Name: Un flux de travail computationnel bilingue pour identifier les inhibiteurs potentiels de PLK1 en langue des signes américaine et en anglais (Vidéo) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 34 s
Description: Découvrez un flux de travail computationnel bilingue pour identifier des inhibiteurs potentiels de PLK1. Cette méthode utilise le docking protéine-ligand et l'évaluation ADMET-S pour optimiser la découverte de médicaments anticancéreux.

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<table><tbody><tr><td>ADMETLab3</td><td>Simulations Plus. Inc</td><td>V3.0</td><td>Propriétés ADMET</td></tr><tr><td>Alphafold</td><td>Cherchez DeepMind & Cherche sur Google Isomorphic Labs (filiales d’Alphabet)</td><td>V3.0.1</td><td>Modélisation 3D des protéines</td></tr><tr><td>Anaconda/Conda</td><td>Anaconda, Inc.</td><td>V24.9.2</td><td>Système de gestion de paquets open source &nbsp ;</td></tr><tr><td>CB-Dock2</td><td>Laboratoire Yang Cao</td><td>V2.0</td><td>Amarrage aveugle protéine-ligand</td></tr><tr><td>CHARMM-GUI</td><td>Université de Lehigh</td><td>V3.8</td><td>Manipulation et simulation biomoléculaires</td></tr><tr><td>DARWIN sur ACCESS</td><td>Université du Delaware</td><td>N/A</td><td>Calcul haute performance</td></tr><tr><td>ORCA</td><td>FAccTs GmbH</td><td>V6.1.0</td><td>Ensemble de chimie quantique</td></tr><tr><td>Banque de données protéiques</td><td>Banque mondiale de données sur les protéines</td><td>RRID : SCR_006555</td><td>Base de données des protéines</td></tr><tr><td>RDKit</td><td>Open source</td><td>RRID : SCR_014274</td><td>Programmation en chimistique</td></tr><tr><td>SuperNatural 3.0</td><td>Institut de physiologie et de science-IT (Berlin)</td><td>V3.0</td><td>Bibliothèque de molécules naturelles</td></tr><tr><td>SwissADME</td><td>Institut suisse de bioinformatique</td><td>RRID : SCR_017865</td><td>Propriétés ADME</td></tr><tr><td>Toxtree</td><td>Ideaconsult Ltd</td><td>V3.1.0</td><td>Classification de la toxicité</td></tr></tbody></table>

un flux de travail computationnel bilingue pour identifier les inhibiteurs potentiels de plk1 en langue des signes américaine et en anglais

A Bilingual Computational Workflow for Identifying Potential PLK1 Inhibitors in American Sign Language and English

Un flux de travail computationnel bilingue pour identifier les inhibiteurs potentiels de PLK1 en langue des signes américaine et en anglais

Polo-like Kinase 1 (PLK1) plays essential roles in the S, G2, and M phases of the cell cycle, and its overexpression is frequently observed in multiple ...

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Chemistry

Chimie

Ici, nous montrons comment utiliser Assay ligature de proximité (APL), avec une combinaison d'anticorps de visualiser des protéines morphogénétiques osseuses (BMP) de signalisation dans les cellules fixes. Cette technique nous a permis de suivre l'accumulation nucléaire de BMP endogènes effectrices activées-complexes et de quantifier leur niveau au cours du temps sous BMP4 stimulation.

Détection de signalisation Effector-Complexes en aval de BMP4 aide In situ PLA, un dosage Ligature Proximité

Ici, nous utilisons une bibliothèque LentiPlex humains mis en commun et des méthodes de séquençage d'traditionnelle identifier les gènes cibles de promouvoir la survie cellulaire. Nous démontrons comment mettre en place et de déconvoluer un écran LentiPlex et valider les résultats.

LentiPlex MISSION dépistage sur mélange d&#39;Bibliothèque shRNA dans les cellules de mammifères

Le contrôle de la synthèse des protéines se produit principalement à l’étape d’initiation de la traduction, dont les déficiences sont liées à divers troubles. Pour mieux comprendre leur étiologie, nous avons décrit ici un protocole utilisant des ovocytes de Xenopus laevis évaluant la traduction du transcrit mos en présence d’un mutant du facteur d’initiation de traduction eIF4G1.

