biophys. 300 (1), 271-279 (1993).</li>
<li>Dang, K., Zhang, W., Jiang, S., Lin, X., Qian, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+lectin+microarrays+for+biomarker+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Chemistry+Open%22%5BJournal%5D)">Application of lectin microarrays for biomarker discovery.</a> Chemistry Open. 9 (3), 285-300 (2020).</li>
<li>Chen, S., Qin, R., Mahal, L. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sweet+systems%3A+Technologies+for+glycomic+analysis+and+their+integration+into+systems+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Crit+Rev+Biochem+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Sweet systems: Technologies for glycomic analysis and their integration into systems biology.</a> Crit Rev Biochem Mol Biol. 56 (3), 301-320 (2021).</li>
<li>Dwivedi-Agnihotri, H., Srivastava, A., Shukla, A. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reversible+biotinylation+of+purified+proteins+for+measuring+protein-protein+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">Reversible biotinylation of purified proteins for measuring protein-protein interactions.</a> Methods Enzymol. 633, 281-294 (2020).</li>
<li>Shimazaki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Auto-lectin+dotcoding+by+two+octopuses%3A+Rapid+analysis+of+fluorescence-labeled+glycoproteins+by+an+8-channel+fully-automatic+bead+array+scanner+with+a+rolling-circle+detector%5BTitle%5D)+AND+%22Anal+Chem%22%5BJournal%5D)">Auto-lectin dotcoding by two octopuses: Rapid analysis of fluorescence-labeled glycoproteins by an 8-channel fully-automatic bead array scanner with a rolling-circle detector.</a> Anal Chem. 95 (32), 11868-11873 (2023).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0,2 mL 8 tubes PCR + bouchon plat</td><td>FastGene</td><td>FG-0028FC/SE</td><td>Pour la distribution et le stockage de réactifs de marquage à la biotine</td></tr><tr><td>2,0 mL SC Micro Tube protéine LB</td><td>SARSTEDT AG&Co. KG</td><td>72.694.600</td><td>Pour le chargement d’échantillons dans le logiciel d’analyse LuBEA-VIII</td></tr><tr><td></td><td>SAS Institute Inc.</td><td>JMP 17</td><td></td></tr><tr><td>Ioniseur antistatique. 110 volts</td><td>Plas-Labs</td><td>800-AS/SPI</td><td>À utiliser lors de l’insertion des billes dans l’embout BIST.</td></tr><tr><td>Pince à épiler antistatique NK2A</td><td>RUBIS&nbsp ;</td><td>9-5681-01</td><td>À utiliser lors de l’insertion des billes dans l’embout BIST.</td></tr><tr><td>Appareil automatisé de mesure de réaction</td><td>Precision System Science Co., Ltd.</td><td>LuBEA</td><td>Toutes les données de cette étude ont été obtenues à l’aide de LuBEA-VIII. Alors que LuBEA est commercialisé, LuBEA-VIII est actuellement en phase de développement. Le site Web pour les détails des produits LuBEA et LuBEA-VIII se trouve à l’URL suivante (https://www.pss.co.jp/english/technology/apit/bist02.html).</td></tr><tr><td>Biotine-(AC5)2 Sulfo-Osu</td><td>Dojindo</td><td>341-06801</td><td>Comme réactif de biotinilation</td></tr><tr><td>Perle d’espacement BIST - V-11</td><td>Precision System Science Co., Ltd.</td><td>F4938000</td><td>Diamètre :</td></tr><tr><td>pointe et gaine BIST</td> de 1 mm <td>Precision System Science Co., Ltd.</td><td>F4930-000</td><td>Remplissez cette pointe vide avec des billes.</td></tr><tr><td>Chlorure de calcium</td><td>Wako</td><td>039-00475</td><td>Pour la préparation de solutions tampons</td></tr><tr><td>Peut obtenir un signal Solution 2</td><td>TOYOBO</td><td>NKB-301</td><td>Ce réactif bloquant est bon pour cette méthode</td></tr><tr><td>Concentrateurs de vide de paillasse CentriVap</td><td>Labconco</td><td>7810010</td><td>Pour sécher le réactif de biotinilation. La substitution fournie par d’autres sociétés est possible.</td></tr><tr><td>Substrat Clarity Western ECL&nbsp ;</td><td>Bio-Rad</td><td>1705060</td><td>Pour mesurer les échantillons par LuVEA VIII</td></tr><tr><td>Piège à froid Série CentriVap</td><td>Labconco</td><td>7460040</td><td>Pour sec de réactif de biotinilation. La substitution fournie par d’autres sociétés est possible.</td></tr><tr><td>Glycine</td><td>Wako</td><td>077-00735</td><td>Pour la préparation des solutions tampons</td></tr><tr><td>Chlorure de manganèse(II) Tétrahydraté</td><td>Wako</td><td>139-00722</td><td>Pour la préparation des solutions tampons</td></tr><tr><td>Milli-Q référence MERCK</td><td></td><td>ZIQ7000T0C</td><td>Comme l’eau déionisée pour la dilution des réactifs et des</td></tr><tr><td>tampons PBS</td><td>Wako</td><td>162-19321</td><td>Pour la préparation des solutions tampons</td></tr><tr><td>Peroxydase Streptavidin</td><td>Jackson</td><td>016-030-084</td><td>Cet anticorps est bon pour l’analyse GlycoBIST. Il est utile pour la détection du western blot, bien que des substitutions puissent être fournies par d’autres sociétés.</td></tr><tr><td>Perle de sonde</td><td>Precision System Science Co., Ltd.</td><td>FP4936000</td><td>Pour préparer des billes fixées à la lectine. Voir Shimazaki, H. et al., Current Protocols in Protein Science, 2020 dans la section de référence pour plus de détails.</td></tr><tr><td>Tubes Protein LoBind 1,5 mL</td><td>Eppendorf</td><td>0030108442</td><td>Utiliser lors de la préparation des échantillons, comme la biotinylation.</td></tr><tr><td>Gel de silice (pour dessiccane)</td><td>Kanto chemical</td><td>37039-02</td><td>À utiliser lors du stockage de l’embout GlycoBIST et du réactif de biotinylation séché.</td></tr><tr><td>Feuille d’élimination de l’électricité statique M</td><td>TRUSCO NAKAYAMA</td><td>SD5050</td> À <td>utiliser lors de l’insertion des billes dans l’embout BIST.</td></tr><tr><td>SV Cartouche II</td><td>Daido Industrie Chimique</td><td>ED041</td><td>Pour la mesure des échantillons par LuVEA VIII</td></tr><tr><td>Table Microcentrifugeuse-CAPSULEFUGE</td><td>TOMY</td><td>PMC-060</td><td>Pour la déformation du mélange dans chaque processus</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Nacalai tesque</td><td>35501-15</td><td>Pour la préparation de solutions tampons</td></tr></tbody></table>

Évaluation glyco-qualitative rapide de protéines recombinantes à l’aide d’un système entièrement automatisé

Rapid Glyco-Qualitative Assessment of Recombinant Proteins Using a Fully Automated System

Protein glycosylation, a critical post-translational modification, influences the stability, efficacy, and immunogenicity of recombinant proteins, ...

rapid-glyco-qualitative-assessment-recombinant-proteins-using-fully

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