Name: Capture des ruptures de sites fragiles communes par γH2A natif. X ChIP (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-01-24T14:20:00.000+00:00
Duration: 9 min 46 s
Description: Découvrez une méthode native de ChIP γH2A.X pour détecter efficacement les ruptures de sites fragiles communs dans les cellules cancéreuses. Cette approche réduit le temps et la main-d'œuvre tout en garantissant une haute reproductibilité.

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<ol><li>Glover, T. W., Berger, C., Coyle, J., Echo, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+polymerase+alpha+inhibition+by+aphidicolin+induces+gaps+and+breaks+at+common+fragile+sites+in+human+chromosomes%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Genet%22%5BJournal%5D)">DNA polymerase alpha inhibition by aphidicolin induces gaps and breaks at common fragile sites in human chromosomes.</a> Hum Genet. 67 (2), 136-142 (1984).</li>
<li>Bignell, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Signatures+of+mutation+and+selection+in+the+cancer+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Signatures of mutation and selection in the cancer genome.</a> Nature. 463 (7283), 893-898 (2010).</li>
<li>Hellman, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+role+for+common+fragile+site+induction+in+amplification+of+human+oncogenes%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Cell%22%5BJournal%5D)">A role for common fragile site induction in amplification of human oncogenes.</a> Cancer Cell. 1 (1), 89-97 (2002).</li>
<li>Kotzot, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Parental+origin+and+mechanisms+of+formation+of+cytogenetically+recognisable+de+novo+direct+and+inverted+duplications%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Genet%22%5BJournal%5D)">Parental origin and mechanisms of formation of cytogenetically recognisable de novo direct and inverted duplications.</a> J Med Genet. 37 (4), 281-286 (2000).</li>
<li>Miller, C. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genomic+amplification+of+MET+with+boundaries+within+fragile+site+FRA7G+and+upregulation+of+MET+pathways+in+esophageal+adenocarcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">Genomic amplification of MET with boundaries within fragile site FRA7G and upregulation of MET pathways in esophageal adenocarcinoma.</a> Oncogene. 25 (3), 409-418 (2006).</li>
<li>Zack, T. I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pan-cancer+patterns+of+somatic+copy+number+alteration%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Pan-cancer patterns of somatic copy number alteration.</a> Nat Genet. 45 (10), 1134-1140 (2013).</li>
<li>Gao, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+fragile+sites+%28CFS%29+and+extremely+large+CFS+genes+are+targets+for+human+papillomavirus+integrations+and+chromosome+rearrangements+in+oropharyngeal+squamous+cell+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Chromosomes+Cancer%22%5BJournal%5D)">Common fragile sites (CFS) and extremely large CFS genes are targets for human papillomavirus integrations and chromosome rearrangements in oropharyngeal squamous cell carcinoma.</a> Genes Chromosomes Cancer. 56 (1), 59-74 (2017).</li>
<li>Thorland, E. C., Myers, S. L., Gostout, B. S., Smith, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+fragile+sites+are+preferential+targets+for+HPV16+integrations+in+cervical+tumors%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">Common fragile sites are preferential targets for HPV16 integrations in cervical tumors.</a> Oncogene. 22 (8), 1225-1377 (2003).</li>
<li>Matovina, M., Sabol, I., Grubisić, G., Gasperov, N. M., Grce, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+human+papillomavirus+type+16+integration+sites+in+high-grade+precancerous+cervical+lesions%5BTitle%5D)+AND+%22Gynecol+Oncol%22%5BJournal%5D)">Identification of human papillomavirus type 16 integration sites in high-grade precancerous cervical lesions.</a> Gynecol Oncol. 113 (1), 120-127 (2009).</li>
<li>Yu, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+viral+integration+in+the+development+of+cervical+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Genet+Cytogenet%22%5BJournal%5D)">The role of viral integration in the development of cervical cancer.</a> Cancer Genet Cytogenet. 158 (1), 27-34 (2005).</li>
<li>Bignell, G. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Signatures+of+mutation+and+selection+in+the+cancer+genome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Signatures of mutation and selection in the cancer genome.</a> Nature. 463 (7283), 893-898 (2010).</li>