Xenopus laevis comme un modèle pour identifier traduction Dépréciation

La résistance aux médicaments à thérapies ciblées est très répandue et la nécessité d'identifier les mécanismes de résistance - avant ou après l'apparition des symptômes - est essentiel pour guider les stratégies alternatives de gestion clinique. Ici, nous présentons un protocole de coupler dérivation de lignées résistantes aux médicaments in vitro avec le séquençage d'accélérer la découverte de ces mécanismes.

Implémentation de<em&gt; In Vitro</em&gt; Résistance au médicament Essais: Maximiser le potentiel pour découvrir cliniquement importants mécanismes de résistance

Est présenté ici, un protocole d’analyse moyen - à haut-débit des événements de phosphorylation de la protéine au niveau cellulaire. Phospho cytométrie en flux est une approche puissante pour caractériser des aberrations signalisation, identifier et valider des biomarqueurs et évaluer pharmacodynamique.

Cytométrie en flux phospho avec cellule fluorescente code-barres pour seule cellule signalisation d’analyse et découverte de Biomarker

Ici, nous présentons un protocole eCLIP pour déterminer les principales cibles d’ARN des candidats du RBP dans les testicules.

Méthode améliorée d’Immunopréprécipitation de réticulation (eCLIP) pour l’identification efficace de l’ARN lié aux protéines dans les testicules de souris

Un protocole détaillé pour la génération de microarrays de protéines humaines auto-assemblés pour le dépistage des inhibiteurs de la kinase est présenté.

Dépistage de l'inhibiteur de kinase dans les microréseaux de protéines humaines auto-assemblés

Cette étude visait à présenter une stratégie pour identifier les interactions médicament-peptide. La stratégie consiste à biopanner les peptides courts reconnaissant les médicaments à partir d'un biocapteur de microbalance quartz-cristal (QCM), suivi d'une analyse bioinformatique pour évaluer quantitativement les informations obtenues pour la reconnaissance et l'annotation des sites de liaison médicamenteux sur les protéines.

Stratégie d&apos;analyse biopanning et bioinformatique à haut débit basée sur biocapteur pour la validation globale des interactions médicament-protéines

Nous avons développé une approche d’oncogénomique comparative inter-espèces utilisant des analyses génomiques et des criblages génomiques fonctionnels pour identifier et comparer des cibles thérapeutiques dans les tumeurs apparaissant dans des modèles murins génétiquement modifiés et le type de tumeur humaine correspondant.

Profilage génétique et criblage de décrochage à l’échelle du génome pour identifier des cibles thérapeutiques dans des modèles murins de tumeur maligne de la gaine nerveuse périphérique

Non ciblée métabolomique fournit une hypothèse générer instantané d'un profil métabolique. Ce protocole démontrera l'extraction et l'analyse des métabolites provenant de cellules, le sérum ou les tissus. Une gamme de métabolites sont interrogés par extraction en phase liquide-liquide, microflow UltraPerformance chromatographie liquide / haute résolution spectrométrie de masse (UPLC-HRMS) couplé à un logiciel d'analyse différentielle.

Metabolomics non ciblées de sources biologiques en utilisant UltraPerformance chromatographie liquide haute résolution spectrométrie de masse (UPLC-HRMS)

Découvrez un flux de travail computationnel bilingue pour identifier des inhibiteurs potentiels de PLK1. Cette méthode utilise le docking protéine-ligand et l'évaluation ADMET-S pour optimiser la découverte de médicaments anticancéreux.

Un flux de travail computationnel bilingue pour identifier les inhibiteurs potentiels de PLK1 en langue des signes américaine et en anglais (Vidéo) | JoVE Journal

Un flux de travail computationnel bilingue pour identifier les inhibiteurs potentiels de PLK1 en langue des signes américaine et en anglais

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