<li>Thavathiru, E., Ludes-Meyers, J. H., MacLeod, M. C., Aldaz, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+common+chromosomal+fragile+site+genes%2C+WWOX%2FFRA16D+and+FHIT%2FFRA3B+is+downregulated+by+exposure+to+environmental+carcinogens%2C+UV%2C+and+BPDE+but+not+by+IR%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Carcinog%22%5BJournal%5D)">Expression of common chromosomal fragile site genes, WWOX/FRA16D and FHIT/FRA3B is downregulated by exposure to environmental carcinogens, UV, and BPDE but not by IR.</a> Mol Carcinog. 44 (3), 174-182 (2005).</li>
<li>Sirbu, B. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+protein+dynamics+at+active%2C+stalled%2C+and+collapsed+replication+forks%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Analysis of protein dynamics at active, stalled, and collapsed replication forks.</a> Genes Dev. 25 (12), 1320-1327 (2011).</li>
<li>Barlow, J. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+early+replicating+fragile+sites+that+contribute+to+genome+instability%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Identification of early replicating fragile sites that contribute to genome instability.</a> Cell. 152 (3), 620-632 (2013).</li>
<li>Petermann, E., Orta, M. L., Issaeva, N., Schultz, N., Helleday, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hydroxyurea-stalled+replication+forks+become+progressively+inactivated+and+require+two+different+RAD51-mediated+pathways+for+restart+and+repair%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell%22%5BJournal%5D)">Hydroxyurea-stalled replication forks become progressively inactivated and require two different RAD51-mediated pathways for restart and repair.</a> Mol Cell. 37 (4), 492-502 (2010).</li>
<li>Rogakou, E. P., Pilch, D. R., Orr, A. H., Ivanova, V. S., Bonner, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+double-stranded+breaks+induce+histone+H2AX+phosphorylation+on+serine+139%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139.</a> J Biol Chem. 273 (10), 5858-5868 (1998).</li>
<li>Shanbhag, N. M., Rafalska-Metcalf, I. U., Balane-Bolivar, C., Janicki, S. M., Greenberg, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATM-dependent+chromatin+changes+silence+transcription+in+cis+to+DNA+double-strand+breaks%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">ATM-dependent chromatin changes silence transcription in cis to DNA double-strand breaks.</a> Cell. 141 (6), 970-981 (2010).</li>
<li>Stiff, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ATR-dependent+phosphorylation+and+activation+of+ATM+in+response+to+UV+treatment+or+replication+fork+stalling%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">ATR-dependent phosphorylation and activation of ATM in response to UV treatment or replication fork stalling.</a> EMBO J. 25 (24), 5775-5782 (2006).</li>
<li>Nelson, J. D., Denisenko, O., Bomsztyk, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+chromatin+immunoprecipitation+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Fast chromatin immunoprecipitation assay.</a> Nuc Acids Res. 34 (5), e2(2006).</li>
<li>Dorbic, T., Wittig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+oligonucleosomes+from+active+chromatin+using+HMG17-specific+monoclonal+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Isolation of oligonucleosomes from active chromatin using HMG17-specific monoclonal antibodies.</a> Nuc Acids Res. 14 (8), 3363-3376 (1986).</li>
<li>Dorbic, T., Wittig, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+from+transcribed+genes+contains+HMG17+only+downstream+from+the+starting+point+of+transcription%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Chromatin from transcribed genes contains HMG17 only downstream from the starting point of transcription.</a> EMBO J. 6 (8), 2393-2399 (1987).</li>
<li>Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+direct+link+between+core+histone+acetylation+and+transcriptionally+active+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">A direct link between core histone acetylation and transcriptionally active chromatin.</a> EMBO J. 7 (5), 1395-1402 (1988).</li>
<li>Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Clayton, A. L., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+acetylation+and+globin+gene+switching%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Histone acetylation and globin gene switching.</a> Nuc Acids Res. 20 (5), 1017-1022 (1992).</li>
<li>Hebbes, T. R., Clayton, A. L., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Core+histone+hyperacetylation+co-maps+with+generalized+DNase+I+sensitivity+in+the+chicken+beta-globin+chromosomal+domain%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Core histone hyperacetylation co-maps with generalized DNase I sensitivity in the chicken beta-globin chromosomal domain.</a> EMBO J. 13 (8), 1823-1830 (1994).</li>
<li>Orlando, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mapping+chromosomal+proteins+in+vivo+by+formaldehyde-crosslinked-chromatin+immunoprecipitation%5BTitle%5D)+AND+%22Trend+Biochem%2C+Sci%22%5BJournal%5D)">Mapping chromosomal proteins in vivo by formaldehyde-crosslinked-chromatin immunoprecipitation.</a> Trend Biochem, Sci. 25 (3), 99-104 (2000).</li>
<li>Myers, F. A., Evans, D. R., Clayton, A. L., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Targeted+and+extended+acetylation+of+histones+H4+and+H3+at+active+and+inactive+genes+in+chicken+embryo+erythrocytes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Targeted and extended acetylation of histones H4 and H3 at active and inactive genes in chicken embryo erythrocytes.</a> J Biol Chem. 276 (23), 20197-20205 (2001).</li>
<li>Litt, M. D., Simpson, M., Recillas-Targa, F., Prioleau, M. N., Felsenfeld, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transitions+in+histone+acetylation+reveal+boundaries+of+three+separately+regulated+neighboring+loci%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+J%22%5BJournal%5D)">Transitions in histone acetylation reveal boundaries of three separately regulated neighboring loci.</a> EMBO J. 20 (9), 2224-2235 (2001).</li>
<li>Madisen, L., Krumm, A., Hebbes, T. R., Groudine, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+immunoglobulin+heavy+chain+locus+control+region+increases+histone+acetylation+along+linked+c-myc+genes%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">The immunoglobulin heavy chain locus control region increases histone acetylation along linked c-myc genes.</a> Mol Cell Biol. 18 (11), 6281-6292 (1998).</li>
<li>Clayton, A. L., Hebbes, T. R., Thorne, A. W., Crane-Robinson, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histone+acetylation+and+gene+induction+in+human+cells%5BTitle%5D)+AND+%22FEBS+Lett%22%5BJournal%5D)">Histone acetylation and gene induction in human cells.</a> FEBS Lett. 336 (1), 23-26 (1993).</li>
<li>Tseng, Z., Wu, T., Liu, Y., Zhong, M., Xiao, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+native+chromatin+immunoprecipitation+to+interrogate+histone+variant+protein+deposition+in+embryonic+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Using native chromatin immunoprecipitation to interrogate histone variant protein deposition in embryonic stem cells.</a> Methods Mol Biol. 1176, 11-22 (2014).</li>
<li>Durkin, S. G., Glover, T. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosome+fragile+sites%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Rev+Genetics%22%5BJournal%5D)">Chromosome fragile sites.</a> Ann Rev Genetics. 41, 169-192 (2007).</li>
<li>Lee, J. B., Keung, A. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+immunoprecipitation+in+human+and+yeast+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromatin immunoprecipitation in human and yeast cells.</a> Methods Mol Biol. 1767, 257-269 (2018).</li>
<li>Miyamoto, R., Yokoyama, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protocol+for+fractionation-assisted+native+ChIP+%28fanChIP%29+to+capture+protein-protein%2FDNA+interactions+on+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22STAR+Protoc%22%5BJournal%5D)">Protocol for fractionation-assisted native ChIP (fanChIP) to capture protein-protein/DNA interactions on chromatin.</a> STAR Protoc. 2 (2), 100404(2021).</li>
<li>Mendez, J., Stillman, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+association+of+human+origin+recognition+complex%2C+cdc6%2C+and+minichromosome+maintenance+proteins+during+the+cell+cycle%3A+Assembly+of+prereplication+complexes+in+late+mitosis%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Chromatin association of human origin recognition complex, cdc6, and minichromosome maintenance proteins during the cell cycle: Assembly of prereplication complexes in late mitosis.</a> Mol Cell Biol. 20 (22), 8602-8612 (2000).</li>
<li>Nowak, D. E., Tian, B., Brasier, A. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two-step+cross-linking+method+for+identification+of+NF-%CE%BAB+gene+network+by+chromatin+immunoprecipitation%5BTitle%5D)+AND+%22BioTechniques%22%5BJournal%5D)">Two-step cross-linking method for identification of NF-κB gene network by chromatin immunoprecipitation.</a> BioTechniques. 39 (5), 715-725 (2005).</li>
<li>Schmittgen, T. D., Livak, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analyzing+real-time+PCR+data+by+the+comparative+C%28T%29+method%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Analyzing real-time PCR data by the comparative C(T) method.</a> Nat Protoc. 3 (6), 1101-1108 (2008).</li>
<li>Lu, X., Parvathaneni, S., Hara, T., Lal, A., Sharma, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Replication+stress+induces+specific+enrichment+of+RECQ1+at+common+fragile+sites+FRA3B+and+FRA16D%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Cancer%22%5BJournal%5D)">Replication stress induces specific enrichment of RECQ1 at common fragile sites FRA3B and FRA16D.</a> Mol Cancer. 12, 29(2013).</li>
<li>Ruijter, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Amplification+efficiency%3A+linking+baseline+and+bias+in+the+analysis+of+quantitative+PCR+data%5BTitle%5D)+AND+%22Nucl+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Amplification efficiency: linking baseline and bias in the analysis of quantitative PCR data.</a> Nucl Acids Res. 37 (6), e45(2009).</li>
<li>Lyu, X., Chastain, M., Chai, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome-wide+mapping+and+profiling+of+%CE%B3H2AX+binding+hotspots+in+response+to+different+replication+stress+inducers%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Genome-wide mapping and profiling of γH2AX binding hotspots in response to different replication stress inducers.</a> BMC Genomics. 20, 579(2019).</li>
<li>Farmer, P. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+epidemiology+studies+of+carcinogenic+environmental+pollutants.+Effects+of+polycyclic+aromatic+hydrocarbons+%28PAHs%29+in+environmental+pollution+on+exogenous+and+oxidative+DNA+damage%5BTitle%5D)+AND+%22Mutat+Res%22%5BJournal%5D)">Molecular epidemiology studies of carcinogenic environmental pollutants. Effects of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in environmental pollution on exogenous and oxidative DNA damage.</a> Mutat Res. 544 (2-3), 397-402 (2003).</li>
<li>Phillips, D. H., Arlt, V. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genotoxicity%3A+damage+to+DNA+and+its+consequences%5BTitle%5D)+AND+%22EXS%22%5BJournal%5D)">Genotoxicity: damage to DNA and its consequences.</a> EXS. 99, 87-110 (2009).</li>
<li>Nitsch, S., Schneider, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Native+ChIP%3A+Studying+the+genome-wide+distribution+of+histone+modifications+in+cells+and+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Meth+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Native ChIP: Studying the genome-wide distribution of histone modifications in cells and tissue.</a> Meth Mol Biol. 2846, (2024).</li>
<li>Nikitina, T., Wang, D., Gomberg, M., Grigoryev, S. A., Zhurkin, V. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Combined+micrococcal+nuclease+and+exonuclease+III+digestion+reveals+precise+positions+of+the+nucleosome+core%2Flinker+junctions%3A+implications+for+high-resolution+nucleosome+mapping%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Combined micrococcal nuclease and exonuclease III digestion reveals precise positions of the nucleosome core/linker junctions: implications for high-resolution nucleosome mapping.</a> J Mol Biol. 425 (11), 1946-1960 (2013).</li>
<li>Teves, S. S., Henikoff, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Salt+fractionation+of+nucleosomes+for+genome-wide+profiling%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Salt fractionation of nucleosomes for genome-wide profiling.</a> Methods Mol Biol. 833, 421-432 (2012).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>0,2 et micro ; Membrane M Nitrocellulose</td><td>Amersham</td><td>10600011</td><td></td></tr><tr><td>Actine B</td><td>Proteintech</td><td>Référence 20536-1-AP</td><td></td></tr><tr><td>Aphidicoline</td><td>MedChemExpress</td><td>HY-N6733</td><td></td></tr><tr><td>Perles magnétiques de protéine A/G de qualité ChIP</td><td>ThermoFisher</td><td>26162</td><td></td></tr><tr><td>Substrat Clarity Western ECL</td><td>Bio-Rad</td><td>#1705061</td><td></td></tr><tr><td>Glycogène, grade biologie moléculaire</td><td>ThermoFisher</td><td>N° de cat. Non&nbsp ; Réf. R0561</td><td></td></tr><tr><td>Anticorps secondaire conjugué à la HRP&nbsp ;</td><td>Proteintech</td><td>SA00001-2</td><td></td></tr><tr><td>hydroxyurée&nbsp ;</td><td>MedChemExpress</td><td>HY-B0313</td><td></td></tr><tr><td>Nucléase micrococcique&nbsp ;</td><td>ONÉ</td><td>M0247S</td><td></td></tr><tr><td>IgG normales&nbsp ;</td><td>Santa Cruz</td><td>SC-2025</td><td></td></tr><tr><td>Taq Universal SYBR Green Supermix&nbsp ;</td><td>BioRad</td><td>1725120</td><td></td></tr><tr><td>et gamma ; H2A. Anticorps X&nbsp ; (pour ChIP)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>05-636</td><td></td></tr><tr><td>et gamma ; H2A. Anticorps X (pour la WB)</td><td>Signalisation cellulaire</td><td>#25955</td><td></td></tr></tbody></table>

capture des ruptures de sites fragiles communes par γh2a natif. x chip

Capturing Common Fragile Site Breaks by Native &#947;H2A.X ChIP

La taille des fragments de chromatine est cruciale pour le succès de la ChIP native, car elle a un impact direct sur l’accessibilité des régions de l’ADN pour la liaison aux anticorps. Pour déterminer la concentration optimale de MNase pour la fragmentation de la chromatine, nous avons préparé une série de tubes de microcentrifugation contenant des concentrations variables de MNase (c’est-à-dire 0,0625 U, 0,125 U, 0,25 U, 0,5 U, 1 U, 2 U, 4 U, 8 U par réaction) et 40 μL de noyaux isolés. Chaque réaction a été incubée à 3...

Capture des ruptures de sites fragiles communes par γH2A natif. X ChIP

Replication stress induced by exposure to extrinsic agents can lead to DNA breaks at common fragile sites, which are regions in the genome known to be ...

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Nous présentons ici un protocole qui décrit la fabrication de canal extensible, double, orgue puce cell culture microfluidiques pour récapitulant les organes au niveau fonctionnalité in vitro.

Fabrication évolutive d’étirable, Dual Channel, puces microfluidiques orgue

Cet article décrit un protocole ainsi qu’une étude comparative de deux techniques de fabrication microfluidiques, à savoir la photolithographie/gravure humide/liaison thermique et l’gravure sélective induite par laser (SLE), qui conviennent aux conditions de haute pression. Ces techniques constituent des plates-formes habilitantes pour l’observation directe du flux de fluides dans les supports perméables de substitution et les systèmes fracturés dans des conditions de réservoir.

Techniques de fabrication microfluidiques pour l’essai à haute pression du transport supercritique de mousse de CO2 à micro-échelle dans les réservoirs non conventionnels fracturés

Ici, nous présentons un protocole pour effectuer des expériences de réaction gazeuse à cellules fermées TEM in situ tout en détaillant plusieurs méthodes de préparation d’échantillons couramment utilisées.

Exécution de réactions gazeuses in situ à cellules fermées au microscope électronique à transmission

Un protocole pour la culture et la manipulation de tissu embryonnaire de souris sur une puce microfluidique est fourni. En appliquant des impulsions de modulateurs de voie, ce système peut être utilisé pour contrôler de l’extérieur les oscillations de signalisation pour l’étude fonctionnelle de la somitogenèse de la souris.

Une approche microfluidique pour l’étude fonctionnelle des oscillations de signalisation régissant la somitogenèse

Cet article retrace le cycle de vie d’un résonateur à membrane en nitrure de silicium, de la conception à la caractérisation en passant par la fabrication.

Fabrication et caractérisation de résonateurs à membrane en nitrure de silicium à haut Q

Un protocole de scellement novateur pour produire des joints étanches à base de silicone pour les membranes de dispositifs à puces polydiméthylsiloxane (PDMS). Destiné aux laboratoires, à la mise en place de modèles de puces et au développement de plateformes de puces à petite échelle. Nous démontrons le protocole en utilisant des membranes tissulaires plastiques et natives. Cette procédure ne nécessite que le PDMS, le toluène, le moule, la membrane et une chambre à vide.

Procédure d’étanchéité silicone accessible entre la puce et la membrane pour une liaison flexible et fiable

Découvrez une méthode native de ChIP γH2A.X pour détecter efficacement les ruptures de sites fragiles communs dans les cellules cancéreuses. Cette approche réduit le temps et la main-d'œuvre tout en garantissant une haute reproductibilité.

Capture des ruptures de sites fragiles communes par γH2A natif. X ChIP

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